Entry |
|
Symbol |
FBN2
|
Name |
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
|
KO |
|
Organism |
ccay Caretta caretta (Loggerhead turtle)
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:ccay00001]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
125637346 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ccay00536]
125637346 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ccay00536]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
125637346 (FBN2)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
5:complement(80309291..80571544)
|
AA seq |
2908 aa
MGRQRGLCPQLYCLWLGCVALWAQGAAGQQKQQQVRPVGGTDAIYPASENREDGAGAATS
RVRRRGQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTC
SSGQISPTCGSKSIQQCSIRCMNGGTCADDQCQCQKGYIGTYCGQPVCENGCQNGGRCIG
PNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCE
MCPAQPQPCRRGFIPNIRNGACQDVDECQAIPGVCSGGNCINTVGSYECKCPAGHRQNEA
TQKCEDIDECSIIPGICEGGECSNTVGSYFCICPRGYVTSTDGSRCIDQRTGTCFSSLVN
GRCAQELPNRFTKMQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEYRRLCTDGVPVGGGSRPVGP
GGNGFLPGGNGNSYGPGGTGFIPIPGGNGFSPGVGGAGVGTGGQSPTGNGAIITGLTILN
QTIDICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCTNGDCVNT
PGSYYCKCNAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGILCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDG
KNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDIDECQTPGICMNGH
CINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCVRPFPGAVTKSECCCAN
PDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICSNGICENLRGSYR
CNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFSSETDTCED
INECEISPCVNSACRNNLGSFNCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDSRCEVNIN
GATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDAACPRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGVCTNGRCV
NSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDACCCAVGSA
WGSDCEECPKSGTKEYEALCPRGPGFSNRGDVLTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGKCRNT
IGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMM
MKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPSREDCVDINECSLSDNLCR
NGKCVNMIGTYQCSCNPGYQATPDRQGCTDIDECVIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGY
ALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLN
SNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCVNVPGSFK
CSCREGWMGNGIKCIDLDECSNGTHKCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGFTCSDIDE
CAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDECIFQNICVFGTCNNLPGM
FHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCV
DNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGIPCETCPPVNSTEYNTL
CPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICED
IDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNRGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENE
LPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKTICGNIPGFTFDIHTGKAVDIDEC
KEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPG
SYRCECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGMCVDMQGGYQCICHNGFKASQDQTMC
MDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNGQCFN
EIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDTNECMALPGACFPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSE
SCIDIDECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPIGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGK
CSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDV
NECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCVDTDECLIGNPCGNGTCTNVI
GSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELREDQKMC
KDLDECVEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMIRRPDGEGCMDENECRTKPGICENG
RCVNIIGSYRCECNEGFQSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCC
DGGRGWGNQCELCPLPGITQYKKLCPHGPGYTTDGRGDVYISSPDIDECKVMPNLCRNGQ
CINTMGSFRCFCKVGYTTEISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQ
EDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGS
KGICQNTPGSFSCECQRGFSLDSTGLNCEDVNECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYI
QHYQWNQCVDENECTNPSACGTASCYNTLGSYKCTCPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKN
PCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLGGDVDEENALSPEACYE
CKINGYSNKNSRRKRSVNETEQAEIEQISLESLDIDSPLKMRLNFSGLGNKEHILELMPA
IQPLTNHVRYIISHGNDYGIFQIHQRDGFSYLHTAKKKSVPGTYTLEITSIPLYKKKELK
KLEDSNEDNYLLGELGEVLRMRLWIELY |
NT seq |
8727 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggggagacagcgggggctttgcccgcagctttattgcttgtggctgggctgtgtcgcg
ctgtgggcgcagggagcagccgggcagcaaaagcaacagcaggtccggcccgtgggggga
acagacgccatctacccagcctcggagaatcgggaggacggggcaggggccgccaccagc
cgggtccgcaggagaggacagcaggatgtgctcaggggaccaaacgtgtgtggctctaga
ttccactcctactgttgccctggatggaaaacgctccctggaggaaatcagtgtattgtt
ccaatttgtagaaatagttgtggtgatggattttgttcccgtcctaatatgtgcacttgc
tccagtggacaaatatcacctacctgtggatcaaaatctatacaacagtgcagtatcaga
tgtatgaatggtggtacttgtgcagatgaccaatgccagtgccagaaggggtacattgga
acttactgtggacaacctgtctgtgaaaatggttgccagaatggaggacgttgtattgga
cccaatcgctgtgcatgtgtgtatggatttactggccctcagtgcgaaagagattataga
acaggcccctgtttcactcaggtcaacaaccagatgtgtcagggccagctgactggcatt
gtttgcacgaagactctttgttgtgcaaccattggacgtgcctggggccatccttgtgag
atgtgtcctgcccagcctcagccctgtcgtcgtggcttcattcctaacatccgcaatgga
gcatgccaagatgttgatgagtgccaggctataccaggggtctgttcaggaggaaactgc
attaatacagttggctcgtatgaatgcaagtgtcctgctggtcacagacagaatgaggca
actcagaaatgtgaagatattgatgagtgcagcatcattccagggatctgcgaaggtggc
gaatgttctaacactgtgggaagttatttctgcatttgtccacgtggctatgtcacatct
acagatggatcccgctgcattgatcaaaggacaggcacatgtttctccagcttggtgaat
ggtcgctgtgcacaagaacttccgaataggtttaccaaaatgcagtgctgttgtgaatct
ggtcgatgctgggccattggatctgttcctgagatgtgtcctgtgagaggctctgatgaa
taccgcagactttgcacagatggagttcctgtaggaggtggttccagacctgttggacca
ggaggcaatggattccttcctggtggaaatgggaatagctatggcccaggaggaactgga
tttattcccattccaggtggcaatggcttctcccctggtgtaggaggagcaggtgttggg
actggtggccagagtcccactggaaatggtgcaatcattactgggctgacaatcctcaat
cagacaatagatatatgtaaacaccaccccaatctctgcttaaatggacgctgcatacca
acaatttccagttaccgatgtgagtgcaacatgggatataagcaagatgcaaatggggat
tgtatagatgttgatgagtgcacgtcaaacccatgcactaatggtgattgtgttaataca
cctggatcctattattgcaaatgcaatgcaggtttccagagaactcctaccaagcaagct
tgcattgatattgatgaatgcatacaaaatggcattctttgtaaaaatggccggtgtgtg
aacactgatggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaactaactacagatgga
aagaactgtgttgatcatgatgagtgtaccaccaccaacatgtgtttaaatgggatgtgc
ataaatgaggatggtagcttcaaatgtatctgcaaaccagggtttgtcctggctccaaat
gggcgttactgtactgacattgatgaatgccagacgccaggaatttgcatgaatggtcat
tgcatcaatacggaaggttcttttcggtgtgaatgtccaccaggcctggcggttggggtt
gatggccgtgtttgtgtagatactcacatgcgcagtacatgctatggaggaatcaaaaaa
ggagtgtgtgtccgccctttccctggggcagtgacaaaatctgaatgttgctgtgccaat
ccagactatggctttggagagccatgtcacccatgtcctgccaagaactcagccgaattc
catggcctgtgtagcagtggagtaggcattactgtggacggacgagatattaatgagtgt
gcattggatcctgatatttgctccaatggaatttgtgaaaacctacgtggtagctatcgt
tgtaattgtaacagtggctatgaacctgatccctctggaaggaactgtgttgacattgat
gaatgttcagtgaacagactgctgtgtgacaatggcctgtgtcgaaacacacctggaagc
tacagctgtacatgtccaaagggttatgtattcagcagtgagactgacacgtgtgaagat
ataaatgaatgcgaaatcagcccgtgtgtcaacagtgcctgcaggaacaatcttggctct
ttcaattgtgagtgttcacctggcagtaaactggattctactggattgatttgcattgat
agtctgaaaggaacgtgctggctgaacatccaagacagtcgttgtgaagtaaacattaat
ggtgctacactgaaatcagaatgttgtgctactttaggagctgcttggggcagcccttgc
gagcgatgtgaactagatgcagcttgcccaagaggatttgccagagttaagggagttacc
tgtgaagatgtaaatgagtgtgatgttttccctggtgtttgtaccaatggacgttgtgtt
aacagcagaggatcatttcactgtgaatgtccagaaggcctgacgctggatggaacaggt
cgagtgtgtttagatatccgcatggagcaatgctacctgaagtgggatgaagatgagtgc
attcagtctgtaccgggcaagtttcgtatggatgcctgctgctgtgctgttggttctgct
tggggctcagactgtgaggaatgtcctaagtctggcaccaaagaatatgaagctttatgc
cctaggggacctggcttttcgaacaggggagatgttctaactggcaggccattttataaa
gatattaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggcaaatgcaggaacaca
attggaagtttcaagtgtagatgtaacagcgggtttgctttagatatggaggaaagaaac
tgtacagacattgatgagtgtcgtatctccccggacctctgtggaagtggtacctgtgtc
aacactccaggcagctttgaatgtgaatgcttcgagggctatgagagtggatttatgatg
atgaagaattgcatggacatagatgaatgtgaacgtaaccctctcctttgcagaggtggc
acttgtgtgaacacagaaggcagctttcaatgtgactgtcctttgggacatgagctatca
ccatcacgtgaggattgtgtggatataaatgaatgctcattgagtgataatctctgcaga
aacggcaagtgtgtgaacatgattggaacatatcagtgttcctgtaaccccggataccag
gccactccagatagacaaggctgcactgatatcgacgaatgtgtgatcatgaatggaggc
tgtgacacccactgcactaactcagagggcagctatgaatgtagttgcagtgatggctat
gctctcatgccagatgtgagaacatgtgcagatattgatgaatgtgaaaacaacccagat
atctgcgatggtgggcagtgtactaatattccaggagaatatcgctgtctttgttatgat
ggcttcatggcttctatggacatgaaaacctgtattgatgtgaatgaatgtgacttgaat
tccaacatctgtatgtttggagagtgtgagaacaccaagggatccttcatttgccactgt
cagctaggatattcagtcaaaaagggaacaactggatgcacagatgtggatgagtgtgag
attggtgcccacaactgcgacatgcatgcctcgtgtgttaatgtcccaggaagcttcaaa
tgcagctgcagagaaggatggatggggaatggcattaaatgtattgatcttgatgaatgt
tctaatggaacccacaaatgtagtgtgaatgctcaatgtgtgaacactcctgggtcatac
cgttgtgcctgtgctgagggattcactggagatggattcacttgttctgatattgatgag
tgtgcagaaaatgttaatctgtgtgagaatggacagtgcctgaatgtccctggtgcatat
cgatgtgagtgtgaaatgggattcactccagcttcagacagcaaatcttgccaagatatt
gatgaatgcatcttccagaacatttgtgtttttggaacctgcaataacttaccaggcatg
tttcactgtatctgcgatgatggctatgaactggatagaactggaggaaactgtacagat
attgatgagtgcgctgatcccattaactgtgttaatggtctctgtgtgaatactcctggg
aggtatgagtgtaactgcccaccagatttccagctgaacccaactggagtaggttgtgtg
gataatcgtgttggcaattgttacctgaaatatggaccccgaggggatggcagcctatcc
tgcaacactgaaatcggcgttggagtcagtcgctcctcatgctgctgctctttggggaag
gcctggggaatcccctgtgagacttgtccccctgtaaacagcacggaatataatactctg
tgtccagggggtgaaggattcagaccaaatcccatcactattatcttagaagatatcgat
gaatgccaggagttgccaggtctctgtcaaggtggaaactgcatcaatacttttggcagc
ttccagtgtgaatgtcctcaaggctactacctcagtgaagaaacacggatctgtgaagat
attgatgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggccctgggacctgctacaacacccta
gggaactacacctgcatctgtcctccagaatacatgcaggtgaatcgaggacacaattgc
atggatatgagaaagagcttttgctatagaagctacaatggaacctcctgtgagaatgaa
ctgcccttcaatgtgaccaagaggatgtgctgctgcacatacaatgttggcaaagcctgg
aacaagccttgtgagccatgtccaaccccaggaacagcggaatttaagaccatatgtggg
aatattcctggcttcacctttgacatccatactggcaaagctgttgatattgatgaatgt
aaggagatcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcattaaccagattggcagtttccgc
tgtgaatgtcccacaggattcagctacaatgacctactcttggtctgtgaagatattgat
gagtgtagcaatggagacaatctctgtcagcgaaacgcagactgtatcaacagtcctggg
agttaccgctgtgaatgtgctgcaggtttcaaactttcacctaatggtgcctgtattgat
cgcaacgaatgtttggaaattcctaatgtttgcagtcatggcatgtgtgtggatatgcaa
ggaggttaccagtgcatctgtcataatggttttaaggcatcccaagaccaaaccatgtgc
atggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgtaaaaacacagtt
ggatcatataactgcctgtgttacccaggatttgagctcactcataataatgactgtatg
gatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaatggacaatgttttaat
gaaattggttcgttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttactccagatggcaag
aattgcattgatactaatgagtgtatggcacttcctggtgcatgctttcctggtacttgt
cagaacttggaagggtcattcagatgcatctgcccaccaggatatgaagtgaaaagtgaa
agctgtattgatattgatgagtgcaatgaagaccccaacatctgtctctttggctcctgc
actaatactccaggaggctttcaatgtatctgtcccataggctttgtgctgtctgacaat
ggacgaaggtgttttgatacccggcagagcttctgttttactaactttgaaaatgggaag
tgctctgtcccaaaggctttcaacaccaccaaggcaaaatgttgctgcagtaagatgcca
ggagagggatggggtgacccttgtgagctctgccccaaggaagaagaagttgctttccag
gatttgtgtccctacggccatggaaccatccctgggattgatgatacacgggaagatgtc
aatgaatgtcttgagagcccaggcatttgttcaaatggtcattgtatcaacactgatgga
tcattccgctgtgagtgcccaatgggatacaacttagattacactggagtgcactgtgta
gatactgatgaatgtttgattggcaatccatgtggaaatggcacatgcactaatgtgatt
ggtagttttgaatgtaactgtcatgaagggtttgagccaggcccaatgatgaattgtgaa
gacataaacgagtgtgctcagaaccctttgctgtgtgcttttcggtgtatcaacacttac
ggtttctatgaatgcacctgtccggttggctatgaactgagagaagaccaaaagatgtgc
aaagacctggatgaatgtgttgaaggtctccatgactgtgaatcaagaggcatgatgtgc
aaaaacttgattggcaccttcatgtgtatctgccctcctggaatgatccgtagacctgat
ggagaaggctgcatggatgaaaatgaatgccgtaccaagccaggtatctgtgaaaatggt
cgctgtgtgaacattattggaagctacaggtgtgaatgtaatgaaggattccagtcaagc
ccatcaggcactgagtgccttgataaccgccaaggattctgctttgctgaagttttacag
acaatgtgccagatggcttccagtagccgtaaccttgtcaccaagtcagagtgctgctgt
gatggagggcgaggctggggtaaccagtgtgagctttgtccactgccaggaatcacccaa
tacaagaaactgtgtccacatggaccaggatatacaacagatggaagaggtgacgtgtat
atttcctctccagatattgatgaatgtaaggtcatgccaaacctgtgtagaaatggccaa
tgcatcaacacaatgggttcctttagatgcttttgtaaagttggctacaccactgaaata
agtgggacatcctgtgtggatcttgatgaatgctcccagtctccaaagccatgcaacttt
atctgcaagaactcagaaggaagctaccagtgctcatgtccccgtggctacatcctgcaa
gaggatggaaagacatgtaaagatcttgatgaatgtcagaccaaacaacataactgccag
ttcctctgtgtcaacactcttgggggcttcacttgtaaatgtccaccgggcttcactcaa
catcacactgcttgtattgataacaatgagtgtggttcacagccatcactttgtggatca
aaaggaatctgtcaaaacactcctggaagttttagctgtgagtgtcagagaggcttctct
ctggattctactggattaaactgtgaagatgtgaatgaatgtgatggaaaccacaggtgc
caacatggctgccagaacatcctgggtggctacagatgtgggtgcccacaaggatacatt
caacattatcagtggaatcagtgcgtggatgaaaatgaatgtaccaaccctagtgcttgc
ggcactgcttcctgctacaacacactcggaagttacaagtgcacttgtccatctggattt
tcttatgaccagttctctagtgcatgccatgatgtgaatgagtgttcctccactaaaaac
ccctgcaattacggctgttccaacacagaaggtggttatctctgtggctgccctcctgga
tactacagagttggacaaggccattgtgtctcaggaatgggatttaacaaaggccagtac
ctccctctgggtggagatgtagatgaagaaaatgctttgtcccctgaagcatgttatgaa
tgcaaaatcaatggttactccaacaaaaacagcaggaggaaaagaagtgtgaatgaaact
gagcaagcggagattgagcagattagcttggaaagcttagacattgactctcctttgaag
atgaggttgaacttctctgggcttggtaacaaagaacacattctagaactcatgccagct
atacagccccttaccaaccatgtccgctacatcatctcccatggcaacgattatggcatc
tttcaaatccatcagagggatggatttagttacctgcacacagctaagaaaaagtcagtg
cctggcacttacacactggaaatcactagcattcctctatacaagaagaaggaactaaag
aaactggaagatagcaacgaggacaactacctcctaggagagcttggagaagtgctcaga
atgagactgtggattgaactctattag |