Campylobacter coli RM5611: YSU_07325
Help
Entry
YSU_07325 CDS
T03167
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K11720
lipopolysaccharide export system permease protein
Organism
ccoi
Campylobacter coli RM5611
Pathway
ccoi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccoi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
YSU_07325
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ccoi02000
]
YSU_07325
Transporters [BR:
ccoi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Lipopolysaccharide transporter
YSU_07325
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptF_LptG
Terminase_6C
PEN-2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHK75647
LinkDB
All DBs
Position
complement(1438458..1439516)
Genome browser
AA seq
352 aa
AA seq
DB search
MWIFFRFISGIYLKNFFIIFLSLLGFYCGIDLLLNFNDLPDAANLSLLYVIFLAFSAVTY
VLPVSLIFALVLSLVSMIRANEFVSLYALGLSKNLVIIFPFLWALFFCFVYVGLNFTPFA
YANDYKRNILKNGTMLKQSGEVFLKFNNEFIYISKVNNGQSTAQNIKIFNIKDLNLSSFI
EAKSGIFEKKNWILKEGNLTLLPKEYELGNKGLNISEFKELNTLEGFKPKIIEGVASDSD
YSILDILESLELFKTQNISIESLKISLYKLVFMPFFAPFLMLIMYYFFPVIARFFNLAFV
AFVAFVVTLLTWGMLFLLSRLSENGVILSELGIVMPIVLLIFLGGFMFYKHR
NT seq
1059 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggatattttttcgttttatttcaggaatttatcttaagaatttttttattatcttt
ctgtctttactgggtttttattgtggtattgatttgcttttaaatttcaatgatttaccc
gatgcagcaaatcttagcttgctttatgtgatttttttggctttttctgctgttacttat
gtcttgcctgtttctttaatctttgctttggtgctttctttggtttctatgataagggct
aatgaatttgtaagcctttatgctttagggcttagtaaaaatttggtcataatatttcct
tttttgtgggctttatttttttgttttgtgtatgtggggttaaattttactccttttgct
tatgcaaatgattataaaagaaatattctaaaaaatggcaccatgctaaaacaaagcggt
gaagtttttttaaaatttaataacgaatttatttatatttctaaggttaataatggacaa
agtaccgcacaaaatattaaaatttttaatattaaggatttaaatttaagttcttttatc
gaagctaagagcggtatttttgaaaagaaaaattggattttaaaagaaggaaatttaacc
ctacttcctaaagaatatgagcttggcaataaggggttaaatatcagcgaatttaaagag
cttaatactcttgaaggttttaagcctaagatcatcgaaggggtagctagtgatagtgat
tattctatcttagatatacttgaaagtttggagctttttaaaacacaaaatatcagcata
gaatcgcttaaaattagtctttataagcttgtatttatgccgttttttgcacccttttta
atgcttattatgtattattttttcccagttattgcaagattttttaatttagcttttgta
gcttttgtagcttttgtagtcactttgcttacttggggtatgttatttttactatcaaga
ttgagcgaaaatggtgtgattttaagtgaattaggcattgttatgcctattgttttgtta
atttttttaggtggttttatgttttacaagcaccgataa
DBGET
integrated database retrieval system
