Chrysoperla carnea: 123303028
Help
Entry
123303028 CDS
T09255
Name
(RefSeq) activating signal cointegrator 1 complex subunit 3-like
KO
K18663
activating signal cointegrator complex subunit 3 [EC:
5.6.2.4
]
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ccrn03400
]
123303028
Enzymes [BR:
ccrn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
123303028
DNA repair and recombination proteins [BR:
ccrn03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
Direct repair
123303028
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
DEAD
SNRNP200_wHTH
ResIII
Helicase_C
AAA_22
DEXQc_Suv3
AAA_19
T2SSE
FF
DUF7004
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123303028
NCBI-ProteinID:
XP_044742058
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(26152160..26168907)
Genome browser
AA seq
2353 aa
AA seq
DB search
YTNVSSKTFLQNNTQKVFDENLFIQRASVKNVTLLSDNSCIPIHYQFWNSIAGKSTESNL
FVPLINAVKKLVPNKNWDRYVEIIFSIFLLKYDRFEAPIKNKEVLLCAILKIGYNDQNIQ
ATQQIFKILAEIHKTFPLDKVIHIEKSSLFFDPNIPQSSDRTKSCTDSIHVDLNSNQLEI
VDNVDLSKAPCDTIIKTLPTDTRKWLRSAHDAFAELKSTKNSNKLINRSWLLRELLIFPI
HDVLDMSNDDFGDNFIIRLHTSHNKDDLFEFMVTAFGYAYQDEINKLLSAYNDLITGTLK
YYLEVICDNCDDKNDQGPSTSQPKQNKFQEFSMLYVKPSTSSSSGNVLENVSGSSSTPKE
YSIQWFYNRLKDLPKFENTFTLQDVPETTSIIQTLLASSRDNRETIETFIDIFGSEIIEL
AFELMRNKDTVMKALNEMKPTGAISKVPKIRKDSKLGPIISSQVVVQSEKEKRLLRELRK
EEKRHLRHFKSDVEADDDLENSGNLPLPSLERFSALQNEYDTACVEPILTSKASKIETLF
ERKASSNRKMDLPHVYQIDKKLKFGTLLLAEGTEIKDLTWCKQVHIPANKCKPTDLLPDN
KHIKIDTLDPLGQKIFTHIERLNTIQSIVFEVAYHTNENLLICAPTGAGKTNIALLTISR
CLQSYCVNTVLVDKSFKIVYIAPMKALAAEMTAKFSKQLRPLGVHVKELTGDMQLSPSEI
KETQILVTTPEKWDVVTRKPDGDTALARLVRLIIIDEVHLLNEDRGHVIEALVARTVRLV
EKTQLFCRIVGLSATLPNYMDVAQFLRVNLSNGLFYFDQRFRPVPLETTFIGCQELNYQT
YLDNACYDQVIKALRNGSQVMVFVHTRRGTVKTAETLLTKAQNAGDLKLFESEHIKTAGY
TKARIQIDKSNFSELRKLFQSGMAVHHAGMLRIDRNRVEKYFMDGYIRVLFCTATLAWGV
NLPAHTVIIKGTNVYANGKNTDLDILDVQQIFGRAGRPQFDTSGHAIIITEMNRLDQYLR
QMTNQVPIESKFIQHLADNLNAEIVLGTVNTVDEAVMWLSYTYLLIRMKMNPLAYGIEYS
EKIDDPELHQRRHAMIHFCAKKLDAARMIRYNETTGDLISTDYGRIASHFYIKYDTIMKF
NEMMQPIMTEAEILKMLTHAEEFENIVVRDEELDELGDLMEEINFPTDSVSRDNGHVKVS
LLLQSYLSRIRIKSSSLIADMHYAVQNIPRLIRALFEIFLRLNNAIMAKLVLRFALMFEQ
QQWDHETPLRQFQRLTYDVLDKIERHDVNIHRIRELELSEVGSIIRNQREASQVKYLADC
FPYVDIETKIMPITRSVLRIIIDIKADFKWDPKIHGYAQSFWLWIEDPDHNIIYHHEYFQ
LTRKLVMKDEPIKLFITIPLVEPTPPQYYVRVFSDRWLRAESDTPFRFDTSMLPTNLTIQ
TDLQNLQPLSKRALKNNAYESLYPFNFFNPIQTQMFYVLYRTDHNILLGAPTGSGKTIVA
EIAILRLFNTEPDRKVIYVAPLKALVRERVDDWTKKFGEKLKKNVAEMTGDSMPDKRTLD
QAQIIITTPEKWDIVSRNWESRSYVQAVGLLIMDEIHLLGEDRGPVLEAIVSRTNYIASK
HSSTIRMMGLSTGIANSYDLATWLGVSEEGLFNFRPSVRPVPLEVHISGYPGQHYCPRMA
LMNKPTFQAIREHAPSSPTLVFVSSRRQTRITAMELINFVSMDSNSTQWLNMSEEDIDNI
VRNDISDETLKHTLIYGVGVHHAGLLEGDRVIVEQLFLNQKIQVLVATATLAWGVNFPAH
LVVIKGTEYYDGKTRRYIDMPITDVLQMMGRAGRPQFDQNGVAVVLVQDIKKSFYKKFLY
EPFPVESHMLEVLPNHIYAEIATGLITSKQVVHEYITWTYLYRRLINNPQYYNLVSTDDA
DILEYITNLVNSTIDILVEYNCCTVDEDGFLLYSTPSAKVGSNYYLDYHTVKFMTDKLHP
NLSLVNVIKLMCDTYEFSEVPVRHNEELMNATLARSCRIHVTEDFDSPHVKTFLLMQSHF
SRLPVPCADYSIDLKLILEQSGRILQAFLDYAAVNGWLLLCIQIAHVSQMIVQADWIDTT
PYAQVPRTHDSQIDILQSVHTREPISFCKFVKLTKNDIMATKLKLYKDGFTRPNIRDIID
YVQNLPLLIVHVTLKDAFAKKVFEGSPSDLKTKVLTLKNNRLYTLEIRLTHYKGYNSKVY
APNYPKTKQEGWMILFGSQDENLGRVTVKRCIFSGKSTCQFIKFTTPNFPGEYIYHIMII
SDSYFGLDQGYTMISKIEMCEESDPEDDEDDVPEVGDNFAQANPPDNYLELDFPKLPQTS
SISEQPGPSTSKT
NT seq
7062 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
tatacaaatgtttcatcgaaaacttttctacaaaataatacacagaaagtattcgatgaa
aatttgtttattcagcgtgcttccgttaaaaatgtaacactcctatcggacaattcctgt
attcctatccattatcaattttggaattcaatagctggtaaatcaacagaaagtaattta
tttgtaccgttaattaatgcagtgaaaaaacttgtgccaaataaaaattgggaccgatat
gtggaaataatctttagcattttcctactcaaatatgatcgattcgaagcccccatcaaa
aataaagaggttttattgtgtgcaattttaaaaattggatacaatgatcaaaatattcaa
gctactcaacaaatttttaagatattggcagagattcataaaacatttccattggataaa
gtcattcatatcgaaaaatcatctttatttttcgatccaaacattccacaatcaagtgat
cgaaccaaatcatgtacagactccatacatgttgatttaaattcaaatcaattggaaatc
gtcgacaacgtggatttatcaaaagctccatgtgacaccataataaaaactttaccaaca
gatacccgtaaatggttacgatctgctcacgatgctttcgccgaattaaaatcaacgaag
aatagcaacaaattaatcaatcgaagttggttgttgcgggaactgttaatattcccaata
catgatgtgttagacatgtcgaacgatgactttggtgataattttataatacggttacat
accagccataataaagacgatttattcgaatttatggtaacagcattcgggtacgcgtat
caagatgagattaataaattgttaagtgcttataacgatttgataacgggtactttaaaa
tattatttagaagttatctgtgataattgtgatgataaaaatgatcagggtccatcaaca
agtcaaccaaaacaaaataaatttcaggagttttctatgttgtatgtgaaaccaagcact
tcatcatcatcgggaaatgttctcgaaaatgtatctggctcctcttcaacaccaaaagag
tattctatccaatggttctataatcgcttaaaagatctgccaaaatttgagaatacgttc
accttacaagatgtaccagaaacgacgagtattattcaaacgttgctagcatcatcacga
gataatagagagactattgaaacgtttatcgatatcttcggctctgaaattattgagcta
gcatttgaactaatgaggaacaaggatactgtcatgaaagcattaaatgaaatgaaacca
actggagctatatctaaagtaccaaaaattcgtaaagattcaaaacttggtccaataata
tctagtcaagttgttgtgcaatcagagaaagagaaacgattacttcgagagttgcgtaaa
gaggaaaaacgtcatttgcgccatttcaagagcgatgtcgaagcagatgacgatttagaa
aattcaggaaatttaccattaccaagtttggagcgtttttcagcgttacaaaacgagtat
gacactgcgtgtgttgaaccaattctaacatcgaaagcgtctaaaatcgaaacacttttt
gaacggaaggcttcatcaaatagaaaaatggacttgccgcatgtttatcagattgataaa
aaattaaaatttggtacattattgttagcagaaggaacagaaattaaggatctaacctgg
tgcaaacaagtacatattcctgccaataaatgtaaaccgactgatttattaccagataac
aaacatataaaaatcgataccctagatcctctaggtcaaaaaatatttacacatatcgaa
cgcttaaatacaatacagtcaattgttttcgaagtcgcttatcataccaatgaaaattta
ttgatatgcgcaccaaccggtgccggtaaaacgaatattgccctactaacaatcagccga
tgtttacaaagttattgtgtaaacactgttctagtcgataaatccttcaaaattgtctat
atagctccaatgaaagcactagcagctgaaatgactgcgaaattctccaagcaactacgt
ccacttggagtacatgttaaagaattaactggtgatatgcaacttagtccaagtgaaatt
aaagagactcaaattttggtaacaactccggaaaaatgggatgtagttacccgaaaaccg
gatggagataccgcgttagcacgattagtacgattaattattatcgatgaagttcatctg
ttaaatgaagatcgaggacatgtaattgaagcactcgttgcgcgaacagtacgcttagtc
gagaaaactcaattgttttgccgaattgtcggcttaagtgcaacattaccaaattacatg
gatgtagcacaatttttacgagtaaatctcagcaatggattattttatttcgatcaacga
tttcgtcccgttccactagaaacaacgtttattggatgtcaggaacttaactatcaaacg
tatttggacaacgcgtgttacgatcaagtgataaaagcgttacgtaatggttcccaagtt
atggttttcgttcacacgcggcgtggtacggtgaaaacagctgaaacgcttctaactaaa
gcacaaaatgctggtgacttaaagttgttcgaatcggagcatataaaaacggctggatat
acaaaagcgagaatacaaattgataaaagtaatttttcggagttacggaaattgtttcaa
tccggtatggctgtacatcatgcgggtatgttacgaatcgatcgcaatcgtgtggaaaaa
tattttatggatggatatattagggttttattttgtacggccaccttagcttggggtgtt
aatttaccggcacatactgttattatcaagggtacaaatgtttacgcaaacgggaaaaac
acagatctagatattctcgatgttcaacaaatatttggtcgtgcaggccgaccacaattc
gatacatccggtcatgccatcataattacagaaatgaatcgtttagatcaatatctacgt
cagatgacaaatcaagtacccatcgaaagtaaatttattcaacatttagcggataatcta
aacgctgagatcgtgctgggtacggttaacactgtggacgaagctgtcatgtggctgagt
tatacttatctcttgattcgtatgaaaatgaatccacttgcatatggaatcgagtattcg
gagaaaattgatgatccagaattgcatcaacgtcgtcatgcaatgattcatttttgtgcg
aaaaaattggacgctgcacgaatgatacgatataatgaaacaactggtgatttaatatca
acggactatggccgcattgcgagccatttttatattaaatatgatacgattatgaaattt
aacgaaatgatgcaaccaattatgactgaagctgaaattttgaaaatgttaacgcacgct
gaagaatttgaaaatattgttgtgcgtgatgaagaacttgacgaactaggagatttaatg
gaagaaataaatttcccaaccgattccgtttctagggacaatggacatgtaaaagttagt
ttactcttacaaagttatttatctcgaattcgaattaaatcatcatcattaatcgctgat
atgcattatgcagttcaaaatataccacgattgattcgtgcattattcgaaatattttta
cgcttaaataatgcaataatggctaaacttgtattaagatttgcgttaatgttcgaacaa
caacaatgggatcacgaaacaccactacgtcaatttcaacgtttaacgtatgacgtatta
gataaaattgaacgtcacgatgtaaatatacatcgtatacgtgaattagaactaagtgaa
gttggtagtataatacgaaatcaacgagaagcctcacaggttaaatatttagcggattgt
tttccgtatgtggacatcgaaacgaaaattatgccaataacacgttctgtattacggatt
attatcgatattaaagcagattttaaatgggatccgaaaattcatggttatgctcaatcg
ttttggctgtggattgaagatcctgatcataatattatatatcatcacgaatattttcaa
ctaactagaaaattggttatgaaagatgaaccaataaaattgtttataacgattccattg
gtggaaccaacacctccacaatattatgtacgtgtgttcagtgatagatggctgcgcgcc
gaaagtgacacaccatttagatttgatacgagcatgttaccaacgaatttaaccatacaa
accgacttacaaaatttacaaccgttatcaaagcgagcacttaaaaataacgcttatgaa
tcattatatccattcaattttttcaatccaattcaaacccaaatgttctatgtcctgtat
cgaacagatcataatattttgttgggagctccaactggatctggtaaaactattgtggct
gagatagcaattttacggctgtttaacactgaacccgatcgaaaggtgatatatgtggct
cccttaaaagctttagttcgagaacgtgttgacgattggactaaaaaattcggcgaaaaa
cttaagaaaaacgtggcagaaatgactggtgattcaatgcctgataaacgaacgttagat
caagctcaaataatcataaccacaccagaaaaatgggatatcgtgagtcgtaactgggag
agtcgatcatacgtacaagcagtgggtcttctcattatggatgaaatacatttgttgggt
gaagaccgtggacctgttctggaagcaatcgtatcccgaacaaattacatagcgtcaaag
catagtagcacaatccgtatgatgggattatcaacgggtatcgcaaattcatacgattta
gcgacttggttaggtgtttcagaggaaggtctttttaatttccgtccatcggtacgacct
gtaccacttgaagtacatatatctggttacccaggtcaacattattgtccacgtatggct
ttaatgaataaacccactttccaagcaattcgtgagcatgcgccgtccagcccaacttta
gtttttgtctcatctagacgacaaactcgtatcactgctatggaactgatcaatttcgtt
agcatggactcaaacagtacccaatggcttaatatgtctgaagaagacatcgataacatc
gttcgaaatgatatatccgacgaaacgttaaaacataccctaatctatggggtgggagta
catcatgctggattattggaaggcgatcgtgttattgtcgagcaattgtttttaaatcaa
aaaattcaagttcttgtagcaaccgctacattggcatggggtgtgaatttccctgctcat
ttagtcgtaattaaaggtactgaatattacgacgggaaaactcgtcgatacatcgatatg
ccgattaccgatgttctacaaatgatgggacgtgcagggcgtccacaattcgatcagaat
ggtgttgccgttgttttggtacaggatattaagaaaagtttttataagaaattcttatac
gaaccgtttccggttgaatcgcatatgttggaagtattacctaatcatatttatgctgaa
attgcgactggtttgataacgtccaaacaagttgtacacgaatatatcacatggacgtat
ttatatcgacgattaattaataatccgcagtattataatttagtttccacggatgatgcg
gatattttggaatatattacgaatttagtgaattcaacaattgatattctggttgaatat
aattgttgtactgtggacgaggatggatttttgttatattcgacgccaagcgccaaagtt
ggatcaaattattatctagattaccataccgttaaatttatgacggataaattgcatcca
aatttgagtttggtgaatgtcataaaattaatgtgcgatacttacgaattttctgaagtt
cctgtacgtcacaacgaagaattaatgaatgcaacattagctcgatcatgccgaattcat
gtcaccgaagatttcgattcaccgcatgttaaaacattcctacttatgcaaagtcatttt
tcacgattacccgttccatgcgccgattattcaatcgatctaaaattaatcttagaacaa
agtggacgtattctacaagcatttttagattatgcagccgtcaatggttggctattgcta
tgcatacaaattgctcatgtctcacaaatgattgtacaggctgattggattgacacgacg
ccatatgctcaggtgccaagaactcacgattctcaaatcgatatcttacaaagtgtacat
accagagaaccgatatcattttgtaaatttgtaaaattaacgaaaaatgatattatggca
actaaattgaaattatataaagatggattcacacgtccaaatatacgtgatattatcgat
tacgttcaaaatttaccgctacttattgttcatgtaacgttaaaagatgcattcgcaaag
aaagtttttgagggatctccatccgacttgaaaacgaaagtacttacgttgaagaataat
cgtttatatacgttagaaattcgattaacgcattataagggatataattccaaagtatat
gcgccaaattatccaaaaactaaacaagaaggttggatgatcttgtttggatcacaagat
gagaatcttggacgagtaacagtgaaacgatgtatatttagtggcaaatcaacgtgccaa
tttattaaatttactacacctaattttccaggagaatacatttatcatatcatgattata
tcagattcatattttggtttggatcaaggatatacaatgatttctaaaattgaaatgtgc
gaagagtctgatcccgaagacgacgaagatgatgttcccgaagtgggtgataactttgca
caagctaatccaccggataattatttggagcttgattttcctaaacttcctcaaactagt
tcaatatcagagcaacctggaccctcaacgtccaaaacttaa
DBGET
integrated database retrieval system