Cajanus cajan (pigeon pea): 109804314
Help
Entry
109804314 CDS
T04868
Name
(RefSeq) homeobox-leucine zipper protein ROC5
KO
K09338
homeobox-leucine zipper protein
Organism
ccaj
Cajanus cajan (pigeon pea)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccaj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
ccaj03000
]
109804314
Transcription factors [BR:
ccaj03000
]
Eukaryotic type
Helix-turn-helix
Homeo domain other
109804314
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PDF2_C
START
Homeodomain
Homeobox_KN
DUF6965
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109804314
NCBI-ProteinID:
XP_020221720
LinkDB
All DBs
Position
8
Genome browser
AA seq
743 aa
AA seq
DB search
MEGHSEMGLIGESFDTSNLLGRMRDDEYESRSGSDNFDGGSGDDQDGGDDQPQKKKKKYH
RHTPQQIQELEAFFKECPHPDEKQRTDLSKRLGLENKQVKFWFQNRRTQMKTQMERHENM
ILKQENDKLRAENSVMKEALANPICNSCGGPAIPGQISLEEHQTRIENARLKDELNRICA
LANKFLGRPLSSMASPMPLPASNSCLELAIGRNGIAGPSNFGMSLPMGLDVGDGVLGSSP
MMANMSSRSPMGMMGNDVQMERTMLLDLALSAMDELVKMTQADSPLWIKSSDGRNEVLNH
EEYARMCSPYIGPKPAGYVTEATRGTGVVLANGLALVETLMDVDRWLEMFASIVASAATL
DVISSGTGGTRSGALQVMLAEIQLLSPLVPARQLSFLRFCKQHAEGVWAVVDVSLDIARN
AANLHPLVSCRRLPSGCVIQDMPNGFSKITWVEHSQYDESVIHQLCRPLVSSGIGFGAHR
WIATLLRQCECLAILMSTPGTSDDPTVMNQAGRRSMLKLAQRMAEYFCSGICASSARKWD
ILPIGNLGDDMRIMARKNGDDPNEAPGIVLSASTSVWMPVSRQKVFDFLRSGQFRGEWDM
LSNGGPMQEMIRIPKGQEDGNCVSILTANSTDSNVQYLQESWTDASGSMVVYSPINMQSL
NVVMSCGDSSFVALRPSGFAILPDGHPVNSDGSDGGGSCLLTVGLQMLQNGNQTSKFTVE
SVETVHNLISCTIQKIKDALGVA
NT seq
2232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggccatagtgaaatgggtctaattggagaaagttttgatactagtaatttgctg
gggaggatgagggatgatgagtatgaaagccgctctggaagtgataattttgatggtgga
tctggtgatgatcaagatggtggtgatgatcagccacagaaaaagaagaagaaataccat
agacacactcctcaacaaattcaggagcttgaagcgttcttcaaggagtgtcctcatcct
gatgagaagcaaagaacagatcttagcaagaggcttggcttggagaataagcaagtcaag
ttctggtttcagaaccgacgaacccaaatgaagacgcaaatggaacgtcatgagaacatg
attcttaagcaggagaatgacaagctccgagctgagaacagtgtcatgaaggaagctttg
gcaaatccgatatgtaacagctgtggtggtccagccattcctggtcaaatttcactggag
gaacaccagactagaattgaaaatgctcggctaaaggatgaattgaaccgaatatgcgca
ttagcaaacaagttcctgggcaggcccctctcatcaatggccagccccatgcctctgccg
gcctcaaattcttgtctagagcttgctataggaagaaatggaattgctggtccaagcaat
tttgggatgtcgttgccaatgggactcgatgtgggagatggggttttgggctcctcacct
atgatggctaacatgagttctagatcaccaatgggaatgatgggaaatgatgtccagatg
gagagaactatgcttttagatcttgcattaagtgctatggatgaattggttaagatgact
caggctgatagccctctttggattaagagttctgatggcaggaatgaagtgctgaaccat
gaggagtatgcaagaatgtgttctccttatattggaccaaaacctgctggttatgtaact
gaagctactagaggaactggagtagtattagccaacggtttggcccttgtggaaacattg
atggacgtggatcgatggttggagatgtttgcatctattgttgctagtgctgccactctt
gatgtaatatctagtggcactggtggtaccagaagtggggctttgcaagtgatgcttgcc
gagatacaattgctttctccactcgtccctgctcgtcaattgagtttcctcaggttttgt
aagcagcatgcagaaggtgtatgggctgtggttgatgtttcactggacattgctcgtaat
gctgccaatttgcacccactagtgagctgcaggaggcttccttctggctgtgttattcag
gatatgcccaatggtttctccaagattacttgggttgaacattcccaatatgatgagagt
gtgatacaccaactttgtcggccgttggttagttctggcattggctttggtgctcacaga
tggattgccaccctcctaaggcagtgtgaatgcttggcaatcctcatgtccactcctggc
acatctgacgaccccacagtcatgaaccaagccggtaggaggagcatgctgaagcttgcg
cagcgcatggccgagtacttctgctcagggatctgtgcttcatctgcacgcaagtgggac
atccttcctattggtaatctgggcgatgacatgaggatcatggccaggaaaaatggggac
gaccctaatgaggctcctggcattgtgctgagtgcatcaacttctgtttggatgccggtg
tcacgccaaaaggtgtttgactttctgcgtagtggacagtttagaggtgagtgggacatg
ctgtccaacggtggtccaatgcaggagatgatccggattcccaagggacaggaagatgga
aattgtgtttccatccttactgctaatagcacagacagcaatgtgcaatatctgcaagag
tcatggactgatgcctccggctcgatggtggtgtattcgccgatcaacatgcaatccttg
aacgtggtgatgagctgtggagattcgtcctttgttgctctccgtccgtcaggctttgct
attctgccagatggccatccggtcaacagcgatggcagtgatggtggtggcagttgcctt
cttacagttgggctacaaatgttgcagaatggcaaccaaacatccaagttcactgtggag
tcagttgaaactgttcataacctcatctcatgcaccattcagaagatcaaagatgcacta
ggagttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
