Clostridium chauvoei: BTM20_11965
Help
Entry
BTM20_11965 CDS
T05083
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cchv
Clostridium chauvoei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NEAT
LRR_8
HemeBinding_Shp
LRR_5
LRR_4
Shr-like_HID
LRR_9
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATD55907
LinkDB
All DBs
Position
complement(2611571..2614900)
Genome browser
AA seq
1109 aa
AA seq
DB search
MKKNLSKTLAMLVFITNAGVMVTPTFADTLNPESKVVSSEGKVELNMPVKALKATAKVIE
DKDKSENQWCHDLLIEFDSSDEDKERDFYDKITSVKVNGVEYTRSYSSEDKTYTASKLYG
GLDIRSLNFKDDINAIEIKSTGYYDTLIEVKKDGSELTSKLINNENVDSENQEDIKNNDN
KSLNSNVLETSVKKEKTDNENLEKDNTIENNLNNLEDGVYTLNFEAFKEENPSESSMLGG
FFDKNVKLEVKEGKKTLTFLNIIMPSMLYDFRLDCNGEFKESKAEDLGNINANGEHKYKS
FTVEAGDLMVSNTVAVLVSAMGGQKNDIGTMGKYRKAILNFDSNYIEGWNGFEQINNEVE
EGQRLNKVLIEKGFDIDKNGEVTAEEVAKYSQDTLSLSGKELTDISLLKNLNSNIEELNL
AANNIKELPEGIFDNLVNLKTLSLNSNLIESLPEGIFDKLTKLEELQISNLKIKSLDANL
FKNLKSLKSLELVENKELEELPEGIFNGLDSLEGIYMYDGSLNKLPSSIFTLTNLNGLHL
WNNKLEVLPDGFNKLTNLRELTLNKNVIRELPKSIYQLKNLTSLSLENNELTSVPNNIRE
LFPKLYGLDLTLNKLENTKDIDGDVKVTPQKNSMNLKLKAENQKISLEYDLSALDIMAWA
YYGDENIKTVEDYNKWIDGKNIVDFLDEKGNDWSIVTEIQKKDANGKYKTIETISISDKA
DEPIDYIDKTMKNGDEYRIIKKLIKTGGMDFVVFKDVQETIAKVDNIEVKSDNENQSNDG
IYEIKNSIEDTSETGKSMVRRVLKDTSNMEIKDGKNYLTLELNPQGMLDNYRILVDGSQV
NYEKEDLDNGLLKIKFEVPSLDSKVSMKLYVIPMARDVQFTVAHDKDSAKLISGNNENKD
NKPVIDNSNDIKPNTTKPIENKTSNNGLNIAKVDSKATEKLEDEVIKGKLYSVQNTVSHD
RQIGREMARKYLEKTSKIEEIDGNMYATITFNNSQFMKEFKIGVNGQDVNYEIVGRNGDL
LSLRFAIPNIDANVKVRMFVIPMNSNVEFGVNFLKDTLNLEKEYEVKKSELKQGGKLPYT
GGMASGGLVTALGSMLLAAGSFMSRRKRK
NT seq
3330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaatttatcaaaaactttagctatgctagtatttataacaaatgcaggagta
atggtaactccaacatttgcagacactctaaatccagaatcaaaggtagtaagttcagag
ggaaaagtggaattaaatatgccagtaaaagcattaaaagccactgcaaaggtaattgaa
gataaagataagagtgaaaatcaatggtgtcatgatttattaatagaatttgattcaagt
gatgaagataaggaaagagatttctatgataagattacttcagttaaggtaaacggagta
gaatatacaaggagttattcaagtgaagataagacttatacagctagtaagctttacggt
ggtttagatattagaagcttaaattttaaagatgatataaatgctatagaaattaagtct
acaggttattatgatacacttatagaagttaaaaaagatggaagtgaattaacttctaaa
ttaataaacaatgaaaatgtggatagtgaaaatcaagaagatataaaaaataatgataat
aaatcattaaattccaatgtattagagacaagtgtaaagaaagaaaaaactgacaatgag
aatttagaaaaagataatactatagaaaataatcttaataatcttgaagatggagtttat
acattaaactttgaagcttttaaagaagagaatccaagtgaaagttcaatgctaggtgga
ttttttgataagaatgtaaaacttgaagttaaagaaggaaagaagaccttaacattttta
aatataattatgccaagtatgctttatgattttaggttagactgtaatggggagtttaaa
gaaagtaaagcagaagatcttggaaatattaatgcaaatggagaacataagtataagagt
tttacagtagaagctggtgatttaatggtatcaaatactgtagcagttcttgttagcgct
atgggtggacaaaaaaatgatataggtactatgggaaaatacagaaaagctatacttaac
tttgatagtaattatatagaaggctggaatggatttgaacaaataaataatgaagttgaa
gaaggtcaaagattaaataaggtacttattgaaaaaggttttgatatagataaaaatggt
gaagttacagcagaggaagtagctaaatactctcaagatactttaagtttatcagggaaa
gaactaacagacatatcattattgaaaaatcttaattcaaatatagaagaattaaattta
gcagccaataatattaaagaattaccagaaggaatatttgataatttagttaatttaaag
acattatctttaaattcaaacttaattgaaagtttaccagaaggaatatttgataaatta
actaaattagaagagttacaaataagtaatttaaaaataaaaagtttagatgctaattta
tttaaaaatcttaagagtcttaaaagcttagagctagtagaaaataaagaattagaagaa
ttaccagagggtatatttaacggattagattcacttgaaggaatttatatgtatgatggt
tccttaaataaattaccttcatcaatatttacactaactaatttaaatggcttacattta
tggaataataaattagaagtattaccagatggatttaataaacttactaatttaagagag
ttaactttaaataagaatgttataagagaactacctaagtcaatatatcaacttaaaaat
ttaacttctttaagtttagaaaataatgaattaacatcagtaccaaataatataagagaa
ttattccctaaattatatggattagatcttactttaaataaacttgaaaatacaaaggat
atagatggagatgtaaaagttacaccacaaaaaaattcaatgaatttaaagctaaaagca
gaaaatcaaaaaatttctctagagtatgatttatccgcattagatataatggcttgggca
tattatggtgatgaaaatattaaaacagtagaagattataataagtggattgacggaaaa
aacattgtagactttttagatgaaaaaggtaatgattggagtatagttactgagattcaa
aagaaagatgcaaatggaaagtataaaactattgagacaatatctatatcagacaaagca
gatgaacctatagattatattgataaaactatgaaaaatggtgatgaatatagaattata
aaaaaattaattaaaacaggtggaatggattttgtagtatttaaagatgtacaagaaaca
attgccaaagttgataacatagaagttaagagtgataatgaaaatcaatctaatgatggg
atttacgaaattaaaaatagcatagaagatacaagtgaaactggtaagtcaatggtaaga
agagtattgaaagatacaagcaatatggaaattaaagatggaaagaattatttaacttta
gaattaaaccctcaaggaatgttagataattatagaattcttgtagatgggtcacaagtt
aattatgaaaaagaagatttagataatggattattaaagataaagtttgaagtaccaagt
ttagattccaaagtatctatgaagttgtatgtaattccaatggcaagagatgtacaattt
acagtagcacatgataaagatagtgcaaaattaattagtggtaataatgaaaataaagat
aataaaccagtaatagataatagtaatgatataaagccaaatacaactaagcctatagaa
aataaaacttctaataatggattaaatattgcaaaggttgatagcaaagcaactgaaaaa
cttgaagatgaagttataaaaggtaaattatatagtgtacaaaatacagtttctcatgat
agacaaattggaagagaaatggctagaaaatatttagaaaagacttcaaagatagaagaa
atagatggaaatatgtatgcaacaattacatttaataactcacaatttatgaaggaattt
aaaataggagtaaatggacaagatgttaactatgaaatagttggaagaaatggggaccta
ttaagcttacgatttgcgattcctaatatagatgctaatgttaaagtaagaatgtttgta
atacctatgaattccaatgtagaatttggagttaatttcttaaaggatactttaaatctt
gaaaaagaatatgaagttaaaaagtcagaattaaaacaaggcggtaagttaccatataca
ggtggaatggcatcaggtggattagttactgcattaggttcaatgttattagcagcagga
tcatttatgagtagaagaaaaagaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
