Clostridium cellulovorans: Clocel_0865
Help
Entry
Clocel_0865 CDS
T01294
Name
(GenBank) ABC transporter transmembrane region
Organism
ccb
Clostridium cellulovorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_22
DEAD
DUF87
AAA_18
AAA_29
nSTAND3
AAA_16
Sigma54_activat
AAA_24
ABC_ATPase
PRK
AAA_25
AAA_33
RNA_helicase
AAA_5
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL50635
UniProt:
D9SSN8
LinkDB
All DBs
Position
1058209..1059921
Genome browser
AA seq
570 aa
AA seq
DB search
MKASLIFIFKYIDKKRWFFLGYFAIFLECLTPIIATLLQRDLIDKVFSEKQYQEFPKILA
LYAIFFFGPKLWFTVRKVAFFHIGYQLQMSLTKEFLFKIYDMPTAIFNKEHVGGLLNNIR
NNIADTSDLSVNQILSESVKNILTVLFLAFSIANINFVMMIIVVTVAIIYYGLLHKFGGK
TKEFAQQVREEKSNISIVVEESISSIREVIAFNRQDWQFKHYDKKFSDYFKAVIKQGLFK
NKILFISDPFLYGTKLVAILFGGMGVISNSISLGEFVVGFTFVDQLVTELGQLFEQGLTG
KRLEASVQCIESVMGAESVNFGSVDFNEEVESIQFKDVTFSYSPDSALVLNKLSMDFPIG
KKIAIVGKSGSGKSTVAQLLIRAYSPDKGEVSINCVPINCYGKQYTDKISMVFQQPYFIP
STIKENLVFDKEYDKLHIENACKEMLCHDFIARFPKGYETQVGERGISLSGGQKQRLALT
RAILKNTDVLILDEATSALDTETEFCVQKNIDKLRKGKTTIIIAHRISTIQNADIIYVLD
KGTVVAQGTHEVLMSESHVYKELYALQQVG
NT seq
1713 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaggctagtttaatattcatatttaaatatatagacaagaaacgttggtttttcttg
ggatatttcgctatctttttagaatgtctcacaccgattattgcgacactattacaacgt
gacttaattgataaagtctttagtgaaaaacagtatcaagagtttcctaaaatattggcg
ctgtatgcaattttcttctttggacctaagttgtggtttactgttagaaaggtggctttt
tttcatattggctaccaacttcaaatgtctttaacaaaggaatttttatttaaaatttat
gatatgcctaccgcaatttttaataaagaacatgtaggtggtttattaaacaatatcaga
aacaatatagctgataccagtgatttatctgttaatcaaatactttcagaatcagtaaaa
aatattcttactgttctatttttagcattttcaatagcaaatattaattttgtaatgatg
attattgtagtaacagtggcgattatctattatggtttacttcataaatttggagggaag
acaaaagaatttgcacagcaggttagagaggaaaaatctaatatttctattgttgttgaa
gaaagtatttcatcaattagagaagtcatagcatttaatcgtcaggattggcaatttaag
cattatgataaaaagttttcagattattttaaggctgttataaagcaaggcttgtttaaa
aacaaaatattatttataagcgatcctttcctatacggaactaaacttgtcgcaattttg
tttggtggtatgggagtaatttcaaatagtatttccttaggtgaatttgttgtaggtttt
acttttgttgatcaattagtaacagaacttggacaattattcgaacaaggtttaacaggt
aaaaggctagaggcttctgttcaatgtattgaatctgtaatgggagcagagagtgttaac
tttggttccgttgattttaatgaagaagtcgagtcaatacaattcaaggatgtaaccttt
agctattcacctgactcggctctagtgcttaataagctatctatggattttcctatcggc
aagaaaattgccattgttggtaaaagtggtagtggaaagtcgaccgtagcacaattacta
attagagcatattcacctgataaaggagaagtttctattaattgcgttccaatcaattgc
tatggaaagcaatatacagataaaatttcaatggtttttcaacagccttattttatacct
tcgacaattaaagaaaatctggtttttgataaagaatatgataagttacatattgaaaat
gcgtgtaaagaaatgttgtgtcatgatttcattgcaagattcccaaagggatatgaaact
caagttggtgagcgtggaattagtttatcaggtggacagaaacaacgacttgcgttaacc
agagctattttaaaaaatacagatgtacttattttagatgaagcaacctccgcattagat
actgaaactgaattttgtgttcaaaagaatattgataaattaagaaaaggtaagacgacg
attatcatagctcatagaatatcaactattcaaaatgcagacataatatacgttttagac
aaaggtacagttgttgctcaaggtacccatgaagtgttaatgtcagaaagtcatgtatat
aaggaattatatgctctacagcaagtaggataa
DBGET
integrated database retrieval system
