Corvus cornix (hooded crow): 104691974
Help
Entry
104691974 CDS
T03546
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ccw
Corvus cornix (hooded crow)
Pathway
ccw04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccw00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104691974 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ccw00536
]
104691974 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ccw00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104691974 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104691974
NCBI-ProteinID:
XP_039423407
LinkDB
All DBs
Position
Z:complement(41834105..41953575)
Genome browser
AA seq
2903 aa
AA seq
DB search
MGRRRRLRAQRCCFLLWLGCLALWAQGAARRQQQQQQHPPALRAAGGAGGSFADAAHRED
GAGSAAGRVRRRGQQDALRGPNVCGSRFRSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCS
RPNMCTCASGQISPTCGSKPAQQCSISCRNGGTCVDEQCQCQKGFSGAHCEQPLCESGCQ
NGGRCVGPNRCACVYGFTGPQCQRDYRTGPCFTQVNKQMCQGQLTGIICTKSLCCATMGR
AWGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINSVGSYECKCPV
GHKQNEATQKCDDIDECSMIPGICEGGVCSNTVGSYFCICPRGYVTSVDGSCTLDQRTST
CFSSTVSGRCAQELPGTFTRRQCCCESGQCWASGSIVEVCPVRGSDEHRRLCVDGAPARG
GSRRGGVGGNGFLAGGNGNGFGPRGAGFIPIPGSNGFSPGVGGAGVGAGGQSPTGSGPII
TGLTILNQTIDNCKHHPNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGYKQDANGDCIADVDECTSNPC
SNGDCVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECVQNGVLCKNGRCVNTEGSFQCICNA
GFELTTNGKNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPDGRYCTDIDECQT
SGICMNGHCINTEGSFRCGCPPGLVVGVDGRVCVDTHVRSTCYGGIRKGLCVRPFPGAVT
KSECCCASPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGIC
ENLRGSYRCNCNSGYEPDPAGTNCVDVDECSMNGLLCDNGLCRNTPGSYSCSCPKGYLFS
SETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFHCECSSGSKLDPTGLICIDSLKGTCWLNIRD
SHCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDINECEVFPG
VCPNGRCINSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECVQPVPGRFWMDS
CCCAVGAAWGSDCERCPMPGTKEHQALCPRGPGFSKRGDVLTGRPFYKDINECKVFPGMC
MNGKCRNTIGSFKCRCNSGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGACVNTPGSFECECFA
GYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFRCDCPLGHELSPSQEECLDVNEC
SLSDSLCRNGKCVNMVGTYQCFCDSGYQPTPDRQGCTDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSY
ECSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMVSIDMKTCV
DVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQVGYSVKKGTTGCTDVNECETGAHNCDMHASC
VNVPGSFKCSCREGWAGNGIKCIDLDECSNGTQRCSANAQCVNSPGSYHCACAEGFTGDG
FTCSDVDECAENVNLCENGQCLNAPGAFRCECEMGFAPASDSKSCQDTDECSFQNICVFG
TCNNLPGMFRCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQL
NPTGVGCVDNRVGSCYLKYGPRGDGGLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPI
NSTEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLS
EETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSY
NGTSCENELPFNVTKRMCCCTYNIGKAWNKPCEPCPTPGMVEFKNLCGNIPGFTFDIHTG
KAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRN
ADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCVCHNGFK
ASQDQTMCMDVDECEQYPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTRNNDCVDIDECSSFFGQV
CRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCVDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICP
PGYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCMNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFC
FTNFENGKCSLPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPG
IDDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTGVHCIDTDECSIGNPCG
NGTCSNVVGSFECSCDEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYE
LREDKKMCKDLDECAEGLHDCESRGMICKNLIGTFVCICPPGMTQRPDGEGCTDENECRS
KPGVCENGRCVNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRRGFCFAEVLQTMCQMASSSQNL
VTRSECCCDGGRGWGNQCRLCPLPGTTHYKKLCPHGSGYTTDGRDIDECKVLPNLCRHGQ
CINTIGSFRCFCKAGYTTDITGTSCNDLDECSQSPRPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQ
EDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSHPSLCGS
KGICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGFI
QHYQWNQCVDENECSNPHTCGSASCYNTLGSYMCVCPSGFSYDQFSHACHDVNECSSAKN
PCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPVDGDADKENALSPDVCYE
CKINGYSKKDSRKKRSANALEQKSLGSIDMESPLKVRVNISRLDSQEHILELLPAIAALT
HRVRYIISRGNEDGTFQIRQRDGTSYLHTVRGRAVPGIHTLEITSVPLYKEKEMKQLEHS
HEDNYLRGELGEALRVRLWVDLY
NT seq
8712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcaggcggcggcggctccgggcgcagcgctgctgcttcttgctgtggctgggctgc
ctggcgctgtgggcgcagggagcggccaggagacagcagcagcagcagcagcatccgccg
gcgctccgcgctgccggaggagcgggcggctccttcgccgacgccgcgcaccgggaggac
ggggccgggagcgccgccggccgggtccgccggcgaggacagcaggacgcgctccgaggg
ccaaatgtgtgtggctctagatttcgttcctactgttgccctggatggaagacacttcct
ggaggaaatcagtgcattgttccaatttgcagaaatagctgtggcgatggattttgttcc
cgtcctaacatgtgcacttgtgccagtgggcagatatcacctacatgtggatcaaaacct
gcacagcagtgcagtatcagctgcaggaatggcgggacgtgcgtggacgagcagtgccag
tgccagaagggcttctctggggcccactgtgagcagcctctctgtgaaagtggctgtcag
aatggaggacggtgtgttggacccaatcgctgtgcttgtgtctacggcttcactggccct
cagtgccaaagagattacaggacaggcccgtgtttcacacaagtgaacaaacagatgtgc
cagggccagctgactgggattatctgcaccaagtccctgtgctgtgccaccatggggcgt
gcgtggggccacccctgcgagatgtgccctgcccagccccagccctgccgccgcggcttc
atcccaaatatccgcactggcgcctgccaagatgttgatgagtgccaggctatccctgga
gtctgccaaggaggaaactgcattaattcagtaggttcatacgagtgcaagtgtcctgtt
ggccacaaacagaatgaggcaactcaaaaatgtgatgatattgatgaatgcagcatgatc
ccaggaatttgtgagggtggagtttgctccaacactgtgggaagttatttctgcatctgc
ccccggggttatgtcacatctgtggatggatcctgcactcttgatcagagaacaagcacc
tgtttctccagcactgtgagtggccgctgtgcacaggagctgcccgggacgttcaccaga
aggcagtgctgctgtgagtctggccagtgctgggccagtggctctatcgtggaggtgtgt
cctgtcagaggatctgatgaacaccgcaggctgtgtgtggacggtgcccctgccagaggc
ggctcccggcgtggcggagtgggagggaatgggttccttgctgggggcaatggcaatggc
ttcggaccaagaggagcaggcttcattcccatcccaggaagcaacggattctccccaggt
gtgggtggagcaggggtaggagcaggtggtcagagtcccactggaagtggcccaatcatt
acagggctgacaatactcaatcagacaatagacaactgcaagcaccatcccaatctttgt
ctcaatggacgttgtataccaaccccctctagttacagatgtgaatgcaatatgggatat
aagcaggatgcaaatggggattgtattgcagatgttgatgagtgcacatcaaacccctgc
tccaacggggactgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccacacaggtttc
cagagaactcctaccaagcaagcctgcattgatatcgatgagtgtgttcagaacggtgtt
ctttgtaaaaatggccggtgtgtaaacactgagggaagcttccagtgcatttgcaatgct
gggtttgaattgactacaaatggaaaaaattgtgtggaccatgatgagtgtgccacgaca
aacatgtgtttgaatgggatgtgcataaatgaggatgggagttttaaatgcatctgtaaa
ccaggatttgttctggctccagatggacgttactgtactgatattgatgaatgccagaca
tcaggaatttgcatgaatggtcattgcataaatactgaaggctcatttcggtgtggttgt
ccacctggcttggttgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtggacactcatgtgcgtagc
acatgctatggaggcatcagaaaagggctgtgtgtccgtcccttccctggtgctgtgaca
aagtctgaatgctgctgtgccagccctgactatggctttggagagccatgtcatccctgc
cctgctaaaaactcagctgagttccatggcctgtgtagcagtggaattggtattactgtt
gatggaagagatattaatgagtgtgctttggatcctgatatttgctccaatgggatttgt
gaaaacctgcgtggcagctatcgctgtaactgcaacagtggctacgagcctgaccctgct
ggaaccaattgtgtggacgttgacgagtgctccatgaatgggctgctgtgtgacaatggg
ctctgccggaacaccccgggcagctacagctgctcctgccccaagggttacctgttcagc
tcggagacagacacctgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggt
gcctgcaggaacaaccttggatcgttccactgtgaatgttcctccggcagcaagttggac
cctacaggactgatttgtattgacagcctgaaggggacttgttggcttaatatccgagac
agccactgtgaagtcaacatcaatggtgccacactgaaatctgaatgctgtgctacctta
ggagcagcttggggcagcccatgtgaacggtgtgaattggacacagcttgctctagagga
tttgccagagtgaagggtgttacctgtgaagacataaatgagtgtgaggttttcccgggg
gtttgtcccaatgggcggtgcatcaacagcagaggctcctttcactgcgagtgccccgag
gggctgaccctggacgggacggggcgagtgtgtttagatattcgcatggagcagtgctac
ctgaagtgggatgaggacgagtgcgtgcagcccgtgcccggcaggttctggatggattcc
tgctgctgcgccgtgggggctgcctggggctccgactgcgagcgctgccccatgcccggc
accaaggagcaccaggctctgtgccccaggggccctggcttctccaagaggggggatgtt
ctgactggcaggccattctacaaagatatcaatgaatgcaaagtgttccctggcatgtgc
atgaatggtaaatgtagaaacacaattggaagtttcaaatgcagatgtaacagtgggttc
actttagatatggaggaaagaaactgtacagacattgatgagtgcaggatctccccagac
ttgtgtggaagtggtgcttgtgtcaacactcctggcagctttgagtgtgagtgctttgct
ggctacgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatatagacgagtgtgaacgc
aaccctctgctgtgcagaggtggcacctgtgtgaacactgaggggagttttcggtgtgac
tgtcccctggggcatgagctgtcaccatcacaggaggaatgcttagatgtaaatgagtgc
tcactgagtgacagtctctgcagaaacggcaagtgtgtgaacatggttgggacataccag
tgcttctgtgactctgggtaccagcccactcctgacaggcaaggatgcacagatattgat
gagtgtatgataatgaatggaggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctat
gagtgcagctgcagtgatggctatgctctgatgccagatgtcaggacatgtgcagatatt
gatgaatgtgaaaacaatccagatatctgtgatggtgggcagtgtacaaatatcccaggg
gaatatcgctgtctctgttacgatggatttatggtttctatagacatgaagacttgtgtt
gatgtgaatgaatgtgatttgaattccaacatctgcatgtttggggagtgcgaaaacacc
aagggctccttcatttgtcactgtcaagtcgggtattcagtcaagaaaggaaccacaggg
tgcacagatgtgaatgagtgtgaaactggagctcacaactgtgacatgcatgcctcatgt
gtcaatgtgccaggaagttttaaatgcagttgcagagaaggttgggctggaaatggcatt
aagtgtattgatcttgatgagtgctctaatgggacccagcggtgcagcgccaacgctcag
tgtgtgaacagcccgggctcctaccactgtgcctgtgcagagggattcactggagacggc
tttacctgctctgatgttgatgaatgtgcagagaatgtcaacctgtgtgaaaatgggcag
tgcctgaatgcccccggtgcctttcgctgtgagtgtgagatggggttcgctcctgcctct
gacagcaagtcctgccaagacaccgatgaatgctccttccagaatatttgtgtgtttggc
acctgcaataatctcccaggaatgtttcgctgtatctgtgatgatggctatgaactagat
agaactgggggaaactgcacagatatcgatgaatgtgccgatcccattaattgtgttaat
ggtctttgtgtaaacactcctggaagatacgagtgcaattgtcctccagacttccagctt
aatcctactggagtgggttgtgtggataaccgtgtgggcagttgctacctgaagtatgga
ccgagaggggatgggggcctgtcctgcaacactgagattggggttggagtcagtcgttcc
tcatgctgctgctcgttgggaaaggcctgggggaacccctgtgagacctgtccccctata
aacagcactgaatacaacactctctgtccaggaggggaaggattcagaccaaatcccatc
actattattttagaagacattgatgaatgtcaggagctgccaggtctctgccaaggtgga
aattgcatcaatacttttggcagcttccagtgtgaatgcccaaaaggctactacctcagt
gaagagacaagaatctgtgaagatattgatgagtgtgttgcacaccctggtgtctgtggt
cctggcacctgctacaacaccttggggaactacacctgcatttgcccacctgaatatatg
caggtgaacggaggacacaactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctat
aatggaacctcctgtgagaatgaactgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgctgctgc
acatacaatattgggaaagcctggaacaaaccttgtgagccgtgtccaactccaggaatg
gttgagttcaagaacctatgtgggaatattcctggcttcacttttgacatccatactgga
aaagctgttgacattgatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgccaatggagtttgc
atcaatcagattggcagcttccgctgtgaatgccctactggattcagctacaatgacctg
ctcttggtctgtgaagatattgacgagtgcagcaatggggacaacctctgccagagaaat
gctgactgtatcaacagccctggtagctatcgctgtgaatgtgctgctggctttaaactg
tcacccaatggtgcctgcattgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagt
catggtttgtgtgtggacatgcaggggagctaccagtgcgtatgtcacaatggcttcaag
gcatctcaagatcagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacagtacccgtgtgga
aatggaacctgcaagaacacagttggatcatacaactgcctgtgttatccaggatttgaa
ttaactcgtaataatgattgtgtggatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtg
tgcagaaatggacggtgtttcaatgaaattggttctttcaaatgtttgtgtaatgaagga
tatgagcttactctggatggcaagaattgtgttgataccaatgagtgtgtggcactgcct
ggttcgtgctctcctggtacctgtcaaaatttggaaggatcgttcaggtgcatctgtcca
ccaggatatgaagtaaaaagtgaaagttgcattgatattaatgagtgtaacgaggatccc
aacatctgcctctttgggtcctgtatgaacaccccgggaggtttccagtgcatctgtccc
acgggttttgtgctgtctgataatgggcggaggtgctttgatactcgtcagagcttctgt
ttcaccaactttgaaaatgggaaatgctcactgccaaaggctttcaacaccacaaaggcc
aagtgttgctgcagtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctctgtcca
aaggaagaagaagttgcttttcaggacctgtgcccatatggtcatggaactattcctgga
attgatgacacacgtgaagatgtcaatgaatgccttgaaagcccaggaatttgctccaat
ggtcactgcatcaatactgacggatcgttccgctgcgagtgccccatgggatacaacttg
gatttcacaggagtgcattgcatagatactgatgaatgttccattggcaacccctgtgga
aacggaacgtgctctaatgtggttggcagctttgagtgcagctgtgacgaaggatttgaa
ccaggcccaatgatgaattgtgaagatatcaatgagtgtgctcagaaccccttgctgtgt
gcctttcgttgtatcaacacttacggtttctatgagtgcacctgcccagtgggatatgaa
ctaagggaggacaaaaagatgtgcaaagatctagatgagtgtgctgaaggtctgcatgac
tgtgaatcaagaggcatgatttgcaaaaatctgattggtacctttgtgtgcatttgtcct
cctggcatgacccagagacctgatggagaaggatgtacagatgaaaacgagtgccgctcc
aagccaggtgtctgtgaaaatggtcgttgtgtgaatgttattgggagctacagatgtgaa
tgtaacgaaggattcctgtcaagtccatcaggcattgagtgtctagataatcgccggggg
ttttgctttgctgaagttctgcagaccatgtgccagatggcttcgagcagccagaacctt
gtcaccagatccgagtgctgctgtgacggaggccggggctgggggaaccagtgcaggctc
tgcccccttcccggaaccacccactacaagaaactctgtccacatggatcaggctacacc
acagatggaagagatattgatgaatgtaaggtcctgccaaacctgtgcaggcatggtcag
tgcattaacaccatcggctccttccggtgcttctgcaaagctggctataccactgacata
actggcacatcttgtaatgatcttgatgagtgctcccagtctcccagaccatgcaatttt
atctgcaagaactcagaagggagctaccagtgctcatgtccccggggctacatccttcag
gaagatggaaagacatgtaaagatcttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaactgtcag
ttcctctgtgtcaacacccttggaggcttcacatgcaagtgtccacctggttttacacaa
catcacacagcttgtattgataacaatgaatgtggttctcatccatcactgtgtggatca
aaaggaatttgccaaaatactcctggaagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttct
ctggattctactggattaaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaaccataggtgc
cagcatggctgtcagaacatcctgggcggatacagatgtggatgcccacagggatttatc
cagcattaccagtggaatcagtgtgttgatgaaaatgaatgctctaatcctcacacgtgt
ggctctgcttcttgctacaacaccctgggaagttacatgtgtgtctgcccatctgggttc
tcctatgaccagttctcccatgcctgccacgatgtgaatgagtgctcttctgccaagaac
ccctgcaattatggttgttccaacactgaaggtggctatctctgtggctgcccacctggc
tattacagagttgggcaaggacattgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtac
ctgccagtggatggagatgctgataaagagaatgctttgtcccctgacgtgtgttatgag
tgcaaaatcaatggctactccaaaaaggacagcaggaagaagagaagtgctaatgctctg
gagcagaagagcttgggaagcatcgacatggagagtcccttgaaggtgagagtgaacatc
tccaggctggacagccaggagcacatcctggagctgctgccggccatcgcggccctcacg
caccgtgtgcgctacatcatctcccggggcaacgaggacggaaccttccagatccgccag
agggacgggacgagctacctgcacaccgtgaggggcagggcagtgcctggaattcacaca
ctggagatcaccagcgtgcctctgtacaaggaaaaggagatgaagcagctggagcacagc
catgaggacaactacctccgaggggagctgggggaagccctcagggtgaggctgtgggtt
gacctctattag
DBGET
integrated database retrieval system