KEGG   Chrysoperla carnea: 123298753
Entry
123298753         CDS       T09255                                 
Name
(RefSeq) VPS35 endosomal protein-sorting factor-like isoform X1
Organism
ccrn  Chrysoperla carnea
SSDB
Motif
Pfam: HGTP_anticodon WHEP-TRS tRNA-synt_2b Vps35
Other DBs
NCBI-GeneID: 123298753
NCBI-ProteinID: XP_044736786
LinkDB
Position
1:44712460..44726445
AA seq 1618 aa
MSTDNLEWSFNRKILQVPKNLNRVLVCDHPLRPNVTLVTESRITRRGYGDSTSASTESST
PIRTPSLDPLSSGFNGEDPLHQFARAAQDPLSEMVEEMKWQDEDDVRVRKKSKEAYPEDS
IEPWCNRRAAILAKYTTSEKLSIVTSFLSGGEKVVVKAQSSTVDKVKTRLEQLDEFEEGS
VRHEGDLSQQEYTVRIEQLNTELVSAWKGDQKVRALKIAIQCAKLLADTSVMSFYPSKFV
LITDILDIFGKLVYERLRVKAEYHLPGNKVAKHLPENFTPDMVLEPAKETCRNWFYKIAS
IRELVPRLYIEMAILKSYSFLTSSEFSDALMRLTHMIRGIGHPIVAIYARCYLCRVGMLV
STPNTDRRYLSENFRDFLASYNQVLSNAVRTECQRQKMEISAYFSLYPPALDWILQAASA
TSQAPPLLDQLLEQCQKLNNSGLLLNTIMASFKPNLIADRAPQFVEMITKCNNESFPSYV
LFRTLGLCLALNPPPQEFRRPVLNNVWNKVSNLSNPNHYIHCAEVWVQYAVVNFSSREVN
TFLGDIIKNMTPNRAYENFYPQLQLILEKVVNHTQDFESLLMMNNFLPLLDLFQKENVRV
DACRIVITAFSNQNLTVSDPIVINALMFVCRILHDSVNALTVDDERRQIGNLLTNFVKRV
NYGRDFEQQLNFYVEARAAFTNLDPVLAQLVQCVNRLSVDTRLVVKGNHTRKTAAFVRAC
AAYCYITIPSIISAFTRMELYLLSGQVALFNQCLGQADACFKAVLSLIADIPRTLEVDGK
QCSTDQYLISYLRNFLSTLLVVPDSPEQSTLYLLRSLLGILQNYAWGPNNSSRAYVFLNV
LDLIAVASKETYPYHIDKIDSNDSLYGSDPKFIEELNKIATLIVEDLLAHLKYLGEQNEY
RIQSNLAVELSVRIMLRADLNNKRLATLAFNLWQLAQKHKTMADPKIEEILAPLRASVKE
QGDLVRELKAQGAPELNVKKAVAELKARKKILEDKELSLVPDSATFDRAKMEDLLKRRFF
YDQSFAIYGGITGQFDFGPMGCSFKSNMLDAWRKFFVLEEQMLEVDCSILTPEPVLKASG
HVDRFADLMSKDVKTGECFRVDHLIKAHLEKLSADKKATDDVKAECKDIVIKLDGMNKDE
MAAIMKKYNMKSPLTGNDLTEPLEFNLMFETQIGPSGLIRGFLRPETAQGIFVNFKRLLE
FNQGRLPFAAAQIGNAFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFCDPIDKNHGKFDSVRDTEV
TLYSACNQMDGKSAEKRTIGDAVKEGLIANETLGYFMGRIYTFLLKIGVHPTKLRFRQHM
NNEMAHYACDCWDAECLTSYGWLECVGCADRSAYDLSQHTKATGVRLVAEKKLPEPKVVK
FVEPVIDKRTLGSEFKQKAKVITETLVSLDKNQLEDLDKELNSNGEYTLKVGNDEYKLKR
NHVPSIKSYEKTVHVEEIIPSVIEPSFGIGRIMYAVFEHNFKMREGDEQRTYLSIPAVVA
PLKCCVLPLSGNPEFESFVKVVSNELTNVGMSYKVDDSSGSIGRRYARTDEIAIPYAVTI
DFDTIGTDTVTLRERDSMQQVRIPIKEVGSCVRDLISEKLTWSSVVEKYPKFEQQENK
NT seq 4857 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctacagataatttagaatggtcattcaaccgaaaaatattacaagttccgaagaat
ttaaatcgagtcttggtttgcgatcatcctctgagaccgaacgttactttggtaacggaa
agtcgtataacccgtcgaggatatggagatagtacgtcggctagtactgaatcctctacg
ccaattcgcactcctagtttagatcctttatcatctggattcaatggagaagatccttta
catcaatttgctcgagctgctcaagacccactttcagaaatggttgaagaaatgaaatgg
caagatgaggatgatgttagagttcgcaagaaaagcaaagaagcatatcctgaggatagt
atcgaaccgtggtgtaacagacgtgccgcaattttagctaaatataccacatctgaaaaa
ttatcaattgtcacgagttttctttccggtggagaaaaggttgtagttaaagctcaaagt
tcaactgtcgacaaagtaaaaacacgattagaacaattagatgaattcgaagaaggctcc
gtacgacatgaaggtgatttatcacaacaagaatatacagttcgaatcgaacaattgaat
actgaattggtatcagcttggaaaggtgaccaaaaagttcgagccttaaaaattgcaata
caatgtgcaaaattattagctgatacatcagtaatgtcgttttatcccagtaaatttgta
ctcattactgatattttagatatttttggaaaactagtctatgaaagattgagagtaaag
gctgaatatcatttacctggaaataaagttgcgaaacatttgcctgaaaattttactcct
gatatggttttagaaccagccaaagaaacttgtcgtaattggttttataaaattgcgtcg
attcgagaactggttccaagactctatattgaaatggccattcttaagtcatacagcttc
cttacatccagtgaattttcggacgcactaatgcgtctaactcatatgattcgtggtata
ggacatccaattgttgcaatatatgctagatgttatctttgtcgagtagggatgctagtc
tcaacaccaaatacagatcgtcgatatctctctgaaaatttcagagatttcctagcatca
tacaatcaagttctatcaaatgcagttcgtaccgaatgtcaaaggcaaaaaatggaaata
agtgcatatttttcattatacccgccagctttagactggatattacaagctgcatctgca
acttcacaggctcctccattattggatcaactgctagaacaatgccagaaattgaacaac
agcggattattattaaacaccattatggcatcctttaaaccaaacctgatagcagataga
gcaccacaatttgtagaaatgataactaaatgtaacaatgaaagttttccatcttacgtt
ttatttagaacattaggtctctgtctagccttaaacccaccacctcaagaatttcgtaga
cctgtgttaaataatgtctggaacaaagtctcaaatttatcaaatcctaatcattatatt
cattgcgctgaagtgtgggttcagtatgcagtggtgaatttctcaagtcgtgaagtgaat
acatttttaggagatatcatcaaaaatatgacgccaaatcgcgcctatgaaaatttctat
ccacaattacaattaatattagaaaaagttgtaaatcatacgcaagattttgaatcgttg
ctgatgatgaataattttttaccactcttagatttattccaaaaagaaaatgttcgagta
gatgcatgccgaattgtgattacagcattttcaaatcaaaatttaactgttagcgaccca
atagttattaatgcgttaatgtttgtttgccgtatattacacgattctgtaaatgcatta
actgttgatgatgagcgtcgtcaaattggaaatcttttaacgaattttgtaaaacgtgtc
aattatggacgtgattttgaacaacaattaaatttttacgttgaagcgcgtgctgccttt
acaaatttagatccagtgttagcgcaacttgtgcaatgtgtgaatcgtctatcagttgat
actcgacttgttgtaaaagggaatcatacacggaaaacagcagcttttgtacgagcatgc
gctgcatattgttacataactataccatcaataatatcagcgtttacaagaatggaattg
tatttattatcaggacaagttgcattatttaatcaatgtttagggcaagcagatgcatgc
tttaaagctgtgttatcactgattgcggatataccacgcacactagaagttgatggaaaa
cagtgcagtactgatcaatatctaattagctatttacgaaatttcctctctacactttta
gtggtacctgatagccctgaacaaagtacattatatttactacgaagtttattaggaatt
cttcagaattatgcatggggaccaaataattcatccagagcatacgtttttttaaatgtc
ctagacttaattgctgtggcttcaaaggaaacatatccatatcacattgataaaattgac
tcaaatgactcactttatggttctgatccaaaatttatcgaggaattgaataaaatagca
accttaattgttgaagatttgctggctcatttaaaatatttaggtgaacaaaatgaatat
agaattcaatcaaatctcgccgtagagttaagtgtacggattatgttacgagcagattta
aataataagcgattggcgactcttgcgtttaatttatggcaattagctcaaaaacataag
acaatggcagatccaaaaatcgaagaaattttagctccgctaagagctagcgtaaaagaa
cagggtgacttagtaagagaattaaaagctcaaggagctcctgaattaaatgttaaaaaa
gctgtagctgaattaaaagcacggaaaaaaatcttagaagataaagaattgagtctggta
ccagattcggcaactttcgatcgtgcgaaaatggaagatttattaaaaagacgatttttt
tatgatcaaagttttgctatatacggtggaatcactggccagtttgattttggaccaatg
ggttgttcgttcaaatcaaatatgctcgatgcttggcgtaaattttttgttttagaagaa
caaatgcttgaagttgattgttcaattttgacaccggaacctgttttaaaggcttcaggg
catgttgatcgatttgctgatctaatgtcaaaagatgtaaaaactggcgaatgttttcgt
gtagatcacttaataaaagcgcatttagaaaaattatcagctgataagaaagctactgat
gacgttaaagctgaatgtaaagacattgttatcaagttagatggaatgaataaagatgaa
atggcagccattatgaaaaaatacaatatgaaaagccctctcactggaaacgatcttacc
gaaccgcttgagtttaatttaatgtttgaaactcaaatcggaccaagtggtttaattcga
ggatttttgagaccagaaacagctcaaggaatattcgtaaattttaaacgactactagaa
tttaatcaaggaagattaccgtttgcagccgctcaaattggtaatgcattccgtaatgaa
atttcccctagatcaggattaattcgtgtacgagaattcacaatggctgaaatagaacat
ttttgtgatccaattgataaaaatcatggaaagttcgatagtgttcgtgatacagaagtt
actttatactcagcttgcaatcaaatggatggaaaaagtgcagaaaaaagaactatagga
gatgctgttaaagaaggtttaattgcaaacgaaactcttggatatttcatgggtcgtatt
tatacatttttattgaaaattggtgtacatcctactaaacttcgattcagacagcatatg
aataatgaaatggcacattatgcttgtgattgttgggatgcagaatgtcttaccagctat
ggttggcttgaatgtgtaggatgtgcagatcgatcagcatatgacttatcgcaacataca
aaagctaccggagtcagattagtcgctgaaaagaaattaccagaaccaaaagtcgtaaaa
tttgtggaacctgttattgataaacgtactctcggttcggaatttaaacaaaaagctaaa
gtgattacagaaactttagtatcattggataaaaatcaattagaagaccttgataaagaa
ttaaattcaaatggtgaatatactctcaaagttggaaacgacgaatataaattaaaaaga
aatcatgttccttctatcaaaagttacgaaaaaactgttcacgtagaagaaattatacca
agtgttattgaaccttcttttggaattggccgcattatgtatgctgtgttcgaacataac
ttcaaaatgcgagaaggtgacgaacagagaacttatttatctatacctgcggttgtagca
cctttaaaatgttgtgtcttaccattgtctggaaatccggaattcgaaagctttgtaaaa
gttgtttcaaatgaattaacaaatgttggaatgtcatataaggtagacgatagtagtggt
tctattggtcgaagatatgcacgtactgatgaaattgctataccatatgcagtaacaatt
gattttgataccattggaacggacactgtgacattgcgtgaaagagattccatgcaacaa
gttcgaataccgataaaagaagttggaagttgtgtccgcgatttaatttcagaaaaatta
acctggagtagcgttgtagaaaaatatccaaaattcgaacaacaagaaaataaataa

DBGET integrated database retrieval system