Chrysoperla carnea: 123299899
Help
Entry
123299899 CDS
T09255
Name
(RefSeq) glutamate receptor ionotropic, kainate 2 isoform X1
KO
K05313
glutamate receptor, ionotropic, invertebrate
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
ccrn04040
]
123299899
Ion channels [BR:
ccrn04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
123299899
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Lig_chan-Glu_bd
SBP_bac_3
Peripla_BP_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123299899
NCBI-ProteinID:
XP_044738242
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(42651751..42940063)
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MELCSNINCSANKNNTIICIVKYLVIFIHLFHSVNSLPDVIRIGGLFHPADDKQEIAFRY
AVEKINADRQILPRSKLSVQIEKISPQDSFHASKRVCHLLRSGVAAIFGPQSSHTASHVQ
SICDTMEIPHLETRWDYRLRRESCLVNLYPHPTTLSKAYVDLVKAWNWKSFTIIYENNEG
LVRLQELLKAHGPSEFPITVRQLGEGTDYRPLLKQIKNSAESHIVLDCSTERIYDVLKQA
QQIGMMSDYHSYLITTLDLHSVDLEEFKYGGTNITAFRLVDPEKPEIQKVVRDWIYGEAR
YGRKLDLGLTSSRDNITFIKAETALMYDAVHLFAKALHDLDTSQQIDIKPLSCDTVDTWP
HGYSLINYMKIVEMKGLTGVIKFDHQGFRSDFVLDIVELNKDGLKKIGTWNSTEGVNFTR
SYGEAYTQIVEILQNKTFVVTTILSSPYCMRKDSSEKLTGNDQFEGYAIDLIHEISRILG
FNYTIRLAPDGRYGSLNRETKEWDGMIKELLDQKADLAIADLTITYDREQAVDFTMPFMN
LGISILYRKPIKQPPNLFSFLSPLSLDVWIYMVTAYLGVSVLLFILARFSPYEWDNPHPC
NDEPDVLENQFSLLNSLWFTIGSLMQQGSNIAPKAVSTRMVAGMWWFFTLIMISSYTANL
AAFLTVERMDSPIESAEDLAKQTKIKYGALRGGSTAAFFRDSNFSTYQRMWSFMESARPS
VFTSSNGEGVERVVKGSGSYAFLMESTSIEYVVERNCDLTQVGALLDSKGYGIAMPPNSP
FRTAISGAVLKLQEEGKLHILKTRWWKEKRGGGTCRDDATKSSSAANELGLANVGGVFVV
LMGGMGVACVMAVCEFVWKSRKVAVEERASLCSEMATELKFAFRCQGSTKPARKKQQPQT
VVGVVSGGEERRFHPLGTYTSYGFKEPLP
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagctttgttcaaatataaactgtagtgcaaataaaaacaatacgataatatgtata
gtgaaatatctagtaatttttatacatttatttcatagtgttaattcgttaccggatgta
attcggataggtggactttttcatccggccgatgacaaacaagagattgccttccggtat
gctgttgaaaaaattaacgctgatcgacagatattaccacgatcaaagttaagtgtgcag
attgaaaaaatatcgccgcaggatagctttcatgcatcgaaaagagtttgtcatctatta
agaagtggtgttgcagcaatatttggtccacaatcatcgcatactgcttcacatgttcaa
agtatatgtgatacaatggaaataccacacctagaaacacgctgggattatcgtctccgt
cgggagtcgtgtcttgtcaacttgtatcctcatccgacaacattatcaaaggcttatgtt
gatttagtgaaagcatggaattggaagtcattcacaattatttatgagaacaatgaaggt
ttggtacgtttacaggaactattaaaggcacatggaccaagtgaatttccaattacggta
cggcaacttggtgaaggtactgattacagaccactactaaaacaaatcaagaattcagct
gaatcacatattgtgcttgattgttctacagaaaggatttacgatgtattaaaacaagcg
caacagattggtatgatgagcgattatcatagttatttgattaccacactggatttacat
agtgtggatttagaagaatttaaatatggcggtacaaatattacagcatttcgacttgtc
gatcccgaaaaaccagagatacaaaaggttgtacgtgattggatttatggtgaagcccgt
tatggacgcaaattagacttaggattaaccagtagtcgggacaatattacatttataaag
gctgaaacggcattaatgtatgatgctgtacacttgtttgcaaaagcattacatgattta
gataccagtcaacaaattgatataaaacctttaagttgtgataccgttgatacgtggccg
catggatacagcttaattaactatatgaaaatagtggaaatgaaaggtttgactggtgtt
atcaaatttgatcatcaaggatttcgtagtgattttgttttggatattgttgaattaaac
aaggatggtctgaaaaaaattggtacatggaattcaacagaaggtgtcaattttacacga
tcatatggtgaagcttatacacaaattgtggaaattttacaaaataaaacttttgtagta
acaaccatcttgagttcaccatactgcatgcgaaaagattccagtgaaaagctaacaggg
aatgatcaatttgaaggctatgcaattgatttgattcatgaaatttcacgtatattaggt
ttcaattatacgatacgtttagcaccagatggtcgttatggttcattaaatcgtgaaact
aaggaatgggatggtatgataaaagaattgttagatcaaaaagctgatttagctattgca
gatttaacgataacatatgatcgtgaacaagctgtagattttacaatgccatttatgaat
ctgggaattagtatattatatcgaaaaccaattaaacaaccaccaaatttattttccttc
ttatcaccattatcgttggatgtttggatttatatggtcacagcatatttgggtgtttct
gttttattattcattttagccagattcagcccatacgaatgggataatccacacccatgt
aacgatgaaccagacgtattagaaaatcaattcagtttactcaactcattatggtttaca
attggttccctcatgcaacaaggttcaaatattgcccctaaagctgtttcaacacgaatg
gtagctggaatgtggtggttttttacattaattatgatttcatcatatacagctaatttg
gctgcttttttgacggtagaacgtatggattcaccgattgaaagtgctgaagatttagct
aaacaaactaagataaaatatggcgctttacgaggtggttcaactgcagcattctttcga
gattcaaatttctcaacatatcaacgaatgtggtctttcatggaatcggcacgaccgtct
gtatttacatcaagcaatggagaaggcgttgaacgtgttgttaaaggctccggcagctat
gcatttctaatggaatccacatcaattgaatatgttgtagaacgaaattgtgatcttacg
caagttggagctttattggattcaaaaggatatggaatagcaatgcctccaaactctccg
ttccgcactgcaataagtggagctgtactaaaattacaagaagaaggaaaattacatatt
ttgaaaaccaggtggtggaaagagaaacgtggcggagggacttgccgggatgacgcaaca
aaaagtagtagtgcagcaaatgaattgggtttagcaaatgttggtggtgtatttgttgta
ttaatgggtggcatgggagtggcatgtgttatggccgtttgtgaatttgtatggaaatca
cgaaaagttgccgttgaggaaagggcttcattatgctcagaaatggcaactgaattaaaa
tttgcatttcgttgccaaggctcaacaaaaccagctcgtaagaagcaacaaccacaaacc
gtggttggcgttgtttctggcggggaagaacgtcgttttcatccattgggaacatatact
tcatatggattcaaagaaccattgccataa
DBGET
integrated database retrieval system
