Chrysoperla carnea: 123293119
Help
Entry
123293119 CDS
T09255
Name
(RefSeq) alpha-sarcoglycan
KO
K27061
epsilon-sarcoglycan
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
123293119
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sarcoglycan_2_C
Sarcoglycan_2
PFF1_TM
SLC52_ribofla_tr
HNF_C
DUF4834
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123293119
NCBI-ProteinID:
XP_044729773
LinkDB
All DBs
Position
1:103471509..103479117
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MSEVFVFKIEPSMFNWTLSYEQVNNDMMIEDEYIYRASLVNKPDLPEWIQYKYSKRYHCG
YLYGVPTPTNNYNYYLNNNNNNNEQHKIIEQLQIIGLNRISYETRLMNLNIHIIDKLHKA
KYEVQLKIDNINIDDMFNNNRNKIDTLLNIFKLKLWRTAYNDLYLTFIDSTINLGGRLPL
HPFDDEGVILRFGSYQPFTSELLELHDEVKPLYKYKTVGHSCPRDFKRTTVDRLFRDLGF
ALDWCSFQLFNVSILLFSRNNNNIDDIANVDRWIQSIYKSQVPERNYSNEFVYTIILPVI
IMSICVWLLSFILCFQHEGISKRFNEEQQQQTTTCTSNNILMNATEQQQNKYTYKTYDND
NDNDNADNTVDTDDNNIIIIKNIINNDNIDNDNDNYKTLTLNQRKTMSYSCNPRCPSPPP
YPGTNTSTTSTLLNNNNNIKHGGRHLQGDDDDDDF
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgaagtatttgtttttaaaatagaaccatcaatgtttaattggacattatcgtat
gaacaagtcaataatgatatgatgatcgaagacgaatacatatacagagcatcgttagta
aataaaccagatttaccagaatggattcaatataaatatagtaaacgctatcattgtggt
tatttatatggcgtacctacaccaacaaataattacaattattatttaaataataataac
aacaataatgaacaacataaaattattgaacaattacaaataattggtttaaatcgtata
tcatacgaaacacgtttaatgaatttaaacatacatattattgataaattacataaagca
aaatatgaggttcaattgaaaatcgataatatcaatattgatgatatgtttaataataat
cgtaataaaatcgatactttattgaatatatttaaattaaaattatggaggacagcgtat
aatgatttatatttgacatttattgattcaacaattaatttgggtggacgtttaccatta
catccgtttgatgatgaaggtgttatattacgatttggtagctatcaaccatttacaagt
gaattattagaattacatgatgaagttaaaccattatataaatataaaactgttggacat
tcatgtccacgtgattttaaacgtacaaccgttgatcgtttatttagagatttaggtttt
gcattagattggtgttcgtttcaattgtttaacgtaagtattttgttattttctcgaaat
aataataatattgatgatattgctaacgttgatcgatggattcaatcaatatacaaatca
caagtaccagaacggaattattcgaatgaatttgtttatacaattatcttaccagttatt
ataatgtctatttgtgtatggttgctgtcatttattttatgttttcaacatgaagggata
tcaaaacgttttaacgaagagcagcaacaacaaacaacaacatgtacatcaaacaatata
ctaatgaatgcaacagaacaacaacaaaataaatacacatataaaacatatgataatgac
aacgataatgataatgccgataacacagtggatacagatgataataatataattatcatt
aaaaatataattaacaatgataatatagacaatgataacgataattataaaacattaaca
ttaaatcaacgtaaaacaatgtcatactcatgtaatccacggtgtccaagtccgccacca
tatcctggaactaatactagtacgacatcaacattgttaaataataataataatatcaaa
catggtggacgtcatcttcaaggtgatgatgacgatgatgatttctga
DBGET
integrated database retrieval system