Cajanus cajan (pigeon pea): 109805771
Help
Entry
109805771 CDS
T04868
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
ccaj
Cajanus cajan (pigeon pea)
Pathway
ccaj03015
mRNA surveillance pathway
ccaj03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccaj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
109805771
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
109805771
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ccaj03041
]
109805771
Spliceosome [BR:
ccaj03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
109805771
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109805771
NCBI-ProteinID:
XP_020223555
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(15084474..15088683)
Genome browser
AA seq
507 aa
AA seq
DB search
MSGAYGQDGGGAAPPSYGASGGYGTAAGYGAGAGGGGSYGGSYGGNDGGGGYGAKGSGNG
GGYGGSDGGGYGGRSGYGGNDGGGYGGRGGGGQGGRGGGGYGGGGSGYGGRGGGGGGDRG
GRGGGRGGRGGGGGSGRDGDWRCPNQSCGNLNFARRVECNKCGAPSPNPNPNSSNDRGGS
GGGYNRGGGGGGYGNSRGGRSDYNSGGGRSGNYDGGRGNDYNSGRSGSSDGRGGSYRGNQ
GREEGGYGQVPPPTAQSYGGAGAGAGGNYPPTYNSYGGNASYGTDAVPPPASYTGGPNSY
PPSYGGNAGGYGGDTQGDGRSGGRSGPPAGYDSSYGAGNRGGFGGSPAEPPAAVKQCDEN
CDDTCDNSRIYISNLPPDVTIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDENGN
NKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYKISVAMAEKSAPRAPAAYNQGGNRGGYGGD
RRRDNYRDGGGSGPDRRDHYGNRSRPY
NT seq
1524 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagcgtacggtcaagacggcggcggtgccgcgccaccgtcctatggggctagt
ggcggttacggtaccgccgctggctacggtgccggtgctggcggaggaggcagttatgga
ggtagttatggtggtaacgatggcggtggaggctatggagcaaaaggcagcggaaacggc
ggcgggtatggcggcagcgatggtggaggatatggcggaaggagcggctacggcggaaac
gatggcggaggctatggaggaagaggcggtggtggtcaaggtggtcggggaggtggaggt
tacggtggtggtggtagtggatacggcgggcgaggtggtggtggtggtggagatcgtggt
ggtcgaggtggtggtcgtggcggccgtggcggtggaggtggcagcggcagagatggagac
tggcgttgtcctaaccaaagttgtgggaacttgaactttgcgagaagggttgaatgtaac
aaatgcggtgctccgagtcctaatcctaatcccaatagttctaatgaccgaggtggcagt
ggtggtggttataatagaggaggcggtggtggaggttatggtaacagtcgaggaggaaga
tctgactataacagtggagggggtagatctgggaactatgatggtgggagaggtaatgat
tataatagtggaaggagtggtagtagtgatggtagaggtggttcatatagaggtaatcaa
gggagagaagaaggtggctatggtcaagttcctcctcctaccgctcaatcttatggtggt
gctggtgctggtgcaggtggaaactacccacccacttacaattcttatggtgggaatgca
agttatggaacagatgcagttcctccacctgcaagttatactggtggtcctaattcctac
cctccatcatatgggggtaacgcaggtggttatgggggagacactcaaggggatgggcgg
agtggtggtagatctgggcctccagcgggatatgacagtagttacggtgctggtaaccga
ggtggatttggtggatctcctgctgaaccccctgctgcggtgaagcagtgtgatgagaat
tgtgatgatacatgtgacaactctagaatctacatctcaaacctaccacctgatgtgact
attgaagaattgagggaactttttggaggcattggacaagttggaagaataaaacagaag
aggggctataaagatcagtggccttggaacataaagatttacactgatgagaatggaaac
aacaagggtgatgcttgccttgcttatgaagacccttctgcagcacattctgctggcggt
ttttacaataattatgatttgaggggttacaaaatcagtgttgcaatggcagaaaaatct
gcaccaagagctccagctgcatataaccaagggggcaataggggtggctacggtggagat
agacgcagagacaattatagagatggtggtggttctgggcctgataggcgtgatcattat
ggaaatcgttctcgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
