KEGG   Campylobacter coli RM5611: YSU_06645
Entry
YSU_06645         CDS       T03167                                 
Name
(GenBank) ligand-gated channel
  KO
K16089  outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
ccoi  Campylobacter coli RM5611
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ccoi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:ccoi02000]
    YSU_06645
Transporters [BR:ccoi02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   YSU_06645
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHK75522
LinkDB
Position
complement(1304998..1307061)
AA seq 687 aa
MNAKKLKLSILCFCLMGLGEIKAEEQYQLDDVVVSASGFEQDLVDAPASISVITKEELSK
KPIKDIGEAISDIPGVDVTMNKTGTYDFSIRGFGSSYTLVLIDGKRQSVANGFYDNGFGG
SESGYLPPASMIERIEVIRGPASTLYGSDAVGGVINIITKKNPNKTEANIEFSTLLQQHS
SKYGNAGGFNAYVATPLIEDTLSISARIKYYDKAASDLKWPTPVWSNGTQRPENYQIASH
SPGYFTSLGFGSRLNWTVDDSNNVYLDVERYINEISVNSTSSSAIKSERQLFKDNVVLNH
DGNYEFGTTNSYLQYGSTKDKDLHSQIWVGEGKVVLPWNLDKYGNLVSTFGTRIDYETLK
NDQESAGSEIRGKNLDQTTVALYGEGEYFISDDLIFTTGLRYIYSDLFDSEVTPRVYLVY
HLNDNVAFKGGVAMGYKTPAAKQLTNGYYNYSNNGASFGNPDLKPEESTNYELGVDFRIF
DFAHYSITGFITDFKNQISSEELTGMYNGIDCANGVTCERSINLGKTQTRGIELAFNTKP
YKGFSVNSSYTFMDNRYKDGQTNWFGGDRIENLPRHIAMLKLNYEQGKFSSYVKARARLD
TIARSKGGGSGTLPWQKYKPFYIVDLGVNYKIDKQSSLSFTVQNLFDKDFFDPQVTRWDG
ANPGGYANRYQDYTEGRSFWLSYKYDF
NT seq 2064 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgctaaaaagcttaaattaagcattttatgtttttgtttgatgggattaggtgaa
atcaaagcagaagaacaataccaacttgatgatgtggtagtgagtgcaagtggttttgaa
caagacttagtggatgcgcctgctagtatttctgttattactaaagaagagcttagtaaa
aagcctattaaggatataggagaagcaatttcggatatcccgggtgttgatgttactatg
aataaaaccggtacttatgattttagcatacgaggttttggaagttcttacactttggtt
ttgattgatggaaagcgtcaaagcgttgctaatggtttttatgataatggttttggcggt
agcgaatcaggatatttaccacccgcatctatgatagagcgtatcgaggtgatacgcgga
cctgcttctacactttatggtagcgatgcagtaggtggggtaataaatatcattactaaa
aaaaatcccaataaaaccgaagcgaatatagaatttagcacccttttacagcagcattct
agtaaatatggaaatgcgggtggttttaatgcttatgtggctacacctttgattgaagat
acgctttcaatttctgctaggattaagtattatgataaggcagcttctgatttaaaatgg
cctacgccagtttggagtaatggtactcaaagacctgaaaattatcaaatcgcaagtcat
agtcctggatattttacgagtttaggttttggatcaagactgaattggactgtagatgat
agcaataatgtttatttagatgttgagcgttatatcaatgaaatttcagtaaattccaca
agtagtagtgctattaaaagcgaaaggcaattgtttaaagacaatgtcgttttaaatcat
gatggaaattatgaatttggaactacaaattcatacttacagtatggtagtactaaagat
aaagatctgcatagtcaaatttgggtaggagaaggaaaggttgtcttgccttggaatttg
gataaatatggaaatttagtaagtacctttggaacaagaatagactatgagacactcaaa
aacgatcaagaaagtgcaggtagcgaaataaggggtaaaaatcttgatcaaactacggtt
gcactttatggcgagggtgaatattttatcagtgatgatttgatttttactacaggcttg
cgttatatttatagtgatttgtttgattctgaagtaactcctagagtatatcttgtttat
catttaaatgataatgttgcttttaaaggaggtgtagctatgggttataaaactccagca
gcaaaacaactcaccaatggttattataattatagcaataatggtgcttcttttggaaat
cctgatttaaaacctgaagaaagtacaaattatgagctaggagttgattttagaatattt
gattttgctcattattctattacaggatttattactgattttaaaaatcaaatcagtagc
gaagagttaacaggaatgtacaatggtattgattgtgccaatggtgttacatgcgaacgt
tctatcaatcttggtaaaacacaaactaggggtatagaattggctttcaatacaaaacct
tataagggttttagtgttaattcaagttatacttttatggataatcgctacaaggatgga
cagacaaattggtttggtggagatagaatagaaaatttaccaagacatattgctatgtta
aaattaaattacgagcaaggaaaatttagctcttatgttaaagcgcgtgcaagacttgat
actatagccagatcaaaaggtggtggcagtggcactttgccatggcaaaaatataagcct
ttttatatagtggatttgggagtaaattataaaatcgataaacaatcaagtttgagcttt
acggtgcaaaatctttttgataaagatttctttgatccgcaagttacaagatgggatggt
gctaatccaggaggttatgcaaatcgctatcaagattatacagaaggaagaagtttttgg
ttaagttataaatatgatttttaa

DBGET integrated database retrieval system