Chrysoperla carnea: 123302482
Help
Entry
123302482 CDS
T09255
Name
(RefSeq) integrator complex subunit 6
KO
K13143
integrator complex subunit 6
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ccrn03041
]
123302482
Spliceosome [BR:
ccrn03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
123302482
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA_2
INT_SG_DDX_CT_C
VWA
DUF6657
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123302482
NCBI-ProteinID:
XP_044741356
LinkDB
All DBs
Position
X:24876865..24886724
Genome browser
AA seq
985 aa
AA seq
DB search
MTIIVFLVDTSASMYQRAYLGGRPSILDVAKNAVETFVKVRQRSQESRGDRYMLLTFEEP
PNNIKAGWKENLSTFMNELKNLQCLGLTSMGSALKHTFDVLNLNRMQTGIDTYGQGRCPF
YLEPSVILVITDGGKLSSTTGVTDDFNLPMHTPIPGSELTREPFRWDQRLFALVLRLSGT
PANERDIGLVPSDNSPIDAMCEVTGGRSYCITSHRMMMQCIDSLVQKVQSGVVINFEKIG
PDPTSGDNRDDVISNTILDHADDDTENNDILLESRQILPPAAKPMSSYTLPPSNLTTGGN
QPNISWHSCRKMILVPRSAQKGFAVGFWPIPESFWPDINISVLPPRSAHPNVKFTCTNQD
PMVIENLPFDKYELEPSPLTQYILARKQPTICWKVFVPNSYKSSEVGHPFGYLKASTNLS
CVNLFVMPYNYPVLLPLLDELFKVLRLKQTPEWTQQFRNYMRTMPSYYAGPLRRALTRMG
APNSLTSTLIPDTYDTTLSVTVLNYLKKMKNQAKIEFDRLCNDVLSKQNAQSKNQSSGAG
SSRVRVLPRAGLKRDMATHPDFHDKFMSMREQLNEYGGFVVGLPASKPNLNTKSYRNPFD
IHRSNLLDQVVRMRANYMQPFNRLKLVDDDVTHSLPVNQMGNYQEYLKRMPAPLREIEST
PVRQHMFGNPFKIDKRMMVDEADIDLVGGNSAGSSTGSSKGGKRTVTNDFKQLPTKRKPG
PIPRDVTIRRPSSPMPLTPPQSPKICDVILPLPAEIPKEEVLLSKSEDSESFDKDKITSN
IDTPTILEGPNHARDFDYMSMKFDDHESINNITPPKIESPNQPSSPIQSSYPPMSDYLSP
LSYNYEDVSLIINESSNSYNLNATDNTSPANHDMDKFDKKIIKNGLPEMDNTENIEPSKE
DYEETIKHNIKIKRMLFADVRKPGKNYQQLLDHLLLLKGEFHQQETIIKQVYRESLRFKR
ENLARAINNFLQINHLESVNNVGGI
NT seq
2958 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactataattgtgtttttggttgatacttcggcgtctatgtatcaaagagcctattta
ggcggtcgtccttcaatattagatgttgctaaaaatgctgtggaaacgtttgtcaaggtg
cgtcaacgtagtcaagagagtcgaggtgatcggtacatgttgttaacgtttgaagagcct
ccaaataatatcaaggctggttggaaagaaaatttatcaacgtttatgaatgaattaaaa
aatttacaatgtttaggcttaacttcaatgggtagtgctttaaaacatacattcgacgtg
cttaatttgaatcgtatgcaaacaggaattgatacatatggccaaggacgttgcccattt
tatctggaaccctctgtaattcttgttatcactgatggtggtaaattatcatccacaacg
ggtgttacggacgattttaatttaccaatgcacacacctatacctggatcggagctgaca
cgtgaaccattccgttgggatcaacgattatttgcgttagttttacggttatctggtaca
cctgccaatgaacgtgatattggtttagttcccagtgataattcaccaattgatgccatg
tgcgaagttactggtggtcgatcctattgtataacgtcacatcgaatgatgatgcaatgt
attgatagtttagttcaaaaagtacaaagtggtgttgttataaattttgaaaagattgga
ccggatccaacgtctggtgataaccgtgatgatgtaatatcaaacacaattctagatcat
gctgacgatgacaccgaaaataatgatatattattggaatcacgacaaatattaccacca
gcagcaaaaccaatgagttcgtatacgttaccaccatcgaatttaactacaggcggtaat
caaccaaatattagttggcattcgtgtagaaaaatgattttagtacctagatcagcgcag
aagggttttgctgttggattttggccaataccggaatctttttggccggatattaatata
tctgttttgccacctagatctgcacatccaaatgtaaaattcacctgtacaaatcaagat
ccaatggtgattgaaaatttaccattcgataaatatgaattagaaccaagtccattaaca
cagtatattttagcacggaaacagccgacaatttgttggaaagtattcgtaccaaatagt
tataaaagttcagaagtgggacatccatttggttatttaaaagcgagcacgaatttaagt
tgtgtgaatttatttgtaatgccttacaactatccggtattgttaccattattggatgaa
ctatttaaagtgttgagattgaaacagacgcccgaatggacacagcagtttcggaattat
atgcggacgatgccttcatattacgctggtccattacgacgcgccttaacacgaatgggt
gctccaaattctttaacatcaactttaatacctgacacatacgacacaacgcttagcgtc
acagtactgaactatttaaagaaaatgaagaatcaagcaaaaatcgaatttgatcgttta
tgcaacgatgtacttagcaaacagaatgcccaatcgaagaatcaatcatcgggtgccggt
tcaagtcgtgtacgtgtactccctcgagccggtttaaaacgtgacatggccacacatcca
gacttccatgataaattcatgtcaatgcgtgaacaattgaatgaatatggtggattcgtc
gtcgggctgccagcttccaaaccaaatttaaatacaaaaagctatcgtaatccattcgat
atacatcgtagtaatttattagatcaagttgtacgcatgcgtgctaattatatgcaaccg
tttaatcgtttaaaattagtggatgacgatgttacgcatagtttacccgttaatcaaatg
ggtaattatcaggagtatttgaaacgtatgccggcaccgttacgcgaaattgagagtaca
ccggtacgtcagcatatgtttggaaatccgtttaaaattgataaacggatgatggttgat
gaggcggatattgatttggttggtggaaattcagctggatcatcaactggaagtagtaaa
ggcggtaaacgaacagttactaacgattttaaacaattaccaacaaaacgaaaacctggt
ccaattccacgtgatgtaaccatacgaagaccatcatcaccaatgccgttaacgccacct
caatcaccgaaaatttgtgatgttattttaccacttcctgctgagattcctaaagaagaa
gttttattatcaaaatccgaggactctgaatcattcgataaagataaaatcacatcaaat
atcgatacaccaacgattctcgaaggaccgaaccatgcacgtgatttcgactatatgtca
atgaaattcgatgatcacgaatcaatcaataacataacaccaccaaagatcgaatctcca
aatcaaccatcatcacctattcaatcatcgtatccgccaatgtccgattatttatcacca
ttatcatataattatgaagatgtctcgttaattatcaatgaatcatcgaattcgtataat
ttaaatgccactgataatacatcaccagcgaatcatgatatggataaatttgataagaaa
attattaaaaatggtttaccggaaatggataatacagaaaatattgaaccatcgaaagag
gattatgaggaaacgattaaacacaacattaaaattaaacgaatgctatttgcagatgtt
cgaaaacctggtaaaaattatcaacaactactagatcatttattattattaaaaggtgaa
tttcatcagcaagagacaattattaaacaagtttatcgtgaatcgttacgatttaaacgg
gaaaatttagcacgagcaattaacaattttttacaaattaatcatttagaatcagtgaat
aatgttggtggtatttga
DBGET
integrated database retrieval system
