Cyphomyrmex costatus: 108780224
Help
Entry
108780224 CDS
T11118
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC108780224
KO
K22984
odorant receptor
Organism
ccoa Cyphomyrmex costatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccoa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04030 G protein-coupled receptors [BR:
ccoa04030
]
108780224
G protein-coupled receptors [BR:
ccoa04030
]
Others
Chemoreception
Insect odorant and taste
108780224
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
7tm_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108780224
NCBI-ProteinID:
XP_018403362
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
950 aa
AA seq
DB search
MHVLQLTFKILTLVGCWRPQSCSSLYLRIIYDAYTVFMIILLYTFLISQFLDIVWNVDNA
EDFTENLYAMMASVVSCSKMLSLLVNRKNINMLINVLIEKPYRPLEMDEMRIRYKFDRLI
YINTLYYTILVETTCACITVTSLFTVFSKRNLTYRAWLPYDYYSSSIIFCLTYAHQLISL
TAGSLVNVGCDSLICGLLVQICCQIEILECRLSKVSNNDDILRNCVRHHNSILQTNTLWY
TILVEATCTCVVLTSLFTDFRKGNLTYREWTPYNNTSEVIFCIVYTRQLISTIFGSMVNV
ACDSLICGLLLHVCCQLEILEYRLKKIFLGQNNLRECVCQHDCIFKFALMVNEKFKMIIA
IQFIVSTLVVCSNLYQLAKIKLTAQCFPLILYTCSMLTQILIYCWYGNEVKLKSVQLTTN
IFGMGWLTMRQSRKQNLLIIMNRSLIPIEFSSAYILTMNLNSFVSLLKTSYSVYNVLQQI
LISLCLLRKCASGLCSAGCLLDCQAIPTLHSPRVTGAYRKPESVFMCLLLLTFMLPQLMD
IILNVNNADDFTDTFYIMLAMIIAVCKMLSLLLNRKNIEILTDALVDKPFRPLEPDEIEI
RQKYNNIIRTNSIIYTIFVEITCGCMNLTSLLTDFRKGDLAYREWIPYEWSDTVYYLTYF
RQLMSLTAASIVNVACDIMICGLLLHIYSQIEILKCRVRKALRNRDDLGECVRQHDHIYK
NIAMCYVFLIMATCAGHFVVSLLTHFKKRQLILRGWIPYNYSSFVLFCFTYTHQYVGVIS
AAFINVACDSLIIGLLLHMCCQIMILQYRFKGLINGQNTLGDCVRQHHHIIQFAYATNDR
FTKIIAFQFIASTFVVCSNLYQITRTKLIIDFIIFFSLQLVDSIFEIEWIALDHKTKKSL
LIIMARAMKPIEFHSAHIFNMNLNSFVAVSIKNLLKTSYSVYNLLAQIQE
NT seq
2853 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacgtcttgcaattaactttcaagattctgacacttgttggatgttggcggccgcaa
tcgtgctcgtcactttatttgcgtataatatacgatgcatacacggtttttatgattata
ttattatatacttttttgatatcgcaatttttggacattgtctggaatgttgacaatgcc
gaagattttaccgaaaatttgtacgccatgatggcatcggttgtttcatgttctaaaatg
ctcagtttgttagtgaatcgaaagaatattaatatgttaatcaacgtactcatcgaaaag
ccgtatagaccactggaaatggacgaaatgagaattcggtacaaatttgatagacttata
tatatcaacacactctactatacaattttggtggaaacaacatgcgcatgtataaccgtg
acatctttattcacggtgttcagtaaaagaaatttaacatatcgagcatggctaccgtat
gactattattcgtctagcatcatattttgtcttacatatgctcatcaacttattagtctg
acggctggatcgctcgtcaacgtgggctgtgacagtctcatttgcggattgttggtgcaa
atttgctgccaaatcgagatcttagaatgccgactaagcaaagtatcgaataatgacgat
attcttcgcaactgtgtacgtcatcacaacagtatattgcaaacgaatacattatggtat
acaattttggtcgaagcgacatgtacatgcgtcgtgttgacatcattattcaccgatttt
cggaaaggtaatttaacatacagagaatggacaccatataacaacacgtccgaggtgata
ttctgtatcgtatatactcgtcaattaataagcacgatttttggctctatggtgaacgtt
gcgtgcgacagtctgatttgtggtttattattacacgtatgctgtcagcttgaaatactg
gagtaccggctgaaaaagatcttcctcggtcaaaacaatctgcgcgaatgtgtatgtcag
cacgactgtatatttaaatttgcattaatggtaaacgaaaaattcaagatgattatcgct
attcaatttattgtgagcacactggtggtatgttccaatttgtatcaattagcaaagata
aaattgactgcgcaatgctttccattgatattatacacatgctccatgctcacacaaatt
cttatctattgctggtatgggaacgaagtaaagctaaagagtgtccaactcaccactaat
atctttggaatgggatggttgacaatgaggcaaagcagaaaacagaatttattaataatt
atgaatcgctcattaatacctattgaattttctagcgcgtacattcttacaatgaatctt
aattctttcgtaagcttacttaaaacatcatattcggtttataacgtactacaacaaatt
ttaatttctctttgtctcctgcgcaagtgcgcaagcggattgtgcagcgcagggtgttta
ctagactgtcaggcaatccctactcttcactcaccacgcgttaccggtgcgtaccgtaag
ccggaatctgtttttatgtgcttattattgctcactttcatgttgccgcaactcatggat
attatcctgaatgttaataatgcggacgatttcacggatactttttatataatgttggcc
atgatcatcgctgtctgcaagatgctcagtctattgctaaatcgcaagaatattgagata
ttaactgatgcattggttgataaaccatttagacctttggaaccagatgaaattgagatt
cgacaaaaatataataacataatacggaccaattctataatatatacgatttttgttgag
ataacgtgcggatgcatgaatttaacatctttgcttacggatttccggaaaggagattta
gcgtacagagaatggataccctatgagtggtccgatacagtgtattatctcacgtacttt
cgtcaattaatgagcttaactgctgcgtcgatcgtgaatgttgcttgtgatataatgatt
tgtggattgctgttgcatatttattcccaaatcgagatcttaaagtgccgtgtaagaaaa
gccttgcgcaaccgagacgacttgggtgaatgtgtacgtcagcacgatcatatctataag
aatatcgcaatgtgttatgtttttttgattatggccacttgcgcaggccacttcgtggta
tcattactaacacatttcaaaaagaggcagttaatacttagaggatggataccatataat
tactcatcgttcgtgctattttgtttcacatacactcatcaatacgtaggcgtgatatcc
gcagcttttattaacgttgcttgtgacagtctcattattggtctgttattgcatatgtgc
tgtcaaattatgattttacaatatcgttttaaaggacttataaatggccaaaatactcta
ggtgattgtgtacgccaacatcatcacataatccaatttgcatacgcgactaacgacaga
ttcacgaaaatcatcgcatttcaatttatagcaagtacattcgtagtgtgctcgaacttg
tatcaaataactagaacaaaattaataatagatttcattattttttttagtcttcaattg
gtcgatagtatattcgaaatagagtggatagcattggaccataaaacaaaaaaaagtctt
ttgataattatggctcgcgcaatgaaacctattgaatttcacagtgcacacatttttaac
atgaatttaaattcttttgtagcggtgagtataaaaaatttgcttaaaacatcatattct
gtttacaatttgctagcccaaatacaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
