Clostridium cellulovorans: Clocel_4235
Help
Entry
Clocel_4235 CDS
T01294
Name
(GenBank) MATE efflux family protein
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
ccb
Clostridium cellulovorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ccb02000
]
Clocel_4235
Transporters [BR:
ccb02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
Clocel_4235
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
MurJ
Mpv17_PMP22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL53896
UniProt:
D9SNA4
LinkDB
All DBs
Position
complement(5102953..5104302)
Genome browser
AA seq
449 aa
AA seq
DB search
MTDLTKGNTLKLIITFAIPILIGNLFQQLYNLIDTVIVGQTLGVKALAAVGATSPIIGLL
LSFAIGMTNGYSVVIARFFGANDIKEMKKAVAGTVVLGLATSILFTVVSLIGIRPVLRIL
ATPDDVIDGAYSFARIIIMGLTFSMLYNMFSSVLRALGDTKSPLYFLIISTVVNIILDYL
FICGFGMGVEGAAFATVLSILLSAVLCFIYILKNYPILRLKKEDFNLNRSIIMDLFSTGI
SMGLMLSVVAIGTVILQNAINGFGTETIAAHTAARKITEMFMLPLSTVSVTAATFSSQNY
GANKPDRIKKGFIQLILISWVWSTVVVIMSFTIVPLIVSGITGTAETEIIDTATRYLRID
TPFYYVLGILLVLRSAMQGIGQKVVPIMASVIELVGKVIAAYYLAPKLGYLGICITEPII
WIACALFLVIKGFGIMQKGMAFSPQSQAE
NT seq
1350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacggacttaacaaagggtaatacactcaaactaattattacatttgcaattcctata
ttgatagggaacttatttcaacaattatataatcttattgatactgtaattgtaggacaa
accttaggagtgaaggctttagcggcagtaggtgcgacaagccctattattggactttta
ttaagctttgctattggaatgactaatggttattctgttgttatagcccgcttttttggt
gctaatgatataaaagaaatgaaaaaagctgtagcaggaaccgttgtattagggttagct
acatccattctttttactgtggtaagtcttattggaataagacctgtcttaagaatatta
gctacaccagacgatgttatagatggtgcatattcatttgcaagaattatcataatggga
ttaacattttctatgctttacaatatgttttcaagtgtactgagagctttaggcgataca
aagagccctttgtatttcttaataatttcaactgttgttaacataatactagattatctt
tttatctgtggatttggaatgggtgttgaaggagcagcttttgccactgtattatcaata
cttttatcagctgttttatgttttatttatattttaaaaaattatcctatattaagattg
aaaaaagaggactttaacttaaatcgttctattattatggatttatttagtacaggcatt
tccatgggcttaatgttatctgtagtggctattggtactgttatacttcaaaatgcaatt
aatggttttggaacagaaacaattgcagcacatacagcggcacgtaaaattacagagatg
tttatgttaccacttagtactgtaagcgttacagcagctactttctcaagtcaaaactat
ggagcaaataaaccagatagaataaaaaagggatttattcaattaatattaatttcctgg
gtatggtcaactgttgtggtgataatgtcttttactattgtaccgttaattgtttcagga
attacaggaactgcagaaactgaaattattgatacagcaactagatatcttcgtatagat
acacctttctactatgttttaggaattctattagttctaagaagtgctatgcaaggaatt
ggacaaaaggtggttccaattatggcaagtgtaatagagttagtaggaaaagtaatagca
gcttattatttagctcctaaattaggataccttggtatatgtataacagaaccaattatt
tggatagcatgtgcgctattcttagtaataaaaggttttggaattatgcaaaaggggatg
gcttttagccctcaaagccaagctgagtag
DBGET
integrated database retrieval system
