Clostridioides difficile CD196: CD196_0870
Help
Entry
CD196_0870 CDS
T00997
Name
(GenBank) putative signaling protein
Organism
cdc
Clostridioides difficile CD196
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
PAS_3
PAS_9
dCache_1
PAS
MCP-like_PDC_1
Cas10-Cmr2_palm2
Peptidase_S49_N
HECW_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBA61658
UniProt:
A0A0H3N1B2
LinkDB
All DBs
Position
1038838..1042386
Genome browser
AA seq
1182 aa
AA seq
DB search
MMNRLKPRILGISILFIIIIILTCGAVFKFKFKLDNKLKETTHTYLSEFTEHNIINLKTR
LSGQFDMLESIANFIGNLNNINNEMVIALMDSDVKRSSLIRMTISTLDGECYSNDGITHN
VQDRDYFKKAKNGEKNISEPLKSIVNNKEIIVLSTPVYKSGKIVGVLSGIYDSKKLNELL
GLSAFDEKADVFVAKKNGDIVAQKTNKNRKTISCIFQLFDKDNCDEDDCLKTIKENMKND
KSGYFNYNLDNEKFMLNYQPLGVNDWYVFSVVPNKIVSIQSENISYDVYIFALEILLVIL
IFIIYIACIINNNTKIIINEKEKFKVLTDNILGGVKTCLKDEYMTMTYVSQGFLELTGYS
CEDLNKIFKNRFKDMIYKDDLDKFNCIILNQLEKQDKIEVEYRIVRKDGSIIWILERSKS
INDNKGSECIQGVLTDITELKKIQEELDSKRFEIQAINDSIVGGIVITEINDDFDSIYLN
EGYLNMIGYTRKQLEDELNNKLIKLIFKDDRTELINSINKQLKLSDTFASEQRVEKRDGT
IIWILLKGRKIIYDNGKSVLCCVIVDITSAKLLEQELKKSEERHEIILKQTQNIIIEWDI
EKDKMNISPNWYNKFKYDPITENATKNIIKSVDIYHDDMDKFISLIKLTSQGSEYEECEI
RLRTRDTIYAWFSIKATTLFDNNGKPYKVVGSLTDIDESKREAEKLKERAEKDPLTDLYN
KKASQSLIEEYITLDKKRKGALMIIDIDNFKGINDNLGHLYGDAVLSEIANDLINLFRAT
DIVGRIGGDEFIVFIKDISETRDIINKAEELVKTFERSFLGKGRNYKISLSVGIAKFPQD
GMDYMTLFRNADMALYSAKGKGKNCYTLYDKKIDKVQYITNTRNAGDSDNVEMSFKEHIT
NYIFDILYESSDIEVAVNLILSIVGKHFNVSRMYIFENSDDNRVCKNTFEWCNEGVTSEI
NNLKNICYKDLGNYLLNFNADGLFYCNDIENLGSDVKKVLKPQGIRSILQCKILEGNEFR
GFIGFDECSYNRMWTNDEVNTLTFISKTLSMFLLKMRIQSKLEESLTIQKSVMDNMDIWA
YVVDRNTYELLFINKKMLESASNTHVGDLCYKAIWNNQDKPCKKCPMIYLKDGDDTYKSF
MRNKKFEVQANITTTTLKWFDGKDACLIFGSEVTSIEAEENT
NT seq
3549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaacagactaaagccaagaattttaggtattagtatcttgtttattattataatt
attttaacatgtggagctgttttcaagtttaaatttaaattagataataaattaaaagaa
accacacatacatatttgtctgagtttacagaacacaatataattaatctcaagacaaga
cttagtggtcaatttgacatgcttgaatctattgctaacttcataggaaacttgaataat
ataaataatgaaatggtgattgctttaatggattctgatgtaaagcgaagttctttaatt
agaatgactatctctacattagatggggaatgttattctaatgatggaatcacccataat
gttcaagatagagattattttaaaaaagctaaaaatggagaaaagaatatttcagagcct
ttaaaatctattgttaataataaagaaataatagttttatctaccccagtttataaaagt
gggaaaatagttggtgttttaagtggaatttatgattcaaaaaagttaaatgagttatta
ggattatctgcatttgatgaaaaagcagatgtttttgttgcaaagaaaaatggagatata
gttgctcaaaaaacaaataaaaatagaaagacgatatcatgtatatttcagctttttgac
aaagataattgtgatgaagatgattgtctaaaaactataaaagaaaatatgaaaaatgat
aagtctggatattttaattataacttagataatgaaaaatttatgttaaactatcagcca
cttggagttaatgattggtatgttttttctgttgtgccaaataaaatagtgtctattcag
tcagagaatatatcttatgatgtatatatttttgcattagaaatactactagttatattg
atttttataatatatatagcatgtattataaataataacaccaaaattattataaatgaa
aaagaaaaatttaaagtactcactgataatatattaggaggggttaaaacctgtttaaaa
gatgaatatatgactatgacatatgtaagtcaggggtttttagagcttacaggttactct
tgtgaagatttaaataaaatatttaaaaatagatttaaagacatgatttataaagatgat
ttagacaagtttaattgtattattctaaatcaattagaaaaacaagataaaattgaagtt
gaatatagaattgtaagaaaagatggaagtataatttggattttggagagaagtaagtct
ataaatgataataaaggaagtgagtgtattcagggagttttaactgatataacagaactt
aagaaaatacaagaagagttagattcaaaaagatttgaaatacaggctatcaatgatagt
attgttggtggaatagtgataactgagataaatgatgattttgatagtatatatttaaat
gaaggttatttaaatatgattggatatacacgcaaacaactggaagatgagctaaataat
aaattaatcaaacttatttttaaagatgatagaacagaattaattaatagtataaacaaa
caactcaaattaagtgatacatttgcatctgaacaaagagttgaaaaaagggatggtact
attatatggattttattaaaaggaagaaagataatttatgataatggaaaatctgtactt
tgttgtgttattgtagatatcacttctgctaaattattagagcaagaacttaaaaagagt
gaagaacgtcatgaaatcattctaaagcagacgcaaaatatcataatagaatgggatata
gaaaaagataaaatgaatatatcacctaattggtataataagtttaaatatgaccctata
actgaaaacgcaacaaaaaatataattaaatcagtagatatatatcatgatgatatggat
aagtttatttcattaattaaacttacttcacaaggtagtgagtatgaagagtgtgaaatt
agacttagaactagagatactatttacgcttggtttagtataaaggcaacaactttattt
gataataatggtaaaccttataaagtagtaggaagtttgactgatattgatgaatcaaaa
cgagaagctgaaaagttgaaagaaagggcagaaaaagaccctcttacagatttgtataat
aaaaaagcatcacaatcacttatagaagagtacataacattggataaaaaaagaaaaggt
gctttaatgattattgatattgataactttaaaggaataaatgataatttaggacattta
tatggggatgctgtattaagtgaaattgcaaatgacctaataaatctatttagagcaacc
gatatagtaggcagaattggtggagatgagtttattgtatttataaaagatatttctgaa
acaagagatattataaataaagcagaagaattggtaaaaacatttgaaaggtctttttta
ggtaaaggacgaaattataaaatatcattaagtgtaggaattgctaagtttccacaagat
ggtatggactatatgacactatttagaaatgcggatatggctctttactcagccaaaggg
aagggtaagaattgttatacattgtatgataaaaaaattgataaagtccaatatataact
aatacaagaaatgcaggagatagtgataatgtagagatgtcttttaaagaacatatcaca
aattatatatttgatatactatatgaatcaagtgatatagaagtggcagtaaatttaatt
ctaagtattgtaggtaaacactttaatgtgagtcgcatgtatatatttgaaaattcagat
gataatcgagtatgtaaaaatacatttgaatggtgtaacgaaggtgtaacctcggaaatt
aataatcttaaaaatatttgttacaaggatttaggcaactatcttttaaattttaatgca
gatgggttattttattgtaatgatattgaaaatttaggtagtgatgtgaaaaaagtactt
aagccacaaggcatacgttcaatattacaatgtaaaattttagagggcaatgaatttaga
gggttcataggatttgatgaatgttcatataatcgtatgtggactaatgatgaagtgaac
actttgacatttatatctaaaacgctcagtatgtttttattaaaaatgcgtattcagagt
aagctagaagagtctttaacaattcaaaaatctgtgatggataatatggatatatgggca
tatgttgttgacaggaatacctatgaattattatttatcaataaaaaaatgcttgagtca
gcatcaaacactcatgtaggtgatttatgttataaagcgatatggaataatcaagataaa
ccttgtaaaaaatgccctatgatatatttaaaagatggtgatgatacttataaatcattt
atgcgcaataaaaagtttgaggtacaggcaaatataactacaactactttgaaatggttt
gatgggaaagatgcatgtttaatatttggaagtgaagtaactagtattgaagctgaagaa
aatacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
