Chrysoperla carnea: 123298303
Help
Entry
123298303 CDS
T09255
Name
(RefSeq) exportin-5
KO
K14289
exportin-5
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
123298303
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ccrn03016
]
123298303
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ccrn03036
]
123298303
Transfer RNA biogenesis [BR:
ccrn03016
]
Eukaryotic type
tRNA transport factors
tRNA export factors
123298303
Chromosome and associated proteins [BR:
ccrn03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
microRNA pathway
Other miRNA pathway proteins
123298303
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exportin-5
Xpo1
IBN_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123298303
NCBI-ProteinID:
XP_044736204
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(24724322..24731488)
Genome browser
AA seq
1204 aa
AA seq
DB search
MAIGNVSALAAELARAVEITMSLEASQAARREAYDACDRFKETSPLCAEVGLYLVANVNH
SPVARHFGLQLMEHTVKYRWNQISQTEKIFIKENAMKLVACGNVGDEPHMKDALSRVVVE
MVKREWPQQWPSLLDELSIACNRGTAQTELVLLVFLRLVEDVALLQTLESNQRRKDIYQA
LTTHMSEIFAFFLRLIELHVSQFRVNTDGGNVALAQSHGRVVQVVLVTLTGFVEWVSISH
IMSNGGRLLEILCILLNDNAFKNSAAECLVQIVNRKGKPEERKPLLILFNDDAARCILAA
VQTERLNFDEQHYLFLKKLVQVLNGLASQLCYLWGRDYGIQSRPANFQLFLDTILCFSRH
PSLTLVHLANPIWAALMKQDLIARDTVFLSYIPLWLEYTAPKVIKIPYPTGRNTGHSIYD
TATYIRYDYDSEEEYISFFNRCKADIAETFRQATIIAPLVTFSYVEQWLIKCLQQPAQFT
SGLGIHDPICLEWEACSQILDSVLGKILQATERPSIASGLKLLEMCLNYEPSDPLLLSTL
LTCISALFVFLSMSTGQMTSTGTCMAISGANLLPRVLDKIFSTLLFSPDGQSKDSRSRAV
KNVRRHAASLMVKIGQKYPLLLLQMFDQIRTTINNLNRQEGPAQLSMLEKVTLQEALLLI
SNHFCDYERQTLFVGEVIAEAHAQWLTIANAGAFQNARQFMHFVGLDQPPVQPGVNDSVG
QNRSQLVYCINMVLGVVNRCAWPDDPERAQRGGFVVGLTESGNPVCRNPATPHVVPLLPH
ILSLMRVFNELWNREAQLQLSAGYQGALGMLDVERTNLLGLIGYVPPTPDSFDHPSKPHN
PLERMQNFLTGIHDSCYHILGSASLSLGRDLYQLPGLGPAIVESVLASLEEVPDYRLRAL
IRVFLKSFIYSCPPAFYESVVLPIAEHIFPFMTGRLMTKWPKLSPDCASPNDNEETNDTQ
EVLEDILIRALTREYIDVFRVALIGGSLPANNMMEMEDSSMDTPLTSRNTVMTEVISDLG
NILLRNEKTCVHIVLTILGAISCNDSIASYKATQLVTPVIRFIVDSNSLTDEMAAQVMGH
MLRALALHGQHQTNQGCLLSFGAQLYELLRPKYPSVVHIMQQIPNVNTTDLQKLDEKIAA
GSTKGNKVDKTKKELFRKLTNSLIGRSIGQLFKREVKIENLPQLVLASRPKTAPVDAPLL
NSFF
NT seq
3615 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctatcggaaatgtatctgccttagctgcagaattagctcgtgcagtggaaattaca
atgagtttagaagcatcacaagcagcaagacgtgaagcttatgatgcatgtgatagattt
aaagagacatcaccgttatgtgctgaagttggtttatatttggttgccaatgtgaatcat
tcgcctgttgcacgacattttgggttgcagttaatggaacatactgtgaaatatcgatgg
aatcaaatctcacaaacggagaaaatatttattaaggaaaatgccatgaaattagttgca
tgcggaaatgttggcgatgaaccccatatgaaagatgccctcagtcgagttgttgtagaa
atggtaaaacgtgaatggcctcaacagtggcctagtctattggacgaattaagtatcgca
tgcaatcgtggaactgcacagactgaattagtattactggtgtttttaagactagttgaa
gatgtggctttactacagaccttagaatcgaatcaaaggcgaaaggatatttatcaagcg
cttacaacgcatatgtcagaaatattcgccttttttctacgtttaatcgaattacatgta
agtcaatttagagttaatacggatggtggaaacgtggctttagcgcaatcccatggtcga
gttgtacaggttgtcctcgttaccttaaccggcttcgtagaatgggtttcgatttcacat
ataatgtcaaatgggggccgactactagaaatattatgcattttattaaatgacaatgca
tttaaaaattcagcagctgaatgtttggtacaaattgtaaatcgtaagggaaaacctgaa
gaacggaaaccattattgatattattcaatgatgatgcagcacgatgtatattggcagcc
gtacagaccgaacgattaaattttgatgaacaacattatttattcttgaagaaattagtt
caagttttaaatggtctagcatcacaattatgctatttatggggacgagattatggaata
caaagtcgaccagcaaattttcaattatttttagacactattctatgtttttcacgacat
ccaagtttaactttagtacatttagcaaatccaatatgggcagctttaatgaaacaagac
ttaatagcacgtgacacggtatttttatcctacatacccttatggttagaatatacagct
ccaaaggtaataaaaattccttatccaaccggacgaaatactggacacagtatttatgac
acagccacatatatacgatacgattatgatagtgaagaggaatatatcagcttttttaat
cggtgtaaagctgatattgcagaaacatttcgtcaagctacaattatcgccccattagtg
acattcagttacgtggaacaatggctaataaaatgtttacaacagccggcacaatttaca
tcgggtttgggtatccacgatccaatatgtttagaatgggaagcatgttcacagattttg
gattcagttcttggaaaaatattacaagctacagaacgcccatcaattgcttcagggcta
aaactgttggaaatgtgtttaaattatgagccttcagacccacttctcttatcaactcta
ctgacttgcatatcagcgttattcgtattcttaagtatgtccactgggcaaatgacgtca
actggtacatgcatggcaatatccggggcgaatttattacctcgtgtgctggataaaata
ttttctactttactgttttctcctgatggacaatcgaaagattcacgatcacgtgctgtg
aagaatgttcgacggcatgctgcatcgttaatggttaaaattggacaaaaatatccactg
ttattgttacaaatgtttgatcaaattcgtacgactattaataatttaaatcgacaagaa
ggtccggctcaattgagtatgttagaaaaagttactttacaagaagcgttactacttata
tcaaatcacttttgcgattacgaacgccaaacattattcgtcggtgaagtgatcgctgaa
gcacatgcacaatggttgacaatagcaaatgctggagcatttcaaaatgcacgacaattt
atgcatttcgtgggcttagatcaaccaccagtacaacctggtgtcaatgatagtgttgga
caaaatcgtagccaattagtatattgtataaatatggtactgggtgtagtaaatcgatgt
gcttggccagatgaccctgaacgtgctcaacgtggtggatttgtagttggacttactgaa
tcgggtaatcctgtgtgtaggaatccagcaacacctcatgtagtcccattattaccacac
atactatcattgatgcgtgtttttaatgaattatggaatcgggaggcacaactacaactc
tcagcaggatatcaaggtgcacttggtatgcttgatgtggaacgtacaaatttattgggc
ctaattggatacgtaccaccaacaccagacagttttgatcatccaagcaaaccacataat
cctttagaaagaatgcaaaactttttaactggtatccatgattcgtgttatcatatttta
ggatcggcaagtttatcattgggacgagatttatatcaattacctggtttaggacctgct
attgttgagagtgttttagctagtttagaagaagtacccgattatcggctacgagcatta
attcgagtatttttaaaatcatttatttactcatgtccgccagcattctatgagagtgtt
gttttaccgattgccgaacatattttcccgtttatgactggtcgtttaatgacaaaatgg
ccaaaattatcaccagattgtgcaagtccaaatgataacgaagaaacaaatgatactcaa
gaagtattagaagatattctaattagagcgttaacacgagaatatattgatgtatttcgt
gttgcattaattggtggtagtttaccagcaaataatatgatggaaatggaagattcatcc
atggatacaccattaacatcacgtaatactgttatgactgaagtgatctccgatttaggg
aatatacttttacgaaatgaaaagacttgtgtacatatagttttaacaattttgggtgct
atatcttgcaacgacagtatcgcatcttataaggcaacacaattagtaacaccagtaata
cgatttatagtagacagtaattcattaacagatgaaatggccgcccaagtaatgggtcat
atgttacgtgcactagcattacatggacaacatcagacgaatcaaggttgtttactatca
tttggtgcacaattatatgaattattacgtccaaaatatccaagtgttgtgcatataatg
caacaaataccgaacgttaatacaacagatttacagaaactagatgaaaaaattgctgct
ggcagtactaaagggaataaagtggataaaactaaaaaagaattatttagaaaattaaca
aattcattaattggacgaagtattggacaattatttaaaagagaagtgaaaattgaaaat
ttaccacaattggtattagcaagtcgacctaaaactgcacccgttgacgctcccttacta
aattcatttttctaa
DBGET
integrated database retrieval system