Chrysoperla carnea: 123297318
Help
Entry
123297318 CDS
T09255
Name
(RefSeq) elongation factor-like GTPase 1
KO
K14536
ribosome assembly protein 1 [EC:3.6.5.-]
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
123297318
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ccrn03009
]
123297318
Ribosome biogenesis [BR:
ccrn03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
GTPases
123297318
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
EFL1
EFG_C
EFG_III
GTP_EFTU_D2
EF-G_D2
EFG_IV
MMR_HSR1
G-alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123297318
NCBI-ProteinID:
XP_044734864
LinkDB
All DBs
Position
4
Genome browser
AA seq
1043 aa
AA seq
DB search
MRVVSQSKLVELQNKPSNIRNICILAHVDHGKTTLADSLVASNGIISQKMAGKLRYMDSR
KDEQERGITMKSSCITLYFSPIPETEVLVNLIDSPGHVDFSSEVSTAVRLCDGAIVVVDV
VEGVCPQTRVALKQAWLENIKPILILNKIDRLITEMKLSPLDAYIHLTQVLEQMNAVMGE
LFLTEVMEKTDTVPENSITTSKNKDQENVYDWSTGVEDADDSNLYFSPETGNVIFASAVD
GWGFGVQEFAKMYSEKLGFKEELLNKVLWGDFYLNSKTKRVMKGAQEKAKKPLFVQLVLE
NIWNLYDILILRKDREKVGPIVEKLGIKLTTRDLRLTDMRLLLQAITNQWLPLANAVLNA
VYKKLPSPLEITSEKVEKLMCSQNTRFDFLPPQTQALKEHFLACKSTSDVPVIVYISKMF
PIEKKSLPENKPKPLTMEEIAQRRELARSRHAQKQLDIENATTPLADQPEVENVSPELVK
DDDEDAFVAFARVFSGVLRKGIELYVLGPKHNPADALKSSDIDPNLTLKDLRGNQHVTKV
TIESLYLLMGRELELLEEVPAGNVLGIGGLDEHVLKTATLSTSLFCPSFTEMQLMAVPIV
RVAVEPKNPADIPKLRKGLRLLNQADACVQVLIQETGEHVLITAGEVHLERCIDDLQQRY
AKIELNVSEPIVPFRETIVEPPKVDMVNETIEVSKKEETDTLITIWTPNKQMCLSLRALP
LPQNVATLLENNNDLLKTVDKVFGRKKIVEKLCELKINELLAERTLKRITSLKDELEKEF
MQDSEKWKGIVDNMMCVGPRKCGPNVFWNKVKDYPRSSMWEIFNELSDPRIDFDASLLNG
FQLATLSGPMCEEPMMGVCFVLESWSYDPTVVDTGVYGPLSGQVVSVVKDGCRKAFQAQP
QRLMAAMYSCNILANTEVLGKMYAVLGRRNGRILSGDMTQGSANFVVTAVLPVVESFQFA
TEIRKQTSGLASPQLVFSHWEIIEIDPYWTPNTEEEYLHFGEKADSANRARQYMDSVRRR
KGLHVETKLVEFAEKQRTIKKNK
NT seq
3132 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgggtcgtttctcaatcgaaattagttgaattacaaaataaaccatcaaatatacga
aatatttgtatcttagcccatgtcgatcatggaaaaacaaccttggcggattcgttggtt
gctagtaatggtattatttcacaaaaaatggcaggaaaattacgctatatggatagtaga
aaagatgaacaagaacgtggtataactatgaaaagtagttgcataacattatacttttca
ccgattccagaaactgaagtacttgttaatttaattgattcaccggggcatgttgacttt
tcttcagaagtgtccacagctgtacgtttatgtgatggtgctatagttgttgttgatgtt
gttgaaggtgtctgtcctcagacgagagttgcattgaaacaagcttggttagaaaatatc
aaacctattttaattttaaataaaatcgatcgattaatcaccgaaatgaaattatctcca
ttagacgcttatatacatttaactcaagttctagaacaaatgaatgctgttatgggagag
ctttttcttactgaagttatggaaaaaacggatactgtacctgaaaatagcataactaca
tccaaaaataaagatcaagaaaacgtttatgattggagtactggtgttgaagatgcagat
gattcaaatttatatttttcgccagaaaccggcaatgtaatttttgctagcgctgttgat
gggtggggatttggcgtacaagagtttgctaaaatgtattcagaaaaattaggatttaag
gaagaacttttaaataaagtattatggggtgatttttatttgaattcaaaaacaaaacgg
gttatgaaaggtgctcaagagaaagcaaaaaaaccactttttgtccagctggtgttggag
aatatttggaatttatatgatattttaattttgcgtaaagatagagaaaaggttggtccg
attgtcgaaaaattaggtattaaattaacaacacgcgatttacgacttactgatatgcga
ttattgttacaagccattacaaatcaatggcttccattagcaaatgctgttcttaatgct
gtttataaaaaattaccgtcccctttggaaattacgtcggagaaagtagaaaaattaatg
tgctctcaaaatacgagatttgattttttaccacctcaaacacaagcattaaaagaacac
tttttagcgtgtaaaagtacctctgatgtcccagtgatcgtttatatatctaaaatgttt
ccaattgaaaagaaaagtttacccgagaataaacccaaaccattaactatggaagaaatt
gctcaaagacgtgaattagcacggtcaagacatgctcaaaaacagttagatatagaaaat
gcaacaactccactagcagatcaacctgaagtggaaaatgtttcaccagagcttgtaaag
gatgatgatgaagatgcgtttgttgcatttgcaagagtttttagtggcgttttacgaaaa
ggtattgaattgtatgttttaggaccaaaacataatcctgctgatgctttgaaaagttct
gatattgatcctaatttaacgctaaaagatttgagaggaaatcagcatgtgacaaaagtt
acaattgaaagtttatatctactaatggggcgagagttagaattgttagaagaagtacca
gcaggaaacgttttaggaataggtgggttagacgaacatgttttgaaaacagctacactc
tcaactagcctattttgtccttcgtttacggaaatgcaattaatggctgtaccaattgta
cgagttgcagtggaacctaaaaatcctgctgatataccgaaattgcgtaaaggtttgcgg
cttttaaaccaagcagatgcttgcgttcaagttttaattcaagaaacaggagaacatgtt
ttaattactgccggtgaagtacatttagaacgatgcatagatgaccttcaacagcgctat
gcgaaaatcgaattgaatgtatcggagccaattgtaccatttcgcgagactattgttgaa
ccaccaaaagttgatatggtaaacgaaactattgaagtaagcaaaaaagaggaaactgat
acattaattacaatatggactccgaacaaacaaatgtgccttagtttaagagcattgccg
ttaccacaaaatgtcgcaactcttttagaaaacaataacgatcttttaaaaactgttgat
aaggtttttggtcgtaaaaaaattgtcgaaaagttatgtgaattaaaaataaatgaatta
ttagctgaacgtacgctgaaacgaataacatctttaaaagacgaattagaaaaagaattc
atgcaagattccgaaaaatggaaaggtattgttgataacatgatgtgtgttggtccaaga
aaatgtggaccaaatgttttttggaataaagtaaaagactatccacgatcatcaatgtgg
gaaattttcaatgaattatccgatccgcgtatagattttgatgctagtttattgaacggg
tttcaattagctacgttatcgggaccgatgtgtgaagaacctatgatgggtgtgtgtttc
gtgttagagagttggtcgtatgatccaacagttgttgacactggtgtgtacggaccatta
tcgggacaagttgtgtcggtagtgaaagacggttgtaggaaagcgtttcaagcacaacca
caacgattaatggctgctatgtattcttgtaacattttagcaaatactgaagttttagga
aaaatgtatgcagtacttggacgaagaaatggacgtatattatctggtgacatgacacaa
gggtccgctaattttgttgtaacagctgtattacctgttgttgaaagttttcaatttgct
actgaaatacgaaaacagacatcaggacttgcaagtccacaattggtcttcagccattgg
gagataattgaaattgatccatattggacaccaaatactgaagaagagtatttacatttt
ggtgagaaagcagattcagctaatcgtgcacgacagtatatggattcagtgagacgtcga
aaaggattacatgttgaaacaaaattagttgaatttgcagaaaaacaacgtactattaag
aaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
