Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke): 112524389
Help
Entry
112524389 CDS
T05604
Name
(RefSeq) extensin-1-like
Organism
ccav
Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112524389
NCBI-ProteinID:
XP_024989981
LinkDB
All DBs
Position
LG 1:complement(23008430..23012503)
Genome browser
AA seq
641 aa
AA seq
DB search
MTPSAVGHRRLWPILIAFTIFAVSNLIAVSAEKPYIYSSPPPPSPSPPPPPSPSPPPPYV
YKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPPPSPPPPYLYKSPPPPVHSPP
PPYYYKSPPPPVKSPPPPPYYYKSPPPPVHSPPPPYHYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPP
VHSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPPPYHYNSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYHY
NSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPAHSPPP
PYYYTSPPPPTKSPPHYYYTSPPPPTPYHSYPHPHHHKVIVKVVGKVYCYSCYDWKYPVK
SHAKHHLKGAVVEVTCKAAGEKEIVAYGKTKINGKFAITVEGLDYSKYGGAKACIAKLHM
PPNGTTCNIPTNLHGGLKGAKLKVKSKNAHLVVLYAKPFAYGPKTPYKICEKPKPTPTPS
PPPPYHYTSPPPPTKSPPPPYHYTSPPPPIKSPPPPYHYSSPPPPKKSPPPPYHYTSPPP
PTEYPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYRYTSPPPPTKSPPPPYHYTSPPPPTESPPPPYHYT
SPPPPKKSSPLPYHYTSPPPPVKSAPSPVYIYTSPPPPVHY
NT seq
1926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaccttctgccgtcggccatcgccgactatggcctatactcattgctttcacaata
ttcgctgtttctaatcttattgctgtttcggctgaaaaaccttacatctattcttcacca
ccaccgccttctccttctccaccaccaccgccttctccttcgcctccaccaccttatgtg
tacaagtctccacctccaccttcaccttctcctccaccaccttatgtgtacaagtctcca
cctcccccttcaccttctcctccaccaccttatgtgtacaaatctccacctccacctcca
ccatccccgccaccaccttatctgtataagtctcctcctccgccggtacattctccaccc
ccaccatactactacaaatctccaccaccacctgtcaagtcaccaccaccaccaccatac
tactacaagtcacctcctccaccagtacattcaccaccaccaccataccattacaaatct
cctcctccaccggtacattcaccaccaccaccttactactacaagtctcctcctcccccg
gtacattctccacctccgccatactactacaagtccccacctccacctgtcaaatcacca
ccaccaccaccaccataccattacaattctcctcctcctcctgtacattctccaccgcca
ccttactactacaagtccccaccgccaccggtcaagtcaccaccaccaccataccactat
aattctcctcctcccccggtgcattctccaccaccaccatactactacaagtccccacca
ccacccgtgaagtcaccgccaccaccatactactacaagtctcctcccccaccagtacat
tctccaccaccgccatactactacaagtctcctcccccaccggcacattctccaccacct
ccatactactacacttctccgccaccaccaaccaaatcacctccccactactactacact
tctcctccaccaccaactccctaccactcctaccctcaccctcaccaccacaaagtaatc
gtgaaggtggtcggtaaagtttactgctacagctgctatgactggaaatacccagttaaa
tcccacgccaagcaccacctcaaaggtgctgtcgtggaggtaacatgcaaggctgctggt
gaaaaggaaattgttgcatatggaaagacaaagatcaatggcaaatttgcaattactgtt
gagggtttggattattccaaatacggaggagccaaggcttgtattgctaagcttcatatg
ccaccaaatggtactacttgtaacatcccaacaaatctccatggaggtttgaagggtgct
aagcttaaggtcaagtccaagaatgctcacctagttgtcctttacgctaaaccatttgct
tacggtcccaagactccttacaagatttgtgagaagccaaagccaacaccgactccgtcg
cctcccccaccataccactacacctcacccccaccaccgacaaaatctcctcctccaccg
taccattacacatcccctccaccacctataaaatcgccccctccaccataccactactct
tcacccccaccacctaaaaagtcaccacctccaccataccactacacatcaccaccacca
cctacagagtatcctcctccaccataccattatacatcacccccaccacctgtgaaatca
cctcccccaccataccgctacacatcccctccaccacctaccaagtctcctcctccacca
taccactacacatcgcccccaccacctacagaatctcctcctccaccataccactacact
tcacccccaccacctaagaagtcgtctcctcttccttaccactacacatcacctccacca
ccagtaaaatcagctccatcacccgtatacatctacacttctcctccaccgccagttcat
tattag
DBGET
integrated database retrieval system
