Chlorobium chlorochromatii: Cag_1235
Help
Entry
Cag_1235 CDS
T00290
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
cch
Chlorobium chlorochromatii
Pathway
cch02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cch00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Cag_1235
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
Big_5
Dockerin_1
IG_AIR9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB28496
UniProt:
Q3AR79
LinkDB
All DBs
Position
1636866..1642940
Genome browser
AA seq
2024 aa
AA seq
DB search
MNIILADALIDDVALLLSSLPAATTCYLLHAQDDAVKVIQTAFQQPNTHLHFLGHGEEGA
ITLGGKTFTADDFIALAPTHSSSGAIHFWSCKTGAGTKGVAFVNSIAQAFNTVVSACSTL
VGAAHKGGSWRLDVHSNERVAVACPFGKAAAYQHTLDASSLLRVNAVALDNGLKVEIWIA
PNTAFSTASLRLSFDPSIIAPVWVNGKVVSTSGLTGWTWLSSPIGDTVLKMNGYTLTEVN
RTTEVLLQSISFTFAADVQNCSISLGGTYLENEVTGKIALGTLPTLTYIAPALPVWDTFA
PPEALSYTAGTTAALDFAVQATDANGDTITYKAVVGQMVESLFTPTTSLSTITLTSSNGH
LTGSVVLPRTFSAGVYLFRLYADDKTTDANLGSVLDVPFSLLAAPNALPTGTVTISGTPT
QNQTLTAANTLADLDGIGTIAYQWNADGTAITGAIGNSLMLTEAHVGKKITVTATYTDNR
GTLESVVSTATSAVVNINDAPTGSVSISGTPTQGQTLTAANTLADLDGLGTIAYQWNADG
TVITGAIGNSFTLTETHVGKKITVTATYTDGHGTTESVVSAATVAVANVNDVPTGTVTIS
GSATQNQMLIAANTLADLDGLGTIAYQWNADGTAITGAIGNSFTLTETHVGKKITVTATY
TDNRGTLESVVSTATSDVVNINDAPTGSIYITGAATKGQILTVNTGTLSDADGLNGEFTY
QWQANEIDITGATSSSYTLTNDDVGKNIRVVASYTDNHGTKESVVSTATVAVANVNDVPT
GAVTISGTPTQNQTLTAANTLADLDGLGTIAYQWNADGTTITGAISNSLVLGETHVGKKI
TVTATYTDGHSTTESVVSAQTTSVANVNDAPTGTVTISGTPTQNQTLTAANTLADLDGIG
TIAYQWNADGTAITGVIGENLTLTEALVGKKITVTATYTDGHGTTESVVSTATVAVANVN
DAPTGTVTINGTPTQEQTLTAANTLADLDGLGTIAYQWNADGTAITGAIGNSFTLTEAHV
SKKITVTAIYTDGHGTTESVVSAATTAVANVNDTPTGTVTITDSATQNQTLTAANTLADL
DGLGTIDYQWNADGTAITGAIGNSLMLTETHVGKKITVTATYTDGHGTTESVVSAQTTSV
ANVNDAPTGTVTITGSATQGQTLTASNTLEDLDGMGSVAYQWQADGMAINGATGNSFTLT
EAHVSKKITVTAIYTDGHGTTENVVSAATSAVVNINDTPTGTVTITGSATQNQTLTAANT
LADLDGIGTIAYQWNANGVAITGAVGDNLTLTEAQVGKKITVVASYIDGHSTTENVVSAQ
TTSVANVNDTPTGTVTITGSATQGQTLTASNTLEDLDGMGSVAYQWNADGTAITGAIGNS
LMLTETHVGKQITVTATYTDGHGTTENVVSAQTASVANVNDAPTGTVTISGTPTQGQTLT
AANTLADADGLGTIAYQWNADGTAITGAIGNSLVLGETHVGKKITVTATYTDGHGTTESV
VSAQTTSVANVNDTPTGTVTITGSATQGQTLTASNTLEDLDGMGSVAYQWNADGTAITGA
IGNSLVLSETHVGKKITVVASYIDGHSTTESVVSAATDIISLDDTTPPYLISTTPINNSI
GISTNSNITLTFSEAINKGNGTIALYLNSPTKTLVENYNVADNVNLSIEGNKLTINPTAD
LEQGKNYLLAIENGAITDSANNLFEITDVYNFTTETLPIERYSLSGNISFWKDKATPLQD
VSIVATSAMQTPDLLEFRNIQLHSDGSRTVELWTTSPSNTLHAIQVELELQEGSTATWQN
STSIPSNWTTVTHVNNNGHFVLGSMGIEPIAMEAPTVKLGELTLSAPIDQERFEIAIVNG
LTNEQAITPFALTSSEIISNKQGHYSFTHLMESLYYLEANKAADALADAVTIEDARAALM
IAVGLNPNSDGTPLLPYQYLAADVNRDGKIRASDALTILKMAIGVDSVPEHAWIFASESI
ESAEMGRSAVDWSHTVPTVLLNQESNTIDFIGIVKGDVDGSALT
NT seq
6075 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacataattcttgctgatgcactaattgatgatgttgctttgttgctaagctcatta
cctgctgcaacaacatgttatttacttcatgctcaagacgatgctgtaaaagttatacaa
acagcatttcaacaaccaaatactcatcttcattttcttgggcatggcgaagaaggtgct
attacacttggtggtaaaacatttaccgctgatgattttatagcgctggcacctactcac
agcagcagtggcgctatccacttttggtcatgtaaaacaggtgctggaactaaaggtgtt
gcctttgttaactccattgcacaagcttttaacacggtagtaagtgcatgtagcacgctt
gttggggctgcccataaagggggaagctggagacttgatgttcactcaaacgaaagagtt
gcggttgcttgtccttttggtaaagctgccgcttatcagcatacgcttgatgcttcttct
ctcctaagagtgaatgcggttgctcttgataatggacttaaagtagaaatttggattgct
ccaaataccgcctttagcacagcaagccttcggcttagttttgatccgtccattattgca
cctgtatgggtaaatggcaaagttgttagcacaagcggcttaacgggatggacgtggctt
tcttcaccaattggtgatacagtcctgaagatgaatggttatacgctcacagaggtaaac
cgtacaactgaggtgcttttgcaatctatcagctttacctttgcggcagatgtgcagaat
tgttccatatcgcttggtggaacttacttggaaaatgaagttaccggtaaaattgcgtta
ggcacattgccaacgttaacgtacatcgcgcctgctttacctgtttgggatacctttgcg
ccaccagaggcgttaagttataccgcaggcacaactgctgcacttgattttgccgtacaa
gctaccgatgcaaatggcgacacgattacctataaagccgttgttggacaaatggttgaa
tcattatttacaccaaccacctcgctttcaacaattacgctaacatcatcgaatgggcat
cttacaggaagtgtagtgttgcctcgtactttttcggcgggagtatatctgtttcgttta
tatgctgatgataaaacaacagacgcaaatcttggtagtgttcttgatgttccgttttca
ctgcttgctgcaccaaatgcgttaccaacgggcaccgttaccattagtggcacaccaacg
caaaaccagacgctcaccgcagctaacacccttgctgatcttgacggaattggcaccatc
gcttatcaatggaatgccgatggaacggctatcacaggagctattggcaattcgcttatg
ctgacggaagctcacgttggcaagaaaatcaccgtgacggcgacttatacggataatcgt
ggaacgctggaaagtgtcgtcagtactgcaacttcagccgttgttaatataaacgatgca
ccaacgggcagcgtctccattagtggcacacctacgcagggacagacgctcaccgcagca
aacacccttgctgaccttgacggacttggcacaattgcgtatcaatggaatgctgatgga
acggttatcacgggcgctatcggtaacagcttcacactgacggaaacgcacgttggtaag
aaaatcaccgttacagcaacctacaccgatgggcacggcactaccgagagcgttgttagt
gctgctacggttgccgttgctaacgtgaacgacgtgccaacaggcaccgttaccatcagt
ggcagtgctacgcaaaaccagatgctcatcgcagcaaacacgcttgctgaccttgatgga
cttggcacaatcgcttatcaatggaacgctgatggaacggctatcacgggcgctatcggt
aacagcttcacactgacggaaacgcacgttggtaagaaaatcaccgttacagctacttat
acggataatcgtggaacgctggaaagtgtcgtcagtactgcaacttcagacgttgttaat
ataaacgatgcaccaacgggaagtatctacattactggagctgcaacaaaaggacaaatt
ttaactgtcaatactggtacgctttcagatgccgatggacttaatggtgaatttacttat
caatggcaggctaatgaaattgatataacaggtgcaacgagtagtagctatacgttaact
aatgatgacgtaggtaaaaacatccgagttgttgcaagctatacagacaatcatggaacg
aaggaaagtgttgttagtactgctacggttgcagttgctaacgtgaacgatgtgccaacg
ggcgccgttaccatcagtggcacacctacgcaaaaccagacgctcaccgcagcaaacacc
cttgctgaccttgacggacttggcaccatcgcttatcaatggaatgctgatggaacgact
atcacgggcgctatcagcaattcgcttgtgcttggtgaaactcacgttggcaagaaaatc
accgttactgcaacctacaccgatgggcacagcaccaccgagagcgttgttagtgcacag
acgacatccgttgccaacgtgaacgatgcgccaacaggcaccgttaccatcagtggcaca
ccaacgcaaaaccagacgctcaccgcagctaacacccttgctgatcttgacggaattggc
accatcgcttatcaatggaatgccgatggaacggctatcaccggtgttattggcgaaaac
ctcacgctaacggaagctctcgttggcaagaaaatcactgttacagcaacctacaccgat
gggcacggcactaccgagagcgttgttagtactgctacggttgcagttgctaacgtgaac
gatgcgccaacaggcaccgttaccatcaatggcacacctacgcaggagcagacgctcacc
gcagcaaacaccctggctgaccttgatggacttggcacaattgcctatcaatggaatgcc
gatggaacggctatcacgggcgctatcggtaacagcttcacgctgactgaagctcatgtt
agcaagaaaatcactgttacagcaatctacaccgatgggcacggcactaccgagagcgtt
gttagtgcagcaacaacagccgttgctaacgtgaacgacactccaacaggcaccgttacc
atcaccgacagtgctacgcaaaaccagacgctcaccgcagcaaacacccttgctgacctt
gacggacttggcaccatcgattatcaatggaatgccgacggaacggctatcaccggcgct
attggcaattcgcttatgctgacagaaacgcacgttggtaagaaaatcaccgttacagca
acctacaccgatgggcacggtactaccgagagcgttgttagtgcacagacgacatccgtt
gccaacgtgaacgatgcgccgacgggcacggttactatcaccggtagtgctacgcaaggg
caaacactcacggcaagcaatacacttgaagaccttgatggtatgggcagcgttgcgtat
caatggcaagcagatggaatggctatcaatggagctacgggtaacagcttcacgctgact
gaagctcatgttagcaagaaaatcactgttacagcaatctacaccgatgggcacggcact
accgagaacgttgtcagtgcggcaacttcagccgttgttaatataaacgacactccgaca
ggcaccgttactatcaccggcagtgctacgcaaaaccagacgctaaccgcagctaacacc
cttgctgatcttgacggaattggcaccatcgcttatcaatggaatgctaacggagttgca
atcaccggtgctgttggcgacaatctcacgcttacggaagcacaggttggtaaaaaaatc
actgttgtagcaagttacattgatgggcacagcactaccgagaacgttgtcagtgcacag
acgacatccgttgctaacgttaacgatacaccgacgggcacggttaccatcaccggtagt
gctacacaagggcaaacactcacggcaagcaatacgcttgaagatcttgatggcatgggc
agcgttgcctatcaatggaatgccgatggaacggctataacaggtgctattggcaattcg
cttatgctgacagaaacgcacgttggcaagcaaatcaccgttacagcaacttacaccgat
gggcacggcaccaccgaaaacgttgttagtgcacaaacagcatccgttgctaacgtgaac
gatgcgccaacgggcaccgttaccattagtggcacacctacgcaagggcagacgctcacc
gcagcgaacactcttgccgatgctgacggacttggcacaattgcctatcaatggaatgcc
gatggaacggctattaccggcgctatcggcaattcgcttgtgcttggtgaaactcacgtt
ggcaagaaaatcaccgttacagctacttatacggatgggcatggtactaccgaaagcgtt
gttagtgcacagacgacatccgttgctaacgttaacgatacaccgacgggcacggttacc
atcaccggtagtgctacacaagggcaaacactcacggcaagcaatacgcttgaagatctt
gatggcatgggcagcgttgcgtatcaatggaatgctgatggaacggctattaccggcgct
atcggcaattcgcttgtgcttagtgaaactcacgttggtaaaaaaatcactgttgtagca
agttacattgatgggcacagcactaccgagagcgttgttagtgcggctactgatattatt
tctttagacgacaccaccccaccctaccttatatcaacaacgccaattaataacagtatt
ggtatttcaacaaatagcaacataactctcacctttagcgaagcaattaataaaggtaac
ggcacaattgcgctctatcttaattcgcctacaaaaacattagttgaaaactataacgtt
gccgataatgttaatctatccattgaaggcaataagctaaccataaatccaactgccgat
cttgaacaaggtaaaaactatctactcgctattgagaatggagctataacggatagtgct
aacaacctatttgaaataactgatgtatataatttcaccactgaaacattgccaatagaa
cgttactcattatcgggaaatatctctttttggaaagataaagctacaccacttcaagat
gtttcaatagttgctacatccgcaatgcaaacaccagacttactggaatttcgaaatatt
caactgcatagcgatggtagccgtaccgttgagttatggacaacctcaccaagcaacacg
cttcatgctattcaagtagaattagagttacaagaaggctcaacggctacatggcaaaat
agtacatcaattccctcaaattggacaacagtaactcatgttaataataacgggcacttt
gtactgggcagcatgggcatagagcctattgctatggaagcacctacggttaagcttggt
gaattaacccttagtgcccccatagaccaagagcgctttgaaattgctatagttaatgga
ttaacaaatgagcaagctatcactccattcgcactaacttcttcagaaataataagtaac
aagcaagggcactatagctttactcatttaatggaaagcctttattacttagaagcaaat
aaagctgccgatgcgcttgccgatgccgttactattgaggatgctcgtgcggctttaatg
atagcggtaggacttaatccaaatagtgatggcacacctttactaccctatcaatatctt
gcggctgatgttaatcgtgatggaaaaattcgcgcctccgatgcgctaactattttaaaa
atggcgattggtgtggattcggtacctgagcatgcatggatttttgcctctgagagcatt
gagagtgccgaaatgggacgcagtgctgttgattggtcgcatacggtgccaaccgtgtta
cttaatcaagagagtaacaccatagattttattggaattgtaaaaggtgatgttgatggt
agtgcgctaacgtag
DBGET
integrated database retrieval system
