Chrysoperla carnea: 123294651
Help
Entry
123294651 CDS
T09255
Name
(RefSeq) tuberin
KO
K07207
tuberous sclerosis 2
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn04140
Autophagy - animal
ccrn04150
mTOR signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04150 mTOR signaling pathway
123294651
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04140 Autophagy - animal
123294651
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01009 Protein phosphatases and associated proteins [BR:
ccrn01009
]
123294651
Protein phosphatases and associated proteins [BR:
ccrn01009
]
Protein serine/threonine phosphatases
Phosphoprotein phosphatases (PPPs)
Protein phosphatase-1
PP1-interacting proteins (PIPs)
123294651
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tuberin
DUF3384
Rap_GAP
MOR2-PAG1_C
TIP120
AbiJ_NTD4
ELMO_ARM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123294651
NCBI-ProteinID:
XP_044731685
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(16741181..16753316)
Genome browser
AA seq
1876 aa
AA seq
DB search
MSSSNKENKSFQETLKQFFRLIKSNPGAFKRNELILTEDSIKDISPGTSLPQRTKAIYEL
SEKLVKNKFEELDISKLYSCIEDLLTDQQNRDNRHLAYSLLSCICRHQAERLDILRARFF
KLIQNSEFPEDVVPRFELLIALTSNGKNILNFEEEIGPFLLQCITEVTGAGKTLEYLTLL
VNVIKFHPAYIDEEIITGFVAHVTTICCNSANQQAIVLECLQVLDTIVCYSILPNESLAT
FIAALCRTVNHEVYCQSSWKIMRNLLGTHLGHASLLTMCRVLQEPALANDPGLLRGAVFH
VNMGLWGRHRITSLQCSPTAVLPSFLQALKCNHPLVMYEVMLSIQMLINKFGCELQDPVW
DCILDIIEAIIQYIETSSKSNPNSQVAIHLHETLCNIEQLMEIGSYKGSIKRIFELIERC
APMRPEASVLRLITYLATAIVPTRHLWLSKLNQLLERYFKHETRTNVRLKALDVLSNVVK
LNRTIYEDELMERIVVVHLQNITSDTDVIVREGAANFLANLSKDCESKRCLELLDILDKI
LKRPFEVYGDSMVPAPESDLIDVKAAVVGLINAFVIKIYRLPFSHCLKIYEILVNHLRMH
YAKPHVFENTNFIRYKIFETFLKIRANSAYHIGYPENFGTVVITNRTGIRYSPYIVVDNS
RVNTSNAVTNSPPPGSPANLITQQSLPHNTGSVCVTHVSLKRGFKCFIMCLTQDKDWEVL
HLILQELPKVMQNKTLILSRQGNNDIDLLANALYDMIAGKSLGLPETLKNTPSKLSKHDF
HSHVLPVLGCLASYHAYLESNIQKKIVLSLVKFGLQSRCSRQCITALTTCTLEMRDVMVK
LLPEVLLDLSKISATVHIAIPILEFLSTLTRLPDIFSSFVGDQYMSVFAISLPYTNPFKY
NHYTVSLAHHVIAVWFLKCRLPFRRDFVKFITTGLKTNVIVPFEEGQLFKPDLVSMNEDS
SNRKRSSSLTEQGSRGRRDRTSAPPAPVTRLDARAALDLRPPIDEALNTFHTELTETCID
FMARYTFSPCSALPKRLPTADFLLSGGQSMTWLLGNMLITVTTSGCSTKALKNGLCDKCW
SICKSFSTTTPDTERYAKSSFNRSTSGEDSQSSRITRQSSSDIQKSSQESPVDEKREFIS
TNTLSSIHNTENLEQQLPNKLHQLINADQTKSTEKLICACWCQGWAEICIRRPTGDISWV
MRIQNQISSQNLHNAEFPLSELSTLYLPSLDRQREDRETHRSSSNIEIEIESSIEKSGNS
INNIKTNSVSGPINIPGSPLRQSPSRQNSQESVDDDYDGDIYDDNLKSRNPVRRSNSSPE
MSASWKNPFLTQEKIDKMNVFSGDNEGTSEVSQKKNKSNYCKDMRVSCEAIPEEMSGLGT
TPPTNEAIDTTSQHHLHSYHSYPGTVPQGTDSENTKASATVPSSPITLIGTGQNQSQDLF
KSVIKSNTKPHTTENADSNDKATHTSNRPKNLPVLNHPLTTKPPQSPTQTSPRLQRHLAI
DNSQQKNISPLIRSNTLDKQSKFGHSTENVNNDSRNDLSSMPIRRDRGHTISVMSHVRKP
RIRRTNSPRTKEVPKSGINPSFVFLQLYHSATFGMNDKPLLVGQSQAVQRSLQLLDKIPP
YEIHKVGVLYVGPGQCNNQAAILRNTYGSLRYVQFLQKLGTMIRLQDIDPQVWIGGLEQN
GKDGKFAYVWHDDVMHMMFHVATLMPNQDNDPSCNEKIKHIGNDFVTIVYNESGDDYNMN
TIKTHFNFSCIVIEPLDHNTNRVTVKAREDLAEHIGHSEPKIISDQNLSILTRQLALHAN
LASLISSSLKSSHGNVNVYASNWLERLRHIKRLRSKVLQELVDEKNSNGSVNSPSETETS
TKRNNKLHMDDFTEYT
NT seq
5631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttcgagcaataaagaaaataaaagttttcaagaaaccttaaaacaatttttcagg
cttataaaaagcaatccaggagcctttaaaagaaatgaattaattttaacagaagatagt
attaaagacatcagtcccggtacatctttacctcagagaacgaaagcgatttatgaatta
agtgaaaaattagttaaaaataaatttgaagagctagacatttcaaaattatattcgtgt
atcgaggatttattaactgatcagcaaaatcgtgataatcgtcatttagcgtattcactt
ttatcatgtatttgtcgacatcaagcagaacgtctcgatatattacgagcacggtttttt
aaattaattcaaaactcagaatttccggaagatgttgttcctcgttttgaattattaata
gcactcaccagtaatggaaaaaatattttaaattttgaagaagagattggcccattttta
ctccagtgtataacagaagttacaggtgctggcaaaactttagaatatttaacattatta
gtaaatgttatcaaatttcatccagcttatatcgatgaagaaattataacaggatttgta
gcgcatgttaccacaatttgttgtaattcagcaaatcaacaagcaatagttttagaatgc
ttacaagtattggatactatagtttgttacagtattctaccaaatgaatcattagctact
tttatcgcagctttatgtcgaaccgtgaatcatgaagtgtattgtcaaagtagttggaag
ataatgcgaaatttgttaggaacacatttaggacatgcttcattgcttacaatgtgtcgt
gttcttcaagagcctgccttagcaaatgatccgggattattacgtggtgcggtatttcat
gtaaacatgggattatggggacgtcatagaattacatccttacagtgttcaccaactgca
gtactgccatcttttttacaagctttaaaatgtaatcatcctttagtaatgtatgaagta
atgctaagtattcagatgttaatcaacaaattcggatgtgaattacaagatccggtttgg
gattgtattcttgacatcattgaagctatcatacaatatatagaaacaagttcaaaatca
aatcccaattcacaagtggctattcatttacatgaaacattatgtaatattgaacaatta
atggaaattggttcatataaaggttctattaaacgaatctttgaattaattgaacgttgt
gcaccaatgcgtcctgaagcatctgtattacgattgattacatatcttgccaccgcaatt
gtgccaactagacatttatggctcagtaaattgaatcaattgttagaacgttattttaaa
catgaaactcgaacaaatgttcgccttaaagcattagatgttttgagcaatgttgttaaa
cttaacaggactatatatgaagacgaattgatggaaagaattgtagttgtacatttgcaa
aacataacaagtgatactgatgtaatagttcgcgagggtgctgcaaattttttggcaaat
ttatccaaagattgtgaatcgaaacgttgtttagagctactcgatatactggataaaatt
ttgaaacgtccatttgaagtatatggagattctatggttcctgcacctgaaagtgattta
atagacgttaaagctgcagttgttggtttaataaatgcattcgttattaaaatatatcga
ttaccattttctcattgtcttaagatttacgaaatattagttaatcatttacgaatgcat
tacgctaagcctcacgtattcgaaaacacaaattttattcgttataagatttttgaaaca
tttttaaaaattcgtgcaaattctgcatatcatattggatatcctgaaaattttggcact
gttgtcatcacgaatcgtactggaatacgttacagtccatatattgttgttgataattct
cgagtaaatacttcaaatgccgttacaaattcaccaccacctggtagtccagcaaacttg
ataactcaacaaagtttaccgcacaatactggatcagtttgtgttacacatgtatcatta
aaaagaggatttaaatgtttcattatgtgtctgacacaagataaagattgggaagtactt
catctaattttacaagaattgccaaaagttatgcaaaataaaactttaattttatctcgg
caaggtaataatgatatcgatttattagcaaatgctttatatgatatgattgctggcaaa
tcattggggttaccagaaactttgaaaaacacaccatcaaaactatcaaaacacgatttt
cattcacatgttttaccagtattggggtgtttagcatcttatcatgcttatttagagagt
aatattcaaaaaaagattgttttgtctcttgttaaatttggattgcaatcaagatgctca
cgtcagtgtataacagcgttaactacatgtacgttagaaatgcgagatgttatggttaaa
cttttaccagaagttttacttgatttgtcaaaaatatcggccaccgttcatattgctata
ccaatattagaatttttatctactttaactcgactgccagatatattttcgtcattcgtt
ggtgatcaatacatgtcagtatttgcaatttctttaccatacacaaatccgttcaaatac
aatcattacacagtatcgttggctcatcacgtaattgcagtttggtttctaaaatgtcga
ttaccgtttcgacgagattttgttaaatttataacaaccggattaaaaacaaacgtaata
gtaccttttgaagaagggcaattgtttaagcccgatttagtttcaatgaatgaagactct
agtaatcgcaagcgcagttcaagtttgacagaacaaggatcacgtggtcgaagagatcgc
actagtgccccaccagcaccggtaacgagacttgatgctagagcagcacttgatttacga
ccaccaattgatgaggctttaaacactttccacacagaattgactgaaacgtgtattgac
tttatggcacggtatactttttcaccatgttcagcattacctaaaagattgccaacagca
gattttctattatctggtggccagtcaatgacgtggctgttaggtaacatgttaataacc
gtaaccacgagtggttgttcaacaaaagctcttaaaaatggactttgtgacaaatgctgg
tccatttgtaaatcattttcaacaactacaccagatacggaaagatatgcaaaatcgagt
tttaatcgctctacaagtggtgaagattcccaaagcagtcgaatcacacgtcaaagttcc
agtgatattcaaaaatcatctcaagaatcacctgttgatgaaaaacgagaatttatatca
acgaataccctttcatcgattcataacactgaaaatttagaacaacaattaccaaataaa
ttacatcaactaatcaatgcagatcaaacaaagagtactgaaaaattgatttgtgcttgt
tggtgtcaaggatgggctgaaatatgtattcgtaggccaactggtgatatttcttgggtt
atgagaattcaaaatcaaattagtagccaaaacttacacaatgcagaattcccattaagt
gaattatcaacattatatttaccatcattagatcgtcaacgagaagatcgtgagactcat
agaagctcatcgaatatagaaattgaaattgaatcaagtattgaaaaaagtggcaatagt
atcaataatataaaaacaaactctgtgtcaggccctattaatattcccggctctccattg
agacaatcaccttcacggcaaaattcccaagaaagtgtagatgatgattatgacggtgat
atatatgatgataatttaaaatcaagaaatccagttcgtcgatcaaattccagtccagaa
atgtctgcaagttggaaaaatccatttttaacacaagaaaaaattgataaaatgaatgta
tttagtggagataacgaaggtacatctgaagtatcccaaaagaagaataaaagtaattat
tgcaaagatatgagagtatcttgcgaagctattccggaagaaatgtcaggtttaggtaca
actcctccaacaaacgaagctattgacacaacatcacaacaccatcttcatagttaccat
agttatcctggtactgttccacaaggaactgactctgaaaatactaaagcctcagcaacg
gttccatcatcaccaattacattaattggaacaggacaaaatcaaagccaagatttattt
aaaagtgtaatcaaatcaaatactaaaccacacacaactgaaaatgcagactcaaatgat
aaagctacacatacgagtaatagacctaaaaatcttcctgttctaaatcatccattaaca
actaaaccaccacagtctcctacccaaacatctccaagattacaaagacatctagcaatt
gataatagtcaacaaaaaaatattagcccattaattcgtagtaatacattggataaacaa
tcaaaatttggtcatagcaccgaaaatgttaataatgattctagaaatgatttgtcatct
atgccaattcgacgagatcgtggtcacacaatatcagttatgagtcatgtacgcaaacct
agaatacggcgtacaaattctccacgtacaaaagaagttcctaaatcagggattaatcct
agttttgtttttctacaattatatcactctgctacttttggaatgaatgacaaaccatta
ttagttggacaaagtcaagctgtacaacgaagccttcaactgttagataaaataccacca
tatgaaattcacaaagttggtgtattatatgtgggaccaggtcaatgtaataatcaagca
gcaattttacgtaatacatatggatcattacgttatgtacaatttttacaaaagctgggt
acaatgatccgattacaagatatagatccacaagtatggattggtggtttagaacaaaat
ggtaaagatggtaaatttgcatatgtatggcatgatgatgtcatgcatatgatgttccat
gtggcaacgttaatgccaaatcaagataatgatccatcatgtaacgagaaaattaaacat
attggtaatgattttgttactattgtgtataatgaaagcggtgatgattacaacatgaac
accataaaaacccacttcaatttttcatgtattgtaatcgaacctttagatcataataca
aatcgagttacagttaaggctcgtgaagatttagcagagcatattggacacagtgaacca
aaaataatatctgaccaaaatctttcaattttaacaagacaattggctttacacgctaat
ttggcatctttaatatcgagttcattgaaatcatcgcatggaaatgtaaatgtttacgcc
tcaaattggttagaacgtttacgtcatattaaacgattacgtagtaaagttttgcaagaa
ttagttgatgagaaaaattcaaatggatcggtgaattcaccatcagagacagaaacatcc
actaaacggaataataagcttcatatggatgattttactgaatatacataa
DBGET
integrated database retrieval system