Chrysoperla carnea: 123301875
Help
Entry
123301875 CDS
T09255
Name
(RefSeq) glutamate receptor ionotropic, kainate 2-like
KO
K05313
glutamate receptor, ionotropic, invertebrate
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
ccrn04040
]
123301875
Ion channels [BR:
ccrn04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
123301875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lig_chan-Glu_bd
Lig_chan
ANF_receptor
SBP_bac_3
Peripla_BP_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123301875
NCBI-ProteinID:
XP_044740754
LinkDB
All DBs
Position
5:43227807..43289256
Genome browser
AA seq
868 aa
AA seq
DB search
METDMVFRNKINYINNLYEQPYLLIPNIQTVAKVDSFKAGKIACNITEDGIAAIFGPQND
ECAGIVEAICYNLKIPNFQTHWQPKKTTFQDAAKMAIKMYPDPHMLSVAINDILKTMEWK
SFTILYEHDDALLRLQEIFRNHKTFENVITVRQLTGFDYRSLLKEIHASGERRIILDCNT
DTTIQLFRQAAEVKMTGEYISYYILNLDTHTLRQEMLQHSLTNMTIISLIDPNYGEARKY
IVDEWTTEMPSLTVTAETIPTELALMYDAVDVFYQGLKMADSIKFEKVICNPGIDTWTDG
EAFYDVLKKVKSDGLSGPIQFDENGYRTDFTLQILDISDDGFRPIGTWDPANGVRRTISE
EDSLAQYSAALRNKTFKVASRIGEPYLMWKNKSAEGNERFEGYAMDLIHEISKLIGFKYE
FYITEKYGSLDKKTKTWNGLIKELLDRKADLAICDLTITFDRRSAVDFTMPFMTLGISIL
FKKPVARPPPFFAFMAPLSVEVWLYMALALLGVAFSVYIITRMCPKDWENPNPQDPNPTE
LENIWSVTNCIWLSLGTIMCLGCDILPKGSSSRITVVLWGFFALIVIQSYIANLTASLTN
EKLGDSIHNAEDLAKQTKVKYGTVSEASTANFFRDSNFSVYQKMWSTMESARPSVFVKDN
NEGQKRVLRDKGTYAFLMESTAIEYVTARECELTQVGGKLDSKGYGIAMPVNSPYRTDIS
GAVLKLQESGKLSTLKTKWWKDMNGGRKCDENPSNKVKEEDANKMGIENFGGIFVVLIAG
TTFAIFIVICEFLWNIRTIAVEHKITTCEALKSELRFAFQIFNKEKPAKPYAPSEASSDE
DTRSVAASVFRSASSFLRLDNVIEKKDN
NT seq
2607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagacggacatggtatttagaaataaaattaactacattaataatttgtatgagcaa
ccatatttattaataccgaacattcaaacagtagcaaaagttgacagcttcaaagctgga
aaaattgcatgcaatattactgaagatggtatagctgccatatttggtccacaaaatgat
gagtgtgctgggatagttgaagctatttgctataatttgaaaataccaaactttcaaaca
cattggcaacctaaaaaaacaacatttcaagatgcagctaaaatggcgataaaaatgtat
ccagatccacatatgttgtccgtggcaatcaatgatattctaaaaacaatggaatggaaa
agttttaccattttatacgagcatgatgatgcattattacgtttgcaagaaatatttcgt
aaccataagacgtttgaaaacgtgattactgttcgtcaactgactggtttcgattacagg
agtttattaaaagaaatacatgccagtggtgaacgtcgaattattttagattgtaatact
gacacaacaattcaattattccgtcaagcggcagaagttaaaatgactggagagtatatt
agttattatattctgaatttagacacacacacattaagacaagaaatgttgcaacactcc
ctaacaaatatgacaataatcagtttaattgatccgaattatggtgaggctcgtaagtat
attgtggatgaatggacaacggaaatgccttcgttaactgttacagcagagactattccg
accgaattagcattgatgtatgatgcagtggatgtattttatcaaggattaaaaatggct
gattctataaagtttgaaaaagtaatttgtaatccaggcattgatacttggactgatggt
gaagcattttatgatgttttaaaaaaagtgaaatcagatggattgtctggtccaatacaa
tttgatgaaaatggttatagaacagatttcactttgcaaatattagatatatctgacgat
ggctttcgtccaattggtacatgggacccagctaatggagtaagacgtactatttccgaa
gaagatagtttggcacaatattcagctgcattacgtaataaaacattcaaagttgcgtct
cgtattggtgaaccttatttaatgtggaaaaataaaagcgctgaaggaaacgaacgtttt
gaaggatatgcaatggacttaatacatgaaatatcaaagcttatcggttttaaatacgaa
ttttatataacagaaaaatatggttctttggataaaaaaacaaaaacttggaatggtttg
attaaagaattactggatcgtaaagctgacttagctatttgtgacttaactattacattt
gatcgccgatcagcagtagatttcactatgccatttatgacacttggaattagtattttg
ttcaaaaaacctgtagcaagaccacctccatttttcgctttcatggctccattatcggtc
gaagtatggctttatatggctcttgcattgttaggggttgcattttcagtatatattata
acaagaatgtgtccaaaagattgggagaatccaaatccacaagatccaaatcccacagaa
ttagaaaatatttggtccgttacaaattgtatttggttgtcgttgggaacaataatgtgt
ttaggttgtgatatattaccaaaggggtcttcgtcacgaataacggtggtattatggggt
ttctttgcattaattgtaattcaatcatatattgctaatttaactgcatctttaacaaat
gaaaaactgggtgattctatacataacgctgaagatttagcaaaacaaacaaaagtcaaa
tatggcacagtttcagaggcgtcaacggcaaatttctttcgtgactcaaatttttcggtt
tatcaaaaaatgtggtcaactatggaatcagcacgaccatctgtattcgttaaagacaat
aacgaaggtcaaaaacgtgtattgagagataaaggaacatatgcatttttaatggaatca
actgctattgaatatgtaactgcacgtgaatgtgaattaacgcaagttggtggcaaatta
gattcaaaaggttatggaattgctatgcctgtcaattcaccatatcgaacagacatcagt
ggtgctgttttaaaattacaagaatcaggaaaattatcaactcttaagacaaaatggtgg
aaagatatgaacggtggtaggaaatgtgatgaaaatccatccaataaagtgaaagaagag
gacgcaaacaaaatgggtatcgaaaattttggtggtatttttgtagtattaattgctgga
accacgtttgctatatttattgttatatgtgagtttttatggaatattcgtacaattgcc
gtagaacataaaataacaacatgtgaagcacttaaaagtgagctacgatttgcttttcaa
atattcaataaagagaaaccagcaaaaccgtatgcaccatcagaagcttcatctgacgaa
gatacaagaagtgttgctgcaagtgtatttcgtagtgcgagttcatttttacgtttagat
aatgttattgagaaaaaggataattga
DBGET
integrated database retrieval system
