Ceratina calcarata (carpenter bee): 108625285
Help
Entry
108625285 CDS
T06061
Name
(RefSeq) sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1-like
KO
K24469
sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1
Organism
ccal
Ceratina calcarata (carpenter bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccal00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
ccal04990
]
108625285
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
ccal04990
]
EGF-like domain-containing proteins
hEGF domain-containing proteins
108625285
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sushi
VWA
EGF
Ephrin_rec_like
Pentaxin
HYR
Laminin_G_3
EGF_TEN
VWA_2
hEGF
VWA_CoxE
Laminin_G_2
EGF_3
RIOX1_C_WH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108625285
NCBI-ProteinID:
XP_026669674
UniProt:
A0AAJ7S1I8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2249 aa
AA seq
DB search
MSREHCQAVVGAIMRVCFLIWLMPRLSITTISLDEISRFDKKLYFEVSREKLDVPMFFNF
EEKRSVNQHESNTTLDSFQKTLKKKTETMSHLLKGHIDRLRNETEQVELVFLVDASGSVG
LKNFQSELNFVKNVLSDFSVEPSATRVAIVTFGGRKYIRRNVDQISRADKKDNKCYLLNK
QLNNISYTGGGTYTRGALFEAVRILEKGRMKAKKAVFLITDGFSNGGDPRPAAELLKHAG
ATIFTFGIRTGNVDELHDIASFPGDTHSYFLDSFTEFEALVRRALHRDLKAGKYIPVAFP
DNCNLLCKNISVIRNELNCCDNFATCACGTITGHYSCICPVGYFGSGFKSSCHPCPNGTY
ASGEISGDFASMCIPCPDVNHVTIDVPATSVEHCICASGFTTDGYKCEVITCPKLKVPEN
GYLVKASACSNVVHAACGIRCKIGFYLTGDSIRLCGTGGNWSGNEPKCLLKTCPAVRVPV
HGRMRCQTEENQRSIAKDLAAYPIDTRCQFKCDTGYQLRGSKIRNCLPLSQWDGLKATCK
AIKCEPLKQIANGLISPNSCFGPEKSPFAMNCTITCKEGFILQGPRFRYCGGKSGVWSQR
KIVNRCIDKTPPSITCPSNIITENLPGKNYAYVNWTIPKVTDNVDKSPTLWSRPQITFPW
KLKIGTRTVVYVAQDSSGNKARCKFKVTVVDTEPPTVHNCIDPLIFFTDSSLGVSNITWD
EPDFYDNSKTPVQVEQNYFPGNNAFNFGLTKVVYYALDKYTNKASCILNITVKDICEEVP
KILNGFSKCSSTPLNKINECALTCEEGYGFAEGLNLSIVDNALLLKCNRNTTNWLEDNYI
PDCSESTNPKSISQEGSIILEGNETNVCDNRTTLRELSEYITDDLRLTLLDICGNDIECN
LITFDPECKETVLPPDTIPTQINNNNNLPTNHVHKKSKRDAKVKNPKDKNMKVKKEKQKI
EIKFKVLGKIINEYSDDPKEGIQKLRKKIDTMSKSGKLNLLNNRTNEEIAKLALNLHLVF
NNLQELCDPGSVLKKHTCVKCPLGTFFNSSTKKCLPCPAGEYENTTGSLKCKRCPEYTST
KKAHSKSLRDCIHLCRPGYYSRKKRYQYLRLALEPCVMCDIGFYQPDHGQNHCLSCPSNF
STKNRGAKSMNDCLPLRAIEPDVCDTKPCLNEGQCTQEEDSFSCECSEYYIGSKCEMFQN
PCNSFPCLNEGSCDVQSFSNGTIFYTCTCKNGYSGRDCELYIDECAINPCQNNGTCVSTE
NDYSCECKNGFEGEFCEIAVNYCDPSPCMEGSTCRNVNNTWQCFCKSGFYGRYCNLLPCD
WLPCNENSYCINIEDQNATRLSYRCECVDGYSGENCTIKKDYCESNPCLNNGKCVNKASS
YTCICRVPFTGLHCETELSSDYVIHFVKSGTTDYVSIKGPSTNLSEISTCLWLQAKDTFN
YGTVLSYATRYYDNAFTLTNYNGFVIYLNSQKVVTDIKVNDSHWHFVCFTWEVKNGSWEI
FVDGILRDNGTHLAKGSPLQGNGTFVIGQEQDRIGGGFSESESFVGKLTLLDVWNSVLTV
TDVNQLFNSCEKYYGDIIAWSQVQEHIHGDVIILNSPFCRGCPMPVVPFKGNINVSEDAL
SITYYCENGYVVRFHGKEYRSLKVKCLKHGQWEGYYTPVCARRRCGFPGYFPRGRMHGRS
YLFGDEIYYSCLIGYELRGNPRRICNANGKWSGLAPICIGKTCRNLLAPEHGDIEYVIEE
YERDDLSILQVGQQIEFKCDPGFRLFGERMLTCVESGVWDHERPTCIAYGCPPPKEILNG
YIISIKSNNLHESSANNVTIDKNYDFNDVVGYSCQSGHKFQDSHVLLSEFKLQCTENGTW
TGFVPDCVPLRCPWPRIVNNGKLSLITQENNTFELPNEQTIINDTNIKIALNVNNNDSKQ
YQNLEDQFIVGTQILIQCNIGYKLIGDSVKICESNEKWLSTPTSCEPQECPIVEHPFFKI
INRTQNQNKKLNDVESYGGFYKNLRYFVQGYTYMKNIVLICKDNNKMKLSNEDLTFSNLT
WICNEHGQWQIVDTPLNDINESVLNNEIDNICQESTCSSVAFPEHGYIVEKNYSKNVNSS
IMFKCNEGYILEGNEKSVCLSNNTWSDIPFCKPITCGKPPKVANAVLNKNYITTVNFTFD
DTITYECIPGYIMYGKPDAKCLSNGKWSRAYSRCSKLSCNKPKLPPGIIIRGRSYLYQDQ
LTYICPNKKQGLITCKADGHWSEPPKCNA
NT seq
6750 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgggagcattgccaagcagtggtcggtgcaatcatgagagtctgctttttaatt
tggctgatgccgcgtttgtcaattacgactatatcgctcgacgaaataagcagattcgac
aaaaagttgtactttgaagtgtctagagaaaagttagatgtgccaatgttttttaatttt
gaagaaaagagaagcgtgaatcagcatgaatcgaacaccactttggatagctttcaaaag
acattgaaaaagaaaaccgaaactatgtcacatcttttaaaaggtcatattgatcgattg
cgaaacgaaaccgagcaggtagaattggtattcttggttgatgcttcgggatcggtcggt
ttaaaaaatttccaaagcgagttgaactttgtaaaaaatgttctgtccgatttctccgtc
gagccttccgcaactagagttgctatcgtgacgttcggtggaagaaaatacattagacgg
aacgtcgatcagatatctcgtgctgataaaaaggacaacaaatgttatttattgaacaag
cagctgaataatattagttacaccggcggtggaacatacacacgtggggcactattcgaa
gctgttaggatcctcgagaagggccgaatgaaagcgaagaaggcggtgtttctcataact
gatggattcagcaacggcggcgatccacgtcctgcggcggagcttttgaaacatgcgggt
gcaacgatattcacttttggaataagaacaggaaatgtggacgaattgcacgacatagct
agctttcccggtgacacgcacagctatttcctcgacagtttcacagagttcgaagctcta
gttcgacgagctttgcatcgtgatttaaaagcgggcaagtacataccagtggcattccca
gataattgcaatcttttgtgcaagaatatcagcgtaatcagaaatgagctaaattgttgc
gataatttcgcgacgtgcgcctgtggcactatcaccggccactattcctgcatttgtcca
gtagggtattttggatctggattcaaaagctcctgccatccttgtccgaacggtacatat
gcatcgggagaaatatccggcgatttcgcgtccatgtgcataccgtgccctgacgtgaat
catgtgactatcgatgtacctgcaacttccgtggagcattgcatttgcgcttccggattc
accacagatggatataagtgcgaggttataacatgcccaaagctaaaagtaccagaaaat
ggatatttggtaaaagcaagcgcatgcagcaacgtggtacacgcggcatgtggcataaga
tgtaaaatcggcttttatctgaccggtgacagtattcgattgtgcggaactggtggcaac
tggtccgggaatgaaccaaaatgtttgctgaagacgtgtccagcggttcgtgttcctgtg
catggacgaatgcgttgtcaaaccgaagagaaccaacgctcgattgcaaaagatttagcc
gcatatccgattgatacgcgttgtcaattcaaatgcgatactggttatcaacttcgtggg
agtaagattcggaattgcttacccctgtcgcagtgggatggcttgaaggctacgtgtaaa
gccataaaatgtgaacccttgaaacaaatcgcaaacggactgatttcgccgaatagttgt
ttcggtccagaaaaatctccttttgcaatgaactgtacgataacgtgcaaagagggtttt
attcttcaaggtccgcgtttcaggtattgcggtgggaagtctggagtttggtcccaacgc
aagatcgttaaccgttgtatagacaaaactccaccttcaataacgtgtccgtccaatatt
atcacggagaacctaccaggcaagaactatgcatacgtaaattggacaatacctaaagtg
actgacaacgtggataaatcacccacgttatggagtagaccacaaatcacgttcccctgg
aagttgaaaatcggcacgcgcacggtagtgtacgttgcgcaagattcgtccgggaataaa
gcgagatgtaaattcaaagtgaccgttgtcgatacagaaccaccaacagttcataattgc
atagatccactgatattttttaccgatagtagtcttggagtaagtaacataacttgggac
gaacctgatttttacgacaactccaagacacctgtgcaagtggagcaaaactattttcca
ggaaataacgcgttcaatttcggattaacaaaagttgtgtactacgctctcgacaaatat
actaataaagcatcttgtattttgaatattaccgtgaaagatatatgcgaagaagtccca
aagatattaaatggtttctcgaagtgttcctcgacaccattgaacaagatcaatgagtgc
gctttgacttgtgaagaaggatacggattcgccgaaggattaaatcttagtattgtggac
aatgcgttgttgttaaaatgcaacaggaatacaactaattggcttgaggataattacatt
ccggactgctcagaatcaacaaaccctaagagtatatcccaggaaggaagtattatatta
gagggaaatgagacaaatgtgtgcgacaatcgcacaactctacgcgaactgagcgaatat
attactgacgatttaagattgacgttactcgacatttgcggaaacgatattgaatgtaat
ctaattacatttgatcctgaatgcaaggaaactgttttacctccagacacaatacctaca
caaattaataataataataatttgccaacgaaccatgtacacaagaaatcaaaacgagat
gctaaggtaaagaatcctaaagataaaaatatgaaagtgaagaaggagaaacagaaaatc
gaaatcaaattcaaggttttaggaaaaataatcaatgaatactctgatgatccaaaagaa
gggatacaaaagttaaggaaaaagatcgacacgatgtctaaatcaggaaaattaaatttg
ttgaacaatagaacgaacgaagaaatcgcgaaactcgcattgaatttacatctcgttttt
aataatctccaggaactatgcgatccagggagcgttttgaagaagcatacttgtgtaaaa
tgccctttgggcactttctttaattcctcaactaagaaatgtctgccttgccctgctgga
gagtacgaaaacacaactgggtctctcaaatgcaaacgttgtcctgaatatacctcgacg
aagaaagcgcattcaaaatctctacgcgactgtatacacttatgcagaccagggtattat
tcacgaaaaaagcgttaccagtacttgcgtttagcactagagccatgtgtaatgtgtgac
attggattttatcagccagaccatggacaaaatcattgtctttcatgtccatccaatttc
agcaccaaaaatcgtggtgctaagagcatgaacgattgtttgccacttcgagcgattgag
cctgatgtttgtgatacaaaaccgtgtttgaatgaaggacaatgcacacaagaagaggac
agcttcagttgcgagtgttccgagtattatatcggttccaaatgcgaaatgtttcaaaat
ccgtgtaattctttcccctgtttgaacgaaggaagttgcgacgttcaaagtttttcaaac
ggtacaatattctacacttgtacatgcaaaaatggatattcgggtcgcgattgtgagttg
tacattgatgaatgcgcgattaatccttgccaaaataatggaacatgcgtcagcacggag
aacgactacagttgtgagtgcaagaacggattcgaaggagaattttgtgagatcgctgtg
aattattgtgatccttcaccttgcatggaaggatctacttgtcgcaacgttaacaataca
tggcaatgcttctgtaaatctggtttttatggtcgttattgcaatctgttgccgtgtgat
tggctaccgtgcaacgagaattcgtattgtatcaatatcgaagatcaaaatgcgacgaga
ctgagttataggtgcgaatgtgtagatgggtacagtggagagaactgtactataaaaaaa
gattactgcgagagtaatccatgtttgaacaatggaaaatgtgttaacaaagcttctagt
tacacgtgcatttgccgtgttccatttactggactccactgcgagactgaattgtcatcg
gattatgtgatacatttcgtcaaatcgggaactacggattatgtcagcataaaaggtcca
tctacaaatctttcagagatatcaacatgcttgtggttgcaagcaaaagatacatttaat
tatggtactgtgttatcgtacgcgacacgctactacgataacgcattcactttaactaac
tataatgggtttgtaatatatctcaatagccagaaagtagtaactgacattaaagtaaac
gatagtcattggcatttcgtttgtttcacctgggaggtgaaaaatggttcatgggaaata
tttgtcgatggtattttaagagataatggtacccatttagcaaaaggaagtcctcttcaa
ggtaacggaacattcgtaatcggacaagaacaagaccgaatcggaggaggattctcagaa
tcggaatcttttgtgggaaaattaacattattagacgtttggaattcggttttaacagtg
acagacgtcaatcagttgtttaactcctgcgaaaaatactatggtgacataattgcatgg
tcacaggtgcaagagcacattcatggtgacgttattatactgaacagcccattctgccgt
gggtgtcccatgcccgttgttccttttaaaggtaacataaatgtcagtgaagacgcacta
agtatcacttactactgcgagaatgggtatgtagtacggtttcatggtaaagagtaccgg
tctttgaaggtaaagtgcctgaagcatggtcagtgggagggatactacacaccagtttgc
gccagaagaagatgcggctttcctggatattttccacgaggccgtatgcacggtagatca
tatttattcggagatgagatatattattcttgtttaattggctatgaacttcgaggaaat
ccacgcagaatttgtaacgcaaatggaaaatggagtggattggctcctatttgcataggc
aaaacctgcagaaatctgttagctccggaacatggggacatcgagtatgtgatagaggaa
tatgaaagagacgatctttcaatcttacaggttggacagcaaatcgagtttaaatgcgat
ccaggatttcgtttgttcggagaaagaatgctaacgtgtgtggaatctggagtttgggat
catgaaagacctacatgtatcgcttatggatgtccaccgccaaaagaaattttgaacgga
tatatcatttctataaaatcaaacaatttacacgaatcttcagccaataatgtcacaatc
gacaaaaattatgattttaatgacgtcgttggatattcttgtcaatcaggacataagttc
caagatagtcacgtattattaagcgaattcaaacttcaatgtaccgagaatggtacttgg
acaggatttgtccctgactgcgtacctttgaggtgcccttggcccagaatcgtgaataat
ggaaagttgtcgcttattacacaagaaaataatacctttgaacttcctaatgagcagaca
ataattaatgacacgaatatcaaaatcgcgttgaatgtaaataacaatgattccaagcaa
tatcaaaatttagaggaccaatttattgttggtactcaaattcttattcaatgtaacata
ggatataaattaatcggcgatagtgttaaaatttgcgaaagtaatgaaaagtggttgtcc
acaccaacgtcttgcgagccccaagaatgtccaatcgtggaacatccattttttaaaatc
attaacagaacacagaatcaaaataagaaattgaatgacgtcgaatcgtacggtggtttc
tacaaaaatttacggtattttgtacaaggctatacctacatgaaaaatatagttcttatc
tgtaaggacaacaataaaatgaaattaagtaacgaagatttaactttttctaacttaact
tggatttgcaatgaacatggtcaatggcaaatagttgatacacctttaaatgacattaat
gaatctgtacttaacaatgaaatagataatatttgccaggaatctacgtgttcttcggtt
gcatttccagagcacggttacattgtagagaaaaattactcgaaaaatgttaacagtagt
ataatgttcaaatgtaatgaaggatacattcttgaagggaatgaaaaatctgtttgcttg
tcaaacaacacatggtccgatatccctttttgtaaacctataacatgtggaaaaccaccg
aaagttgcaaacgctgtattgaacaaaaattatatcaccactgtaaattttacgttcgat
gacacaattacgtatgaatgcatacctggctacataatgtatggaaaaccggatgcgaag
tgtctttcaaatgggaaatggtctcgagcatatagcagatgttcaaaactgtcatgtaac
aaaccaaaacttccacccggaataatcattcgtggtcgttcctacttgtatcaagatcag
ttgacgtacatatgccccaataagaagcaaggattgattacgtgcaaagcagatgggcat
tggagcgaaccaccgaaatgtaacgcataa
DBGET
integrated database retrieval system