Campylobacter coli OR12: ATE51_01076
Help
Entry
ATE51_01076 CDS
T04527
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS-assembly protein LptD precursor
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
ccoo
Campylobacter coli OR12
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccoo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ccoo02000
]
ATE51_01076 (lptD)
Transporters [BR:
ccoo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ATE51_01076 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALU99073
UniProt:
A0A5Y6PJJ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(534901..536949)
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MWRKILFLSASLTLLNATQVDIYALDAKKQGDILTANDDVIIFSDFYFITANKAIYNEKT
GDLELFGDVNILRGQNERSHSNYAKINLNSNEANFNNFFFSNNNLEVWFQSKTSYLDENV
FKSEISAVSSCNVEDPDWEIRFSKGWLNRENNFVHLYNAKLYVKDFPIFYLPYFGFSADT
HRQSGLLIPKIVLKNSEGLYYEQPIYIAPYENWDLELNPQIRTDRGFGLYSTLRFIDSPY
SIGEVNLGAFRENSSYYHDENLKNQSHYGAELKYARNDLIKTLLGDNFQEGLWIDATYLN
DIDYLNLGSRDYRDLNSLVTSKINYFLADENNYYGAYAKYYIDTSALNNDNTLQEYPSFQ
YHRFLNNFFDERLRYSFDASFHNFYRPVGPYANQLNLNLPISYHNAFFDDFLHFTFTERF
YASFLNYSHYPQKDHEHYFRNTHDFNLYTDLSKAYDNFFHTLNFGLKYVLPGAKSGSISE
DYLEEIDKEEEHLGFYTTQYFYNNEGQKKIKHRINIDYLNKQGEFDEISNLLSYYYNNNI
SFNSEIIYSDLQDRFTNIISQMEINPNPKFNWSFSHAYQNDEYGKYSFIGTRANYLANAN
YHLFGGIWFDTQRAHANMWELGYTFQRKCWNYSLMYRERIDPQLTSAGITAKNQSGIYFI
FNFYPLGGVKYDFSLAETESKI
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggcgtaaaattttatttttaagcgctagtcttactttactcaatgccactcaagtt
gatatctatgcacttgatgctaaaaaacaaggggatatactcactgcaaacgatgatgtg
attattttttcagatttttattttatcactgccaataaggctatttacaatgaaaaaacc
ggagatttagagctttttggtgatgtgaatatattaagaggacaaaatgaacgctctcat
tcaaactatgctaaaatcaatttaaattcaaatgaagctaattttaataattttttcttt
tctaataataatttagaagtatggtttcaaagcaagactagctatttagatgagaatgtt
ttcaaaagcgaaatttcagctgtttcaagttgtaatgtcgaagatcctgattgggaaatt
cgcttttctaaaggatggctcaatagggaaaataattttgttcatttatataatgcaaaa
ttatatgttaaagattttcctatattttatttaccctattttggttttagtgcagatacc
caccgccaaagcggacttttaatcccaaaaatagtcttaaaaaacagcgaaggtttgtat
tatgaacagcctatttatatcgcaccttatgaaaattgggatctagaattaaatcctcaa
attagaaccgatcgtggttttgggctttactcaaccttaagatttatcgactctccttat
tctataggagaggtaaatttaggagcttttagagaaaattcatcctattatcatgatgaa
aatttaaaaaaccaaagtcattacggcgcagaattaaaatatgctagaaatgatttaatt
aaaaccctgttgggcgataattttcaagaaggcttatggatagatgctacctatcttaat
gatatagattatcttaatcttggcagcagggattatcgtgatttaaattcattagttact
tcaaaaatcaattattttctagcggatgaaaataattattatggagcttatgcaaagtat
tatatcgatacttctgcattaaataacgataataccttacaagaatatccaagctttcaa
tatcatcgttttttgaataatttttttgatgaacgcttgcgttattcttttgatgcatct
tttcataatttttatcgccctgtaggcccttatgcaaatcaattgaatttaaatttgcct
atttcttatcataatgctttttttgatgacttcttgcattttacttttaccgaacgcttt
tatgcttcatttttaaactatagtcattatcctcaaaaagatcatgagcattattttaga
aatacgcacgattttaatctttatactgatttatctaaagcatatgataatttttttcat
actcttaattttgggttaaaatatgttcttccaggagccaaatcaggaagtatttcagaa
gattatcttgaagaaattgacaaagaagaggaacatcttggcttttatactactcaatac
ttttacaataatgaaggtcaaaaaaaaatcaaacatagaattaatattgattatttaaac
aagcaaggtgagtttgatgagataagcaatttattaagctattattataataacaatatc
agttttaatagtgagattatttactctgatcttcaagatcgttttacaaatatcatcagt
caaatggagatcaatcctaaccctaaattcaattggagtttttcgcatgcttatcaaaac
gatgagtatggaaaatatagttttataggcacacgtgcaaattaccttgcaaatgcaaat
tatcatttgtttggaggaatttggtttgatacccaaagagcgcatgctaatatgtgggag
cttggatatacttttcaacgcaaatgttggaattattctttaatgtatagagaaagaatt
gatccgcaacttacaagtgcgggaattactgctaaaaatcaaagcggtatttattttatt
tttaacttctatcctttaggtggagttaaatacgatttttctttagcagaaacggagagt
aaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
