Cinclus cinclus (white-throated dipper): 134054099
Help
Entry
134054099 CDS
T10813
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
ccic Cinclus cinclus (white-throated dipper)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
fn3
Ig_3
Ig_2
ig
Ig_DSCAM-DSCAML_C
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
134054099
NCBI-ProteinID:
XP_062365547
LinkDB
All DBs
Position
27:complement(6981866..7010925)
Genome browser
AA seq
2535 aa
AA seq
DB search
MSSHQTVKIFKKSPIPGVAITQFVNDVPQGCSTPDFEKKPLTLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PAPEVKWSRTRKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIKSLVLDDSDLYRCCAVNAYGEASCC
AGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKTLLDSKKLLRKRVAAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DKRDYEKICMKYGIVDFRGMLRKLQEMRKDTETEQEKLIHSLKNFEHIRVNKEGNATFSL
EMELKNSNSNVYLLKDGERLRYGMGDEYRKHCLRRVGRRYYFTVNDVQPEDAGVYQVRVE
DVPVFSTELDAQAIPARFRQPLSDVCCAEAGDAEFQCVLCTPCHKPLWLHKSHPLQASDK
HQMSVTPDGLTHKLIVRNVGPSDSGLYTLDVGQGSSSAWLLVEYAKGKRQQDEGEKTERE
TSEWLKETMADNERARKLRRQEQAAAEDRPSFSTSSGVEKSGWYRTGQGSSRGRGQGHSI
DSDDGIQRFLGKEGLRKTHINGEVVSGQFSGAGLDGDSAANDGSIFGLKGLEGRSRLRPV
HSMDSVSGRAGPGGAVGGAGEWNSVDGRGEGVLGAANTDMDDGEGLGSQHEKDLSDASYR
AGFGGAGSSGAGSSVPDGLDPDSTGVGASVGDLSPHSKDGHPTVGDMNGAGINREGQTRT
VYGKNGLTPHASGHLGQTGRSGSLCGPRGLPGGDQAIPGAGGNSRGEMEAFYGPDGQALG
AGDGVSGAGGFGSPYGKDGLPAGAGAGVSGAGGVGGPYGKDGLPGGAGFDGAGGAGSPYG
KNGLPAGPGAGGGGIAGAGAGGFESPYGKDGLPAGAGVGVSGAGGVGGPYGKGGLPGVGG
AGVGGFGAPYGKDGLPAGVGFGGVGAGGFGAPYGKDDFPIGAGVGSAGGAGGVGGPYKND
GLPVAAGVGGAGGTGGVGAPYGKDGLPGGASGAGAGGFGEALYGPDGRTLGAGVGAVGAG
GFGSPYGKDRLPVGAGFGGAGDAGGLRSPYGKDGLPGGAAGAGVGGAGSASARGIGGPYG
KDGLPVGAVVSSAGGVGGPYGKDGFTAGAGAGGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGA
GGSYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAG
AGVSGAGGAGGHYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGSYG
KDGLPVGAGAGVSGAGGAGGSYGKDGLPVGVGAGVSGAGGAGGSYGKDGLPVGAGAGVSG
AGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGSYGKDGLP
VGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGSYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAG
GSYGKDGLPVGVGAGVSGAGGAGGSYGKDGLPVGVGAGVSGAGGAGGSYGKDGLPVGVGA
GVSGAGGAGGSYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGKDGLPVGAGAGVSGAGGAGGPYGK
DGLLAGAVAGAAHFSVGGQEAMGSGRGMDAMLSGAPGYAGGEGFSGEGFALWGAGSLYDK
DRGSAVAMAGAGGVWGSGRNEWDSVSGKGGVGGAGGPGGEYGLDAHLGRSLRGQTGKSTA
SDVRGPGNKGSAGDRGSGPGGDRGEGQDFRQLGSLYGTNSAFGGAGSKSHDRSVDGSSSG
GFGEGPLSYGQMSGPCGGPPSANQRNEEPGLDLKANNFLNNTESTGQRRRSVLDDLKVPR
CYLNKQLATVRVLKGDPAELSCTVSKDNVTGTWFKDGLKLTSMDGVVFEKKGLVHKLIIN
KVEDIHAGKYRFEGGDVKTEASIFVEDPPQVDKILLKNLTSVPTVAKAGEGLKLRIPFEG
RGPIRAAWLKDRMELGDDTRIRVDKTDTCTMLSISSCDRRDCGDYKVRLKNDSGVLEINL
KLMVIDKPQPPAGPIKTVERSANNITIQWKPPEDDGGKPVQRYLVERQQVGRNDWETLGE
TPRSCTSFTTSKVEEEMSYYFRVRAVNAEGVSDALESEEVKAAGKASPGAPDAPEIISTS
RDTITISWKAPCKTGASQITGYIVQKRKKGTVTWLPVTNVPVKDKKLKVTSLKKGVQYEF
RVAAVNAAGTGQPSDPSEPAFARDPTKSPGQVQDLKVSSSDSTSVTLTWNKPEVQDGNDV
KGYEVEMRPCNSLSWTKCFTLPAESTSCRVQGLQAREKLFLRVRALSDGGPGEPSELKAC
AGAAAAVVSPRLLIDDTVKSFLVIKAGNPIRVKIPFEGSPELVVTWLKDGLPLPSQAVVS
TEDGSTQLLIRAAEFSDSGTYTVELGDELGKRETFSFQVQIADIPQPPGAIRLEENVPNT
VTVTWDPSASEQWEKNLYYTVLKRESQKGLWHVLGDLIYNNKFTFTRVVPGRDYYFRVVA
KNNLGASDPSDTVQPWRIWKKKAEFRVKAQKYRGINQNQHPRFLVPLKSHVVVTGSECHM
SCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSRDPNYFCTNDFGVCSLVVLGVTKQDAGEYMVEASNEVG
RAYSKAFLTIKDSSL
NT seq
7608 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcagccatcagacagtaaaaatcttcaagaaatctcctatcccaggagttgctatc
actcagtttgtaaatgatgttccacagggatgcagtacacctgattttgagaagaaacca
ctcactctgacactccaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccagctcctgaggtgaaatggtcgcgtacacggaagggaatggatgatcctgccaaatat
gaaatgtccttcaatagtgctacaaatgaattcattctgcagatcaagagcctggttctg
gatgacagtgatttgtatcgctgctgtgctgtcaatgcctatggagaggcctcgtgctgt
gctggcctcaggatcatccaagttggctttaagaggaaggcaaaatatgttcctgttcat
gctgctgatgagctcaagaagacactcctggactccaagaagctgctgaggaagagggtt
gcagcaccaaaaccaaagcccctggacaaagaagctgtgtggcagctgttgctgcatgca
gataagagagattatgaaaaaatctgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatg
ctaaggaagctgcaggagatgagaaaggacacagaaactgaacaagaaaagttaattcac
agtctcaaaaactttgaacacatcagagtcaataaggagggaaacgctacattcagcctg
gagatggagctgaaaaacagcaacagcaatgtttacctgctcaaggatggcgagcggctc
cggtacgggatgggggatgagtacaggaagcactgcctgaggagagttggcaggaggtac
tacttcactgtcaatgatgtgcagccagaggatgcaggggtgtaccaggtcagggtggag
gacgtccctgtcttctcaactgaactggatgctcaagccatcccagcgcggttccggcag
ccgctctcggacgtgtgctgtgccgaggccggggatgctgagttccagtgtgtgctgtgc
acgccctgccacaagcccctgtggctgcacaagagccacccccttcaggccagtgacaag
caccagatgtctgtgacacccgatggcctgacccacaagctgattgtcaggaacgtgggg
ccctcggacagcgggctgtacacgctcgacgtgggacagggttcctccagcgcctggctc
ctcgtggagtatgccaaaggaaagaggcagcaggatgaaggagaaaagactgaaagggag
acatctgagtggctgaaagaaacaatggcagacaatgaaagggcgaggaagcttcggcga
caagagcaagctgctgctgaagatcgtccttccttttccacatcatctggtgtggagaaa
agtggctggtacagaactggtcaaggcagcagccgaggcaggggccaaggacactccatt
gattctgatgatggaatccaaagatttttgggaaaagaggggctacgcaaaacccacata
aatggagaggtggtgtctgggcaattttctggagcaggcctagatggagattcagcagcc
aatgatggcagcatctttggactaaaaggcttagaaggcagaagcaggttaaggcctgtc
catagcatggactctgtgtcaggcagagcaggtcctggtggtgcagtaggaggggcaggt
gaatggaattctgtggatggcagaggtgagggtgtgctgggtgctgctaatactgacatg
gatgatggagaaggtctgggctctcagcatgagaaggacttaagtgatgccagttacaga
gctggttttgggggtgctggcagttcgggtgctggaagttctgtgccagatgggcttgat
cctgattcaactggagtgggagccagtgtgggtgatctgtccccccacagcaaggatggg
catcccactgtgggtgatatgaatggagcaggtataaacagagagggacaaacaagaact
gtctatggcaagaatggcctgacgcctcatgctagtggtcacttagggcagacaggaaga
tctggctcattgtgtgggccccgaggccttccaggtggagatcaggctatacctggtgct
ggtggcaattccagaggagaaatggaggctttctatggtccagatggtcaggcactggga
gcaggtgatggtgttagtggtgcaggaggatttggatctccatatggaaaggatggtctc
ccagctggagcaggtgctggtgttagtggtgcagggggggttgggggtccctatggaaag
gatggtctcccaggtggagcaggttttgatggggctggtggtgctggttctccctatgga
aagaatggtctcccagcaggaccaggtgctggtggtggtggtattgctggtgctggtgca
ggaggatttgaatctccatatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgttggtgtt
agtggtgcagggggggttgggggtccttatggaaagggtggtctcccaggtgttgggggt
gctggtgtagggggatttggagctccctatggaaaggatggtctcccagccggggttggt
tttggtggtgttggtgcagggggatttggagctccctatgggaaggatgattttcccatt
ggagcaggtgttggtagcgctggtggtgcaggaggagttgggggtccctataaaaatgat
ggtctcccagttgcagcaggtgttggtggtgctggtggtacaggaggagttggggctccc
tatggaaaggatggtctcccaggtggggctagtggtgctggtgcaggaggatttggagag
gctttgtatggtccagatggtcggacacttggagcaggtgttggtgctgttggtgcaggg
ggatttggatctccctatggaaaggatcgtctcccagtgggagcaggttttggtggggct
ggtgatgcagggggactcagatctccctatggaaaggatggtctcccaggtggggctgct
ggtgctggtgttggtggagctggttctgcaagtgccaggggaattggaggtccctatgga
aaggatggtctcccagttggagcagttgttagtagtgcagggggagttgggggtccctat
ggaaaggatggtttcacagctggagcaggtgctggtggtgcaggaggagctgggggtccc
tatggaaaggatggtctcccagttggagcgggtgctggtgttagtggtgcaggaggagct
gggggttcctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtgttagtggtgca
ggaggagctgggggtccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtgtt
agtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggt
gctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggtcactatggaaaggatggtctcccagtt
ggagcaggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaaggatggt
ctcccagttggagcgggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggttcctatgga
aaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggt
tcctatggaaaggatggtctcccagttggagtgggtgctggtgttagtggtgcaggagga
gctgggggttcctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtgttagtggt
gcaggaggagctgggggtccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggt
gttagtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaaggatggtctcccagttggagcg
ggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggttcctatggaaaggatggtctccca
gttggagcgggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaaggat
ggtctcccagttggagcaggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggttcctat
ggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctggg
ggttcctatggaaaggatggtctcccagttggagtgggtgctggtgttagtggtgcagga
ggagctgggggttcctatggaaaggatggtctcccagttggagtgggtgctggtgttagt
ggtgcaggaggagctgggggttcctatggaaaggatggtctcccagttggagtgggtgct
ggtgttagtggtgcaggaggagctgggggttcctatggaaaggatggtctcccagttgga
gcaggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaaggatggtctc
ccagttggagcgggtgctggtgttagtggtgcaggaggagctgggggtccctatggaaag
gatggtctcctggctggggctgtggcaggagctgctcatttttctgttggaggtcaggaa
gcaatgggatctggccgtggcatggatgccatgctaagtggagctccaggatatgcagga
ggagagggcttttctggggaaggctttgcactgtggggtgcagggtctctctatgacaag
gacagagggtcagctgtagccatggctggtgcaggtggagtttggggatcaggaaggaat
gaatgggactcagtcagtggtaaaggaggtgtgggaggtgctggtggaccaggtggtgaa
tatggcctggatgcacatcttggcagatctttgagaggtcaaactggaaagagcactgcc
agtgatgtcagaggaccagggaacaaaggttcagctggtgacagagggtcaggtccagga
ggagacaggggagagggccaagatttcagacagttgggttccctttatggcacaaattct
gcctttggaggagcagggagtaaatcccatgacagatctgttgatgggagtagttcaggt
gggtttggtgaaggtccactgagttatggccagatgtcaggtccttgtggtggacctcct
tcagcaaaccagagaaatgaggaacctggcctggatcttaaagcaaacaatttcctgaac
aacacagaaagcacaggacaaaggagacggagtgtcctggatgatctcaaagtcccgcgc
tgttacctcaacaagcagctggcaaccgtgcgagtgctgaagggggacccagctgaactg
tcctgcactgtcagcaaggacaatgtgacaggaacctggtttaaggatggcctaaagtta
acaagcatggatggagttgtctttgaaaagaaaggtcttgtccacaaactgatcattaac
aaagtggaagatattcatgctgggaaatacaggtttgaaggtggagatgtaaaaactgaa
gcttcaatttttgttgaagatcctccccaggtggacaaaatcctgctcaagaacttgacc
agtgtccccacggtggccaaggctggggagggattgaagctgcggatcccatttgagggt
cgggggcccatcagggcagcgtggctgaaggacaggatggagctaggggatgacactagg
atccgtgtggacaagacagacacctgcaccatgctgtccatctccagctgtgacaggagg
gactgtggggattacaaagtcaggctcaagaatgacagtggtgtcctggagatcaaccta
aaactcatggtgatagacaagccacaacctccagcaggacccatcaaaactgtggaaaga
tctgctaacaacatcacgatccagtggaagcccccagaggatgatgggggcaaaccagtg
caaaggtatctcgtggagaggcagcaggtgggcaggaacgactgggagactttgggagaa
acccccaggagctgcaccagcttcaccacaagcaaagtggaggaagagatgagctactac
ttcagggtgagggctgtgaatgctgagggagtgagcgatgcgctggaatcagaggaagtg
aaggctgctggtaaagcttcccctggtgccccagatgcccccgagatcatcagtaccagc
agggacaccattaccatatcctggaaagctccttgtaaaactggtgcttcccaaattacg
ggatacattgttcagaaacgcaagaagggcactgtgacctggctgccagtcaccaacgtg
cctgtcaaagacaagaagctgaaggtcaccagcctgaagaagggtgtgcagtacgagttc
cgcgtggcagctgtcaatgctgctggcacgggacagcccagtgacccctccgagcccgca
tttgcccgggaccccaccaaatctccaggccaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagt
gacagcaccagtgtcaccttgacatggaacaaacctgaagtacaagatgggaatgatgtg
aaaggctacgaggtggagatgaggccctgtaacagccttagctggaccaagtgcttcact
ctccctgcagagagcacctcgtgcagggtccagggcctccaggccagggaaaagctgttc
ctgcgcgtcagggccctcagtgacggtggccccggggagccctcggagctcaaggcttgt
gctggagctgctgctgccgtggtctctcctaggttactgatagatgacacagtgaaaagc
ttcctggttataaaagcagggaatcccatccgggtgaagattccctttgagggatctcct
gagctggtggtgacctggttaaaggatgggctcccccttcccagccaggctgttgtgagc
accgaggatggaagcacccagctgctgatcagggcagccgagttcagtgacagtggcacc
tacactgtggagcttggggatgagctggggaaaagggaaaccttcagcttccaggttcaa
attgcagatatccctcagccccctggagccatccggctggaggagaatgttcccaacaca
gtcacagtgacctgggacccctcagcatccgagcagtgggagaagaacctgtattacaca
gtcctgaaacgggaatcccagaagggtctgtggcatgtgctgggggacctgatctacaac
aacaagttcaccttcaccagggtcgtcccaggcagggattattacttcagggttgtggca
aaaaataacctgggagccagtgatccatcagatactgtgcagccctggaggatctggaaa
aaaaaggctgaatttcgagtgaaagcacagaaatacaggggaattaaccagaaccagcac
ccgaggttcctggtgccacttaagtcccacgtggtggtgacaggcagtgagtgtcacatg
agctgcgccgttggaggccatcctcccccaaaaatcacatggtataaggacagcagagac
ctctccagagatcccaactacttctgcaccaacgactttggagtgtgctccctggtggtg
ctgggggtcaccaagcaggatgcaggggagtacatggtggaagccagcaatgaagtgggt
cgtgcctacagcaaagccttcctcaccatcaaagactcctctctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
