Chryseobacterium daecheongense: MUU74_09325
Help
Entry
MUU74_09325 CDS
T08680
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
cdae
Chryseobacterium daecheongense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
AIDA
G8
GBD_T9SS_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOU96699
LinkDB
All DBs
Position
1926470..1929967
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
MKQKLSVFGKTSLMFFMTLFSIWSWGQINESFETGLPGSYNSTLSTVTLSSGSWQIKDVI
AGTTGATAGTKSAQIRSATAAQIITPTLTGGVGTVSFTIVASTASGAYQVNVSEDNGQTW
TPASGSPFTVGTTSSTRTININSSTVNKIQIYRTGATLYVDNFSTTAFSSTSPTITTVGT
FNAFSYVENNGPSASQSIQASGNNLDGTDVTVTAPTNYEVSLTNGNDFADTKTIPYSGGA
FTGQNIYLRLKSGLAVNSYSGNLTISGGGISSNASVAANGSVTEPPPANDLCSASTVLNA
GQTTNGTMVNATATSGLSYAATKRDVWYKFTPTSTGDHIITANFASGPDLDLDIFTSTCP
TSGTAQFTAHTSGATSEVLTANLTASIDYYIRVIDFNNDASAFDITVQTPQPCTSPNVAS
NLALTPASNSISGNFTDASASGYMVVVSQNATLSTSPVNGVTYNVGDSFGGGTVVKYSSG
TTFTANTLNQNTNYYIYVFSYNNQCLGAPYYSTTSVSGSTTTLAAPCMSENFSSNTQPSG
WVNSGTGITYTSGYADMSVNNGSITTSSLAYPAQLTFDLARTTNTTAKTLYIEVSTTSQS
AGFVTVKMYDHSNTTSGGSTACTVDLSAYSSNPTVYIRFRKESGTTSPWRIDNVQTFCSA
VWNGSTWTTTPNANTDAIITGNYSTTTNPSFTAKNVVIKNGGVLEVTSGNTVNAVDITVE
HGGNFIQRDGSTINYTGTFKTLKNELSDINKYAFWSSAVANQDLTAIYGVGNTPAFITQY
NTATDYFVNATSTISGVGTGYSIKTPVANASLTFTGAPNSGTYTKTLSTAGNGFNLIGNP
YPSNLDLNAFYNANSTRISNTFYFWDNTSNSVTTQGGATTVNIGYATYNPATQVWVSAPN
IANIPTDNVAAIGQGFIVKATNAADTSLSFTNNMRVGISGVFFNKTTTTDEGKFWLRLSS
SYNTSNTLAVAYLAQASDAYDKYDSQAIATGSDAFYTLADAQKLVIQGKGGFDINDIVPV
GTKHFETGNFVISLVKKEGIFDNGQPIYIHDKVLGTYTNLQNGNYTFSANAGELTTRFEI
VYKDMNVLAANEIKNEAFEVYQDGEDFVVRNNKNIDRIELFDASGRKINQTVGYTKEIRF
KLITKGLYILKAFSAGKEYTKKLIK
NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaaattatcggtttttggaaaaacgtctctgatgtttttcatgactctgttt
tctatatggagttggggccaaatcaatgagagttttgaaacaggtcttccgggaagttat
aattccactttatcaacggtcacactaagcagtggatcatggcaaattaaagatgtaata
gcgggaactaccggagctacggcgggtacaaaatctgcgcagatcagaagtgctacggcg
gctcagattattactcctacattaacaggcggagttggaacggtaagctttactattgta
gcatctactgcttccggtgcttatcaggtaaacgtttctgaagataatggacagacttgg
acacctgcatctggatcaccgtttacagttgggacaacttcttctacaagaactattaat
attaatagttcaacagttaataagatccaaatttatagaacgggagcaacactttatgta
gataatttttctacaactgcattttcttctacttcaccaaccattactactgtaggtaca
tttaatgctttttcctatgtggaaaataatggcccgtcagcaagccagtcaattcaggct
tcagggaacaatttagatggtacagatgtaaccgtgactgcaccaactaactacgaagta
tcccttaccaatgggaatgattttgcggatacaaaaacaattccatactcaggtggtgca
tttacaggtcagaatatatatcttcgtttaaagagcgggcttgctgtaaacagttactca
gggaatttaactatttccggaggaggtatttcgtctaatgcaagtgttgcggcaaatggt
agcgtaacagaaccaccacctgccaacgatttatgttcggcttctactgttttaaatgca
ggacaaactaccaatggcactatggttaatgccactgctacttcaggtttaagttatgct
gcaactaaaagagatgtttggtataaattcactcccacaagcacgggagatcatattata
acggctaactttgcaagtggtccggatttagatcttgatatttttacatcaacttgtcca
acttcaggtactgcacagtttacagcacacacatcaggtgcgacttctgaggttcttact
gcaaatttaacagcaagtatagattattatatcagagtgattgatttcaataatgatgca
tcagcttttgatattacagttcagactccacaaccttgtacttcgccaaatgttgccagc
aacctggctcttactccggcaagtaacagtatcagcgggaattttacagatgcttctgct
tcaggatatatggtagtggtaagccaaaacgctactttatcgacttcacctgttaatgga
gtgacttataatgtaggggatagtttcggaggaggaactgttgtgaaatattcttcagga
acaacatttacagccaatactttgaatcagaatacaaactattatatatatgtattctca
tataataaccagtgtctgggagcaccttattatagtactacatctgtatcgggaagtaca
acaactttggcggcgccttgtatgagtgaaaacttttcatcaaatacacagccatccggt
tgggtaaattcaggaacgggaattacttacacttccggatacgctgatatgtccgtaaat
aatggttctataaccacgtcttcgctggcttatcctgcgcaactgacttttgatctggca
agaacaaccaacactacagcaaaaacactttatatagaagtttcaacaacaagccagagt
gcagggtttgttacagtaaagatgtatgaccattctaatacaacatctggaggaagtacg
gcatgtactgtcgatttatctgcatattcttcaaatcctacggtgtatataagattcaga
aaagaatctggcactacttcaccttggagaatagataatgtgcaaaccttctgttcggca
gtctggaatggttcaacatggacaactactccaaatgccaatacggatgcaattattaca
ggaaattattcaaccactaccaatccttctttcacagctaaaaatgttgttattaaaaat
ggaggggttttagaggttacttccggtaatactgttaatgcggtggatattactgtagag
catggagggaatttcattcaaagagatggttctaccataaactatacgggaacttttaaa
actttgaaaaacgaattaagtgatatcaataaatatgctttctggtcatcagctgttgca
aaccaagatttgactgcaatttatggtgttggaaatactccggcatttattacacagtat
aatacagctacagattattttgttaatgcaacttctacaatatcaggtgtaggtaccgga
tactctattaaaacaccggttgccaatgcttcacttacctttacaggagctccaaacagt
ggaacatatacgaaaacactttctactgcaggtaatgggttcaatcttattggaaatccg
tacccttcgaacctagatctgaatgctttctataatgcaaactccacaagaatatccaat
acattctatttttgggataatacaagtaattcagtaaccacacaaggaggtgcaaccact
gttaacatcgggtatgcaacttacaatcctgcgacacaggtttgggtttcagcacctaat
attgccaatatacctacggataatgttgctgctatcggacaaggtttcatcgtaaaagct
acgaatgcagcggatacctctttaagctttaccaataatatgcgagtaggtataagtgga
gtattctttaataaaacaaccactacagacgaaggtaaattttggttgagattaagttca
tcatataatacaagcaatactcttgcggtagcttatcttgctcaggcttctgatgcatat
gataagtatgactctcaagcaatagctacaggttctgatgctttctatacattggcagat
gctcaaaaactggttattcaggggaaaggtggttttgatattaatgatatcgtacctgta
ggaactaaacattttgaaaccggtaattttgttatttccttagtaaaaaaagaaggaata
tttgataatggacagcctatttacattcatgataaagtattaggaacttataccaatcta
caaaacggaaactatactttttcagctaatgcaggagaacttacaacaagatttgaaatt
gtatataaagacatgaatgtacttgctgctaatgaaattaaaaacgaggcttttgaagtg
tatcaagacggagaggattttgtggtaagaaataataagaatattgacagaatagaatta
tttgatgcttcgggaagaaaaatcaatcagaccgttggttatacaaaagagattcgtttt
aagttgattacaaaaggattatatattttaaaagcattttcagcaggaaaagaatacact
aaaaagttaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
