Cariama cristata (Red-legged seriema): 104165224
Help
Entry
104165224 CDS
T08341
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ccri
Cariama cristata (Red-legged seriema)
Pathway
ccri04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccri00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104165224
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ccri00536
]
104165224
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ccri00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104165224
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
EGF_3
TB
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104165224
NCBI-ProteinID:
XP_009703102
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1835 aa
AA seq
DB search
INECKVFPGMCMNGKCRNTIGSFKCRCNSGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVN
TPGSFECECFNGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSS
SREECIDVNECSLSDSLCRNGKCVNMVGSYHCSCNSGYQTTPDRQGCIDIDECMIMNGGC
DTHCTNSEGSYECSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDG
FMASMDMKTCIDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVNECEI
GAHNCDMHALCVNVPGSFKCSCREGWIGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYR
CACAEGFTGDGFTCSDVDECAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPALDSKSCQDID
ECSFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDVDECADPINCVNGLCVNTPGR
YECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKA
WGNPCETCPPVNSTEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSF
QCECPKGYYLSEETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPAEYMQVNGGHNCM
DMRKSFCYRSYNGTSCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFRNICGN
IPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQVGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDE
CSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDIQG
SYQCICHNGFKASQDQTMCMDVDECEHHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMD
TNECSSFFGQVCRNGQCFNEIGSFKCLCNEGYELTVDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQ
NLEGSFRCICPPGYEVKSDSCIDINECNDDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNG
RRCFDTRQSFCFTNFENGKCSLPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQD
LCPYGHGTIPGIDDTREDVNECLESPRICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCID
TDECSVGNPCGNGTCTNVIGSFECSCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYG
FYECTCPVGYELREDQKMCKDLDECAQGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDG
EGCTDENECRTKPGICENGRCVNLIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQT
MCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGNQCELCPVPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDTDEC
KVMPNLCRNGQCINTMGSFRCFCKAGYTTDISGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSY
QCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNN
ECGSQPLLCGSKGICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILG
GYRCGCPQGYIQHYQWNQCVDENECSNPNMCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSAC
HDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDGDADA
ENALSPETCYECKINGYSKKDNRRKRSANDTIEQISLESLDMDSPLKMRVNISRLDNKEH
ILELMPAIEPLTNHVRYIISHGNDDGIFQIHQRDGLSFLHTVKKKSVPGTHTLEITSIPL
YKKKQLKKLEDSNEGNYLLGELGEALRMRLWIDLY
NT seq
5510 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atatcaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggtaaatgcagaaacacaa
ttggaagtttcaagtgtagatgtaacagtggatttactttagatatggaggaaagaaact
gtacagacattgatgagtgccggatctccccagacttatgtggaagtggtacttgtgtca
acactcctggaagctttgagtgtgagtgtttcaatggttatgaaagtggatttatgatga
tgaagaactgcatggatattgatgaatgtgaacgcaaccctctgctgtgtagaggtggca
cttgtgtgaacactgaagggagttttcagtgtgactgtcccttgggacatgagttgtcat
catcacgtgaggaatgcatagatgtaaatgagtgctcattaagtgacagtctctgcagaa
atggtaaatgtgtgaacatggttggatcataccactgttcctgtaactctgggtaccaga
ccacccctgacagacaaggctgcatagatattgatgaatgtatgataatgaatggaggct
gtgacacccactgcactaattcagaaggcagctatgaatgtagctgcagtgatggctatg
ctctaatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgagaacaatccagata
tctgtgatggtgggcagtgtactaatattccaggagaatatcgctgtctctgttacgatg
gatttatggcttctatggacatgaaaacttgtattgatgtgaatgaatgtgatttgaatt
ccaacatctgtatgtttggagagtgtgaaaacactaaaggttccttcatttgtcactgtc
agctaggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgcacagacgtgaatgagtgtgaaa
ttggtgctcacaactgtgacatgcacgccttgtgtgttaatgtaccaggaagttttaaat
gtagttgcagagaagggtggattggaaatggcattaaatgtattgatcttgatgagtgct
ccaatgggacccaccaatgcagcgtgaatgctcagtgtgtgaacaccccagggtcatatc
gctgtgcctgtgcagagggattcactggggatggatttacttgttctgatgttgatgagt
gtgcagaaaatgttaatctgtgtgaaaatggacagtgtttgaatgtccctggtgcctacc
gttgtgagtgtgagatgggattcactcctgccttggatagcaagtcgtgccaagatattg
atgaatgctccttccagaacatatgtgtatttggtacctgtaataatctaccaggaatgt
ttcattgtatctgtgatgatggctatgaattagatcgaactgggggaaactgtacagatg
tcgatgaatgtgccgatcccattaattgtgttaatggtctttgtgtaaatactcctggaa
ggtatgagtgtaattgccctccagacttccagctgaatcctactggagtgggttgtgtgg
ataaccgtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggggatgggagcttatcct
gcaacactgaaattggggttggagtcagtcgttcctcgtgctgctgctctctgggaaagg
cttggggaaacccctgtgagacatgtccccctgtaaacagcacggaatataatactctct
gtccagggggagaaggattcagaccaaatcccatcactattattttagaagacattgatg
aatgtcaggaactgccaggtctctgccaaggtggaaactgcatcaatacttttggcagct
tccagtgtgaatgtccaaaaggctactacctcagtgaagagacaagaatctgtgaagata
ttgatgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcctggcacttgctacaataccttgg
ggaactacacctgcatttgcccagctgaatatatgcaggtgaacggaggacataactgca
tggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacctcttgtgagaatgagc
tgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgttgctgcacgtacaatgttgggaaagcctgga
acaagccttgtgaaccatgtccaactccaggaacagctgaattcaggaacatatgtggga
atattcctgggttcacttttgacattcatactggaaaggctgttgacattgatgaatgta
aggaaatcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcatcaatcaggttggcagcttccgct
gtgaatgccccactggattcagctacaatgacctgctcttggtctgtgaagatattgatg
agtgcagcaatggagacaatctctgtcagagaaatgcagactgtatcaacagtcctggta
gttaccgctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccaatggtgcctgtgttgatc
gcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcatggtttatgtgtggacatccaag
gaagttaccagtgcatatgtcacaacggttttaaggcatcccaggaccagactatgtgca
tggatgttgatgaatgtgaacaccatccatgtggaaatggaacttgtaaaaacacagttg
gatcatataactgcctgtgttatccaggatttgaattaactcataataatgattgcatgg
ataccaatgagtgcagttccttcttcggtcaggtgtgcagaaatggacagtgtttcaatg
aaattggttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttactgtagatggcaaga
attgcattgatacaaacgagtgtgtggcactacccggttcatgctctcctggtacctgtc
aaaatttggaaggatcattcagatgcatatgtccaccaggatatgaagtaaaaagtgaca
gttgtattgatattaatgagtgtaacgacgatcccaacatctgtctctttggctcttgta
cgaacactccaggaggtttccagtgcatctgtcctacaggttttgtgctgtctgataatg
ggcggagatgttttgatactcgccagagcttctgtttcactaactttgagaatgggaaat
gctctctgccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgctgcagtaaaatgccag
gagaaggatggggtgatccttgtgagctctgtccaaaggaagaagaagttgcttttcagg
acctgtgtccatatggtcatggaactattcctggaattgatgatacacgtgaagatgtca
atgaatgccttgaaagcccaaggatttgctcaaatggtcactgcatcaatactgatggat
cattccgctgtgagtgccccatgggatacaacttagattacactggagtacattgcatcg
atactgatgaatgttcagttggcaatccatgtggaaatggtacgtgcactaatgtgatcg
gcagttttgaatgcagctgtcatgaaggatttgagcctggcccaatgatgaattgtgaag
atataaacgagtgtgctcagaatcccttgttgtgtgcttttcgttgtatcaacacttatg
gtttctatgaatgcacatgtccagttggctatgaactaagagaagaccaaaagatgtgca
aagatctagatgagtgtgctcaaggtctccatgactgcgaatcaagaggcatgatgtgca
aaaatttgattggtactttcatgtgcatttgtcctcctggaatgacacggcgacctgatg
gagaaggctgtacagatgaaaatgaatgccgcactaagccaggtatctgtgaaaatggtc
gttgcgtgaaccttattgggagctaccgatgtgaatgtaatgaaggattcctgtcaagtc
cgtcaggcattgagtgtcttgataatcgccaagggttttgttttgctgaagttttacaga
caatgtgtcagatggcttcaagcagccggaatcttgtcactaaatctgagtgctgctgtg
atggaggccggggctggggtaaccagtgcgaactctgtccggttcctggaaccacccaat
acaagaaactctgtccacatggaccaggctatactacagatggaagagatactgatgaat
gtaaggtcatgccaaacctatgtagaaatggacagtgtattaacactatgggctcctttc
gatgcttttgcaaagctggctataccactgacataagcggcacatcatgtattgatcttg
atgagtgctcccagtctcctaaaccatgcaattttatctgcaaaaactcagaagggagct
atcagtgctcatgtccccggggctacatccttcaagaagatggaaagacttgtaaagatc
ttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtcaacacccttggag
gcttcacatgcaaatgtccacctggtttcacacaacatcatacagcttgtattgataaca
atgaatgtggttctcagccattgctttgtggatcaaaaggaatttgccaaaacacccctg
gaagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattctactggattaaactgtg
aagatgtggatgaatgtgatggaaaccacaggtgccagcatggctgtcaaaacatcctgg
gtggatacagatgtggatgcccacaaggatatattcagcattaccagtggaatcaatgtg
ttgatgaaaatgaatgctccaatcctaacatgtgtggctctgcttcttgctacaacacac
ttggaagttacaagtgtgcctgcccatctggtttttcttatgaccagttctccagtgcat
gccatgatgtgaatgagtgttcttctaccaagaacccctgcaattatggttgttcaaaca
ctgaaggtggctatctttgtggctgtccacctggctattacagagttggacaaggccact
gtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctgccactggatggagatgctgatg
cagagaatgctttgtcccctgaaacatgttatgagtgcaaaatcaatggctattccaaaa
aagacaacaggaggaagagaagtgctaatgacactatcgagcagattagcttggaaagtc
tagacatggatagccctttgaagatgagagtcaacatttccaggcttgacaacaaggagc
acatcctagaactcatgccagccattgagccccttaccaaccacgtgcgctacattatct
cacatggcaatgacgatggcatctttcaaatccatcagagggatggactgagttttttgc
acacagttaagaaaaagtcagtgcctggaactcacacactggagatcaccagcattcccc
tatataagaaaaagcagctgaagaagctggaagacagcaatgagggcaactacctcctag
gagagcttggggaagctctcagaatgaggctgtggatagacctctactag
DBGET
integrated database retrieval system