Clostridium carboxidivorans: Ccar_01180
Help
Entry
Ccar_01180 CDS
T03979
Name
(GenBank) transporter
Organism
cck
Clostridium carboxidivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKN29527
LinkDB
All DBs
Position
234400..237486
Genome browser
AA seq
1028 aa
AA seq
DB search
MSVTEISVKRPTAVWMAVVLILALGVFGYKSMGSSLLPDMNMPILSIMTTYNGASAEDIK
KDIVKPIEDSVSGISGVDTISSTSQEGSGSVMIKFKSSANMNTAYLDVQKAMDNASRRLP
KDADKPTIFKMDTNAIPILVVSLNGNANSDELYNEGDTLKQKLEKIPGVGQVSIMGAQKK
ELVIRIDKTAMEYYGVSTNTISSKIQAANTTVPAGQIKQDNMNQSVRVIGQFNNIDSVKN
MLIPTTAGGTVRLGDIAKVSLEAPEDTSIMRYKGKKTLAVVISKQSDANVVEVADTVKKE
LQSMKKDIPSGINMDIAMDTTTFITSSLVQIKHNLIEGIITTAIVLYLFFRSLRSSLVVL
VAIPTSLIATFFMMYELHFSMNMLSMMGLSLVVGTLVDDSIVVIENIQRHFDMGKPPIEA
AIGGRKEVGLAAIAISFCDMVVFAPISLMSGQIGQMFKEFGLTIVVATVFSLIVSFTVTP
MLSARLLKKTEESTKEKSGLFTKSIEIYRGLIIKSLHHRGKVVIAFIIGLIFSVALIPMG
LVKLENMPKYDQSEFTIDIKLSAGATLKQTDEKVAQVENYLNGLKEVKSYYSSIGASGRN
SQAASGQITVNLVPKDKRKKGQTELVSQVRDFGSKNLTGVDFNVSESESGSSGASKPIAI
EIKGSNSDTIKELSKEVEDIIKKVPGVTDIGSSAEQTDNEIKVNIDNLAASQYGLSTSDI
GSTIRVALAGSSAGTYRANDNENDITLKFMDGQIKSVEDIKNMKIANQSGQQIAVSQVAT
VEKADTKQSISREDKQDIVTVSANIAQGKSLGEVSKAIDSKLKATTIPSGYTVSFGGDRK
SMDDSFSSLGKALAASVALVYMILVVLYQSYLTPAIRMLSLPSAIMGALIALALTGQSIN
TMSFIGIIMLEGLSSKNGTLLIDYTNTLMDRGMSLREALVESAITRLRPIVMTTSTIIVS
MLPVALSLGEGAELKKSMGIVIIGGMLMSTVLTLFVIPVVYTLMEDFKNFIFRKRKSKNV
GGRGQYEV
NT seq
3087 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgtaactgaaatatcagtaaaaagaccaactgcagtgtggatggctgtagtatta
atacttgcactaggtgtatttggttataaaagcatgggatcaagcttattaccagatatg
aatatgcctattttatcaataatgacaacatataatggtgcaagtgctgaagatataaag
aaagatattgttaagcctatagaagattcagtatcaggaataagcggcgttgacactatt
agttccacttcccaagaaggaagcggttctgttatgataaaatttaagtcaagtgctaat
atgaatacggcatacctagatgtgcagaaagctatggacaatgcatctagaagacttcct
aaagatgctgacaaaccgactatatttaaaatggatactaatgctattccaattctagta
gtttcattaaatggaaatgctaattctgatgaattgtataatgaaggggatacattaaag
caaaaattagaaaaaatacctggtgtaggacaggttagtataatgggcgcacaaaagaaa
gagctggttataagaattgataaaactgctatggagtattatggagttagcacgaatacc
atatccagtaaaattcaagcagctaatacaactgtaccagcaggacaaattaagcaggat
aatatgaatcaatcagttagagttattggacaatttaataatatagattctgtaaaaaat
atgttaatccctacaacggctggcggaactgtacgtcttggtgatattgctaaagtaagc
ctagaagctcctgaagatacatcaataatgagatataagggaaagaaaactttggcagtt
gtaattagcaagcaaagtgatgctaatgtagtagaagtagcagatactgtaaagaaagaa
ttgcaatcaatgaaaaaagatattccaagtggaattaatatggatattgcaatggatact
actacttttattacttcttcattggttcaaataaagcacaatcttattgaaggaattata
actactgcaatagtgctttatttattcttccgtagtttacgttcttctttagttgtttta
gttgcaatacctacatcacttatagctactttctttatgatgtatgaattgcatttttca
atgaatatgctgtctatgatgggattatcccttgttgtaggtactctggtggatgactct
atagttgtaatagaaaatatacagaggcattttgatatgggaaaacctcctatagaggca
gctattggtggtcgtaaagaagtaggactagcagctatagcaataagtttttgtgatatg
gttgtatttgcacctatttcacttatgtctggacaaataggtcagatgttcaaagaattt
ggtctaactatagttgtagctacagtattttcgcttatagtatcatttacagtaactcca
atgctgtcagcacgtttacttaagaagacagaagaaagtactaaagaaaaaagtggatta
tttactaaatcaatagaaatttatagaggtttaattataaaatcattacatcatagagga
aaagttgtaattgcttttattataggattgatatttagtgtggctcttatcccaatggga
ttagtaaaattggaaaatatgccaaagtacgaccaaagtgaatttactattgatataaaa
ctatcagctggagctacattaaagcaaacagatgaaaaagtggcacaagtagaaaattat
ttaaatggactaaaagaggtaaaaagctactattcatcaattggagcaagtggacgaaac
tcccaagcagcttcaggacaaattactgttaacttagttccaaaggataagcgtaaaaaa
ggccaaactgaacttgtaagtcaagttcgtgattttggaagtaaaaatttgactggagta
gactttaatgtatcagaatcagaaagtggttcaagtggtgctagtaagccaattgctatt
gagataaaaggtagtaattcagataccataaaggaattgtcaaaagaggttgaagatata
ataaagaaggttccaggtgttacagatattggaagctcggctgagcaaacagataatgaa
attaaggtaaatatagataatcttgctgcttctcaatatggtctttctacttcagatata
ggaagtactattagagtagcattagcaggcagcagtgcaggaacatatagagcaaatgat
aatgaaaatgacataactcttaagttcatggatggacaaataaaaagtgttgaagatata
aagaatatgaaaatagcaaatcaatcaggtcagcaaatagcagtaagtcaggttgctact
gttgaaaaagcagatactaaacaatcaatatcaagggaagataaacaggacatagttact
gttagtgctaacattgctcaaggaaaatccttgggagaagtatcaaaggctattgacagt
aaattaaaagcaactacaataccttcaggttatactgtaagctttggtggagatagaaaa
agtatggatgattcattttcatctcttggaaaagctttagcagcttcggtagctcttgtt
tatatgatactggtagtactttatcaatcatatttgactccagctataagaatgttgtcc
ttgccttcagctataatgggagcacttattgcattggcactaacagggcaaagtataaat
acaatgtcgtttattggtataatcatgcttgaaggattgtcgtctaaaaatggtacattg
cttatagattatactaatactcttatggatagaggaatgagtttaagagaggctcttgta
gaatcagcaattaccagattgagacctatagtaatgactacatctacaataatagtttca
atgcttccagttgcactatctcttggagaaggtgctgaattgaaaaagagtatgggcata
gtaataataggtggtatgcttatgtcaacggtacttaccctttttgtaataccagtagtt
tacacattaatggaagattttaagaactttattttcagaaaaagaaaatctaagaatgta
gggggtagaggacagtatgaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
