Corvus cornix (hooded crow): 104692462
Help
Entry
104692462 CDS
T03546
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
ccw
Corvus cornix (hooded crow)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
fn3
Ig_3
Ig_2
ig
Ig_DSCAM-DSCAML_C
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104692462
NCBI-ProteinID:
XP_039421360
LinkDB
All DBs
Position
26:complement(6102283..6143025)
Genome browser
AA seq
3349 aa
AA seq
DB search
MSSHQTVKIFKKSSIPGVVITQFVNDVPEGCSTPDFEKKPLTLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PAPEVKWSRTRKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIKSLVLDDSDLYRCYAVNAYGEASCS
AGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELRKTLLESKKLLRKRVIAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DKRDYEKICMKYGIVDFRGMLRKLQEIRKDTETEQDKFIHSLRNFEHIKVNKEGNATFSL
EMELKSRNSKVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRVGRRYRFTINDVQPEDAGVYQVRVE
DIPIFSTELDAQAIPVRFRQPLSDVRCAEAGDAEFQCVLCTPCHEPLWLHKSHLLQASDK
HQISVTPDGLTHKLIVRNAVPSDSGLYTLDAGQGSSSAWLLVEYAKGKRRQDEGEQIERE
TSEWLKETMADNERARKLRRQEQAGDEDHPSFSTSPGVEKTGWYRTGQGSSQGRGQGHSI
DPDDGSQRFLGKEGLRKTHINGEMGSGQFSGAGLDGDSGANDGSTFGLKGLGGRSGLRAV
HGMDAVSGRAGPGGAVGGAGEWNSVDGRGEGVLGAVNIDMDDGEGLGSQHDKDGNLGDAS
YRAGFGGAGRLGGGSSVPDGLDPDSTGVAASVGDLFSRTRPGTGAGGDAAGAGMAGRMRS
HHGKDGHPTVGDKNGAGINREGQTGTPYGKDGLTPHASGQLGQAERSGSLYVPGGLPGGD
RAIAGAGGNFTGEMEALYGPDGQALGAGAGGAGGAGVGGFGAPYGKDGLPAGAGGTGARG
LGSPYGKDGLPAGEGIGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGEGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPV
GAGTGGAGGAGGLGAPYGKDGLPAGEGIGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGEGTGAAGGAGG
LGAPYGKDGLPVGVGTGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGVGTGGAGGAGGLGSPYGKDGLPA
GAGTGGAGTGGFGAPYGKDGLPAGAGAGGAGGFGEALYGPDGRPLGAGVGGTAGAGAGGL
GAPYGKDGLPVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPVGVGTGGAGGFGEALYGPDGRPLGAG
VGGTAGAGAGGLGSPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGVFGAPYGKDGLPVGAGAGRAGGAGVF
GAPYGKDGLPVGTGIDGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGIGGAGGAGGLGSPYGKDGLPVG
VGTGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGAGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGTGAGGAGGAGVF
GSPYGKDGLPVGAGIGGAGAGAGGLGAPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGGLGSPYGKDGLPV
GAGIGGAGGAGGLGSPYGKDGLPVGAGTGGAGDARGLGAPYGKDGLQFGAGGAGEGGFGE
PLYGPDGKQLGAGVGAAGAASARGLGTPYGKDGLPVGGGAGGAGGAGGLGAPYGKDGLPT
GPVVGGATTGALGYPRGKDGLAAGLGVGGAAGAGFGGAASPYGMDGFPAGGAVAGGLGAP
YGKDGLPVAAGAGGAGGAGGPGAPYGKDGLPVGAGIGGAGAFGEALYGPDGRPLGAGVGG
TAGAGAGGLGAPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGGHGAPYGKDGLPVGAGAGGAGGAGGLGAP
YGKDGLPAGAGTGGAGTGGFGSPYGKDGLPAGAGTGGAGTGGFGSPYGKDGLPAGAGAGG
AGRGGFGAPYGKDGLPVGAGAGGAGAGGLGAPYGKDGLPAGAGAGGAGGFGEALYGPDGR
PLGAGVGGTAGAGVFGSPYGKDGLPVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPVGVGTGAAGGA
GGLGAPYGKDGLPAGTGAGGAGGAGGLGSPYGKDGLPVGVGTGGAGGVGGLGAPYGKDGL
PVGAGTGGAGAGAGGLGAPYGKDGLPVGAGAGGAGAGGLGAPYGKDGLPAGAGAGGAGGF
GEALYGPDGRPLGAGVGGTAGAGAGGLGSPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGGLGAPYGKDGL
PVGAGAGGAGGAGGLGSPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGTGAAGGA
GGLGAPYGKDGLPVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGL
PVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGGAGGVGGLGAPYGKDGLPVGAGAGGAGGAGG
LGAPYGKDGLPVGAGTGAAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGTGGAGGAGGLGAPYGKDGLPA
GTGIGGAGGAGGLGAPYGKDGLPVGAGGAGGAGGFGEPLYGPDGRPSGAGVGGAGAAAVG
GLGSPYGKDGLPAGAGGGGAGGAGVLYGKDGFSAGAVAGAAHFPPGGEEAMGSGRGRDAM
LSRALGYAGGGGGEGFSGEGSALWGAGSLYGKDRGSAVARAGASGIGRLGGDEQDSVRGK
GGVGGAGGPDGGYGLDSHLGRSLGGETGKGTASDVRGPGNKGSADDRGSLSGPGGARGEG
RDFGQLGSLDGTNSAFGGAGSKSHDRSVDGSSSGGFGQGPLSYGQMSGPFGGPPSANQRK
QEPDLDLKANDSLNNTESTGQRKRSALDDLKVPRCYLNKQLATMRVLKGDPAELSCTVSR
DNVTGTWFKDGLKLTSMDGVIFEKKGLVHKLIINKAEDIHAGKYRFEGGDVKTEASIFVE
DPPQVDKVLLKNLTSVPMVAKAGEGLKLRIPFEGRGPIRATWLKDRMELGDDTRIRVDKT
DTCTTLSISSCDRRDCGDYKVRLKNDSGVLEINLKLVVIDKPQPPAGPIKIVESSASNIT
IQWKPPKDDGGKPVQRYLVERQQMGRNNWETLGETPRSCTSFTTSKVEEEMSYYFRVRAM
NAEGVSDALESGEVKAAGKASPGAPDPPKIISASRDTITISWKAPRKTGTSQIMGYIVQK
RKKGTVTWLPVTSVPVKDKKLKVTGLKEGVQYEFRVAAVNAAGTGQPSDPSEPSFARDPT
KSPGQVQDLKVSSSDSTSVTLTWNKPEVQDGNDVKGYEVEKRPCNSLSWTKCFTLPAEST
SCRVQGLRAGEKLFLRVRALSDSGPGEASELEACAGAAAPVVSPRLLIDDTVKRFLVIKA
GNPIRVKIPFEGSPEPVVTWLKDGLPLPSRAAVNTEDGSTQLLLRAAELSDSGTYTVELG
NGLGKRETFSFQVQITDIPQPPGAIRLEENVPNTVTVTWDPSASEKWEKNLYYTVLKRES
QKGLWHVLGDLIYNNKFTFTTVVPGRDYYFRVVAKNDLGASDPSETVKPWRIWKTKAEFR
VKAPKYRGVNQNQPPRFLVPLKPHVVVTGSECHMSCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSGDPN
YFCTNDFGVCSLVVLGVTKQDEGEYMVEASNEAGRAFSKAFLAIKDSSL
NT seq
10050 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcagccatcagacagtaaaaatcttcaagaaatcttctatcccaggagttgttatc
acccagtttgtgaatgatgttccagaaggatgcagtacacctgattttgagaagaaacca
ctcactctgacactgcaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccagcccctgaggtgaaatggtcgcgtacacggaaaggaatggatgatcctgccaaatat
gaaatgtccttcaacagtgctacaaatgaattcattctgcagatcaagagcctggttctg
gatgacagtgatttgtatcgctgctatgctgtcaatgcctacggagaggcctcgtgctct
gctggcctcaggatcatccaagttggctttaagaggaaggcaaaatatgttcctgttcat
gctgctgatgagctcaggaagacactcctggagtccaagaagctgctgaggaagagggtc
atagcaccaaaaccaaagcccctggacaaagaagctgtgtggcagctgttgctgcatgca
gataagagagattatgaaaaaatctgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatg
ctgaggaagctgcaggagataaggaaggacacagagactgaacaagacaagttcattcac
agtctcagaaactttgaacacatcaaagtcaacaaggagggaaatgctacgttcagcctg
gagatggagctgaaaagcagaaacagcaaggtttacctgctcaaggacggcgagcggctc
cggtacgggacaggggacgagtacaggaagcactgcctgaggagagttgggagaaggtac
cgcttcactatcaatgatgtgcagccagaggatgcaggggtgtaccaggtcagggtggag
gacatccccatcttctcaactgaactggatgctcaagccatcccggtgcggttccggcag
ccgctctccgacgtgcgctgtgccgaggctggggacgctgagttccagtgtgtgctgtgc
acgccctgccacgagcccctgtggctgcacaaaagccacctcctccaggccagtgacaag
caccagatctctgtgacacctgatggcctgacccacaagctgattgtcaggaatgcggtg
ccctcggacagtggcctgtacacgctcgacgcgggacagggctcctccagtgcctggctc
ctcgtggagtatgccaaaggaaagaggagacaggatgaaggagaacagattgaaagggag
acatctgagtggctgaaagaaacaatggcagacaatgaaagggcaaggaagcttcggcgc
caagaacaagctggtgatgaagatcatccttccttttctacatcccctggtgtggagaaa
actggctggtacagaactggccaaggcagcagccaaggcaggggccaaggacactccatt
gatcctgatgatggaagccaaagatttttgggaaaagaggggctacgcaaaacccacata
aatggagagatggggtctgggcagttttctggagcaggtctagatggagactcaggggcc
aatgatggcagcacctttggactaaaaggcttaggaggcagaagtgggttaagggctgtc
catggtatggacgctgtctcaggcagagcaggtcctggtggtgcagtaggaggggcaggc
gaatggaattctgtggatggcagaggtgagggtgtgctgggtgctgttaacattgacatg
gatgatggagaaggtttgggctctcagcatgacaaggatgggaatttaggtgatgccagt
tacagagctggttttgggggtgctgggaggttgggtggtggaagttctgtgccagatggg
cttgatcctgattcaactggagtggcagccagtgtgggtgatctgttcagcaggactcgt
ccaggaactggagctgggggagatgctgcaggtgctggaatggcaggaagaatgaggtcc
caccatggcaaggatgggcatcccactgtgggtgataagaacggagcaggtataaacaga
gagggacaaacagggactccctatggcaaggatggcctgacacctcatgccagtggtcag
ttagggcaggcagaaaggtctggctctctgtatgtgccaggaggccttccaggtggagat
agggctattgctggtgcaggtggaaatttcacaggagaaatggaggctttatatggtcca
gatggtcaggcactgggagcaggtgctggtggtgctggtggggctggtgtagggggattt
ggagctccatatggaaaggatggtctcccagctggggctggtggtactggagcacgggga
cttggatctccatatggaaaggatggtctcccagctggagaaggcattggtggggctggt
ggtgcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagaaggcact
ggtgcagctggtggtgcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagtt
ggagcaggcactggtggggctggtggtgcaggaggacttggagctccctatggaaaggat
ggtctcccagctggagaaggcattggtggggctggtggtgcagggggacttggagctccc
tatggaaaggatggtctcccagttggagaaggcactggtgcagctggtggtgcaggggga
cttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagtaggcactggtggggctggt
ggtgcaggaggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagtaggcact
ggtggggctggtggtgcaggaggacttggatctccatatggaaaggatggcctcccagct
ggagcaggcactggtggggctggtacaggtggatttggagctccctatggaaaggatggt
ctcccagctggagcaggtgctggtggtgcagggggatttggggaggctttgtatggtcca
gatggtcggccacttggagcaggtgttggtggtactgctggtgctggtgcagggggactt
ggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcactggtgcagctggtggt
gcagggggtcttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagtaggcactggt
ggtgcagggggatttggggaggctttgtatggtccagatggtcggccacttggagcaggt
gttggtggtactgctggtgctggtgcagggggacttggatctccctatggaaaggatggc
ctcccagttggagcaggcactggtggggctggtggtgcaggggtatttggagctccctat
ggaaaggatggcctcccagttggagcaggtgctggtagggctggtggtgcaggggtattt
ggagctccctatggaaaggatggcctcccagttggaacaggcattgatggggctggtggt
gcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcattggt
ggggctggtggtgcaggaggacttggatctccctatggaaaggatggtctcccagttgga
gtaggcactggtggggctggtggtgcgggaggacttggagctccctatggaaaggatggc
ctcccagttggagcaggtgctggtggggctggtggtgcaggaggacttggagctccctat
ggaaaggatggtctcccagttggaacaggggctggtggggctggtggtgcaggggtattt
ggatctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcattggtggggctggtgct
ggggcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcact
ggtggggctggtggtgcagggggacttggatctccctatggaaaggatggcctcccagtt
ggagcaggcattggtggggctggtggtgcagggggacttggatctccctatggaaaggat
ggcctcccagttggagcaggcactggtggggctggtgatgcaaggggacttggagctccc
tatggaaaggatggtctccagtttggggctggtggggctggtgaagggggatttggagag
cctttgtatggtccagatggtaagcagcttggagcaggtgttggtgcagctggtgctgcg
agtgcaaggggacttggaactccctatggaaaggatggtctcccagttggaggaggtgct
ggtggggctggtggtgcaggaggacttggagctccatatggaaaggatggtctccccact
gggcctgttgttggtggggctactacaggagcacttgggtatccacgtggaaaagatggt
ctcgctgctggattaggagttggcggagctgcaggtgctggttttggaggggctgcatct
ccttatggaatggatggtttcccagctggaggggcggttgcagggggacttggagctccc
tatggaaaggatggcctcccagttgcagcaggtgctggtggggctggtggtgcaggggga
cctggagctccatatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcattggtggtgcaggg
gcatttggggaggctttgtatggtccagatggtcggccacttggagcaggtgttggtggt
actgctggtgctggtgcagggggacttggagctccctatggaaaggatggcctcccagtc
ggagcaggcactggtggggctggtggtgcaggaggacatggagctccctatggaaaggat
ggtctcccagttggagcaggtgctggtggggctggtggtgcagggggacttggagctccc
tatggaaaggatggtctcccagctggagcaggcactggtggggctggtacaggtggattt
ggatctccatatggaaaggatggtctcccagctggagcaggcactggtggggctggtaca
ggtggatttggatctccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggtggg
gctggtagaggcggatttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggt
gctggtggggctggtgcaggaggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagct
ggagcaggtgctggtggtgcagggggatttggggaggctttgtatggtccagatggtcgg
ccacttggagcaggtgttggtggtactgctggtgcaggggtatttggatctccctatgga
aaggatggtctcccagttggagcaggcactggtgcagctggtggtgcagggggacttgga
gctccctatggaaaggatggtctcccagttggagtaggcactggtgcagctggtggtgca
gggggtcttggagctccctatggaaaggatggtctcccagctggaacaggggctggtggg
gctggtggtgcagggggacttggatctccctatggaaaggatggtctcccagttggagta
ggcactggtggggctggtggtgtagggggacttggagctccctatggaaaggatggcctc
ccagttggagcaggcactggtggggctggtgctggggcagggggacttggagctccctat
ggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtggggctggtgcaggaggacttgga
gctccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggtggtgcaggtggattt
ggggaggctttgtatggtccagatggtcggccacttggagcaggtgttggtggtactgct
ggtgctggtgcagggggacttggatctccctatggaaaggatggcctcccagttggagca
ggcactggtggggctggtggtgcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctc
ccagttggagcaggtgctggtggggctggtggtgcagggggtcttggatctccctatgga
aaggatggtctcccagttggagcaggcactggtggggctggtggtgcaggaggacttgga
gctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcactggtgcagctggtggtgca
ggaggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcactggtgca
gctggtggtgcaggaggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagca
ggcactggtgcagctggtggtgcaggaggacttggagctccctatggaaaggatggtctc
ccagttggagcaggcactggtgcagctggtggtgcaggaggacttggagctccctatgga
aaggatggtctcccagttggggctggtggggctggtggtgtagggggacttggagctccc
tatggaaaggatggtctcccagttggagcaggggctggtggggctggtggtgcaggagga
cttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggcactggtgcagctggt
ggtgcagggggacttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagctggcact
ggtggggctggtggtgcgggaggacttggagctccatatggaaaggatggtctcccagct
ggaacaggcattggtggggctggtggtgcaggaggacttggagctccatatggaaaggat
ggtctcccagttggggctggtggtgctggtggtgcaggaggatttggagagcctttgtat
ggtccagatggtcggccatctggagcaggtgttggtggggctggtgcagctgctgtaggg
ggacttggatctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtggtggtggtgcg
gggggagctggagttctctatggaaaagatggtttctcagctggggctgtggcaggagct
gctcattttcctcctggaggtgaggaagcgatgggatctggccgtggcagggatgccatg
ctgagcagagctctgggatatgcaggtggaggaggaggagagggcttttctggggaaggc
tcagcactgtggggtgcagggtctctctatggcaaggacagagggtcagctgtagccagg
gccggtgcaagtggcattgggaggttgggaggggatgaacaggattcagtccgtggtaaa
ggaggtgtgggaggtgctggtggaccagatggtgggtatgggctggattcacatcttggc
agatctttgggaggtgaaactggaaagggcaccgccagtgatgtcagagggccagggaac
aaaggttcagctgatgacagagggtccctgtcaggtccaggaggagccaggggagagggc
agagattttggacagttgggctcccttgatggcacaaattctgcctttggaggggcaggg
agtaaatcccatgacagatctgttgatgggagtagttcaggtgggtttggtcaaggtcca
ctgagttatggccagatgtcaggtccttttggtggacctccttcagcaaaccagagaaag
caggaacctgacctggatcttaaagcaaatgattccctgaacaacacagaaagcacaggc
caaaggaaacggagtgccctggatgatctcaaagtgccacgctgttacctcaacaagcag
ctggcaaccatgcgagtgctgaagggggacccagctgagctgtcctgcactgtcagcagg
gacaatgtgacaggaacctggtttaaggatggcctaaagttaacaagcatggatggagtc
atctttgaaaagaaaggtcttgtccacaaactaatcattaacaaagctgaagatattcat
gctgggaaatacaggtttgaaggtggagatgtaaaaactgaagcttcaatttttgttgaa
gatcctccccaggtggacaaagtcctcctcaagaacttgaccagtgtccccatggtggcc
aaggccggggaggggctgaagctgcggatcccatttgagggccgggggcccatcagggcc
acatggctgaaggacaggatggagctgggggatgacaccaggatccgtgtggacaagaca
gacacctgcaccacactgtccatctccagctgtgacaggagggactgtggggattacaaa
gtcaggctcaagaacgacagtggcgtcctggagatcaacctaaagctcgtggtgatagac
aagccacagcccccagcaggacccatcaaaattgtagaaagctccgccagcaacatcaca
atccagtggaagcccccaaaggacgatgggggcaaaccagtgcaaaggtacctcgtggag
aggcagcagatgggcaggaacaactgggagactttgggagaaacccccaggagctgcacc
agcttcaccacaagcaaagtggaggaagagatgagctactacttcagggtgagggccatg
aatgccgagggagtgagcgacgcactggagtcgggggaagtgaaggctgctggtaaagct
tctcctggtgccccagatccccccaagatcatcagtgccagcagagacaccatcaccata
tcctggaaagctcctcgcaaaactggcacttcccaaattatgggatacattgttcagaaa
cgcaagaagggcactgtgacctggctgccagttaccagcgtgcctgtcaaagacaagaag
ctgaaggtgaccggcctcaaggagggtgtgcagtacgagttccgggtggcagctgtcaat
gctgctggcacgggacagcccagtgacccctctgagccctcctttgcccgggaccccacc
aaatctccaggccaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagtgacagcaccagtgtcacc
ttgacatggaacaaacctgaagtacaagatgggaatgatgtgaaaggctacgaggtggag
aagaggccctgtaacagcctcagctggaccaaatgcttcaccctccctgcagagagcacc
tcgtgcagggttcaggggctgcgggccggggagaagctgttcctgcgcgtgagggccctc
agcgacagcggccccggggaggcctccgagctcgaggcttgtgctggagctgctgctcct
gtggtctctcccagattactgatagatgacacagtgaaaaggttcctggttataaaagca
gggaatcccatccgggtgaagattccctttgagggatctccagagccagtggtgacctgg
ttaaaggatggactcccccttcccagccgggctgccgtgaacaccgaggatggaagcacc
cagctgctgctcagggcagctgagctcagtgacagcggcacctacactgtggagcttggg
aatgggctggggaaaagggaaaccttcagcttccaggttcaaattacagacatccctcag
ccccctggagccatccggctggaggagaatgtgcccaatacagtgacagtgacctgggac
ccctcagcatctgagaagtgggagaagaacctgtattacactgtcctgaaacgggaatcc
cagaagggtctgtggcatgtgctgggggacctgatctacaacaacaagttcaccttcacc
acggtggtcccaggcagggattattacttcagggtcgtggcaaaaaacgacctgggagcc
agtgatccatcagagactgtgaagccctggaggatctggaaaacaaaggctgaatttcga
gtgaaagcaccgaaatacaggggagttaaccagaaccagcccccgaggttcctggtgccg
ctgaagccgcacgtggtggtgacgggcagcgaatgccacatgagctgcgccgttggaggc
caccccccgcccaaaatcacatggtacaaggacagcagagacctctccggagatcccaac
tacttctgcacgaacgacttcggagtgtgctccctggtggtgctgggggtcaccaagcag
gatgagggcgagtacatggtggaagccagcaatgaagcgggccgtgccttcagcaaagcc
ttcctcgccatcaaagactcctccctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
