Candidiatus Paracoxiella cheracis: ACJMKR_11945
Help
Entry
ACJMKR_11945 CDS
T10945
Name
(GenBank) ankyrin repeat domain-containing protein
Organism
cchr Candidiatus Paracoxiella cheracis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank_4
Ank_5
Ank_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XQW92158
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:41520..47132
Genome browser
AA seq
1870 aa
AA seq
DB search
MQPELTDKFYKYQDKKLSVLAEKQEAFLTTHYGAGPLYYDQNHPTSFEKAKSQLIQILAS
MLKLNNLALGNFDRLKERLGREFTMENISSENDRSLILVSAKKTIEYAYYAHERTIKNIN
PSLLRDFTFDACYPGVYSNLVRFCEYLESTFEAMVRYAKKSAIEQIAAQYVSEVNWTAGF
PGDEIHYVHALHNYVAQEYALPEIIDPLAPVNLDAQLLNKFRDQLKSTINHTMIVDFLLM
KVQGIIGDKFSCDNSSRMKKWLGCPNEEDLRLYSYGMYSEDEKSNGGDTNNTLKIPNVSR
MLRLFVNICLEQNKFSKDCVHKFDAGKGKIIQTVSDLFIVEEIKDEKLDMDRWVVRVAQA
EDIEGLKNENHQFVAWPSFQHMHGDGLLRLLKSEYCQEQSSYREALIWSFLYGSPSNELL
EVLRANTAFLLGKKGITFDSKCCFGKSVLEILIDRTDLHKLADFLNYTVAEFGLEKLMNA
LEGDVVRLMVWVATQTGRVGVLEKLHEWNIDLATATKNGETPAFIAADNGHIGVLEKLHA
WGIDLTTPNNQGETPAFIAASNGHIGVLEKLHEWNIDLTAANEYGVTPAFIAARNGHTGV
LEKFHEWNIDLTTATKNGVTPAFIAARNGHTGVLEKFHEWNIDLTTATKNGVTPAFIAAA
NDQIGVLEKFHEWNIDLTAANEHGVTPALIAVKAGRVGVLEKFHEWDIDLTTPNNQGETP
ALIAAQAGRVGVLEKLHEWNIDLTAANEYGVTPAFIAAGNGHTGVLEKFHEWDIDLTAAN
EHGVTPAFIAAQAGRVGVLEKLHEWGIDLTTATKNGVTPALIAVKAGRVGVLEKFHEWDI
DLTTPNNQGETPALIAAQAGRVGVLEKLHEWNIDLTAANEYGVTPAVIAAGNDQIGVLEK
FHEWNIDLTAANEHGVTPALIAVKAGRVGVLEKFHEWDIDLTTPNNQGETPAFTAAKYGC
LKVLDKFHEWGIDLTTATKNGETPAFIAADNGHIGVLEKLHEWNIDLTTATKNGETPAFI
AADNGHIGVLEKLHEWNIDLTTATKNGETPAFIAADSGHIGVLEKLHEWNIDLATATKNG
ETPAFIAADNGHIGVLEKLHAWGIDLTTPNNQGETPAFIAASNDQIGVLAKLHEWDIDLT
TPNNQGETPAFTAAKYGCLKVLDKFHEWGIDLTTATKNGETPAFIAADSGHIGVLEKLHE
WNIDLATATKNGETPAFIAADNGHIGVLEKLHAWGIDLTTPNNQGETPAFTAAKYGCLKV
LDKFHEWGIDLTTATKNGETPAFIAADSGHIGVLEKLHAWNIDLATATKNGETPAFIAAD
NGHIGVLEKLHAWGIDLTTPNNQGETPAFTAAKYGCLKVLDKFHEWGIDLTTATKNGETP
AFIAADSGHIGVLEKLHEWDIDLTTPNNQGETPAFIAADNGHIGVLEKLHAWNIDLTTAT
KNGETPAFIAAGNDHIGVLEKLHAWNIDLTTATKNGVTPALIAAGNDHIGVLEKLHAWGI
DLTTATKNGVTPALIAAANGQIGVLEKLHAWGIDLTTATKNGVTSAFIAADSGHIGVLEK
LHAWNIDLATATKNGETPAFIAASNGHIGVLEKLHAWGIDLTMATKNGATPAFIAAGNGH
IGVLEKLHAWGIDLTMATKNGATPALIAAGNGQIGVLEKLHAWNIDLTTATKNGATPALI
AAGNDQIGVLEKFHEWDIDLTTPNNQGETPAFTAAKYGCLKVLDKFHEWGIDLTTATKNG
ETPAFIAASNGHIGVLEKLHEWNIDLTTPNNQGETPALIAAGNDQIGVLAKLHEWGIVVT
ITNQHSKTNTFDLTLGEVNKKNKTRTENNYSLFRSRKLSQPAVSKGEGNANSEYGFVAGC
VANLEAGVYN
NT seq
5613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaccagaattaacagataaattttacaagtatcaagataaaaaacttagcgttctt
gcagaaaagcaagaagcctttttgactacgcattatggtgcaggtcccttgtattatgat
cagaatcatccgacatcatttgagaaagcaaaaagccagctgatacagattttagcttca
atgctaaagctaaataatcttgcgttgggtaattttgaccgtttaaaagagcgcttaggc
agagagttcactatggagaacatctcttctgaaaatgatagaagcttaatattggtatcg
gcaaaaaaaaccattgaatatgcatactatgctcatgaaagaactatcaaaaatataaat
ccaagtttgttaagagatttcacttttgatgcttgctacccgggcgtttattctaatttg
gttaggttttgtgaatatctagaaagcacatttgaagcaatggtgcgttatgcgaagaaa
agtgcaattgaacagatcgcagcccagtatgtttctgaagttaattggactgctggattc
ccgggggatgaaatccattacgtgcatgccctgcataactatgttgctcaagagtatgct
ctaccagaaataatagatccgcttgccccagttaatttggatgcacagctgcttaataaa
ttccgtgatcaattaaaatcaacgattaaccacacgatgattgttgattttcttttgatg
aaagtacagggcattataggggataagttctcttgtgataacagtagccgtatgaaaaag
tggttggggtgtccaaacgaagaggatttaagactatattcttacggtatgtattcggaa
gacgaaaaaagcaatggtggcgacacaaataacactttgaaaataccaaatgtttctcga
atgctgcggctgtttgtaaacatctgccttgaacaaaataagttttctaaagattgtgtg
cataagtttgatgcaggaaaaggaaaaatcattcaaacggtgtccgatttatttattgtc
gaagaaatcaaagatgagaaacttgatatggacagatgggttgttagagtggctcaagcg
gaggatatagaagggttaaaaaatgaaaatcatcaatttgtggcttggccatcgtttcag
catatgcatggagatgggctgcttcgtctattgaaaagtgagtattgccaagagcagtct
tcttatagagaggcgttgatctggtcttttctctatggcagtccaagtaacgaactatta
gaagtgttacgcgccaatactgcttttttattagggaaaaaaggtattactttcgattcc
aaatgctgttttggaaagtcagttctggaaattttgattgatagaactgatctgcataaa
ttagctgattttcttaactacacagtggctgaatttgggctagaaaaattgatgaacgca
ctagaaggcgatgtggtaagactgatggtgtgggttgcaacacaaaccgggcgtgttggt
gttttagaaaagctccacgagtggaacattgatctggcgaccgccactaaaaatggtgaa
acgcccgcattcattgcggcagacaacgggcatattggtgttttagaaaagctccacgcg
tggggaattgatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgcccgcattcattgcggcg
agcaacggtcatattggtgttttagaaaagctccacgagtggaacattgatctgacggct
gccaatgaatatggcgtgacgcccgcgtttattgcggcgcgcaacggtcatactggtgtt
ttagaaaagttccacgagtggaacattgatctgacgacggctactaaaaatggcgtgacg
cccgcgtttattgcggcgcgcaacggtcatactggtgttttagaaaagttccacgagtgg
aacattgatctgacgacggctactaaaaatggtgtaacgcccgcattcattgcggcggcc
aacgatcagattggtgttttagaaaagttccacgagtggaacattgatctgacggctgcc
aatgaacatggcgtgacgcccgcattaattgcggtgaaagccgggcgtgttggtgtttta
gaaaagttccacgagtgggacattgatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgccc
gcattaattgcggcgcaagccgggcgtgttggtgttttagaaaagctccacgagtggaac
attgatctgacggctgccaatgaatatggcgtgacgcccgcgtttattgcggcgggcaac
ggtcatactggtgttttagaaaagttccacgagtgggacattgatctgacggctgccaat
gaacatggcgtgacgcccgcgtttattgcggcgcaagccgggcgtgttggtgttttagaa
aagctccacgagtggggaattgatctgacgacggctactaaaaatggtgtaacgcccgca
ttaattgcggtgaaagccgggcgtgttggtgttttagaaaagttccacgagtgggacatt
gatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgcccgcattaattgcggcgcaagccggg
cgtgttggtgttttagaaaagctccacgagtggaacattgatctgacggctgccaatgaa
tatggcgtgacgcccgcggttattgcggcgggcaacgatcagattggtgttttagaaaag
ttccacgagtggaacattgatctgacggctgccaatgaacatggcgtgacgcccgcatta
attgcggtgaaagccgggcgtgttggtgttttagaaaagttccacgagtgggacattgat
ttaacaactcccaacaatcagggtgagacccccgcgttcactgcagcaaagtatggatgc
ctgaaggtattggacaagttccacgagtggggaattgatctgacgacggctaccaaaaat
ggtgaaacgcccgcattcattgcggcagacaacgggcatattggtgttttagaaaagctc
cacgagtggaacattgatctgacgacggctaccaaaaatggtgaaacgcccgcattcatt
gcggcagacaacgggcatattggtgttttagaaaagctccacgagtggaacattgatctg
acgacggctaccaaaaatggtgaaacgcccgcattcattgcggcagacagcgggcatatt
ggtgttttagaaaagctccacgagtggaacattgatctggcgaccgccactaaaaatggt
gaaacgcccgcattcattgcggcagacaacgggcatattggtgttttagaaaagctccac
gcgtggggaattgatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgcccgcattcattgcg
gcgagcaacgatcagattggtgttttagcaaagctccacgagtgggacattgatttaaca
actcccaacaatcagggtgagacgcccgcgttcactgcagcaaagtatggatgcctgaag
gtattggacaagttccacgagtggggaattgatctgacgacggctaccaaaaatggtgaa
acgcccgcattcattgcggcagacagcgggcatattggtgttttagaaaagctccacgag
tggaacattgatctggcgaccgccactaaaaatggtgaaacgcccgcattcattgcggca
gacaacgggcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaattgatttaacaact
cccaacaatcagggtgagacgcccgcgttcactgcagcaaagtatggatgcctgaaggta
ttggacaagttccacgagtggggaattgatctgacgacggctaccaaaaatggtgaaacg
cccgcattcattgcggcagacagcgggcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtgg
aacattgatctggcgaccgccactaaaaatggtgaaacgcccgcattcattgcggcagac
aacggtcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaattgatttaacaactccc
aacaatcagggtgagacccccgcgttcactgcagcaaagtatggatgcctgaaggtattg
gacaagttccacgagtggggaattgatctgacgacggctaccaaaaatggtgaaacgccc
gcattcattgcggcagacagcgggcatattggtgttttagaaaagctccacgagtgggac
attgatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgcccgcattcattgcggcagacaac
gggcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtggaacattgatctgacgacggctacc
aaaaatggtgaaacgcccgcattcattgcggcaggcaacgatcatattggtgttttagaa
aagctccacgcgtggaacattgatctgacgacggctactaaaaatggtgtaacgccggca
ttaattgcggcaggcaacgatcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaatt
gatctgacgacggctactaaaaatggtgtaacgcccgcattaattgcggcggccaacggt
cagattggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaattgatctgacgacggctaccaaa
aatggtgtaacgtccgcattcattgcggcagacagcgggcatattggtgttttagaaaag
ctccacgcgtggaacattgatctggcgaccgccactaaaaatggtgaaacgcccgcattc
attgcggcgagcaacggtcatattggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaattgat
ctgacgatggctactaaaaatggtgcaacgcccgcattcattgcggcaggcaacggtcat
attggtgttttagaaaagctccacgcgtggggaattgatctgacgatggctactaaaaat
ggtgcaacgccggcattaattgcggcaggcaacggtcagattggtgttttagaaaagctc
cacgcgtggaacattgatctgacgacggctaccaaaaatggtgcaacgccggcattaatt
gcggcaggcaacgatcagattggtgttttagaaaagttccacgagtgggacattgattta
acaactcccaacaatcagggtgagacccccgcgttcactgcagcaaagtatggatgcctg
aaggtattggacaagttccacgagtggggaattgatctgacgacggctaccaaaaatggt
gaaacgcccgcattcattgcggcgagcaacggtcatattggtgttttagaaaagctccac
gagtggaacattgatttaacaactcccaacaatcagggtgagacgcccgcattaattgcg
gcaggcaacgatcagattggtgttttagcaaagctccacgagtggggaattgttgtaacc
attaccaatcaacatagtaagaccaacacatttgatttaacactaggtgaggttaataaa
aaaaataagactagaacagaaaacaactattctttattcagatcaagaaaactcagtcag
ccagcagtatcgaaaggagaaggcaacgccaatagcgagtatggctttgttgccggttgt
gtcgcaaatctcgaagccggtgtgtataattga
DBGET
integrated database retrieval system