Clostridioides difficile CD196: CD196_1489
Help
Entry
CD196_1489 CDS
T00997
Name
(GenBank) cell surface protein (putative penicillin-binding protein) precursor
Organism
cdc
Clostridioides difficile CD196
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CW_binding_2
LRR_4
Flg_new
InlJ_IG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBA62856
UniProt:
A0A0H3NBC3
LinkDB
All DBs
Position
1727689..1730088
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MIFKKYIKSLLIVVSVTLIMNKSILFVNALDLESNNNIKSYKRKNVKEIDISNKFVDESF
RRDIVEKVLDNRDDPLTNEVASKDNYKIYESDLNKIESCLELDLHKNPDVSNPNKIDNLD
GIENFRNLEKLDCSSNNLESVDLSKNIKLKYLDISGNKILNIDLKNNNLINELHCDANKL
SNLDLKNNKNLVSLFFTSNELTEIDLSNNVNLENLQFLNNNLKSIDLSHNKKLKSLNCTN
NKLKSLDLSNNVFLKNLSCSGNNLSKLNIKGLTSLEYLGCAKNKLQDLDVSTNIKLDSLL
CGKNSLTKIDISKNKELNSLECSGQYIEKSIIKNGENIVVDIGIENSKLKELYPQNYNIS
TGFLTWENLSDFPNSISYSLEYEYGPVNDTETMDVNISIDKLVKCRIRYIDYDGSIINEK
EISDNSSINEIQINPQRENYEFSGWRNNKDEKIYTSEQVSKLVFDDSTDFIATYKRKSTG
SSGSSGGTSSKEDFNIAPSKEKITGADRNETSVKISQKGWNKADNIVLINDSSISDALSA
TPFAKSKDAPILLTKNNNLNKLTEKEINRLEAKNVYIVGGLKSVDEKVVSDLKKKGLNVI
RISGNDRYETSIKLAKELDKNSNLSKVVVVNGEKGLADAVSMGAISAKEEMPILLTNQND
DMKDIKDLIANKNISKSYVIGGESLFNNKEVNNTLPSVTKIAGSDRTETNSKVISHFYSK
DTLNDLYVAKNGMNKQDDLVDALSVGVLAGKTESPVVLVGNGLDDSQKELIKNKKFKNIT
QIGGNGNEKAFNEVENLVK
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatttaagaagtatataaaatcattactgatagttgttagtgttacattgataatg
aacaaatcaatattatttgtaaatgcattagatttagagagtaacaataacataaaatct
tataaaagaaagaatgtaaaggaaattgatataagcaataaatttgttgatgaatccttt
agaagagatattgttgaaaaggtattagataatagggatgatccattaacaaatgaagtt
gcatcaaaagataactataaaatatatgaaagtgatttaaataaaattgagagttgctta
gagttagatttacataaaaatccagatgtttctaatccaaacaaaatagataatttagat
gggatagaaaattttagaaatctagaaaagcttgattgtagttcaaataatctagaaagt
gtagatttaagtaaaaatataaaattaaaatatctagatattagtggaaataaaatatta
aacattgatttaaaaaacaataatcttattaatgaattacattgtgatgcaaataaatta
tcaaatttagaccttaaaaataataaaaatttggtaagtttattttttactagtaatgaa
ttaacagagatagatttaagtaataatgtgaacttagaaaatttacaatttcttaataat
aatttaaaaagtatagatttaagtcataataaaaagttgaaatctctaaattgtactaac
aataaacttaaatcccttgatttaagtaataatgtttttttgaaaaatttaagttgttca
ggtaataacctgagtaaattaaatataaaaggacttacaagtcttgagtatttgggatgt
gctaagaataaattacaagatttagatgtatctacaaatataaaattagattctttactt
tgtgggaaaaatagtttaacaaaaatagatataagtaaaaataaagaattaaattcactg
gaatgtagtggtcaatatatagaaaaaagcattataaaaaatggtgaaaatatagttgta
gatataggaattgaaaattcgaaattaaaggaattatatccacaaaattataatatttca
acaggttttctaacatgggaaaatctttctgactttccaaatagcataagttatagtttg
gaatatgaatatggtccagtaaatgatacagagactatggatgtaaatatatcaatagat
aaattagtgaaatgtagaatcagatatatagattatgatggaagtataattaatgaaaaa
gaaatatcagataattctagtataaatgaaattcaaattaatcctcaaagagaaaactat
gagtttagtggttggaggaacaataaagatgaaaaaatatatacatcagagcaggtaagt
aaattagtttttgatgatagtactgattttatagcaacttataaaagaaaatcaacagga
tcaagtggttcttctggtggaacttcaagtaaagaagattttaatatagcaccatctaag
gaaaaaataacaggtgcagacagaaatgaaacatcagtgaaaataagtcaaaaaggatgg
aataaagctgataatatagtgttaataaatgactctagcatatcggatgctttatcagca
acaccatttgctaagtctaaagatgcaccaatattacttactaaaaataataatttaaat
aaattaacagaaaaagaaataaatagattagaagcaaaaaatgtgtacatagtgggtgga
ttaaagtctgttgatgaaaaagtagtgtctgatttaaagaaaaaaggattaaatgtaatt
agaatatctggaaatgatagatatgaaacatcaataaaacttgcaaaagaattagacaaa
aattctaacctgtcaaaagtagtagtggtaaatggagaaaagggactagctgatgcagta
agtatgggagctatatcagcaaaagaggaaatgccaattcttcttactaatcaaaatgat
gatatgaaagatataaaagacttaatagctaataaaaacatatcaaaatcatatgtaata
ggtggagaatctttatttaataataaagaagtgaataatacattaccatctgtaactaaa
atagcaggttctgatagaacagaaactaactcaaaagtaataagtcatttctatagcaaa
gatacacttaatgacttatatgtagctaagaatggaatgaataaacaagacgatttagta
gatgccttatcagtaggagtgcttgcaggtaaaactgaatctccagtagtattagttgga
aatggattagatgatagccaaaaagagttaatcaagaataaaaagtttaaaaatataact
caaattggtggaaatggaaatgaaaaagcatttaatgaagtagaaaacttagttaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
