Chlorobium chlorochromatii: Cag_0406
Help
Entry
Cag_0406 CDS
T00290
Name
(GenBank) Alkaline phosphatase
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
cch
Chlorobium chlorochromatii
Pathway
cch02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cch00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Cag_0406
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alk_phosphatase
He_PIG
HemolysinCabind
SWM_repeat
Metalloenzyme
FliW
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB27679
UniProt:
Q3ATJ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(472535..479083)
Genome browser
AA seq
2182 aa
AA seq
DB search
MATLRFDGSQSPLLNASVDGLATRLTLYFSAPLDSSKLPSLSQFAVTNDGNAVTASSMQV
VDNQLHLYFATPLNSTKSIAISYTDATAGNDVLALQDVAGNDAQSFEHVAVTTALSLTAN
ESESLAFASSLLLAGAEISAYDTASQRLFVTSSSGLQVVSVGNNLAMSLLGTITTLGTND
ITSVAVKNGIVAASVVATDKTQAGTVYFLDADGDVASPSMVLGSVAVGALPDMLTFTADG
KKLLVANEGEQDTLGNNPEGSVSIIDLTNGVASATVTTASFTSFNSQVDALKAEGVRLFA
GETGFETITVAQDLEPEYISISPDGATAFVTLQENNALGVLDIASATFTDIVPLGLKSFY
GIPFDGSDKDGVSGAVAINLQTDQPVYGIRMPDAISSFRGADGKTYYVIANEGDDRDDFI
APDETARLSTLNLDDTLFPNEATLKTNSEIGRLTVSNAPGNNGDIDGDGDIDQILAYGAR
SFTILDEAGRVVFDSGSHLEEFTAVAGLFTDANGAGLFDDTRSDNKAAEAEGITIGHVGD
KVLAFVGLERGGGGVMVYDVTNPQEVSFVEYLRNVGDVSPEGLTFVPNDISPTNQGLLFV
TNEVSNTVSLFTISNKNDAPTVAEPLSDITVAEDSALYQRIAANSFADLDAGDSLTWTAT
RADGSALPEWLKFNASHHDLESMEDYFLSVASGSGSYSTPATDSASAGTAIATGEKTVDG
NIAWERTDSAGGALTTIAETLRAEKGFAIGVASTVPFSHATPATFVSHDVSRNNYWDIAH
EILFEVQPEVVIGGGMENSNFAKAVTSAGNVDRDIDNNGYNDDYDAFLNDTDGTEYVFVK
RTSGTDGGTSLMNAAATVSLADGDKLFGLFGTSGGNFEYYELSDTPGSVTITRSTTDATP
TVDEDPTFAEVTNVTLSVLNQDSDGFFVMLEQGDIDWTNHANDYENMVGGVYDLETAVTE
AENFIEEGVNGINWSNTLVIVTSDHSNSYLRAQEELGLGDLPTQNGSSYPDGDVTYGTGS
HTNELVSVSARGAGASYFGELAGQIYAGTEIIDNTQIYDAMMHAATEAGAEHIVLFIGDG
MNIEHEIAGSRYLYGTDFGLTWHDWSTLENGWNGYATTWDVTAYNKYATAASATAYNETS
VDPLIGYNPALGGNTPYPVAMTFSGTPTNENVGAIDIKVTATDESGASVSDTFKLTVTNT
NDAPTVAEPLSDITVAEDSALYQRIAANSFADLDAGDSLTWTATRADGSGLPEWLTFNAS
HHDLETMEDYFLSVASGSGSYSTPATDSASAGTAIATGFKTVDGNIAWERTDSAGGALTT
IAETLREDLGYAIGVASTVPFSHATPATFVSHNVSRNNYWDIAHEILFEVQPEVVIGGGM
ENSNFAKAVKSAGNIDRDLDDNGYNDDYDAFVNDTDGTEYVFVKREAGTDGGTALSAAAA
TVSLADGEKLFGLYGTSGGNFEYYEVADTPGTVTTITRSTTDATPTVDEDPTFAEVTNVT
LSVLNQDSDGFFVMLEQGDIDWTNHANDYENMVGGVYDLETAVTEAEYFIASGANGINWS
NTLVIVTSDHSNSYLRAQEELGLGELPTQNGSNYPDGDVTYGTGGHTNELVSVSARGAGA
SYFGELAGQIYAGTEIIDNTQIYDAMMHAATTAGAEHIVLFIGDGMNIEHEIAGSRYLYG
TDFGLTWHDWSTLEDGWNGYATTWDVTAYNKYATAAGATAYSETSVDPLIGYNPTLGGDT
PYPVAMTFSGTPTNENVGAIDIKVTATDESGASVSDTFKLTVTNTNDAPTGSILITGIAG
EGNTLQAEAMLADDDGLGTLHYQWKRDNQAITNATGSNYTLTAADKNQEITVIVSYTDAR
GNAEQVTSAYGVRYNTLTSNSNSTPITLVQGSGSGSDPLLSVVMPTGFEMVTQQVTGNNL
QSQLEAAAPTFAQQTDIQTAIEEYLANVGSQAVTVRTIAFPTSMANATVNDAAPIIINGS
DTAGTQEALVINTQNLPSGTLIQLNDVEFATVIGAARITGGEGNNTVFADGSAQYIVLGT
GDDTLHGGAGNDTIGSLDGNDYLYGEAGNDTLSGGDDNDHLSGGTGNDLLDGGAGSDIAM
FSGALNDYTITHNAITDTYTVADKVSGRDGVDTLTNMEYCQFADTLYDLEAANPYHHDTD
FGHDTTAIGIAGLGLVGLLLFL
NT seq
6549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaactcttcgctttgatggcagccagtcgccgttgcttaatgccagcgttgatggc
ttagcaactcgccttactttgtatttttctgcacctctcgacagttccaagctcccctct
ctctctcaatttgccgtaacaaatgatggcaacgctgttaccgcgagcagtatgcaggtg
gttgataatcagctccatttatattttgcaacgcctcttaatagcacaaaatcaattgct
atttcttataccgatgcaacagcaggtaacgatgtgttggcattgcaagatgttgcagga
aatgatgctcaatcgtttgaacatgttgctgttactaccgccttgagcttaacggcgaat
gagagcgaatcgcttgcgtttgcatcgtcattgttgcttgctggtgctgaaatttcagct
tatgataccgcaagccagcgcttgtttgttacctcgtcatcaggcttgcaggttgttagc
gttggcaacaatctcgccatgagtttgcttggaactattactactcttggcacaaatgat
attacaagtgttgcggtaaaaaatggcatagtggcggcttcggtagtggcgactgataaa
acacaggctggtacggtttattttcttgatgccgatggcgatgttgcttcgccaagcatg
gtacttggcagtgttgcggttggtgcgttgcccgacatgcttacctttacggctgatggc
aaaaagctgttggtggctaacgaaggtgaacaagatacgcttggcaacaatcccgaaggt
tcagtaagcatcattgatcttacgaatggtgttgcgtctgctacggttaccacagcctca
tttacttcctttaatagtcaagttgatgctttaaaagctgagggtgttcgcctttttgca
ggtgaaaccggatttgaaaccatcaccgttgcacaagaccttgaacctgagtacatcagc
atttcccccgatggcgctacagcatttgtaaccttgcaagaaaataacgctcttggcgtg
cttgatattgcttcagcaacattcaccgatattgtaccacttggcttaaaaagcttttat
ggcataccatttgatggcagcgataaagatggagtaagtggagcggttgccattaatttg
caaaccgatcaacccgtttatggcattcgtatgcctgacgcaattagcagcttccgtggg
gctgatggcaaaacctactatgtgattgcaaacgagggtgatgatcgcgatgactttatt
gcacccgatgaaactgctcgcctttcaacgctgaatcttgacgatacccttttcccgaat
gaagcaacgttaaaaaccaatagtgaaattggacgtttaacggtttctaacgccccaggt
aacaatggcgacattgatggggatggagatattgatcaaattttagcatacggtgctcgc
tcctttactattctggatgaagctggacgtgttgtttttgatagtggctcgcatcttgaa
gagtttaccgccgtcgcaggactttttactgatgcaaatggtgcagggctgtttgacgat
acccgttccgataacaaagcagccgaggctgaaggtattaccattgggcatgttggcgat
aaagtgcttgcatttgtaggacttgagcgtggtggcggcggcgttatggtttatgatgtt
accaatccgcaagaggtgagctttgttgagtacctccgcaacgttggtgatgtttcacca
gaaggcttaacctttgtgccaaatgatatttcgccaacaaatcaaggcttactctttgtt
acgaatgaagtttccaatacggtgtcgctctttactatctcgaataaaaacgacgcacca
acggtagcagagccattaagcgatattactgtagccgaagattctgcgctctaccaacgc
attgctgcaaatagctttgcggatcttgatgcgggcgatagccttacatggacggcaacg
cgtgccgatggttcagccctgcctgaatggttgaagttcaatgcgtcgcaccacgatctt
gaaagcatggaggattacttcctgagcgttgcaagtggtagtggtagctatagcacccca
gcgaccgattcagcttcagcaggcaccgcaattgctactggcgaaaaaacagttgatggt
aacattgcatgggagcgtaccgacagtgcaggtggtgcattaacaaccattgccgaaacg
ttgcgtgcagaaaaaggttttgccattggtgtagccagcacggtgcccttctcacatgct
acgccggcaacctttgtaagccatgatgtaagccgcaacaactattgggatatagcgcat
gagattctgttcgaggtgcaacccgaagtggtaattggtggcggcatggagaacagcaac
tttgccaaagcggtgacgtcggcgggtaatgtagatagagacattgataacaacggctac
aacgacgactacgatgcctttttgaacgataccgatggtaccgagtatgtttttgtaaag
cgtacaagcggcaccgatggtggtacttcgctcatgaatgcagccgctaccgtaagctta
gctgatggcgataaactctttggattgtttggcacctcaggcggtaactttgaatactac
gaactaagcgatacacccggtagtgtaacaatcacacgcagcaccactgatgcaacgcca
actgttgatgaagatccaacctttgcagaggtaacaaacgtaacgctctcggtgctaaat
caagatagtgatggattctttgtaatgcttgagcaaggcgacattgattggacaaaccat
gccaacgactacgaaaacatggttggcggcgtctatgaccttgaaactgctgttaccgaa
gccgaaaactttattgaagaaggtgtaaacggcattaattggtcaaataccttggttatt
gtaaccagcgaccactccaacagttacctccgtgcgcaggaagaacttggtttaggtgac
cttccgactcaaaatggcagcagctatcccgatggcgatgttacttacggcaccggtagt
cataccaacgaattagtaagcgtttcggcacgcggtgctggtgcctcgtactttggtgag
cttgctggtcaaatctacgctggaacagagattattgataatacgcagatttatgatgca
atgatgcacgccgctaccgaagcaggtgccgagcacattgtgttgtttattggcgatggc
atgaacattgagcacgaaattgctggcagccgttacctctatggcaccgattttggctta
acgtggcacgattggagtacgctggaaaatggctggaatggttatgcaaccacatgggat
gttaccgcttacaacaaatatgctacagccgcaagtgcaactgcctacaatgaaacaagt
gttgatcctctgattggctataatcctgcactgggtggtaacactccatatcctgtagca
atgacctttagtggcactccaacgaatgaaaatgttggggcaattgatattaaagtaacg
gcaactgacgagagcggtgcctccgtgagcgataccttcaagcttacggttaccaatacc
aacgacgcaccaacggtagcagaaccattaagcgatattactgtagccgaagattctgcg
ctctaccaacgcattgccgctaatagctttgcggatcttgatgcgggcgatagccttaca
tggacggcaacgcgtgccgatggttcaggcttaccagagtggttaacgttcaatgcgtca
catcacgatcttgaaaccatggaagattacttcctgagcgttgcaagtggtagtggtagc
tatagcaccccagcgaccgattcagcatcagcgggtacagctattgcaacgggctttaag
actgtggatggtaacattgcttgggagcgtaccgacagtgcaggtggtgcattaacaacc
atagcagaaacgcttcgcgaagatttagggtatgccattggtgtagccagcacggtgcct
ttctcgcacgctacgcctgcaacatttgtaagccataatgtgagccgcaacaactattgg
gatattgcgcatgaaattctgttcgaggtgcaacccgaagtggtaattggtggcggcatg
gagaacagtaactttgctaaagcggtgaagtcggcgggtaacatagatagagaccttgat
gacaacggctacaacgacgattacgatgcctttgtgaacgataccgatggcactgagtat
gtttttgtaaagcgtgaagctggtaccgatggtggcacggcgttgtcagcagcagccgct
accgtaagcttagctgatggcgaaaaactcttcggactatacggtacctcaggcggcaac
tttgaatactacgaagtagccgatacgccaggcaccgtaacaactatcacacgcagcacc
acagatgcaacgccaacggttgatgaagatccaacgtttgccgaggtaacgaacgtaacc
ctttcagtactgaatcaagatagtgatggattctttgtaatgcttgagcaaggtgatatt
gattggacaaaccatgccaacgattatgaaaacatggttggcggcgtctatgaccttgaa
accgccgttaccgaagccgaatactttattgcatcgggggctaatggcattaattggtca
aataccttggttattgtaaccagcgaccactccaacagttacctccgtgcgcaggaagag
cttggtttaggcgaactccccacccaaaatggcagcaactatcccgatggcgatgttact
tacggcaccggtgggcataccaacgaattagtaagcgtttcagcacgcggtgctggtgcc
tcgtactttggtgagcttgccggtcaaatctatgcaggaaccgagattattgataacacg
cagatttatgatgcaatgatgcacgccgctaccacagcaggtgccgagcacattgtgttg
tttattggcgatggtatgaacattgagcacgaaattgccggtagccgttacctttatggc
accgattttggcttaacgtggcacgattggagtacgctggaagatggctggaatggttat
gctaccacatgggatgttaccgcttacaataaatatgctacagccgcaggtgcaacagcg
tacagtgaaacaagtgttgatccgctcattggctacaatcctacactgggtggcgatact
ccatatcctgtagcaatgacctttagtggcacaccaaccaatgaaaatgttggggcaatt
gatattaaggtaacggcaactgacgagagcggtgcctccgtgagcgataccttcaagctt
acggttaccaataccaacgatgcaccaactggtagtattctcattaccggcatagctggt
gaaggcaacacgctgcaagctgaagccatgcttgccgatgacgatgggcttggaacactt
cactaccaatggaagcgcgacaatcaggctattaccaatgcaacaggtagcaattacacg
cttacggcggctgataaaaatcaggaaattactgtaatcgtaagttataccgatgcacga
gggaatgcagagcaagtaacaagcgcttatggtgttcgttacaatacactgacgtcaaac
agcaattcaacacctatcacccttgtacaaggtagtggtagtggaagcgacccattgctc
agtgttgttatgcctacgggctttgaaatggttacacagcaggttacaggtaataacttg
caatcgcaacttgaagccgcagctcctactttcgcccagcaaaccgatatacaaacagct
attgaagaatatctcgcaaatgttggttcgcaagcagtaacggttcgcactattgccttt
cctacctcaatggcaaatgcaacagtaaatgatgccgcgccaatcattattaatggctcc
gatacggctggtacgcaagaggcgttggtgattaatacccaaaacttgccctctggtacg
cttattcaattaaatgatgtagaatttgctaccgttattggtgctgcacgcattacgggt
ggcgaaggcaacaacactgtttttgccgatggctctgcacaatacattgtactcggtaca
ggcgatgatacgttgcatggcggcgcaggtaatgacaccattggttcacttgatggtaac
gattatctctatggcgaagcaggcaacgatacgcttagtggcggagatgataacgaccac
ctctctggcggcactggcaatgaccttctcgatggcggtgctggctccgatattgcaatg
tttagtggtgctttaaacgactacaccattacacacaatgcaataaccgacacctacacc
gttgctgataaagtaagtggacgcgatggtgtagatacactcacgaatatggagtattgc
caatttgctgatacgctttatgacctcgaagcagcaaatccctaccatcacgataccgat
tttgggcacgataccacagccattggtattgcagggcttggcttagttggtttacttctt
ttcttatag
DBGET
integrated database retrieval system