Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke): 112524077
Help
Entry
112524077 CDS
T05604
Name
(RefSeq) beta-arabinofuranosyltransferase RAY1 isoform X1
KO
K20892
beta-arabinofuranosyltransferase [EC:2.4.2.-]
Organism
ccav
Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccav00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
ccav01003
]
112524077
Glycosyltransferases [BR:
ccav01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
112524077
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleotid_trans
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112524077
NCBI-ProteinID:
XP_024989472
LinkDB
All DBs
Position
LG 13:892755..899017
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MVNYHLQAVKIGLLLVWLCGFVLITISFYATTHILPSSSSIKEHIKNLNGSEGPTVTIFA
AVRPFSGSIGSRQVLAIRSWLGLSLDIRVVLFGQDPSLFSFAGSFGPGSRVSVEPTIDFT
FLGTPFFHSMVARAQTSDSDISVLMDSETILLPDFFSTLSYVHRLDHDWLVIASPKNVSE
FPFQLDIDGKHWLGNNGKRIKTKKLQDFLSHGSWEHCDDKKTIMAWNNGDLPLHNGVLPP
FLYGKGFHNFWVVNEALSSDFRFVFDASWTVSSFFINDLDGGNNIESRNWENVGNSHLGA
LYGSLFFREAGYSNMVKLFKCGGHYHFGSTKENIVYPLGSPKGLSFNDLGVFRFTKYTKL
LSCFDKMKSLAGNVGCSRKNQLTSLEPLALPYSLELLLSKRADQNKTIVLAVAGYSYKDM
LMSWVCRLHLLHVTNFVVCALDDEIYDFCILQGLPVFRDRLAPTNISYNDCHFGTNCFQR
VTKVKSRVVLQILKLGYNLLMSDVDVYWFKNPLPLLSAFGPAVFVAQSDEYKITGPINLP
RRLNSGFYYAHSDGSTIAALDKVVKHASLSNLSEQPSFYDTLCGSNGSYRVGDDMCLEPE
TNLTVRFLDRNLFPNGAYQDLWDSSNVSLTCMEKGCFVLHNNWINGRQKKLKRQVSSGLW
EYDMSTRMCWQSWQRSKSISYF
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaattatcatttgcaggcagtaaaaattggattattgttggtttggctatgtggg
tttgtcttaattacaatctccttttatgctactactcacatattgccttcttcttcttcc
attaaagagcatatcaagaatcttaatggttcagagggtcctactgttacaatatttgca
gctgttaggccttttagtggttcaattgggagtagacaggtgttagctattagatcatgg
cttggtttatcacttgacataagggttgttctttttggccaagacccttctcttttctct
tttgcaggttcttttggacctggttctagggtttctgttgaacccaccattgatttcaca
tttttaggtactccattctttcattcaatggttgcaagagcacaaacatcagattccgat
atatctgttttgatggattctgaaaccattcttttgccggacttcttttcaacgttgagc
tatgttcatagactcgaccatgactggctcgtaattgcttcaccaaaaaatgtatcagaa
ttcccatttcaattggatatagacggaaaacattggctagggaacaacggtaaaagaatt
aaaacgaaaaagttgcaggactttctttctcatgggtcgtgggaacattgtgatgacaag
aagacgattatggcatggaataacggagatcttcctttgcataacggagttcttccccca
tttttgtatgggaaaggttttcacaacttttgggtcgttaatgaggctttgtcctctgat
tttagatttgtatttgatgccagttggaccgtctcaagtttctttattaatgatcttgat
ggtggcaacaatatagaatcaagaaattgggagaatgtgggaaattctcatttgggtgct
ttatatggatcgttattcttccgtgaagccggttactccaacatggtcaaacttttcaaa
tgtggcggtcactaccatttcggaagtactaaagagaacattgtttacccattaggatcg
cctaaaggattaagctttaatgatttaggggtatttagattcacgaaatatacaaaactt
ttgagttgttttgataaaatgaagtcactagcgggaaatgtaggctgttcaagaaagaac
caattgacgtcattagagccactagcccttccatattctttagagcttctcctatccaaa
cgtgctgaccagaataagacgattgtgctagcagttgcgggatatagttataaagatatg
ttaatgagttgggtatgtaggttacacctccttcacgtcacaaactttgtggtttgtgcc
cttgatgatgaaatatacgacttctgtatcttgcagggattgcctgtttttagagataga
ttagctccaaccaatatcagctataatgactgccactttggaacaaattgctttcaaagg
gtaactaaagtgaaatcgagagtggttttgcaaatactgaagctgggatataacttgcta
atgagcgatgtcgatgtttattggttcaagaatcctttgccactgctttcagctttcggt
cctgcagttttcgtggctcagtccgatgagtacaaaatcacagggccaataaatttgcca
cgacgcctaaactccggcttttactacgctcactccgatggttcaacaattgctgctttg
gataaggtagtaaagcatgcatctttatcaaatctttcggaacaaccaagtttttatgat
acgttgtgtgggtcgaacggatcctaccgtgtaggtgacgacatgtgtctagaacccgaa
acaaatcttactgtccgtttcttggatagaaacctctttccaaacggggcctaccaagac
ctatgggactcgagtaatgtttcgttaacgtgcatggaaaagggttgttttgtgcttcat
aataactggatcaacgggagacaaaagaagctcaaacgccaggtgtcatcgggcctttgg
gagtacgatatgagcacgaggatgtgttggcagagctggcaaagatccaaatccataagt
tatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
