KEGG   Campylobacter coli RM5611: YSU_02085
Entry
YSU_02085         CDS       T03167                                 
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
ccoi  Campylobacter coli RM5611
SSDB
Motif
Pfam: VacA_C Autotransporter Spectrin_7 DUF8443
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHK74678
LinkDB
Position
418322..420601
AA seq 759 aa
MKKNASSKILLSLGVATLLYSSAFAQEINLTQSSDVGNYFEENGKDINLKNPDKYKGQDL
NIKMGVWDLPNDDYDSADYRLNIDIGKNNTLSFTHNNDQNPVYVTNLNATAKEVKTTDIV
LQASAPSVINGNLTMTSSGAGTITEDEKKGSGIILYNGNGAVEGKSANGSLTINGNFTAD
KTLFAAYGNFVKVNGTANLTNSNFGLMKRSYTDLEANNVVIVQAKDFNENILKANNNAGA
LLLKFAGDYISTDVQGKDPLEAGTIIDISDEDKYGDGEKGLVDYKLSVQNCGGNKCLVIN
GGATAAAKDKLVQLQVDIDTIDKLLKNEFDSSQGEEWEQAKETLKKQQAEIQTMLEEAKK
NGGKIDDEKYIDLVNKNLNLNLSANDKASILALRSITEQLGSIGADLASREGVKLALDIK
KDTDNTGKSVSNLNSASSAVNTTMNISNDVSIGSRVAMLNNPFGTYASKMNGLKFAALDS
DMRPSYVNEYTNSVWANAFGGANIIDGDSGAMYGATVGVDKQANDDVLWGAYFTYANAKI
KDNNLEQKSDNFQLGMYSTINVAPQWELNLKAYAQVSPTKQDNVQIDGAYNSDYTSKFLG
LSANAGRVFDFSDNTLFIKPFAGVNYYFSYTPSHTENGAIAKDIDSMKNNSVSVEVGAEF
RKYMNENSYIFVTPKIEQFVINSGDDYTANLAVNNAFFTSVEANNKKKTYGQIIVGGNVD
FTNQLSMNLGFGAKQILAGKVDNKNETYLSGQVGLKYKF
NT seq 2280 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagaaaaatgcttcgagcaagatattgctaagcttaggtgtagcaactttgctttat
tcgagtgcttttgcacaagaaatcaatcttacacaatcttcagatgtgggaaattatttt
gaagaaaatggtaaggatatcaatcttaaaaatcctgataagtacaaagggcaagatttg
aatatcaaaatgggtgtttgggatttaccaaacgatgattatgatagcgctgattatcga
ttgaacattgatatcggtaaaaacaatactttaagctttacacacaataatgaccaaaat
cctgtttatgtaacaaatctaaacgctactgctaaagaggttaaaacaacagatatagtt
ttacaagcttctgcaccttcggtgattaatggaaatttaactatgactagctcaggagct
ggaaccattaccgaggatgaaaaaaaaggttcaggtataattctttataatggaaatgga
gcagttgaaggaaaaagtgctaatggtagcttaactataaatggaaattttactgccgat
aaaaccctttttgctgcttatggaaattttgttaaggtaaatggaactgcaaatcttaca
aattcaaattttggacttatgaagcgctcttatacagacttagaagcaaataatgtagta
atagttcaagctaaagatttcaatgaaaacattttaaaagcaaataataacgcaggtgca
ttacttttaaaattcgcaggtgattatatctcaaccgatgttcaaggcaaagatcctttg
gaagcaggaactataatagatattagcgatgaagataaatacggcgatggagaaaaaggc
ttagtagattataaacttagtgttcaaaactgcggtggcaataaatgcttagtgattaat
ggaggtgctactgcagcggctaaagataagctagttcaacttcaagtagatatagatact
atcgataaattgcttaaaaatgaatttgattctagccaaggtgaagaatgggagcaagcc
aaagaaacccttaaaaagcaacaagctgaaattcaaacaatgttagaagaagctaagaaa
aacggcggtaaaatcgatgatgaaaaatacattgatttagtaaataaaaacttaaattta
aatcttagtgctaatgataaagcttctatcctagctcttcgttctattacagaacaatta
ggaagtataggagcagatttagcaagtagagaaggtgtaaaactagctttagatatcaaa
aaagacacagacaacacaggtaaatctgtatctaatctaaattcagcttctagtgcagtg
aataccactatgaatatttctaatgatgtttctataggttctcgtgtagcaatgctaaac
aatccttttggaacttatgcttctaaaatgaatggtcttaaatttgctgccttagatagt
gatatgagaccaagctatgtaaatgaatatactaatagtgtttgggctaatgcttttggt
ggtgctaatattatcgatggagatagtggtgcaatgtatggtgctaccgtgggagtagat
aaacaagctaatgatgatgttttatggggtgcttattttacttatgcaaacgctaaaatc
aaagacaataatttagaacaaaaaagcgataacttccaattaggtatgtattctactatc
aatgtagctccacaatgggaacttaatcttaaagcttatgctcaagtttctccaactaaa
caagacaatgttcaaatagatggtgcatataactcagattatacaagcaaattcttagga
cttagtgctaatgcaggtcgtgtgtttgactttagtgataatactttatttatcaaacct
tttgcgggagtaaattattattttagttatactccatctcatacagaaaatggtgctatt
gctaaagatattgattctatgaaaaacaattctgtaagtgttgaagtgggtgctgaattt
agaaaatatatgaatgaaaactcttatatttttgtaactccaaaaatagaacaatttgtt
atcaatagtggtgatgattacacagctaacctagctgtaaataatgctttctttactagt
gtagaagctaacaacaagaaaaaaacatacggacaaattatcgtagggggtaatgtagat
tttacaaatcaactcagtatgaatcttggctttggtgctaaacaaatactagcaggtaaa
gtagataataaaaatgaaacttacttaagtggtcaagtaggacttaagtataaattttaa

DBGET integrated database retrieval system