Clostridium carboxidivorans: Ccar_09720
Help
Entry
Ccar_09720 CDS
T03979
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K18887
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
cck
Clostridium carboxidivorans
Pathway
cck02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cck00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
Ccar_09720
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cck02000
]
Ccar_09720
Transporters [BR:
cck02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
Ccar_09720
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_15
ABC_ATPase
DUF3584
RsgA_GTPase
60KD_IMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKN31115
UniProt:
C6PPW4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2239500..2241227)
Genome browser
AA seq
575 aa
AA seq
DB search
MKFLIKYIKNYWKLFIAAVIFLTIEALCDLMQPTIMSKIIDIGVANKQMDYVMNKGLIML
LITALGAAAACGRNILSNYVSQKFSAELRLDLFKKIQGFSFDNLDKFKGASLVTRLTNDV
TQLQNFCNGLMRIFVKAPLVCIGSIIMAAKLNPRMSLVLVVVVPIVIIFIFTNMQIGYPF
FIKVQKALDRVNTVMREYLSGVRVVKAFNKFDYEIKRFEGANGELASASTNAMRLMSVFS
PSIRLTVNLGIVAVIWIGGFRVNDGNMYVGQVIAFINYMTQILFSLMMISFVFTVFVRAR
ASAERIGEVFMEKNERNDSGAIKINAKTKGRVDFEKVYFSYATNKGEPIIKDVTFSCMPG
ETIGIIGATGAGKTSLVNLIPCFYNVTSGAVKVDGIDVKYIDLKNLRQKISIVPQKSILF
TGTVKDNIIWGKENASDEEIRNAAIMAEAHDFISSFPEGYETKIGQGGVNFSGGQKQRIS
IARALIKKPDILILDDCTSAVDAATEAKIRLSLKKHFKNLTCFIIAQRITSVMEADKIIV
MDNGEIAGVGKHEQLMKSCNIYKEIFYSQIGKEVV
NT seq
1728 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaattcttaataaagtacataaaaaactactggaaattgtttatagcagcagtaata
ttcttaactattgaggccttgtgtgatttaatgcagcctacaataatgtctaagataata
gatataggtgtcgcaaataaacaaatggattatgtaatgaataaaggacttataatgctt
ttaattacagcacttggtgcagcagcagcttgtggaagaaatattttatccaattatgta
tctcaaaaattttcagcagaacttagactggatctttttaagaaaatacaaggtttttcc
tttgataatttggataaatttaaaggggcatcacttgtaaccaggttaactaatgatgta
actcaactgcagaatttttgtaatggacttatgagaatttttgtgaaggctcctcttgta
tgtataggaagtattataatggctgctaaacttaatcctcgcatgtctttagtattagtt
gtagttgtgccaattgtaataattttcatatttactaacatgcaaattggttatccattt
ttcattaaggttcaaaaggctttagacagggtgaatactgtaatgagagagtatttatct
ggagttcgagtagttaaagcctttaataagtttgattatgagattaaaagatttgaaggt
gcaaatggggaattggcatcagcatctactaatgcaatgagattgatgtctgtgttttca
ccaagcataaggttaacagtgaacttagggatagtagcagttatctggattggaggattt
cgtgtaaatgatggaaatatgtatgtaggtcaagtaattgcctttattaattatatgaca
caaattcttttttctcttatgatgatatcttttgtttttacagtatttgttagagctagg
gcttctgctgagcgtataggtgaagtatttatggaaaaaaacgaaaggaatgactctgga
gctattaaaataaatgctaaaacaaagggtagggtagattttgaaaaggtctatttttca
tatgctacaaataagggagaacctataattaaagatgttacatttagctgtatgccaggg
gaaacaataggaatcataggagctacaggcgcaggaaaaacaagtcttgttaatttgata
ccttgtttttacaatgtaactagtggagcagttaaggtagatggaatagatgtcaagtat
attgatttgaaaaatttaagacaaaaaatatcaattgttcctcaaaaatctatattgttt
acaggtactgttaaagataatataatttggggaaaggaaaatgcttcagatgaagaaata
aggaatgcagcaattatggccgaggctcatgattttatttcttcctttccagaaggttat
gaaacgaaaataggtcagggaggcgtaaatttttcaggaggtcaaaaacagcgtatttcc
attgcccgtgcattaattaaaaaaccagatattctaatattagatgattgtacaagtgct
gtagatgcagcaacagaagcaaaaattagattatctttaaagaagcattttaaaaatctt
acttgctttataatagctcagcgtattacaagtgttatggaagctgataaaataattgta
atggataatggtgaaatagctggtgttggtaaacatgagcagcttatgaaaagttgcaat
atctataaagaaatattttattcacagataggtaaagaggtggtgtaa
DBGET
integrated database retrieval system