Clostridium cochlearium: SAMEA4530647_1682
Help
Entry
SAMEA4530647_1682 CDS
T06756
Name
(GenBank) spore germination protein (amino acid permease)
Organism
ccoh
Clostridium cochlearium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spore_permease
DUF7290
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV83720
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1645344..1646489)
Genome browser
AA seq
381 aa
AA seq
DB search
MDSVNIINSNKSYFSSKHKIDSVMLALLTNRLQIINLIIFSTERLQYPHMVWLIILGGVI
SQLYIYILSRWLSSNMGKKGVIGIFDLFGNVFTKIFLFVLLCCMLIKFIIASSYYVYLLH
KYLMTQHRKLTLVLVLIISSVYLASKGFSNALKFSVIAFVFSVGILLLYILLMFNAFVSI
QDIFPLFGNVFNSNFLNSMLLIWGFFSGPEYLILIGPYIRSDVNIHKSMFIGNLMTIIEY
VAFFLGTFIFYGSDFLPYVQHSYINMINFLQFQFIQRIEMITLPVLMVNFTLSLAVILLS
SFKAIVYITGSKKIPKETTLAFFMTSSFFTFACIFFILKLFTTEIQALFWDDVLLYLSVF
TYTSIPAIIFIAILAKSRRVK
NT seq
1146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagtgttaatattatcaattcaaataaatcttatttttcaagcaagcataaaatt
gattctgttatgcttgccttactgacaaatagattgcaaataattaatcttattatattt
tcaactgaaagattacaatatcctcatatggtatggcttattattcttggcggggtgatt
tctcaactttacatttacatattgtctagatggctttcaagtaacatgggaaaaaagggt
gttatcggtatatttgacttgtttggaaatgtatttactaaaatctttttgtttgttttg
ttgtgttgtatgctcataaaattcattattgctagttcctactatgtttatctactacac
aaatatcttatgacacaacaccggaaactaactctagtacttgttttaatcatttcaagc
gtctatttggcaagtaaaggtttttcaaatgctttgaaattttcagttattgcatttgtt
ttttctgttgggattttattgttgtacatactattaatgtttaatgcttttgttagcatt
caagatatatttccgttgtttggaaatgtatttaattctaattttcttaactctatgctg
ttaatatgggggttctttagcggtcctgaatatcttatcttaattggaccgtatattcgt
tctgatgtaaacattcacaaatccatgtttattggaaatttaatgactattattgagtat
gtagctttttttcttggtacatttatcttttatggatccgattttttaccttatgttcaa
catagttatattaatatgattaactttttgcaatttcaattcatacaaagaattgaaatg
attaccctgccggttcttatggtaaattttactctttcccttgctgtaattctactttct
tcttttaaggctattgtttatattacgggaagcaagaaaataccaaaagaaaccacactt
gcattttttatgacaagctctttttttacattcgcctgtattttttttatcttaaagctt
tttacaactgaaattcaagcactcttttgggacgatgttctattatacttatccgtattt
acttacacttcaatcccagctataatattcattgcaattttagctaagtcacggagggta
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
