Chlorobium chlorochromatii: Cag_1539
Help
Entry
Cag_1539 CDS
T00290
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase
Organism
cch
Chlorobium chlorochromatii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS
PAS_9
PAS_4
PAS_8
HATPase_c
HisKA
PAS_7
PAS_PdeA
HATPase_c_5
HATPase_c_2
HEPN_AbiU2
DUF2207_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB28794
LinkDB
All DBs
Position
2015173..2018994
Genome browser
AA seq
1273 aa
AA seq
DB search
MNTIIPDFQQPDAVVIALLDSFSDALFIMDADSIILHANEAFATQCGKKPEECIGFNACS
LIESVFVMPHFAYECSATTNEVLDSAKQQSFETTYLHQSWKTTITPLHLKEYDQGATQLL
VRIEDISEKKNLEQQSQVTDTLHKTLLETIPGFAIILDASGHLMAWNNYTRTIIFGKTDN
EMYDVDPFGFICPTERTSIRKKFFKTLRAGCEKSAEIKIFPQKEKHAIWLLIHAKPVFID
NQMCVVAVGINITERKRVEAELLENKLRYNHAMEAARAGIWEWNVKTDKLTWSEQLWGLY
GLQVNSEPLTHQLCVTTVHPDDREMASQMIKSAVQQQIPASIEYRVLHPDGSVHWLNSRG
IPLHDDDGTLHHYIGTIIDITERKETEIVLLENKIRLKQALKATRAGVWEWELATNENSW
SDEIWALYGIEQDHQQPSFDLWVNTVHPDDRLLAIKAVTEATQQGAEINVEYRVCHHDGS
EHWLMSRGKPILDPQGNTIRYIGTALDITERKKMEIALGESQRRFTFALEATNAGVWEWD
IKTDVITWTERVWTLYGLEPFSATPSHQLCATHVHHDDYEKIFQNIMVAVQRESNINVEY
RVCHPDGTTHWLMCRGMPLRNANGTVSCYMGTVMDITKRRELLEKLRRSEQRYRLLFDNM
MNGFAYCNMIYDGKKPIDFVFLNVNQTFKKFCKTKDVVGKKASEVIPNFMTLANELFVVC
ARVAHSCQSEQFEYFFKPFNEWLFISISSPQKGYFMVIFDIISERKRAEQLILDSKLKLE
AALESMSDAIFISDTAGRFIEFNNAFAAFHKFERKEKCFMTLTEYPAILDLFTDNNQLTD
LAEWPVSRALQGETMTNAEYTLHRKDTNHTWIGSYNYAPIRNNEGEITGSVVTARDITEQ
KLIEKTLKESELKFRSIFDYSPVAIGIGNATNGMLIDVNTFWLELFGYTKEEVVNQTVTD
IGIYVKPQERNEILDILAAHGRVTNKPVRLRKKSGEYITILYSSVFMKLDHKTILLVIIT
DVTLQEIQQQNITLLEKAVAERTQQLQDEVEQLQRFISMISHEYRTPLAIIRGNLDLIGL
KNKTKKISNEAEINKINRAIDRLVEVMEVSMQESRMIESKQETVMTTFQIAAIVTSQIET
FRAMWTERLIIYSETVENSLVLGEPSQLKLAIFNLLDNARKYSPTDSPIKVTCSLDADTV
MIRIRNYGTSITKDEEKTLFEKFQRGSNSMNTSGAGLGLWLVKSIINRHNGQVSLTCIDS
GVETLVRLPLHTT
NT seq
3822 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatactataattcctgattttcaacaacctgatgctgtagtaattgcattacttgat
tcattttctgacgccttgtttattatggatgctgatagcattattcttcatgctaatgag
gcttttgcaacacagtgtggtaaaaaaccagaagagtgtattggttttaatgcgtgcagc
cttatagagtcggtgtttgtaatgcctcattttgcttatgagtgtagtgcaacaaccaat
gaggtactcgatagtgcaaagcaacaatcatttgagactacttatttacatcaaagctgg
aaaaccaccataaccccattgcatctaaaagaatacgatcaaggtgccacacaactcctt
gttcgcattgaagatatttcagaaaaaaagaatcttgaacagcaatcacaagtaacagat
acactgcacaaaacactgcttgaaactattccgggttttgccattattcttgatgcttct
ggtcatctgatggcatggaataattacactcgtactattattttcggtaaaaccgataat
gaaatgtacgatgttgatccatttggttttatatgtcctaccgaaagaacttctattaga
aaaaaattctttaaaacgcttcgcgctggatgtgaaaaaagcgctgaaataaaaattttt
ccacaaaaagaaaaacatgctatttggctactcattcatgcaaaacctgtatttattgat
aatcaaatgtgtgttgttgctgttggaattaacattaccgaacgcaagcgtgttgaagct
gaactgcttgaaaataagctacgctacaaccatgcgatggaagctgctcgtgctggaata
tgggagtggaatgttaaaaccgataaactcacttggtcagaacaattatggggattgtat
gggctacaagtcaatagtgaacctctaactcatcagctttgtgttacaacggttcatccc
gatgatcgagaaatggcatcgcagatgattaaatcagccgtgcaacaacaaattcctgcc
tctattgaatatcgagttcttcatcctgatggctcagtccattggctcaattcccgtggc
attcccctgcatgacgatgatggaacactgcatcattacattggcactattattgatatt
actgaacgcaaggaaacagaaattgtgctgcttgaaaacaaaatacgactgaaacaagcg
ttgaaagctacccgtgcaggggtttgggaatgggagcttgcaactaatgaaaatagttgg
tcagacgaaatatgggcactctatggaattgaacaagatcatcaacaaccatcgtttgac
ttatgggtaaataccgttcatccagatgatcgcttactcgcaataaaggctgttacagaa
gctactcaacagggcgcagaaattaacgttgagtatcgtgtttgccatcatgacggttct
gagcattggcttatgtcgcgtggtaaaccaatattagacccgcaaggcaataccatccgt
tatattggaactgcccttgacattacagagcgcaaaaaaatggaaattgcgcttggggaa
agccaacggcgctttacctttgcgcttgaagctaccaatgccggtgtttgggagtgggat
attaaaaccgacgtcattacgtggactgagcgagtatggacactctatggtttagagcct
tttagtgcaacgccctcgcatcagttatgtgcaacacacgttcatcatgatgattacgaa
aaaatctttcaaaacatcatggtagccgttcaacgcgaaagcaatatcaacgttgaatat
cgtgtatgccatcctgatggtacaactcattggctcatgtgtcggggaatgcctttgcgc
aacgcaaacggcaccgtttcatgctatatgggcacggtaatggatattacaaaacggcga
gagttattagaaaaactacggagaagtgaacagcgttatcgcctgcttttcgataatatg
atgaatggttttgcctattgcaatatgatatatgatggcaaaaaaccaatagattttgtt
tttcttaatgtaaaccaaacatttaaaaaattctgtaaaacaaaagatgttgtaggtaaa
aaagcaagcgaagtcatacctaattttatgacgttagctaatgaattatttgtggtatgt
gctcgcgtagctcatagttgccaatcggaacaatttgaatatttctttaagccatttaat
gaatggctttttatctcgatttcaagcccacagaaaggctattttatggtgatattcgat
atcatctctgaacgcaaacgggcagagcaacttattttggatagcaagctaaaactcgaa
gccgcacttgaaagcatgagtgatgctatttttatttctgacactgcgggacgttttatt
gaattcaacaacgcatttgccgctttccataagtttgaaagaaaagaaaaatgctttatg
acgcttaccgaatatccagccattctcgacctttttaccgataataaccaactaaccgat
cttgcagaatggccagtatcaagagcattacagggtgaaaccatgaccaatgcggaatac
accttacatcgtaaagacacaaaccatacatggataggaagctataattatgcacctatt
cgcaataacgaaggggaaattaccggttctgttgttactgctcgcgacattaccgaacaa
aagctcattgaaaaaacacttaaagaaagcgaacttaagtttagaagtatttttgactat
tcacccgttgctattggtattggcaatgctacaaacggtatgctcatagatgttaacacc
ttttggttagaactttttggctacaccaaagaagaagtcgttaatcaaaccgtaaccgat
attggtatttacgttaaaccacaagaacgaaacgagattcttgacattcttgcagcacat
ggtagagtaactaacaaacctgttcgattacgcaaaaaaagtggtgaatatataacgatt
ctctactcatcggtatttatgaagcttgaccataaaaccattttactcgtaattattacc
gatgttacgttgcaagaaatacaacaacaaaacattacgctgcttgaaaaagctgtagct
gaacgcacacaacaattacaagacgaagtggaacagcttcaacgctttataagtatgata
tctcacgaataccgcacaccacttgcaattattcgaggcaatcttgatctcattggttta
aaaaacaaaacaaagaaaatttccaatgaagctgaaatcaataaaataaatcgagctatt
gatcgcttggttgaagtaatggaagtctctatgcaagaaagtcgaatgatagaatctaag
caagaaaccgtcatgacaacgttccagattgccgcaatagttacctcacagatagaaaca
ttccgtgccatgtggactgaacgcttaattatatattcagaaacggtagaaaatagctta
gtgcttggtgaaccatcgcaactcaaattagccatttttaaccttttagataatgcacga
aaatactcacccactgattcacctatcaaagttacatgctctcttgatgccgatacggtt
atgattcgaatacgtaactatggtacaagtattaccaaagatgaagaaaaaacgttattt
gaaaaatttcagcgtggcagcaactctatgaatacaagtggagctggtttagggctttgg
cttgtaaaaagcattatcaatcgccataatggacaagtaagcttaacctgtattgattca
ggtgtagaaacgttagttcggttacctttgcacacaacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system