Chrysoperla carnea: 123302999
Help
Entry
123302999 CDS
T09255
Name
(RefSeq) contactin
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_3
I-set
Ig_2
fn3
ig
V-set
Pur_ac_phosph_N
Lectin_C
UL45
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123302999
NCBI-ProteinID:
XP_044742029
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(21053914..21059457)
Genome browser
AA seq
1275 aa
AA seq
DB search
MYDKPQLLILILSIIILNLNIRQTESQQQPNYYGNPNLNDINRDGDIYEKPKCPQIWTQF
GYDLCYRFIKSPLRNYNDARKVCQAYEADLVSINSLEEHGFIVRQLNKIDPQHRKWYIGV
HQSTPGYWMNEADNSQLISMENAFLPINYNNLDRDNRRDSFTYNQANPQQTIQQNQQNQQ
IITRDRDFLAYSFSKNLMKWGFEQMHGDELLCYICEAPAGKLHYLDEDEHRTYEYGVDID
NPELVPRGPYFIRQPKDKIFDLSTKTEYDVKLGCLAGGYPTPEYEWYREDFENDKFISKK
IDPFQDDRITISGGTLIIFNPDKKKDRGWYHCKATNKFGTIISESVQLNFGFIMEFNMMR
AAESGNQNWGKAIYCDPPTHYPGVKFYWAREYFPNLVEEDKRVFVSYDGALYFSALETID
RGNYSCNVQSKISVTGRNGPTFALRVNPHSNYQQLKFPNSFPKIFPEAPIVGQEVRFECI
AFGYPVANYNWTRKDGVLPRGSYQMNYNRVLIIPRVQVEDQGEYVCRAFNDRSQLTHSVV
LTVQAEPNFTIPLVDKHVDQKADVTWTCEAFGIPDVNYTWYRNGVELKMETLEEEDRDRY
KIQDNVLTIRYLDDKRDPGMYQCKAKNQLKARYSSAQLRVLSLKPSFKKFPLESETYAAE
QGNVTIKCNPEAAPKPKFVWKKDNNVIGSGGRRIILPNGNLVIRPVSRDDAGIYTCSASN
VYGVGESRGRLIVLHSPRLVESLQPQIQMSVRNNLALRCQADTENLLDVAYIWKHNGIRI
RDVDVYNSNNRIKMDRGFLDIENATFAEGGEYECIVKSAVGLISSKSHVIVEGPPGPPGG
VQVLTVQHRSATLQWTDGSANGRPVEYYIITAKTNWNQTWHTISQNVHAREIDRYTGRKE
VKLEAEFVPWSTYEFRVAAVNALGVGPASLPSPRHAIPPDRPYKAPDNIGGGGGKIGDLT
ITWKPLVPAEQHGPGIYYKIFWKRDHPQELEYQQLDLKSFGNTGMHVVHIPITYYYTKYL
VKVQAFNEIGSGPESNPVGIYSAEDMPQVAPQQVSARSFNSTSLNVTWQPILETRERVRG
KLIGHRLKYWKKDNDEQDSIYYLSRTRRPWALIVGLQPDTYYFVKVMAYNSAGEGPESER
YLERTYRKPPQKPPSAVHVSPVNPSTVKVVWRYVSPSAEEEPLSGYKIRVWEADRDMSTA
NDTIIPTGVDLQAYIDYLSPGKTYHLRVLAFSNGGDGHMSSPALTFQMGDAAQFKSTAAV
THQTSVTLLLSSFLL
NT seq
3825 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatgacaaaccccaattattgatattaatattatcaataataatattaaacctaaat
attcggcagactgagagtcagcaacagcctaattattatggaaatccgaatctaaatgac
ataaatcgagacggtgatatatacgaaaaaccaaaatgtccacaaatctggacacaattt
ggttacgacttatgttatcgatttatcaaatcacctctccgaaattacaatgatgctaga
aaagtttgtcaagcctatgaagccgatttggtttcgattaatagtttagaagaacacggt
tttattgtacggcagctaaataaaatcgatccgcaacatcgaaaatggtatatcggggta
catcaatccacccctggatattggatgaatgaggcagataattcccaactaataagtatg
gaaaatgcatttttgccgattaattacaataatttggatcgtgataatcgtcgagattca
tttacgtacaatcaagcaaacccccaacaaacgattcaacagaatcaacaaaatcagcaa
attataacgcgtgatcgtgattttctagcgtatagtttttcgaaaaatctcatgaaatgg
ggattcgaacaaatgcacggagacgaattactgtgttacatttgcgaagcgccagctgga
aaacttcattatttggatgaagatgagcatcgaacatacgaatatggtgtcgatatcgat
aaccccgaattagtacctcgaggtccatactttattcgtcaaccaaaagataaaattttt
gatttatctacgaaaaccgaatatgatgtcaagctaggttgtttggccggaggttatcca
actccagaatacgaatggtatagagaagatttcgaaaatgataaattcatttcgaaaaaa
attgatccattccaagatgatcgaataacaatcagtggtggtaccttgatcatatttaat
ccagataagaagaaagatcgtggttggtatcattgtaaagcaacgaataaattcggaacg
attatttcggagagtgtacaattaaattttggttttataatggagtttaatatgatgcga
gcggctgaaagtggtaatcaaaattggggtaaagctatttattgtgatccgccaactcat
tatcccggtgttaaattctattgggctcgtgaatacttcccgaatttagttgaggaagat
aagcgtgtgtttgtgtcctatgatggtgcactgtatttctcagctttggagacgattgat
cggggaaactacagttgtaatgttcaatcgaaaatttctgttactggacgtaatggacct
acatttgcacttcgtgtaaatccgcactccaattaccaacaactgaagtttccgaattca
ttcccaaaaatattcccagaagcaccaattgttggacaagaagttcgatttgaatgtata
gcatttggatacccagttgcaaattacaattggacccgtaaggatggagtcttaccccga
ggttcttatcaaatgaattacaaccgagtcttaattataccccgcgttcaagttgaagat
caaggcgaatatgtttgtcgtgcattcaatgatcgtagtcaattaacacattcggtggtg
ttaaccgttcaagccgaaccaaactttacaattccattagtggacaaacatgtggaccaa
aaagctgatgtaacttggacttgtgaagcttttggtatacccgatgtcaattatacgtgg
tatcgaaacggggttgaattaaaaatggaaacacttgaagaggaagatcgagatcgatac
aagatccaggataatgtgttaacaattcgatacttggatgataaacgggaccctggaatg
taccagtgtaaggcgaaaaatcaattaaaagcccgatattcctccgcccaactgcgagtg
ttatcgttgaaaccatcatttaaaaagttccctctagaatcagaaacatacgcggccgaa
caaggtaacgtaacgattaaatgtaatcccgaagctgccccaaaaccaaagtttgtgtgg
aagaaagataataatgtgattggttccggtggaagacggattatcttaccgaatggtaat
cttgtaattcgacctgtatctcgagacgacgctggaatctacacttgttcagcatcgaat
gtttacggagttggcgaatctagagggcgtcttattgtattacattctccaagacttgtt
gaatcgttacaaccccaaatacaaatgtcagtacgaaataatttagctttacgatgtcaa
gctgatacggagaatttattggatgtcgcatatatttggaaacataatggaattcgaatt
cgagatgtcgatgtttataattcaaataaccgtattaaaatggatcgtggctttttagat
atcgaaaacgcaacattcgccgaaggtggtgaatatgagtgtattgtaaaatccgcagtc
ggattaatatcctcaaaatctcatgtcatcgttgaaggaccaccaggtcctccaggcggt
gtccaagtcttaactgttcaacaccgatcagctacattgcaatggacagatggatccgct
aacggtcgtccagttgaatattacataataactgcgaaaacaaattggaatcaaacatgg
catacaatttcccaaaatgtacacgcacgggaaatcgatcgttatactggacggaaggaa
gtgaaattggaagcagaatttgttccatggtcgacatacgaattccgtgtggcagctgtg
aatgcattaggagtaggtccagcttcgttaccatccccaagacatgcaattccaccagat
cgtccatacaaagcaccagataacattggaggaggtggcggtaagatcggtgatttaaca
atcacatggaagccgctagttccagctgaacaacatggacctggaatttactataaaatc
ttctggaaacgagatcatcctcaagaattggaatatcaacaactcgatttgaaaagtttt
ggaaacactggcatgcatgtcgtccacattccaattacctactattacacgaaatactta
gtcaaagttcaagcgttcaatgaaattggttcaggtccagaatcgaaccccgttggaatt
tatagcgcagaagacatgccccaagttgcaccacaacaggtttctgcccgatcattcaat
tcaacctcgttgaatgttacttggcaaccaatcttagagactcgagaacgcgttcgaggt
aaattaataggacatcgtttgaaatattggaagaaagataacgatgaacaagattccatt
tactatttatctcgaacacgtcgtccatgggccttaatcgtgggtctacaaccagatacc
tactattttgtaaaagtaatggcctataattcagctggagaaggacctgagagtgaacga
tatctagaacgtacttacagaaaaccaccacaaaaacctccgtcagcggttcatgtatct
ccagtcaatccatcaactgtaaaggttgtatggcgatatgtctcaccatcggccgaagaa
gaaccactctctggttataagattcgtgtatgggaagcagatcgagatatgagtacggca
aatgatacaatcatacctacaggagttgatctgcaagcgtatattgattatttatctccg
ggtaaaacttatcaccttcgtgttctagccttctcaaatggtggagatggtcatatgagt
tcaccagctctaaccttccaaatgggtgatgctgcacaatttaaaagtactgccgcagta
acgcatcaaacatcagtcacattgttattatcatcatttttatta
DBGET
integrated database retrieval system