Cajanus cajan (pigeon pea): 109804860
Help
Entry
109804860 CDS
T04868
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ccaj
Cajanus cajan (pigeon pea)
Pathway
ccaj03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccaj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
109804860
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ccaj03019
]
109804860
Messenger RNA biogenesis [BR:
ccaj03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
109804860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109804860
NCBI-ProteinID:
XP_020222337
LinkDB
All DBs
Position
9:4362042..4365771
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEDKLKDHFGNYGDVLSTSVMREKNTGKPRGFGFVVFADPSIL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKKAFSREDQQISVTSRTGNPNSGMNSGSGGNVRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRQYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKSFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRMMGGGGGGGGGIGGYQGYGASGGNQNAYDSRMDSSRYMQPQ
SAAGGFPPYGSSAYSAPGYGYGPANNGIGYGAYGNYGGATAGYGGPAGATYGNPNVPNAA
YAGGPPGGPRSSWPTQAPSGYGSMGYGNTAPWGAPSGGAGSGGGGPGSATAGQSPGGAAG
YGNQGYGYGGYGGYGGSDSSYGNSSAYGTVGGRTGSAPNSNASGPGGNELTSSGGSGSYM
GAGYGDANGNSGYGNAAWRSEQTHASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaagggaagctcttcatcggtgggatttcgtgggacacgacggaggac
aagctgaaggaccacttcggcaactacggcgacgttttgagcacttccgtcatgagggag
aagaacaccggcaagcccagaggcttcggcttcgtcgtcttcgcggatccctccattcta
gatagggttttggaagacaaacatgttatagatggcagaacggttgatgccaaaaaggcc
ttctcaagagaggatcagcaaatttctgtcacttcaagaactggaaatcccaattctggc
atgaattctggaagtggtggtaatgttaggactaaaaagatatttgttggtgggttgcct
cctaccctgactgaagaaaaatttcgtcagtactttgaatcttatggacatgtaactgat
gtagtagtcatgtatgaccagaatactggacggccaagaggatttgggtttatttcattt
gatactgaagaggcagttgatagggttttgcacaaatcatttcatgatttaaatggtaaa
caagtagaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgccaatcctggtgcaagtggccgtatg
atgggaggtggtggagggggtggtggtggaattggtggatatcaagggtatggggcatct
ggtggcaaccaaaatgcatatgatagtcgtatggattctagtaggtatatgcagcctcaa
agcgctgcaggtggattccctccttatggttcttctgcctatagcgctcctggttatggg
tatggtcctgctaataatggcattggatatggtgcatatggaaattatggtggtgccact
gctgggtatggtggacctgctggtgcaacatatgggaatcctaatgtccctaatgctgcc
tatgctggtggtccaccaggtggcccaaggagttcatggcccactcaggctccttctggt
tatggatctatgggctatgggaacactgctccttggggtgctccaagtggtggtgctgga
tctggtggaggcggtcctggttcagcaactgcaggtcagtcccctggtggagctgctgga
tatgggaatcaaggttatggatatggtgggtatggtggatatggtggaagtgatagttct
tatggcaattctagtgcttatggtactgtaggtggacgtactggaagtgcaccaaacagt
aatgctagtggtcctggtgggaatgaactaacaagtagtggtggcagtggcagctatatg
ggtgctggctatggggatgcaaatggaaattcaggttatggtaatgcagcttggagatct
gaacaaactcatgcatctggaaattatgggactcctcagggaaatggtgggcaagttggt
tatggtggtggctatggtggtgctcagtctcgacaagcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
