Clostridium cochlearium: SAMEA4530647_0939
Help
Entry
SAMEA4530647_0939 CDS
T06756
Name
(GenBank) transcriptional regulator
KO
K23253
PucR family transcriptional regulator, proline-responsive transcriptional activator
Organism
ccoh
Clostridium cochlearium
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccoh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
ccoh03000
]
SAMEA4530647_0939
Transcription factors [BR:
ccoh03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
Others
SAMEA4530647_0939
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV74322
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(927728..929167)
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MNSNFYDIYNYFKDISRNIFMNNKPSKIVDTKLITKHQNIFLTDILYVGKTSYLPKEIYK
SNYCNLLLINDAHIPIDKLFNTSCNNIIELNGDQDIYEVFNKSKDFLFNNLEIINNSAIL
LDSILKENSLNKIIEISSKLLDNPLILIDNSFKIIAYSNSYDITDIYWKENIKNGYCSYD
FIVAVNKIINLKKASKNHDTFEVICGENPVIKLVCKVTIDEKVTGYLLALSSNKPFSDND
NDTLKLISKIIGMEIKKNNLYNNIDNIAYENLLLDLLEDKILNSKILSDRLKNIKHNLGK
YFYVFSFDISNYNLNGKKNNYLSKNITNLFQGKNSIYYKNNIIMLYDFNDINLDINKAKY
TWEKFLIKNNIKLAISKSFINLLEFKKYYIQSLKALELGKILKPNYHIVFYEELQFYDLI
SFINKEINLKEYCHKSLKSLNQYDEINNTNYYHTLFLYLKNNQNSTLTAKDLFIHRNTI
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactcaaacttttatgatatttataattattttaaagacattagtagaaatattttt
atgaataataagccctcaaaaatagtagataccaaacttataactaaacatcagaatata
tttttaactgatattttatatgtaggtaaaacttcttatttgccaaaagaaatatacaaa
tcaaattattgtaatctattgcttataaatgatgcacatattcctatagataaattattt
aatacatcttgcaataatataatagaactcaatggtgatcaagatatctatgaagtattt
aataaatcaaaggatttcttatttaataatttagagataataaataattctgctattctt
ttagattctattcttaaagaaaatagcttaaataaaataatagaaatttcttcaaagcta
ttagacaatcccttaattttaatagataatagttttaaaataatagcttattccaattct
tatgatataactgatatctattggaaggaaaatataaagaatggatattgctcctatgat
tttatagttgcagtaaacaaaattataaatttaaaaaaagcttctaaaaatcatgatacc
tttgaagttatatgtggtgaaaatcctgtaataaaattagtttgcaaagttacaattgat
gaaaaagtaactggttacttattagctttatcttctaacaaacctttttctgataatgat
aacgatacattgaaattgattagtaaaataataggaatggaaattaaaaaaaataactta
tataataatattgataatatagcctacgaaaatttactattggacttattggaagataaa
attttaaactctaaaatattatcagataggcttaaaaatattaaacataatttaggaaaa
tacttttatgttttttcatttgatatttcaaactataatttaaatggtaagaaaaataac
tatttaagcaaaaacataacaaacttatttcaaggtaaaaattctatatattataaaaat
aatataataatgctttatgactttaatgatataaatcttgatataaacaaagcaaaatat
acgtgggaaaaatttttaataaaaaataatataaagcttgccataagtaagtcatttata
aatcttttagaattcaaaaaatattatattcaatctttaaaggctttagagttagggaag
atattaaaacctaattatcacatagttttttatgaagaattacagttttatgatttaatt
tcttttataaataaagaaattaatttaaaagaatattgtcataaatcgttaaaatctttg
aatcaatatgatgaaattaataatacaaattattaccataccctatttttatatttaaaa
aacaatcaaaattcaactttaacagctaaagacttatttattcacagaaatacaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
