Chrysoperla carnea: 123301556
Help
Entry
123301556 CDS
T09255
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
123301556
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ccrn03021
]
123301556
Enzymes [BR:
ccrn01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
123301556
Transcription machinery [BR:
ccrn03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
123301556
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123301556
NCBI-ProteinID:
XP_044740289
LinkDB
All DBs
Position
5:5388673..5394683
Genome browser
AA seq
1135 aa
AA seq
DB search
MRQINDKMENHWGDPKNYKNPIKNIEEKWKLVPAFLKVRGLIKPHIDSFNYFINVEIKKI
VEANNKIQSDADPLFYVKYLDVQVGKPDMEEGFDTTRKVTPHECRLRDMTYAAPITVNIE
YTRGTQRVIRNGLVIGRMPIMLRSSNCILTNKTEHELGKLKECPLDPGGYFIVKGQEKVI
LIQEQVPRNRMITEEIDGEIHCSVNSSTHERKSRTTVFSKNKKYFVGHNTFTDPVPISII
FRAMGITTDQEIISLIGTDEETRIKYMPTMEHCIDLNIYTQNQAFAYLGTKLVPKRYLTA
SSKTKTPIDDARDVISTTILSHIPAENFNYRLKAIYLALMLRRVMCGQVNKKMIDDRDYY
GNKRLELSGMLLSLMFEDVFKRFNFEIKAMADKLIPKVRATQFDVVKYMRPALITQTLVF
AISTGNWTIKRFRMERKGVSQVLSRLSYISALGMITRVNSQFEKSRKVSGPRSLQPSQFG
MLCPSDTPEGEACGLVKNLALMAHITTESDEAPIIKFIYNIGVQDVKLLGGEDIYNDETF
LVFLNGGILGVVKNYRHLIRVVRLIRRMGKISPFVSIYPNLLHQCVYISSDGGRLCRPYI
IVENGQPLVTAKHIDELKRGVRKFNDFLDDGLIEYLDVNEESDALIACAETDIEKDTSHL
EIAPFTLLGVCAGIIPYPHHNQSPRNTYQCAMGKQAMGVVGYNQQHRMDTLMYNALYPQA
PMCKTKPIEMIGYDKLPAGQNATVAVMSYSGYDIEDALIINKASIDRGFGRCLVFRTEKC
TLRRYANQTFDKIQGPLLDPNTKKPIWTHDNLDLDGIISPGEKVEQYQVLVNKSMPTISV
NPGNATGQQQVEYKDVPSTYRNKIPSYIDDIMIAADEDDAALIKIRTRQTRIPQIGDKFS
SRHGQKGVIGLVVEQEDMPFNDYGICPDIIMNPHGYPSRMTVGKLLELLSGKAGLVEGKF
HYGTAFEGSTVEEVSEELAAHGFNYLGKDFFYSGITGEPLEAYIYSGPIYYQRLKHMVQD
KMHARARGPRDVMTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCLIGHGASMMLVERLMTSSDECTVD
ICNVCGHIGYDGYCHSCRNSNSVSRVKMPYAFKLLLTELQAMNITPWLTLTKHNR
NT seq
3408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggcaaatcaatgataaaatggaaaaccattggggtgatccgaaaaattataagaat
ccgataaaaaatattgaagaaaaatggaaattggttccagcatttttaaaagtgcgtgga
ttaattaaaccgcatattgattcgtttaattatttcataaatgttgaaataaagaaaatc
gttgaagcaaataataaaattcaaagtgatgcagaccctttgttctatgttaagtacttg
gatgttcaagttggtaaacccgatatggaagaaggtttcgatacaacacgtaaagtgacc
ccacacgaatgtcgcttacgtgacatgacctatgcagcaccaattaccgttaatatcgaa
tacacccgtggtacacaacgtgttattcgtaatggtttagttatcggtcgtatgccaatt
atgttacgttcatcgaattgtattctaacgaataaaaccgaacatgagctgggtaaatta
aaagaatgtccgttagatccgggcggatattttattgtaaagggacaagagaaggtgatt
ttaatacaggagcaagtaccacggaatcgtatgatcaccgaagagattgatggggaaatt
cattgttccgtgaatagttcaacgcatgagcgtaaatcacgtacaacggtgttttcgaag
aataaaaagtattttgttgggcataatacttttacagatccggtaccaatatcaataata
ttccgtgccatgggtattacaaccgatcaagaaatcatctcgctaatcggtaccgatgaa
gaaactcgtatcaaatatatgccaacaatggaacattgtattgatttaaatatttataca
caaaatcaagcgtttgcatatttaggtacaaaactagtaccaaaacgttatttaactgct
tcgtccaaaacgaagacaccgattgatgatgcccgtgatgtaattagtacaacaattcta
tcacatattccagcagaaaattttaattatcgtttaaaagcgatttatttagctctgatg
cttcgtcgcgtaatgtgtggccaagtgaataaaaaaatgatcgatgatcgtgattattat
ggtaataaacgtttagaattatctggaatgttgttatcgttaatgtttgaagatgttttt
aaacgtttcaattttgaaattaaagccatggctgataaattaataccaaaagttcgtgcc
acacaatttgatgttgtgaaatatatgagaccagctttaattacacaaacacttgtgttt
gctatatcaacgggtaattggacaataaaacgttttcgaatggaacgtaaaggtgtatct
caagttttgtcacgtttaagttatatatcagctttaggtatgattactcgagtcaattca
caatttgaaaagtctcgtaaagtatctggaccacgatcgttacaaccatcacaatttggt
atgctttgtccatcagatacacctgaaggagaggcatgtggtttagtaaaaaatcttgca
ttaatggcgcacatcacaaccgaatcggatgaagcaccaattataaaatttatttataat
atcggtgtacaagatgttaaattattaggcggtgaagatatttataatgatgaaacattc
ttagtctttttaaatggtggtatcttaggtgttgtgaaaaattatcgtcatttaatacgt
gttgtacgattaattcgacgtatgggtaaaatatcaccatttgtatcgatttatccgaat
ttattacatcaatgtgtttatatatcatcggatgggggacgattatgtcgtccatatatt
attgttgaaaatggacaaccgttggtcacagcgaaacatattgatgagttaaaacgtggt
gtacgaaagtttaatgattttttggatgatggtttaatcgaatatctggacgtaaatgaa
gaaagtgatgctttaatcgcatgcgctgaaactgacatagaaaaagacacaagtcatctg
gaaatagcaccttttacactgttgggtgtttgtgctggtattataccatacccacatcat
aatcaatcaccacgaaacacgtaccaatgcgctatgggtaaacaagcgatgggtgtcgtt
ggatacaatcaacaacatcgcatggatactctcatgtacaatgcattgtatccgcaagct
ccaatgtgtaaaacaaaaccaatcgaaatgattggctacgataaattacccgccggacaa
aatgcaaccgtggctgtaatgagttatagtggttacgatattgaagacgcattaattata
aataaagcgtcaattgatcgtggttttggacgatgtttagttttccgtacggaaaaatgt
acattacgtcgatacgccaatcaaacgtttgataaaatccaaggtccattattagatcca
aatacgaagaaaccaatatggacccatgataatttagatttggatggtattatttcaccg
ggtgaaaaagttgaacaatatcaggttctagtcaataaatcaatgccaacgatcagtgta
aatccgggaaatgcaaccggacaacagcaagtcgaatataaggatgtgccaagtacatat
cgaaataaaataccgagttatattgatgatattatgatagcggccgatgaggatgatgct
gcgttaattaaaatacgaacacgtcaaacacgtattccacagattggtgataagtttagt
tcgaggcatggtcagaaaggtgttatcggtttggttgttgaacaagaagatatgccattt
aatgattatggaatatgtccggatattatcatgaatccgcatggatatccatcacggatg
actgttggtaaattgttggaattactttctggaaaagctggtctagtggagggtaaattc
cattacggtacagcatttgaaggttcgaccgttgaagaagtaagtgaagaattagccgca
catggttttaactatttgggaaaagatttcttctattcgggtataactggtgaaccgctc
gaagcatacatttattctgggccaatttactatcaacgtttaaaacatatggtccaagat
aaaatgcatgcacgtgcccgtggtccacgcgatgtaatgacacgacaaccgacagaaggt
cgaagtcgtgacggtggtttacgtttaggtgaaatggaacgtgattgtttaattggacac
ggggccagtatgatgttagtagaacgattaatgacgtccagtgatgaatgtacggtggat
atatgtaatgtatgcggtcatattggttacgatggttactgtcactcgtgtaggaattcg
aatagtgtgagtcgtgttaaaatgccgtacgcttttaagttattgttaacggagctacag
gctatgaatatcacaccatggttaacattaaccaaacataatcgataa
DBGET
integrated database retrieval system