Chrysoperla carnea: 123305222
Help
Entry
123305222 CDS
T09255
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat protein soc-2 homolog
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_14
LRR_1
LRR_LRWD1
LRR_13
LRR_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123305222
NCBI-ProteinID:
XP_044742815
LinkDB
All DBs
Position
1:83337299..83341255
Genome browser
AA seq
580 aa
AA seq
DB search
MSQMPSGGSGIQCYGASMPEAAENIAPLTFRGDKSERESSIKEKKLSTGSLGGSSDGVRP
KMVTVKHPESNKPKPTVKKNKPIQADLDVSKEFIRCRDEGITRLDLSKSNITNLPASLRD
LTHLSELYLYGNKLSSLPPEIGCLTNLKTLALSENSLTCLPDSLVNLKQIRVLDLRHNKL
NDIPNVVYRLTSLTTLFLRFNRIRIVGDDIKNLTNLIMLSLRENKIRELPAGIGKLVNLI
TFDVSHNHLEHLPEEIGNCVNLSTLDLPHNELLDIPDTIGNLTSLTRLGLRYNRLTAIPV
TLCNCKHMDEFNVEGNAISQLPEGLLASLVELTTITLSRNNFSSYPSGGPAQFTNVHTIN
LEHNQIDKIPYGIFSRAKKLTKLNMKENLLTALPLDIGTWTNMVELNLGTNQLLKVPEDI
QCLQSLEVLILSNNLLKKIPASIGNLRKLRVLDLEENKLESLPNEIGFLRDLQRLIVQSN
QLTALPRAIGHLTNLIYLSIGENNLTYLPEEIGTLENLESLYINDNPSLCNLPFELALCG
NLQIMSIENCPLSQIPPEIVSGGPSLVIQYLKMQGPYRAM
NT seq
1743 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcagatgccatcaggaggtagtgggattcaatgttacggcgccagtatgccagag
gctgccgaaaatatcgcgcccttaacatttcgtggggataaatctgaacgggaatcatcc
attaaggagaaaaagttatcgactggttctctgggtggaagtagtgatggtgttcgccct
aaaatggtaacagtgaaacacccggaatccaataaaccgaaaccaacagtgaaaaagaac
aaaccaatacaagctgatttagatgtaagcaaagaatttatacggtgtcgtgacgaagga
atcacacgtttagatttgagtaaatcaaacataacaaatttaccagcatcattacgagac
ttaacccacttatccgaattgtatttatatggtaataaattatcatcattaccaccagaa
attggatgtttaacaaatttaaaaactttagcattaagtgaaaattcgttaacatgttta
ccggattcattagtgaatttaaaacaaattcgagtactcgatttacggcataataaatta
aacgacataccaaacgttgtttatcgtttaacatcgttaacaacactctttttacgtttt
aatcgaatacgtatcgttggtgatgatataaaaaatttaacgaatttaataatgttaagt
ttacgagagaataaaatacgagaactacccgctggtattggtaaattagtaaatttaatt
acatttgatgtatcccataatcatttagagcatttgcctgaagaaattggtaattgcgtg
aatttatccacgttagatttaccccataatgagttacttgatattccggatacaattgga
aatttaacatcgttaacgcgacttggattacgctacaatcgtttaactgctatccctgtt
acactttgtaattgtaaacatatggatgaatttaatgtggaaggaaatgcaatatcacaa
cttcctgaaggattattagcaagtcttgtggaattgacaacaattacactatccagaaat
aatttttcgtcttatccatctggaggacccgctcagtttacgaatgtacatactattaat
ttagaacataatcagattgataaaatcccgtatggaatattttcacgtgcgaaaaaatta
accaaattaaatatgaaagagaatttattaactgcacttcccttggacattggaacttgg
acaaatatggttgaattgaatttgggaacgaatcaactattaaaagttcccgaagatatt
caatgtttacaaagtttagaagtattaattttatcaaataatttactcaaaaaaatacct
gcaagtattggaaatttacgtaaattacgtgttctggatttggaagagaataaattggaa
tcgttgccaaatgaaattggatttttacgtgatttacaacgtttaattgtgcaatcgaat
cagttaacagcgttgccacgtgcaattggtcatctaacaaatttgatttatttaagtatc
ggtgaaaataatttaacatatttaccagaggaaattggtacgctagagaatttagaatca
ttatatatcaatgataatccatcattatgcaatttaccatttgagcttgcgctatgtggt
aatttacaaataatgagtattgaaaattgtccattatcacaaataccaccggaaatagtt
agtggcgggccatcattagttatacagtatttaaaaatgcaaggaccttatagagcaatg
tga
DBGET
integrated database retrieval system
