Chondrus crispus (carragheen): CHC_1080
Help
Entry
CHC_1080 CDS
T02916
Symbol
gltB
Name
(RefSeq) ferredoxin-dependent glutamate synthase
KO
K00284
glutamate synthase (ferredoxin) [EC:
1.4.7.1
]
Organism
ccp
Chondrus crispus (carragheen)
Pathway
ccp00630
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism
ccp00910
Nitrogen metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccp00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00630 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism
CHC_1080 (gltB)
09102 Energy metabolism
00910 Nitrogen metabolism
CHC_1080 (gltB)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ccp01002
]
CHC_1080 (gltB)
Enzymes [BR:
ccp01000
]
1. Oxidoreductases
1.4 Acting on the CH-NH2 group of donors
1.4.7 With an iron-sulfur protein as acceptor
1.4.7.1 glutamate synthase (ferredoxin)
CHC_1080 (gltB)
Peptidases and inhibitors [BR:
ccp01002
]
Cysteine peptidases
Family C44
CHC_1080 (gltB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GATase_2
Glu_synthase
Glu_syn_central
GXGXG
FMN_dh
DUF7516
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14971080
NCBI-ProteinID:
YP_007627474
UniProt:
M5DET9
LinkDB
All DBs
Position
PT
AA seq
1530 aa
AA seq
DB search
MQISKYFTHKLVQYSGYPSILIERDACGVGFIAQINQLPSHNLVIKAINALSCMEHRGGC
SADRISGDGAGITTQIPWNLLKSSFASQQIQFYNDVAVAMVFLPSEHIQAIRKIFVWALE
EEGLNVLNWRNVPRNDSVLGTQAKLNQPEIQQCFVQAKDVTGDALERLLYLTRKKIEKLI
AQTNLNLNKQFYFCSFSSKMIVYKGMVKSKILAQYYLDLSDSRYESNFAIYHRRFSTNTL
PKWPLAQPMRFMAHNGEINTLLGNLNWMKSKESLLKHSYWNNNHDILIPVTSSENSDSAN
LDAVLELFIQSGKSPQEALMILIPEAYQDQPALDQFPEIIDFYEYYKPLQEPWDGPALVV
FSDGKIVGATLDRNGLRPARYLITQDGFISLSSEVGVFDIDSKSIVQKGRLGPGQIFCVD
LVNNLILDNWTIKQFIANKFPYKKWIQKYQKVLIPEHYLNDEGINKLQMNKLHTAFGYTN
EDIELVIEHMASSAKEPTFCMGDDIPLAVLSEKPHLIYDYFKQRFAQVTNPAIDPLRESL
VMSLNMHLGSKGNLLEPQDYMAKSILLDSPILNERELKQLFNHGFKITVINTFFNQDVEF
QNFHVKIQDICKKSVHSINNGAEIIVLSDKVQNLSDQEAFIPPLLIIGAVHHYLISKHLR
HKVSLVVETAQCWNTHHFACLIGYGASAICPYAAFLTVRQWWNSPRTQKLMSKEKLDSLT
IQQSQNNYRVAINKGLLKILSKMGISLLSSYHGAQIFEILGLGKELVNMAFLGTTSRLDG
ITLNELAMQTIKIYNTAFLSSLPKKLPNLGYVQYRPSAEYHVNNPEMSKTLHKAVRNNDH
LLYTKYKNLLNNRPPTNLRDLLTVSSNLPSIHINEVEPIESILECFCTGGMSLGALSRET
HETLAVAMNRIGGKSNSGEGGEDASRFGLIQDVDIAGISKSFSHLKGLKLNDTASSAIKQ
VASGRFGVTPEYLVNAKQLEIKIAQGAKPGEGGQLPGKKVSPYIAQLRNCKPGVTLISPP
PHHDIYSIEDLAQLIFDLHQINPIAKVSVKLVAEIGIGTIAAGVAKGNADIIQISGHDGG
TGASPLSSIKHAGSPWELGLTEVHQTLVENNLRDRVLLRVDGGLRTGHDIILAALMGAQE
FGFGTVAMIATGCVMARICHTNNCPVGVATQRQDLRNRYPGIPSDLVNFFLFIAEEVRQI
LATLGYKSLQEIVGLSKLLKYKSTVLSKTKYLNLDTLLFNPVAIDVIEKHDFVHSNGTVL
DDILLSDPDFKNAIQFQSDITKTVQIVNTDRCVGARISGVIAKKYGNYGFNGNLQLDFQG
VAGQSFGAFISKGIHLSLIGEANDYVGKGMNGGEIIICPSQYENNHASEKVILGNTCLYG
ATGGYLFASGQAGERFAVRNSSGQAVVEGVGDHPCEYMTGGLIVVLGPSGRNIGAGMTGG
LAYFLDEDNTLVSKINQEIVKYQHIVTKEGEEQLKNMIELYEIKTKSIKAKHILDNWNKY
LDMFWQIVPPSENSTPLTDFKYSIFNTVSN
NT seq
4593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaatatcaaaatattttactcataagcttgttcaatattcaggctatccttctatt
ttaattgaacgagacgcatgtggagtaggtttcattgctcaaataaatcaattgccttct
cataatttagttataaaggctataaacgcattaagctgtatggagcatagaggtggatgt
agtgcagatcgtatttctggtgatggtgctggtataacaacacaaataccttggaatttg
ttgaaaagttcttttgcatctcaacagattcaattttacaatgatgtagctgttgcaatg
gtctttttaccttctgaacatattcaggcaatacgaaaaatttttgtatgggctttggaa
gaagagggtttaaatgtattaaattggagaaatgttcccagaaatgattcggttttagga
actcaagcaaaattaaatcagcctgaaattcaacagtgctttgttcaagccaaagacgta
acaggagatgctctagagcggttattatatcttacaagaaaaaaaatcgaaaaattaata
gcacaaacaaacttaaatctaaataaacaattttacttttgttctttttcatcaaaaatg
attgtgtataaaggtatggtgaaatcaaaaattttagcacaatattatttagatttatct
gattcacgttatgaaagtaattttgcaatatatcatagaagatttagcactaatactttg
cctaaatggcctttagcacagccgatgagatttatggctcataatggagagatcaatact
ttactaggtaatttaaattggatgaaatcaaaagagtcattattaaagcattcttactgg
aataataatcatgacatcttaataccagttacaagctctgaaaatagtgactctgctaat
ttagatgcagtacttgaattatttattcaatcaggtaagagtccacaagaagcattaatg
attttgattccagaagcttatcaagatcaaccagcactagatcaatttcctgaaatcatt
gatttttatgagtactacaaacctctgcaagaaccttgggatggccctgccttagtagtt
tttagtgatggtaaaatagtaggtgcaactctagatagaaatggtctgagaccggcacgt
tacttaattactcaagatggatttattagtttatcttctgaagtaggtgtttttgatatt
gattctaaatctatagtgcaaaaaggtcgattagggccgggacaaattttttgtgttgac
ttagtaaataatttaattttagataattggacgattaaacagtttatcgcgaataaattt
ccatataaaaaatggatacaaaagtatcaaaaagttttgataccggaacattatttaaat
gatgaaggtattaataaattgcaaatgaataaattgcatacagcttttggttatacgaat
gaagatatagaattagtaattgaacatatggctagctcagcaaaagagcctacgttctgt
atgggtgacgatataccattggctgtcttatcagaaaagccacatctcatttatgattat
ttcaaacaaagatttgctcaagttactaatcctgcaatagatcctctaagagaaagttta
gtaatgtctttaaatatgcatctgggatctaaaggtaatttgttggaacctcaggattat
atggcaaaatcaatcttactagattctcctatattgaatgagagagaattaaaacaactt
ttcaatcatggttttaaaattacagtcattaatactttttttaatcaagatgtagaattt
caaaattttcatgtcaaaattcaagatatatgtaaaaagagtgtgcattcaataaataat
ggagctgaaattattgtattaagtgacaaagtacaaaatttgtctgatcaagaagcattt
attccacctttactaattataggtgcagtgcatcattatttaatatcaaaacatttgaga
cataaggtatctttagttgtagagacagcgcaatgctggaatacacaccattttgcatgc
ttgattggttatggagcaagtgcgatctgtccttatgcagcatttttaactgtaagacaa
tggtggaatagtccaagaacacaaaaattaatgtctaaggagaaattggatagtttaact
attcaacaatctcaaaataattatcgtgttgctattaataaaggcttattaaaaattctt
tctaagatgggaatttcactactatctagttatcatggtgcacaaatatttgaaatacta
ggattaggtaaagaattagtaaatatggcatttttaggaacaacatctcgtctagatgga
attactttaaatgaattagctatgcaaactataaaaatatataatactgcttttttatca
tcattgcctaaaaaattacctaatttaggttatgtacaatatcgtccaagcgcagaatat
catgttaataatcctgaaatgtctaaaacattacataaagctgtaagaaataatgatcat
cttttgtatactaaatataaaaatttattgaataatcgtccaccaacaaatcttcgagat
ttacttactgtttctagtaacttaccttccattcacattaatgaagtagagccgatagaa
tctattttggaatgcttttgtactggtggtatgtctttaggtgctttatctagagaaacg
catgaaactttagcagtagctatgaatagaataggaggaaaatcgaattcaggtgaaggt
ggagaagatgcaagtcgctttggattaatacaagatgttgatattgcaggtatttccaaa
agcttttcgcatttaaaaggtctcaaattgaatgatacggctagttcagctataaagcag
gtagcttcagggcgttttggtgttactcctgaataccttgttaatgccaagcaattagaa
attaaaatagctcaaggagctaaaccaggtgaaggagggcagttacctggaaaaaaagtc
agtccatatattgctcagttaagaaattgtaagccaggtgttacattaatctcaccacca
ccacaccatgatatttattctatagaagatttagctcagttaatttttgatttgcatcaa
attaatccaatagcaaaggtgtctgtgaagttagttgcagaaattggtataggtactatt
gccgcaggtgttgcaaaaggaaatgcagatataattcaaatatctggtcatgatggaggt
acaggagcatcaccattaagttctattaaacatgctggtagtccatgggagttaggtttg
acagaagtgcatcaaacattagtagaaaataacttacgagacagggtcttattaagggta
gatggtggtttaagaacaggtcatgatattattcttgcagccttaatgggtgctcaagaa
tttggctttggtacagttgctatgattgcaacaggttgtgttatggctagaatttgtcat
acaaataactgtcctgtaggtgttgcaacacaacgtcaagatttaagaaatcgttatcct
ggtataccttcagatttagtaaacttttttctatttattgcagaagaagttaggcaaata
ttggcaactttaggttataaaagtttacaagagatagttggtttaagtaaattattaaaa
tataaatctactgttttatctaaaacaaagtacctgaacttagatactttattatttaat
ccagtagctattgatgtaattgaaaagcatgattttgttcatagtaatggtacagtttta
gatgatattttactaagtgatccagattttaaaaatgccattcaatttcagtcagacatt
actaagacagtgcaaatagtgaatactgatagatgtgtaggtgctagaatatcaggagtt
atagcaaaaaaatatggtaattatggctttaatggtaacttgcaattagattttcaagga
gttgccggacagagctttggtgcttttatttctaaaggtatacatttaagcctgataggt
gaagccaatgattatgttggaaagggtatgaatggaggagaaataattatctgtccttct
caatatgagaataatcatgcttcagaaaaagtgattcttggtaatacttgtttatatgga
gcaacaggaggttatttatttgcaagtggacaagcaggtgaaagatttgctgtaagaaat
tcatctggtcaagctgtagtggaaggggtgggtgatcatccatgtgagtatatgacagga
ggtttaattgttgttttaggcccatcaggtcgtaatattggcgcaggtatgacaggaggc
ttagcttactttttagatgaagataatacgttagtttctaaaatcaatcaagaaattgta
aaatatcaacatatagtaactaaagaaggtgaagagcaattaaaaaatatgatagagctt
tatgaaattaaaactaaaagtattaaagcaaaacatattttagataattggaataaatat
cttgatatgttttggcaaatagtaccaccttcagaaaattcaactcctttaactgatttt
aaatattctatttttaatacagtatcaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
