Chlorobium chlorochromatii: Cag_1014
Help
Entry
Cag_1014 CDS
T00290
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor-related protein
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
cch
Chlorobium chlorochromatii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cch00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cch02000
]
Cag_1014
Transporters [BR:
cch02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cag_1014
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB28276
UniProt:
Q3ARU9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1356053..1357996)
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MNKKVFVVVMAGLLCSKGLMAADGQPMSVMGEEMVVTSSRFEEPKKNLTSNITIIGKDEI
AQSSAQDLGELLAEKNLGQVQKYPGTMTSVGIRGFRSETHGNDLMGKVLVLIDGRRAGTG
NTAKIMTENVERIEIIQGPAAVQYGSAAIGGVVNVITKKGDNVPSFFVEQKGGSNEFVKT
AAGVQGKIGKLDFASALSRSEAGDYKTGSGKTYFNTGYDEQVLANLNVGYEIADGHRIGF
GYHSFDVDKAGSPSYLSLNDLQSYTSNNNHAIDVSYEGALTNKRWLWSTRYFSGMDSYQY
VDPSTSYTSSSDVEQQGAQAQISFTEKSLLITAGVDWLNYELTSTLAPKWSKYNNPAVFL
LAKYGVFEDRLLLSAGVRYDDYKVDLQPAEGTSRSTDNFAHQVGAAWQVNDVVKLRASYA
EGFRMPSARELAGNIVSFGKTYIGNPNLNPEVSETWETGIDVVWREITSSLTWFSTDYTD
MIETQLTAPKTYLYKNIGSTSLSGIEAEFAWKSSATTWNIEPYVNYSYLLEHKDNATGDD
LLYTPEWNASTGVRLQHTNGLSAALNVTATGSSNVQDYESNSGKVITKGGFSVVNLSASK
KFTLDKQERRAITIKAEVDNLLDRDYQYVKGYPMPGRTFVIGLRADI
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaaagtatttgtggttgtcatggcgggtttgctatgcagcaaggggcttatg
gcggctgatgggcagccgatgagcgttatgggtgaggagatggtggttacttcaagccgt
tttgaggagccaaagaaaaatctcacatcgaacattaccattatcggtaaagatgagatt
gctcaatcgtcggctcaagatttgggggaattgttggctgaaaaaaatcttgggcaagtt
cagaaatatcccggcacgatgacttcggttggtattcgaggttttagaagtgaaacgcat
ggcaacgatttaatgggtaaagttttagtgcttattgatggtcggcgtgcaggtacgggc
aatacggctaaaattatgaccgagaatgttgagcgtattgaaattattcaaggtccagcg
gcagtgcaatatggttcagccgcaataggtggagtagtaaatgttattactaaaaaaggc
gataatgtaccttcattttttgtagaacaaaaagggggaagcaatgaatttgtgaaaacg
gctgccggtgtgcagggcaaaattggtaagcttgattttgcaagtgccctttcgcgctct
gaagctggtgattataaaacgggttctggtaaaacatattttaatacgggatatgatgag
caggttttagctaatcttaatgttggctatgaaattgctgatgggcatcgtatcgggttt
ggatatcattcatttgatgtagataaagctggatcgccatcatatcttagcctgaatgac
ttacaaagttatacaagcaataacaatcatgctattgatgttagctatgaaggtgctctt
accaataaacgttggttatggtcaactcgctattttagtggtatggatagctatcaatat
gttgatccatcaacttcttatacaagttcgagtgatgtggaacagcaaggtgctcaagcg
caaatttcatttaccgaaaagagcttgcttataacggctggagttgattggctaaattat
gaattaacctcaacgttagcccctaagtggagtaaatacaataacccagccgtttttttg
cttgctaaatatggagtgtttgaggatcggcttttgctttcggctggtgttcgctatgat
gattataaggttgatttacaacctgcggaaggcacctcgcgtagtacggataattttgcc
catcaagtaggagctgcatggcaagtgaatgatgttgtaaaactacgcgcttcttatgcc
gaaggttttagaatgccatcggcacgtgaacttgctggaaatattgtgtcgtttggtaaa
acttatattggaaatcctaatttaaaccctgaagttagcgaaacatgggaaacaggtatt
gatgttgtatggagagagattacatcatcacttacatggttttcaaccgattacaccgat
atgattgaaacccagctcactgctcctaaaacatatctctataaaaatattggtagtact
tcgttgtcgggtattgaagctgaatttgcatggaaaagttctgcaactacttggaacatt
gagccttacgtaaactacagctatctcttagagcataaagataatgctacgggcgatgat
ttgctttatacccctgagtggaatgccagcacaggagtgcgtcttcagcatacgaatggc
ttaagtgctgcactgaatgttaccgcaacgggtagtagtaatgtgcaagattatgaaagc
aattcaggtaaagtgattacgaagggtggctttagtgttgtaaatctttcagcatcgaaa
aaatttacgcttgataaacaagagcgtcgtgctattactataaaagctgaggttgataat
ttgcttgatcgcgattatcaatacgttaaaggttatcccatgcccggacgcacgtttgtg
attgggttgcgtgccgacatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
