Cajanus cajan (pigeon pea): 109798558
Help
Entry
109798558 CDS
T04868
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ccaj
Cajanus cajan (pigeon pea)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF445
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109798558
NCBI-ProteinID:
XP_020214471
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(3210644..3217215)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MEQKSFAEIFQDDLGRNTSVTGLPSRPSSRNAFDENDIIGSAEADMAHVRRESAATDALR
SGSNVQGSSAAQNIGQSASYSYAAALGSSLSRSTTPDPQLVARAPSPCITPIGGGRAIAS
DKRGIASTDAFNGVSSGINESADLVAALSGMNLSADDVLDGENHLPSQVESDVDNHQRYL
FGRQGGQDHGKQHAYLKKSESAHMQNSGKIRSGSDLNNPSFDRQAELQKSAVSSNNSYFK
GSPTSHFSRGGSSPPQYQPLDGTNSSFTNYGLSGYAGNPALASLMTNQLGSGNLPPLFEN
VAAASAMGAPGMDSRIIGGGLASGGAASSDVHNLGRMGNQIPGSALQASFVDPMYLQYLR
TSEYAAAQLGALNDPSVDRNYLGNSYMNILELQKAYLGSILSPQKSQYNVSLGGKSGSST
PQGYYGNPAYGVGLSYPGSPMANSVLSTSPVGSGSPVRHNELNMRFASGMRNLAGVMGPW
HVDNGNIDESFASSLLEEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEE
KNMVYQEIMPHALALMTDVFGNYVVQKFFEHGLASQRRELANKLLGHVLTLSLQMYGCRV
IQKAIEVVDLDQKIEMVQELDGNVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVTEDAIHFIVSTFFDQV
VTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDPITQQKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPH
ERSSIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPSERQLLVNEMLGSTDENEPLQAMMK
DQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAA
QSPQPA
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacagaagagctttgcagaaattttccaggatgatttggggcgtaatacttctgtg
acaggtcttccttctcgtccatctagtcgtaatgcatttgatgaaaatgatatcataggt
tctgctgaagcagatatggcccatgtacgccgtgagtctgcagccactgatgctttaaga
tcaggatcaaatgttcaaggatcatctgccgcccaaaatattggccagtcagcttcttat
tcttatgctgctgctctaggatcttccttgtcgagaagcactactcctgatccacaactt
gttgctagggctcccagtccctgcatcacacccattggtggtggcagagccattgcttct
gacaaaagaggtattgccagtacagatgcatttaatggtgtttcatctggcatcaacgag
tcagcagatcttgtggctgcattgtcagggatgaacttgtcagcagatgatgtgttagat
ggtgaaaaccatttgccatcacaggttgaatcggatgttgataatcaccaaagatatctt
tttggtaggcaaggtggtcaagatcatggtaaacaacatgcttatttaaagaagtctgaa
tcagcgcacatgcaaaattcaggtaagattaggagtgggtcagatctcaacaatccatcc
tttgatcggcaggctgagctacaaaagtctgctgtttcttccaataactcatatttcaaa
ggatcgcctacctcccattttagtagaggaggtagttcgccgcctcagtaccagccttta
gatggtacaaattcatcatttactaactatggtctgagtgggtatgccggaaatccggca
ttggcatccttgatgactaaccaacttggcagcggtaatctaccgcccttgtttgaaaat
gttgctgcagcatcagcaatgggggcccctggaatggactcaagaattattggaggtggt
ttggcatctggaggtgctgcttcatctgatgtgcataatcttggtaggatgggaaatcaa
attcctggcagtgctctccaggcctcttttgttgatccaatgtatcttcaatacctgagg
acatctgaatatgctgcagcacaacttggtgctcttaatgacccctctgtggacaggaac
tacttggggaattcatacatgaatatacttgagcttcagaaagcttatctagggtctatt
ctctctcctcagaaatcccaatacaatgtatcactgggtggaaaatcaggcagctccact
cctcagggttattatggaaatcctgcatatggtgttgggttgtcttatccaggaagtcca
atggcaaactctgttttatccacttctccagttgggtctggaagtcctgttaggcacaat
gaactaaatatgcgttttgcttcgggaatgaggaatttagctggggtcatgggaccttgg
catgtagataatgggaacattgatgaaagttttgcttcttctctgttggaagagtttaaa
agcaataaaactaagtgttttgagctctctgaaattgctggtcatgttgttgagttcagt
gcggatcaatatgggagccgatttattcagcaaaagcttgaaacagctactacagaagaa
aaaaacatggtttatcaggaaatcatgccacatgcgcttgctttgatgactgatgtcttt
ggtaattatgtggttcaaaagttttttgagcatggacttgcatcccaaaggagagaatta
gccaacaaacttcttggccatgttctgacacttagccttcaaatgtatggttgccgggtc
atccagaaggccatcgaagttgttgatttggatcagaagatagagatggttcaagagctt
gatggtaatgtaatgcgctgtgtacgtgatcagaatggtaatcatgtcattcagaagtgt
attgaatgtgtcactgaagatgcaatacactttattgtgtcaacatttttcgatcaagtt
gtgacactctcaacccatccatatggttgtcgggtgatacagagggtattggagcactgc
aaagatcctataactcagcagaaagttatggatgagattttaggagcagttagcatgtta
gctcaagatcagtatggcaactacgttgttcagcatgtactggaacatgggaagcctcat
gaacgctcttctataataaaggaactagcaggcaagatagttcaaatgagtcagcagaag
tttgcttcaaatgttgtggagaaatgtttgacctttggaggtccttctgagcgccaattg
ctagtgaacgagatgcttggctctaccgatgaaaatgagcctcttcaggcaatgatgaaa
gatcaatttgcaaattacgttgtacaaaaagtgctggaaacttgtgatgatcaacaacgc
gagctgattctttcacggattaaggttcatttgaatgcattgaaaaagtacacctatgga
aagcacattgttgcacgtgtagaaaaactcgttgctgctggagaaaggagaattgctgct
cagtctcctcaacctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system