Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke): 112507064
Help
Entry
112507064 CDS
T05604
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ccav
Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke)
Pathway
ccav03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccav00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
112507064
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ccav03019
]
112507064
Messenger RNA biogenesis [BR:
ccav03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
112507064
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Nup35_RRM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112507064
NCBI-ProteinID:
XP_024967238
LinkDB
All DBs
Position
LG 2:65606890..65612395
Genome browser
AA seq
483 aa
AA seq
DB search
MQSDLGKLFIGGISWDTNEERLKEYFSSYGEVLEAVIMKDHTTGRARGFGFVVFADPVVA
EQVTKEKHNIDGRMVEAKKAVPRDDQSTMSRNSSSFQGSPGPGRTRKIFVGGLASTVTEA
DFKRYFEQFGTITDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYDSEDAVDKVLLKTFHELNGKMVEVKR
AVPKELSPGPSRSPLGAYPYGLSRTSSFLNGYNQGAYSPNAVGVGGYGVRMDGRFSPIPS
ARSGFATFGSGYGMGLNFEPGMSGNYGGGTNYNSTLSYGRGMNPYYVGNSNRFGSPISFD
GGNGGNTSFFSSNPRNLWGNGGLNYGSNSTGSSGYVGSGSGVIGGGILGNTGLNWGSSPI
SPQGGGNGSTQSANLGYGGGDNSYGLRGAAYGRNATTNGVPTSSYAASSVGYDGPFSDFY
GGSGSVYGGDPTWRSTNNEREGSGSFGGYGLGGGGSDVQTKSSSGYVGGYSVAKRQENRG
ITG
NT seq
1452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatctgatcttggcaagttatttatcggtgggatatcatgggacacaaatgaagaa
cgtctgaaggagtattttagtagttatggtgaggtgttggaagctgtaattatgaaagat
cataccactggccgtgcccgtggttttggtttcgttgtctttgctgatcctgttgttgct
gagcaagtcaccaaagagaaacacaacattgatggtagaatggttgaggcaaaaaaggct
gttcctagggatgatcaaagcaccatgagtagaaacagtagtagctttcagggttctcct
ggtccaggacgaacaagaaagatttttgtaggaggtttagcgtccacagtcactgaggct
gatttcaagaggtactttgagcaatttggaactattacggatgttgtggttatgtatgat
cataatacacagaggcctagaggttttggattcattacttatgattcagaggatgcagta
gacaaagttttgttgaaaactttccatgagctcaacggtaaaatggttgaggtcaaacgt
gcagtcccaaaagagctttcacctggtccaagccgaagtccacttggtgcatatccttat
ggtttgagccgaaccagtagctttcttaatggctacaatcaaggagcctattctccaaat
gcagttggagttggtggttatggtgttaggatggatggtagattcagcccgattccttct
gctagaagtgggtttgctacatttggttctggatatggaatgggattgaactttgaacca
gggatgagtggtaattatggtggtggcaccaactataatagtactctgagctatggaagg
ggaatgaacccttattatgttgggaattcaaataggtttgggagtcctattagttttgat
ggtggaaatggagggaatacttctttctttagttcaaatcctcgaaatttatggggtaat
ggagggcttaactatggatcaaattccacaggttcgagtggttatgtaggatccggaagt
ggggtcattggtggcggaatcttggggaacactgggcttaactggggttcttctcctatt
tcacctcaaggtggcggaaatggttctacacagagtgcgaatcttggttatggaggtgga
gataacagttatggtttaagaggtgcagcttatggaagaaatgctactactaatggggtt
cctacatcatcatacgctgcatctagtgtaggttatgatgggcctttttcagatttctat
ggtggtagtggctcagtctatgggggagacccaacttggcggtcaacgaataacgagcga
gaggggtctggttcatttggagggtatgggctaggcggtggaggttctgatgtccagact
aaaagttcttctggttatgttggtggttatagtgttgctaagagacaggaaaacagagga
atcactgggtag
DBGET
integrated database retrieval system
