Clostridium cellulovorans: Clocel_3380
Help
Entry
Clocel_3380 CDS
T01294
Name
(GenBank) LPXTG-motif cell wall anchor domain protein
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
ccb
Clostridium cellulovorans
Pathway
ccb00040
Pentose and glucuronate interconversions
ccb01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccb00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
Clocel_3380
Enzymes [BR:
ccb01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
Clocel_3380
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pel9A-like_beta_helix
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL53059
UniProt:
D9SV85
LinkDB
All DBs
Position
4138092..4141106
Genome browser
AA seq
1004 aa
AA seq
DB search
MKFKNFKKKFLSLSLTLTLASTFLPNFAPVTYAENGNVSNISNYVASDWNQVTFGQTTDT
GYNNISVDDANKSVTLTAGTADGKRTGGKITGSHDGISYYYTTVDPSKNFVLSANVKVNF
FAKPKFDKQEGFGIMARDAIGPDKNADAFPSNMVLVGGYSGLIQSVFRNNIVDATGAGAT
MEDVTKFGDRPVNDGTATYKLTMKKTNTGYQVSVDDGKEKIYYRPKQLEIRDKDHVYVGF
FVARVASITVSDINFTTSDVATDPPGEPEPPKPVAPSIIMTSATTTGDSSYNFNLLSNVN
GDIKIKQNGTELYKGALDNNAITKNTTLVSGDNTFDVVFTPDKTQNITSADPITSKYVVS
LKSYGTSNESIYASPTGTADGKGTLDSPTDIYSAIQYVGTGQKIYLIGGTYDLKAPINIS
KSNSGTYDTPKVLTAYNQEKPVLNFSSSGGFVAGGDYWNISNIDVTNTVATGFKVSGNHN
VIYKLNAYKNGDTGIQISGNANDKIDKWPSYNLLLDCTSHDNIDASQNNADGFAAKLTCG
VGNVLRGCIAYSNCDDGYDLYSKLETGPIGAVTIENSIAYGNGVLSDGTRTLGDGNGFKM
GGEGLPVKHVLRNSLAFNNFSDGITSNSDPAVTFENCTSFNNGKVNFNLQYFNSAIPQFT
ANNNLSFKTTAALADNIPDTNLNDSNYFYNGTDSQNKSGEKLLASDFKSLEAPKLIERNA
DGSIIQGNFMMLADNSSILGGADLSDFSNITAVPGTPGIPDSAAPRAPFVYNQANGICDI
PVHNAKLAPSIVKFNNGNFIVTIINSIFADAKTGVKLQKAAPTVSEATLKSSIPNTLKLI
LDIFDLNLYINGSEVHALAEPITYTIKVDAKALNNVDTKNLALYSFNKDTNKWEFVSDAV
YDNKLSEITVKTPHLSTFAIMEKVSQNTVVTNTDPTGNNNDNTNTNTNTNTNTNNDNTST
TNTAQLLPQTGSSIDTNVLIGLGMIISALGVITLISLKNRKENA
NT seq
3015 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttaaaaattttaagaaaaaattcttatcattatcgttaacgttaacgttagct
tcgacatttttacctaattttgctcctgtaacttatgcggagaatggaaacgtttcgaat
atttccaattatgtagcttcagattggaaccaagtaacatttggacaaacaacagacaca
ggatataacaatatctcagtagatgatgctaataagtccgttactcttactgctggtact
gctgatggtaaacgtactggtggaaaaataactggttcccatgatggaatttcttactac
tacactacagttgatccttcaaagaattttgtactatcagctaatgtaaaggttaatttc
tttgctaaaccaaaattcgataagcaagaaggctttggtattatggcaagagatgctata
ggaccagataaaaatgctgatgcttttccatcaaacatggttttagttggcggatacagt
ggacttattcaatctgtatttagaaacaacattgtggatgctactggcgctggcgctact
atggaggatgtaactaaatttggtgatcgtccagtaaatgatggtactgctacatataaa
ttaacaatgaaaaagacaaatacaggctatcaagtaagcgttgatgatggcaaagaaaaa
atatactatagaccaaaacagcttgaaatacgagataaggatcatgtttatgttggattc
tttgttgctcgtgttgcttcaataacagtttcagatataaacttcaccacatcagatgta
gcaactgatccacctggtgaaccagaaccaccaaaacctgtagcaccttcaataattatg
acttcagctactactacaggcgattcaagctacaactttaatcttttatcaaatgttaat
ggcgacattaaaattaaacaaaatggcactgaattatataaaggtgctcttgataataat
gctattactaaaaacacaactttagtttcaggcgataatacttttgatgtagtatttact
cctgataaaacacaaaacatcacaagcgctgaccctataacctctaagtatgttgtatcc
cttaaatcttacgggacatcaaatgaatctatatatgcttcaccaacaggtacagcagat
ggaaaagggactttagattctcctacagatatttattcagcaatccaatatgtaggtact
ggccaaaaaatatatttaattggtggaacctatgatttaaaagctcctataaacatcagc
aagagtaacagtggaacttatgatactccaaaagttttaactgcttataatcaagaaaaa
cctgtacttaactttagtagttctggtggctttgttgctggcggtgattattggaatata
agcaatatcgatgttacaaacactgtggcaacaggctttaaggtttcaggaaatcacaat
gttatatataaattgaatgcatataaaaacggtgatactggtattcaaataagcggaaat
gctaatgataaaatagataaatggccttcttataatcttttgttagattgtacatctcac
gataacatagacgcatcacaaaataatgctgacggctttgcagcaaaacttacttgtggc
gtaggtaatgttcttagaggctgtattgcctatagcaattgcgacgatggttacgattta
tattcaaaacttgaaacaggtccaatcggtgcagtaaccatagaaaactctatcgcttat
ggaaatggagttctttcagatggtactagaaccttaggagatggaaatggcttcaaaatg
ggtggtgaaggtcttccagttaaacacgttttaagaaacagtcttgctttcaataacttc
agcgatggtattacaagtaactctgaccctgctgtaacctttgaaaattgtacatccttt
aacaatggaaaagttaattttaatttacaatacttcaatagtgctattcctcagtttact
gctaataataatctttcatttaaaactactgctgctttagcagataacataccagataca
aatttaaatgacagtaattatttttataacggtacagattctcaaaataagagtggcgaa
aaacttttagcatcagactttaagagtcttgaagcacctaaattaattgaaagaaatgct
gatggaagcataattcaaggaaactttatgatgcttgcagataactctagtattctaggg
ggagctgatttatcagatttctcaaatataacggcagtaccaggaactcctggaatacca
gacagtgctgctccacgagcgccatttgtatataatcaagctaacggaatctgcgatatt
cctgtccataatgctaaattagctccaagtatagttaaatttaataatggtaactttata
gttactattattaattctatatttgctgatgcaaaaactggtgttaaacttcaaaaagct
gctcctactgtttcagaagctacactaaagagtagcataccaaatacattaaaattaata
ttagacatttttgatttaaacttatatatcaatggatctgaagttcatgctttagcagag
cctataacatatacaataaaggtagatgcaaaagctttaaacaatgttgatacaaagaac
cttgcactttattcttttaataaagacacaaacaaatgggaatttgtatctgatgctgta
tatgataacaaattatcagaaatcacagtaaaaacacctcatttaagcacctttgctata
atggaaaaagtatcacaaaataccgttgttacaaatacagatcctactggtaataacaac
gataatactaatactaatactaatactaatactaatactaataacgataatactagcact
actaatactgctcaacttcttcctcaaacaggctctagcattgatacaaatgtacttatt
ggcttaggtatgattatatctgctttaggtgttataactttaatatctttaaaaaataga
aaagagaatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
