Clostridium carboxidivorans: Ccar_12265
Help
Entry
Ccar_12265 CDS
T03979
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
cck
Clostridium carboxidivorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cck02000
]
Ccar_12265
Transporters [BR:
cck02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
Ccar_12265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
DUF4064
YchF-GTPase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKN31595
UniProt:
C6PY62
LinkDB
All DBs
Position
complement(2791280..2793265)
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MYSKIAINNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALIDVKSSNAQYISRLIEI
MSGVSVFVSMILGSLILYANNFLIKKRKKELGIYMTLGMGKRKVSRIIVTETSIVGAISL
IAGIILGMAVSQVLSIFTLKLFEISINEYRFALSTSAVTKTALYFGIMFLIVMIFNIFVI
SKYKIIDLLTAGRKNENIKFKSSFVYLLAFILCVVLLGFTYSSLLKIGLDTRNTMFKPLI
VLLIVGTVLFFFSLSGFILYIVNKNKNLYLKGLNIFVVKQINSKVNTNFISMSVICLMLF
MTILVLSTGISIKKDFEVGLKKEAPFDASITINNHSENLEDVLKKIDFKINENEKYATYN
EYRSDVKVGDLLSTTNEDNKDSKVFFIKISDYNKMLKLRNKKEVSLNKDEVLIMSNYKDM
VKLIDEKFKSSKKVNIKGKEYSVKNDEIIDENLADYTMQDTYLTIVIDDEFLPKPNKIYR
SILNVMYSDKNRKQNNKKYSEIHENLLKHKYKDLSISNMDAYSKDDIYSRSKSGTTAVLF
IGIYLGIIFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLIYFSLP
VMIALIHSIIGITVVNDELSKFNQTDIRFSALITALLFIVVYAGYFCTTYTGYKNIVKNN
I
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattctaagatagctataaataatattaagaagagttataaggactatactatatat
ttcttaacactaatattagctgtttgtatattttacagctttaattctatagattcacaa
aaggcacttatcgatgtgaaatcctcaaatgcacagtacatatcaagattaattgaaatt
atgtctggtgtgtcagtatttgtatcgatgatattaggcagcttaatattatacgcaaat
aattttttaataaagaaacgtaaaaaagaattaggaatatatatgactttaggtatggga
aaaagaaaagtatctagaattatagtaacagagacctctatagttggagctatatcctta
attgcgggtattatattagggatggcagtatctcaggttttatctatttttacattgaag
ttatttgagatttcaataaatgaatatagatttgcactttcaacaagtgctgtaactaag
actgcattatattttggaataatgtttttaattgttatgatatttaatatatttgttatt
tctaaatataaaataattgatttgctaacagcaggcagaaaaaatgaaaatataaaattt
aaaagttcatttgtatatttattagcttttattctatgtgtagtattacttggattcaca
tatagttctctattaaagatagggttggatacaagaaatactatgtttaagccattaata
gtccttttgatagtaggtacagtattatttttcttcagtttatctggatttatattatat
atagtaaataaaaacaaaaatttatatttaaaaggattaaatatatttgtagtaaaacag
ataaacagtaaagttaatacaaattttatatcaatgtcagtaatatgcttaatgctattt
atgacaatacttgtgttatctacaggaataagtattaagaaagattttgaagtagggctt
aaaaaagaagcaccttttgatgctagtataacaataaataatcatagtgaaaatttagaa
gatgtattaaaaaagattgactttaaaataaatgaaaatgaaaaatatgcaacttacaat
gaatatcgttcagatgtaaaagtaggtgatttattatccactaccaatgaagataacaaa
gatagcaaagtattctttattaaaatatctgattataataaaatgttaaagttaaggaat
aaaaaagaagtaagtttaaataaggatgaagttttgattatgtccaactataaagacatg
gttaagttaattgatgaaaaatttaaaagtagtaagaaagtcaatatcaaaggaaaagag
tattcagtaaaaaatgatgaaataatagatgaaaatcttgcagattatactatgcaggat
acttacttaacaatagttatagatgatgaatttttacctaagcccaataaaatttatagg
tctatacttaatgtgatgtattcagataaaaataggaaacaaaataataaaaaatatagt
gaaatacatgagaatttattaaagcataagtataaagacttaagtatttcaaatatggat
gcttattcaaaggatgatatttattctagaagcaagagtggaacaacagcagtattattt
attggaatatatttaggaataatattcttaataaccagcatggcagtgcttgctcttcaa
caattgtcagaagccagtgatagtatagaaagatataaagctttaaagagaattggtgca
aacaaaaaaatgatagataagacaatatttatccaaaccttgatatatttcagccttcca
gtgatgattgcattaatacattcaattattggtattacagtagttaatgatgagttaagt
aagtttaaccaaacagatattagattttcagcgctaataacagctttattatttattgta
gtttatgcaggatatttctgtacaacatatacaggatataaaaatatagtaaaaaataat
atttag
DBGET
integrated database retrieval system
