Chrysoperla carnea: 123296146 Help Entry 123296146         CDS       T09255                                  Name (RefSeq) nucleoporin Nup188   KO K14311   nuclear pore complex protein Nup188 Organism ccrn  Chrysoperla carnea Pathway ccrn03013   Nucleocytoplasmic transport Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ccrn00001]  09120 Genetic Information Processing   09122 Translation    03013 Nucleocytoplasmic transport     123296146  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ccrn03019]     123296146 Messenger RNA biogenesis [BR:ccrn03019]  Eukaryotic type   mRNA surveillance and transport factors    Transport factors     Nuclear pore complex      123296146 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Nup188_N-subdom_III TALPID3 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  123296146 NCBI-ProteinID:  XP_044733543 LinkDB All DBs Position 3:59471982..59480203 Genome browser AA seq 1744 aa AA seqDB search MNLQSENLPYWKSIWLTCSGVQQTTARDAVKKDLNDWKDFFLVGLHQFKSQQSEDNHNIK KKPNINEKLWDFVKRLSSFLDVTTDLAWSIITQYLLCEFHGTPTTLQNLTLTYDTSSKLL RDIWYFYTSERMFYLKTLKFILEYHTDINHPYRQEFAEFIEDCNLTVFRESLISQLKLLI SVNINSSDDMNAEMHFLWIKRNLQEQIEILQCISLTHKTNNITPEEFISLLELFSCHRFG TQPIYFNEAALIPQHLQRRLTDCEIALLLCILDSTLVKKNVEKWDTPIKKDVDNWITRLS NEFGDDLSSIVLSWMLIRFNIKFKPNKDIVTATLKQLRVLVTSTTFKDKSQASIIFRKSV YNLLHLIRNRESEEGNEQVYTQCLSQVLKDSETAEHYWKEQDEQMSIPREKWFFPTDFNS YSLVANGLALADNNSYNKVLEETHKMPGICIPFSQSVAKCLVRKNNIYYFRTNYCVINKQ SIPEGSVCILEPEHNPKTVHVQCESNYWVVFSHLLSMCIKSVRGGGKSHFKEVENGLQFW LTILNNIKSKNQLTNDLVKPLNNTFELFNELLLKRNTNTKVYALIIEIMAALHKISVTDD ICERLRQYSFFPVLVDSYLPFEQLVKPTNFIQGRIFELILDYEIIHNKYYLLEAYLKFLR VRFEKNKGDFDAFEIPGIIFILQDILPKFSDWRFDISSPEQTILYNSISLLFDILRESSG NKNNNFQILQKICIFDLLHITNGKVILNIVARGNRYLELIMQSETNWVSGEVIQYLHIVQ MSLTILMLLFQKKSLITSRENDMPLEVLMFTQPKEEDTLQIIRNIASYMDHIFHKQLPVL SCRILRKFALKIQISLHGCFDMDSDQIRHVFIHRLRNKEESNDLKIAILDFIIACVKKQP GLTQTFFSKSSLEENNKTDEESLLSLMEEFLDLMSSETEFLGDPTLRSMMSLFHELWKNQ KQVVVSVMLFNIISIELYMTIYETDANLKAVVKNILNPNEIYFERWINYIFKENISSKIR NNSQDVENNCPHWLSLLQSWKDFMNIIINRYPNFMEPKAKSMMGHACLKALVDQINIMED SRVITVLSELYILMLGAWRESIFDNRTKTIRYLAKIVLLTHNSHRAWHRRIRSAVLSITV CMTRLLKDEIKLNEDYAIKIFNSSCKLACDELNSLETYHRSPSTTMEVEKKELDTELSTQ QESILKINLLNEILIVCHDMTDLYRSCVHMKLCLRLVQCLESIVQIKHLRPITLTILDCV MHLVKTRYADEFLSCELSLKLWLKVLPPKELMLKNRDPFNETLWTTDEWCPLYQRVILIV GLLLRKLQSRFLEDALLFVVIHEGYLIECLSLIRQSIDLNALNVVESTVTFICEIMQFQK QWKPYHAESYIQIIKALTTGLYCTIALLLRPNHIQSYKYHDNTSNADDPISQTRIIDILN KLVDLVTKITQVLLKQSPPLMTLLCNHSSFMEPSSIILDLEFNLPNLRNDDDVELSFGTI MAAINLLSRALQQIYIDESKNENTGIMSRSQLSPRKRLGPSITSNSTKINSNSDFTDLYP SSPSVNISNTSWFRHLDKNKSIRALEVMLSLLASQTLIYLFDKQEPRKNRQLICREISSE LGVFHEYVKLISRGWSSRGFEDYSVIPRIKLGCSPIHEKVTIEPRDLSLQYYEEEFNPYT LEKTMFSDLRKQIVDVYLKNSRELIGSQSDGDPIVILSKVKFDFPDYFIFISNLFVSICK REEY NT seq 5235 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaacttgcaatcagaaaatctgccgtattggaaaagtatatggttaacatgctctggc gttcaacaaaccacagctcgagatgctgtgaaaaaagatttgaacgattggaaagatttt tttctagttggattacatcaatttaaaagtcaacaaagtgaagataaccataacataaaa aaaaagccaaatatcaatgaaaaattgtgggatttcgtaaaacgattaagctcttttctc gatgtgaccacagatcttgcttggtcaataatcacacaatatttattatgcgaatttcat ggaacaccgaccacactacaaaatttaactttaacatatgatacctccagtaaattatta cgcgatatttggtatttttatacatcagaacgtatgttctatttaaaaaccctaaaattt attttggagtatcacacagatattaaccatccatatcgtcaagagtttgcggaatttatc gaagattgtaatttaactgtgttcagagaatctttaatatcacagttaaaattgttaata tctgttaatattaattcaagtgatgatatgaacgcagaaatgcattttttatggattaaa cgaaatttacaggaacaaattgaaatattacagtgtatcagtttaacccataaaacgaat aatattactccagaggaatttatttctttgttagaattatttagttgtcatcgatttgga acacaaccaatttattttaatgaggctgccctgataccacaacatttacaaagacgttta actgactgtgaaattgcattacttctttgcatattagatagcactttagtgaaaaaaaat gtggaaaagtgggatacaccaattaaaaaggatgtagataattggataactcgtttatct aacgaatttggtgatgacttatcatcgattgttttatcgtggatgttaattcgatttaat atcaaattcaagccaaataaggatattgtaacggcaacactcaaacaattgcgagtactt gtcacaagcactacattcaaggataaatcccaagcatcgataatctttcgtaaaagtgtt tacaatttattacatttgataagaaatcgagaaagcgaagaaggcaacgaacaagtgtat acgcagtgtttatcacaagttttaaaggattctgaaacagctgaacattattggaaagaa caagatgaacaaatgtcgataccgagagaaaaatggttttttccaactgattttaatagt tacagtttggttgccaatgggttagccctagctgataataatagttataataaggtactc gaagaaacacacaaaatgcctggcatttgcattccattttcacaaagtgtagctaaatgt ttagttcgcaagaataatatttattattttcgcactaactattgcgtaataaataaacag agcattcccgaaggaagtgtttgtattcttgaaccagaacacaatccaaaaacagttcat gtacaatgtgaatcaaattattgggttgtattttcacatttattgtcgatgtgtataaaa tcagtacgaggtggtggaaaatcacatttcaaagaagtggaaaatgggctacagttttgg ctaacaattttaaataatattaaatcaaaaaatcaattaacaaatgatctagttaagccg ttaaataatacttttgagttatttaatgaattattactaaaacgtaatacaaatacaaaa gtttatgctttgataatagaaattatggctgctttgcataaaatatcagttactgatgac atttgtgaaagattacgtcaatatagtttttttcctgtattagttgatagttacttaccg tttgaacaacttgttaaacccacaaatttcatccagggtcgaatttttgaattaatttta gattacgaaattattcacaacaaatattatttattggaagcttatttaaaatttcttcga gttagatttgagaaaaataaaggagattttgatgctttcgaaataccaggaataatattt attttacaagatattttaccaaagttttctgattggagattcgatattagttcccctgaa caaacaattttatacaatagtatttcgctattgtttgatattttgcgagaatcctctggt aacaaaaataataattttcaaattttacaaaaaatatgtattttcgatttattgcacatt acaaatggcaaagtgattttaaacatagtggcacgtggaaatcgttatttagaattaatt atgcaatcagaaacaaattgggtatccggcgaagttatacaatatttgcatattgttcaa atgtcgttaacgattttaatgttacttttccaaaagaaatctttgattaccagcagagag aatgacatgccattagaagttcttatgttcacacaaccaaaggaggaagatacattacaa attattcgaaatattgccagctacatggatcacatatttcataaacaattaccagtgctt tcttgtcgaattcttcgaaaatttgcattgaaaatacaaatttctttacatggatgtttt gatatggattccgatcaaattcgacatgtttttattcatcgattacgtaataaagaagaa tcaaatgatttaaaaattgccatattagattttataattgcatgtgttaaaaaacaaccg ggattgacacaaacattcttctcaaaatcatcattggaagaaaataataaaactgatgaa gagagcttattaagtttaatggaggaatttctcgatttaatgtcatcagaaacggaattt ttaggtgatccaacattacgatctatgatgagtctgtttcatgaattatggaagaatcaa aaacaagttgttgtatctgtaatgctttttaatattatcagtattgaattatacatgacc atatatgaaactgatgcaaatttaaaagcagtagttaaaaatattttaaatcctaatgaa atttatttcgaacgatggattaattatatttttaaagaaaatatttcatcaaaaattcga aataattcgcaagatgttgaaaataactgtccacattggctatcgttattacaatcgtgg aaagattttatgaatattataataaatcgatatccaaattttatggaacctaaagcaaaa tctatgatgggacatgcttgtttaaaggcacttgtggatcaaatcaatattatggaagat agtcgtgtaattaccgtgttatctgaactttatatactgatgttaggtgcttggagggaa agtattttcgataatcgtacaaaaacaattcggtatctcgccaaaatcgtattattaaca cataattcacatcgagcttggcatagacgtattcgatccgctgtattgtcaattacagtg tgcatgacacgtttgttaaaagatgaaattaaattaaatgaggattatgccataaaaata tttaattcatcttgtaaattagcatgcgatgaattgaattcattagagacatatcatcga tcgccttcaactacaatggaagttgaaaaaaaagaattggataccgaattatcaactcaa caagaatcaattttaaaaattaatttattaaatgaaattttaattgtatgtcacgatatg actgatttgtatcgcagttgcgtacacatgaaactgtgtttacgtctagttcagtgttta gagtcgattgtgcaaattaaacatcttcgacctattacgttaacaattttagattgtgtt atgcatttagttaaaacacgatatgcagatgaatttttaagttgtgagttgagtttgaaa ttatggttgaaagttttaccaccgaaagagttaatgctcaaaaatcgtgatccttttaat gagactttgtggacaaccgatgaatggtgcccattatatcagagagtaattttaatagta gggctattattacgtaaacttcaaagtcgatttttagaagatgcattgttatttgttgtg attcatgagggctatttgattgaatgtttatcacttattcgtcaaagtatcgatctaaat gcattgaatgttgttgaatctacagttacctttatatgtgaaataatgcaatttcaaaaa caatggaaaccttatcatgccgaatcatatattcaaattattaaagcattgacaactggt ttatactgtacaattgcattattattacgaccaaatcatattcaaagttataaatatcat gataacacatcgaatgctgatgatccaatatcacaaacacgaattattgatattttaaat aaattagttgatcttgtcaccaaaattacacaagttttgttaaaacaatctccaccatta atgacattactttgcaatcacagttcatttatggaaccaagttcaatcatattagacttg gaattcaatttaccaaatttaagaaatgatgatgatgtagaattaagttttggtacaata atggccgcaattaatttactttctcgagcactacaacagatatatatcgatgagtcaaaa aatgagaatactggaataatgtcacgtagtcaattaagccccagaaaacgtttgggccct tcaattacaagtaatagtacgaaaattaattcaaactctgattttacggatttgtatcca tcatcaccgtcagtgaacataagtaacacatcgtggttccgacatttagataaaaataaa tcgatacgggcgttggaagttatgttaagtctgctcgcgtcacaaactctaatttattta tttgataagcaagaaccacgaaagaatcgacaacttatatgcagagaaattagctctgaa cttggtgtatttcatgaatatgttaaactcatttctcgtggatggtcctctcgtggtttc gaagattattcagttataccacgaataaaacttggatgcagtccaatacatgaaaaagtc actattgaacctagggatttgagcttacaatattatgaagaagaatttaatccgtatacg ctagagaagacaatgttttctgatttgagaaaacaaattgttgatgtttatttgaaaaat tcacgagaattaattggttcacaatcagatggtgatcctattgttattttaagtaaagtt aagtttgattttcctgattattttatttttatttcgaacttatttgtatcaatttgtaaa cgcgaagaatactaa

DBGET integrated database retrieval system