Campylobacter coli RM5611: YSU_00970
Help
Entry
YSU_00970 CDS
T03167
Name
(GenBank) peptide ABC transporter substrate-binding protein
KO
K25103
nickel transport system substrate-binding protein
Organism
ccoi
Campylobacter coli RM5611
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccoi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ccoi02000
]
YSU_00970
Transporters [BR:
ccoi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Nickel transporter
YSU_00970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
DUF7625
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHK74465
LinkDB
All DBs
Position
190812..192350
Genome browser
AA seq
512 aa
AA seq
DB search
MLRWFILLFLLFFNLEAKIPKDTLIVAVENEISRINPAYSEDHDAVINLVFSGLTRFDEH
MSLKPDLAASWNVSKDGLSYDIFLREDVLWHDGVKFSADDVKFSLEAFKNPKNNSSVYVN
FEDIKSIEILNPYHLKITLSKPFPAFLDALSIGMLPKHLLSDKDLNTASFNQNPIGTGPY
KFVKWKKGEYVEFKANENFYLTKVKTPRLIIKHIFDPSVASVELKNGKIDAALIDVSLLN
IFKKDENFKILRERSADYRALMFNLENEFLKDIQIRKALNYAVNKQSIVKNLLHDYGFVA
NHPLERSWADSKAFKTYEYNPKKAQDLILALGFKKNDEGIFEKDGKILDFEIWTMSNDPL
RVSLAGILQSEFKKIGVIAKVVAKPAGSFDYSKVDSFLVGWGSPLDPDFHTFRVFESSQD
SALNNEGWNFGHYHDKKVDIALQKARNTLNLEERKKYYKEFIDALYENPPFIFLTYLDFA
LVYNAKLEGVKARNLGHHGVGFTWNIYEWSKK
NT seq
1539 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcttagatggtttattttactatttttattgtttttcaatcttgaggctaaaattcca
aaagatactttaatcgtagctgtggaaaatgaaatttcaaggataaatcctgcatatagc
gaagatcatgatgcggtgattaatcttgtattttcaggacttacgcgttttgatgagcat
atgagcttaaagcctgatttagctgcgtcgtggaatgttagcaaggatggacttagctat
gatatctttttgcgtgaagatgttttgtggcacgatggagtgaaatttagtgccgatgat
gttaaattcagtcttgaagcttttaaaaatcctaaaaataattcttcagtttatgtgaat
tttgaagatattaaaagtatagaaattttaaatccttatcatcttaaaatcacgctttct
aaaccttttcctgcatttttagatgctttaagtataggaatgcttcctaaacatttactt
agtgataaagacttaaatactgcttcttttaatcaaaatcccataggcacaggtccttat
aaatttgtaaaatggaaaaagggcgaatatgtagagtttaaagctaatgagaatttttat
cttacaaaagtaaaaaccccaagacttatcatcaaacatatttttgatccttcggttgca
agcgtagagcttaaaaatggcaaaattgatgcggctttgattgatgtttctttattgaat
atttttaaaaaggatgaaaattttaaaattttgcgtgaaagatctgctgattatagagct
ttaatgtttaatttagagaatgaatttttaaaagatattcaaataagaaaggctttaaat
tatgctgttaataagcaaagtatagtcaaaaatcttttgcatgattatggttttgtagcc
aatcatcctttagagcgttcttgggcggattctaaagcttttaaaacttatgaatacaat
cctaaaaaagcccaagatttgattttggctttaggttttaagaaaaacgatgagggtatt
tttgaaaaagatggcaagattttagactttgaaatttggactatgagtaatgatcctcta
agggtgagtttggcaggaattttgcaaagcgagtttaaaaaaataggggttatagctaag
gttgtagcaaagcctgcgggcagttttgattattctaaagtagatagttttttagtgggt
tggggaagtcctttagatcctgattttcatacctttagagtgtttgaaagttcgcaagat
agtgctttaaataatgagggttggaattttgggcattatcatgataaaaaggtagatata
gccttgcaaaaagctagaaatactttaaatttggaagaacgcaaaaagtattataaagaa
tttattgatgctttgtatgaaaatcctccttttatttttctaacttatcttgattttgcc
ttagtttataatgctaaacttgagggtgttaaagcaagaaatttaggccatcatggagta
ggttttacttggaatatttatgagtggagtaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
